Genes within 1Mb (chr6:138020100:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0696 0.0852 0.218 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 6.80e-01 0.0343 0.083 0.218 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0416 0.0651 0.218 B L1
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0732 0.0648 0.218 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 8.36e-01 0.0109 0.0524 0.218 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0373 0.0733 0.218 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 7.80e-01 0.023 0.0824 0.218 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0152 0.0932 0.218 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0125 0.0545 0.218 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 3.48e-01 0.0587 0.0624 0.218 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 9.02e-02 -0.0997 0.0586 0.218 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 6.77e-01 0.023 0.0553 0.218 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0785 0.0609 0.218 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 8.33e-01 0.0147 0.0696 0.218 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0816 0.104 0.218 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 2.34e-01 0.0755 0.0632 0.218 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 7.74e-01 0.0196 0.0679 0.218 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00727 0.0692 0.218 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 1.26e-01 0.0817 0.0531 0.218 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0457 0.0698 0.218 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 8.69e-01 -0.013 0.0784 0.218 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 3.84e-01 0.0875 0.1 0.218 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00704 0.0745 0.218 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 5.25e-01 0.0449 0.0705 0.218 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 6.89e-01 0.032 0.0796 0.218 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 2.14e-01 -0.114 0.0917 0.218 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 1.55e-02 -0.196 0.0802 0.218 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 6.71e-01 -0.041 0.0962 0.218 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 9.95e-01 0.000531 0.0812 0.218 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 6.77e-01 0.0311 0.0746 0.218 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 7.03e-01 0.0243 0.0636 0.218 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 7.13e-01 0.019 0.0516 0.218 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 2.88e-01 0.0574 0.0538 0.218 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 5.99e-01 0.0513 0.0974 0.218 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 7.50e-02 -0.101 0.0567 0.218 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 8.27e-01 0.0222 0.101 0.218 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 1.94e-01 0.0868 0.0666 0.218 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 6.04e-01 0.0475 0.0913 0.217 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0675 0.0701 0.217 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 5.35e-01 0.05 0.0804 0.217 NK L1
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00654 0.0683 0.217 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 6.10e-01 0.0298 0.0585 0.217 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 4.89e-01 0.0521 0.0751 0.217 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 7.11e-01 0.0308 0.0829 0.217 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 5.62e-01 0.0627 0.108 0.218 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0572 0.0656 0.218 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0398 0.0697 0.218 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0192 0.086 0.218 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 2.07e-01 0.0517 0.0408 0.218 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 3.33e-01 0.0815 0.0839 0.218 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 6.88e-01 0.0327 0.0812 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 8.63e-01 0.0213 0.123 0.219 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 2.85e-01 -0.118 0.11 0.219 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0392 0.0559 0.219 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 1.20e-01 -0.169 0.108 0.219 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0646 0.123 0.219 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0754 0.0947 0.219 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0154 0.105 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 5.64e-02 0.184 0.0961 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 3.94e-01 0.0619 0.0725 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 4.54e-01 0.0693 0.0924 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 4.65e-01 -0.053 0.0725 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 9.83e-01 0.00214 0.098 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 5.29e-01 0.0648 0.103 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 3.10e-01 0.107 0.105 0.22 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 8.48e-01 0.0152 0.0791 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 2.13e-01 -0.123 0.0982 0.22 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 1.44e-01 -0.099 0.0675 0.22 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 2.27e-01 0.119 0.0982 0.22 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 5.91e-01 0.0543 0.101 0.22 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 5.56e-01 -0.059 0.1 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0185 0.0828 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0124 0.0704 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0743 0.0954 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00259 0.0554 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0587 0.0807 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 3.25e-01 0.0854 0.0866 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0195 0.0976 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0152 0.101 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 4.11e-01 0.0549 0.0666 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0475 0.0801 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0977 0.0798 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0902 0.0874 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 8.85e-01 0.015 0.104 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 9.39e-01 0.00779 0.102 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0554 0.0953 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 4.15e-02 0.179 0.087 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 7.39e-01 0.0358 0.107 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.67e-01 0.0564 0.0624 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 8.09e-02 0.174 0.099 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0666 0.0972 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000477 0.0988 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.56e-01 0.00949 0.0522 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 7.52e-01 0.0195 0.0616 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 8.57e-01 0.0147 0.0814 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.36e-01 0.0549 0.057 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0693 0.0679 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 3.25e-01 0.0728 0.0738 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 7.95e-01 -0.025 0.0963 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0673 0.0723 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 1.70e-01 0.0983 0.0714 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0178 0.0899 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 5.03e-01 0.035 0.0522 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0129 0.0731 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 9.11e-01 0.00819 0.0732 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 8.35e-01 0.0224 0.107 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 5.21e-02 0.157 0.0806 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 2.56e-01 0.083 0.0729 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 6.10e-01 0.0434 0.085 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00458 0.054 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00546 0.091 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 1.95e-01 -0.112 0.0863 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0925 0.112 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 4.73e-01 0.0542 0.0754 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 5.54e-01 0.0475 0.08 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0919 0.0997 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 1.94e-01 0.0824 0.0633 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 2.82e-01 0.094 0.0872 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 8.92e-01 0.0122 0.0893 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 2.13e-01 0.133 0.106 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0232 0.0744 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 5.69e-01 0.0389 0.0681 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 4.01e-01 0.0689 0.0818 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.14e-01 0.0585 0.058 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0459 0.0825 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 3.27e-01 0.0844 0.0858 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 7.10e-02 -0.211 0.116 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0715 0.0967 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 1.17e-01 0.129 0.0819 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 4.89e-01 0.0754 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 5.08e-01 0.0348 0.0524 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0812 0.089 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 2.21e-01 -0.117 0.0957 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0626 0.105 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.19e-01 0.0209 0.0914 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 2.64e-01 -0.107 0.0957 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 3.33e-01 -0.106 0.109 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 1.01e-01 0.11 0.067 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0142 0.103 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0227 0.1 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 5.96e-01 0.062 0.117 0.219 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0645 0.0757 0.219 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 8.38e-01 0.0166 0.081 0.219 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0485 0.107 0.219 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 2.36e-01 0.0603 0.0508 0.219 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 9.18e-01 0.0098 0.0956 0.219 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 4.85e-01 0.0658 0.0942 0.219 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 7.96e-01 0.0277 0.107 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0522 0.0835 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0335 0.0911 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0336 0.0975 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 5.90e-01 0.0336 0.0622 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 2.47e-02 0.202 0.0894 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0459 0.0991 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 9.86e-01 0.00179 0.0988 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0936 0.0646 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0232 0.0877 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0396 0.0786 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 9.91e-01 0.000711 0.0611 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0311 0.0805 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0468 0.0915 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0489 0.114 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 7.25e-01 0.0295 0.0837 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 3.53e-01 0.0902 0.0968 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 6.26e-01 0.042 0.0862 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 5.72e-01 0.0375 0.0663 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 7.75e-01 -0.03 0.105 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 8.19e-02 0.185 0.106 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 1.25e-01 0.154 0.1 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0074 0.0678 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 2.11e-01 0.108 0.0864 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000571 0.0808 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 5.40e-01 0.0372 0.0605 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0409 0.0894 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 2.85e-01 0.0976 0.091 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 3.44e-01 0.11 0.116 0.244 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 4.21e-01 0.0988 0.122 0.244 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.103 0.244 PB L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0803 0.0783 0.244 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0264 0.0953 0.244 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0929 0.112 0.244 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 3.82e-01 -0.1 0.114 0.244 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 5.23e-01 0.0714 0.112 0.22 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 7.73e-01 0.0246 0.0851 0.22 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 3.91e-01 0.0763 0.0888 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 8.75e-01 0.0129 0.0822 0.22 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.68e-01 0.0467 0.0518 0.22 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 8.25e-01 -0.023 0.104 0.22 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 4.83e-01 0.0707 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0142 0.105 0.218 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 1.41e-01 0.145 0.0982 0.218 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0164 0.0716 0.218 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 6.66e-02 -0.206 0.112 0.218 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.32e-01 0.0609 0.0626 0.218 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0642 0.0901 0.218 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0313 0.0957 0.218 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 7.35e-01 0.0342 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0191 0.0823 0.217 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 4.09e-01 0.0598 0.0723 0.217 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 5.29e-01 0.0511 0.081 0.217 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 1.28e-02 -0.232 0.0924 0.217 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 1.01e-02 -0.277 0.106 0.217 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 1.67e-01 -0.143 0.103 0.217 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 9.82e-01 0.00238 0.106 0.217 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0214 0.0817 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 6.69e-01 0.0254 0.0595 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 9.32e-01 0.00499 0.0587 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 4.76e-01 0.0457 0.064 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0124 0.0983 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 1.61e-02 -0.21 0.0866 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 8.59e-01 0.0183 0.103 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 7.22e-02 0.123 0.0679 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 9.80e-01 0.00229 0.092 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 9.81e-01 0.00159 0.0676 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 2.12e-01 0.0784 0.0627 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 4.04e-01 0.0501 0.0599 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 6.64e-01 0.0428 0.0985 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 2.45e-01 -0.108 0.0929 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00744 0.108 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0114 0.0862 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0345 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 5.83e-01 0.0554 0.101 0.209 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00264 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 6.03e-01 -0.058 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.69e-01 0.0558 0.0619 0.209 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 4.06e-01 0.103 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 2.89e-01 0.119 0.112 0.209 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 1.89e-02 0.252 0.107 0.222 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 1.31e-01 0.11 0.0724 0.222 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00774 0.0726 0.222 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.12e-01 0.0636 0.0627 0.222 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0389 0.0978 0.222 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 1.64e-01 -0.14 0.101 0.222 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000132 0.11 0.222 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 6.32e-01 0.0449 0.0936 0.222 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 8.30e-02 0.174 0.0996 0.21 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0112 0.0854 0.21 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 6.58e-01 0.0266 0.0598 0.21 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 3.56e-01 0.0698 0.0754 0.21 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0611 0.0963 0.21 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0772 0.0725 0.21 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 8.95e-01 0.0141 0.107 0.21 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 7.69e-01 0.0278 0.0945 0.21 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 1.26e-01 0.174 0.113 0.203 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0422 0.0965 0.203 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 1.11e-01 0.141 0.0878 0.203 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 8.38e-01 0.0184 0.0895 0.203 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 3.57e-01 0.0812 0.0879 0.203 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 9.53e-01 0.00525 0.0892 0.203 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 1.55e-03 0.276 0.0857 0.203 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 7.58e-01 0.028 0.0908 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 7.19e-01 -0.036 0.1 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 1.25e-01 0.131 0.085 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 7.38e-01 0.0232 0.0693 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00623 0.0913 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0868 0.06 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 4.46e-01 0.0705 0.0922 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 6.31e-01 0.049 0.102 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0739 0.0931 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0256 0.0871 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00473 0.0646 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0771 0.0948 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 9.88e-01 0.000779 0.0499 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0347 0.0743 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 2.92e-01 0.0935 0.0886 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0346 0.0746 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.24e-01 0.0132 0.0595 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 7.79e-01 0.0157 0.0557 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 2.17e-01 0.0679 0.0548 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 6.12e-01 0.0497 0.0979 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 1.59e-02 -0.193 0.0794 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0265 0.105 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 1.80e-01 0.0882 0.0656 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 5.54e-02 0.192 0.0998 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 8.55e-01 0.0129 0.0705 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 6.68e-01 0.0231 0.0538 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 7.84e-01 0.0181 0.0658 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -672471 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0871 0.0954 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0459 0.0594 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -672448 sc-eQTL 4.14e-01 0.0863 0.106 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 5.72e-01 0.0499 0.0882 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -753409 sc-eQTL 4.60e-01 0.0701 0.0948 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 800651 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0815 0.0662 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -383431 sc-eQTL 5.41e-01 0.0504 0.0823 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -87319 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0128 0.0695 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 152886 sc-eQTL 5.85e-01 0.033 0.0605 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -968161 sc-eQTL 9.29e-01 0.00708 0.0791 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 151867 sc-eQTL 5.71e-01 0.048 0.0846 0.216 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000237499 AL357060.1 151867 eQTL 0.0299 -0.0331 0.0152 0.00139 0.0 0.245


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina