logo

Genes within 1Mb (chr6:138018193:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0987 0.119 0.098 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00637 0.116 0.098 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 2.96e-02 -0.196 0.0896 0.098 B L1
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 8.59e-01 0.0161 0.0905 0.098 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0289 0.0729 0.098 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0755 0.102 0.098 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 9.35e-01 0.0093 0.115 0.098 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000438 0.132 0.098 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 1.56e-01 0.11 0.077 0.098 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.69e-01 0.0644 0.0887 0.098 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0773 0.0835 0.098 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0967 0.0782 0.098 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 1.12e-01 -0.138 0.0862 0.098 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.85e-01 0.027 0.0987 0.098 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 3.89e-01 -0.125 0.145 0.098 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 3.08e-01 0.0903 0.0884 0.098 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.46e-01 0.0724 0.0948 0.098 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 7.13e-01 0.0356 0.0966 0.098 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 7.24e-01 0.0264 0.0746 0.098 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0591 0.0975 0.098 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 6.02e-01 0.0572 0.11 0.098 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0226 0.145 0.095 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 2.23e-01 0.132 0.108 0.095 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0957 0.102 0.095 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.36e-01 -0.137 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 5.57e-01 0.0784 0.133 0.095 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 3.01e-02 -0.255 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 3.40e-01 0.133 0.139 0.095 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 5.68e-01 0.0673 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0439 0.107 0.098 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 5.48e-01 0.0549 0.0913 0.098 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00944 0.0742 0.098 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.19e-01 0.0952 0.0773 0.098 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 5.39e-01 0.0861 0.14 0.098 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 1.38e-01 -0.122 0.0816 0.098 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 5.24e-01 0.0929 0.146 0.098 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.96e-02 0.168 0.0954 0.098 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 5.30e-01 0.0809 0.129 0.097 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 7.66e-01 0.0295 0.099 0.097 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.86e-01 0.00198 0.113 0.097 NK L1
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0358 0.0962 0.097 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 5.69e-01 -0.047 0.0823 0.097 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 6.39e-01 0.0498 0.106 0.097 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0552 0.117 0.097 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 3.27e-01 -0.151 0.154 0.098 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 6.66e-01 0.0406 0.0938 0.098 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0808 0.0994 0.098 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 2.95e-01 0.129 0.122 0.098 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 4.38e-01 0.0453 0.0583 0.098 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 3.23e-01 0.119 0.12 0.098 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 5.07e-01 -0.077 0.116 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 5.94e-01 0.0938 0.176 0.097 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 5.67e-01 -0.09 0.157 0.097 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.23e-01 -0.123 0.154 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 4.71e-01 0.0577 0.0799 0.097 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 5.36e-02 -0.298 0.154 0.097 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 9.88e-01 0.00257 0.175 0.097 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00135 0.136 0.097 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.12e-01 0.0354 0.149 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 4.37e-01 0.107 0.137 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.84e-01 0.00209 0.103 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 1.94e-01 0.17 0.131 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0893 0.103 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 2.85e-01 -0.149 0.139 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0452 0.146 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 7.46e-02 0.267 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 2.23e-01 0.181 0.148 0.099 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 1.56e-01 -0.16 0.113 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 3.72e-01 -0.126 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 1.33e-01 -0.145 0.0965 0.099 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 5.66e-01 0.0809 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.79e-01 -0.102 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 2.14e-01 -0.175 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 7.18e-01 -0.042 0.116 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 3.06e-01 -0.102 0.0989 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0398 0.134 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0938 0.0777 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 7.04e-01 0.0433 0.114 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.94e-01 0.032 0.122 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 6.25e-01 0.07 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 2.59e-01 -0.166 0.147 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 2.62e-01 -0.11 0.0974 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 5.69e-01 -0.067 0.117 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 1.66e-01 -0.162 0.117 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 3.05e-01 -0.132 0.128 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.77e-01 -0.043 0.152 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 6.70e-01 0.0608 0.142 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 1.00e+00 4.7e-06 0.133 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 6.66e-01 0.0531 0.123 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 5.69e-01 0.0854 0.15 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0152 0.0874 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 3.76e-01 0.124 0.139 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0148 0.136 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0308 0.14 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 1.61e-01 0.104 0.0736 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00154 0.0873 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 4.11e-01 0.0949 0.115 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0419 0.0808 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0748 0.0963 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 6.43e-01 0.0486 0.105 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0612 0.138 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 8.54e-01 -0.019 0.104 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 1.63e-01 0.143 0.102 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0868 0.128 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0771 0.0744 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0425 0.104 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 8.15e-01 0.0245 0.105 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 5.84e-01 0.0842 0.154 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 3.21e-02 0.248 0.115 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 6.79e-01 0.0434 0.105 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00355 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 1.58e-01 -0.109 0.077 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0114 0.13 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00648 0.124 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 4.79e-01 -0.111 0.157 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 8.71e-01 0.0172 0.106 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.26e-01 0.0104 0.112 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0812 0.14 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 1.40e-01 0.131 0.0885 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0826 0.122 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 6.83e-01 0.0511 0.125 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.78e-01 0.023 0.149 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 5.82e-01 0.0573 0.104 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 3.54e-01 0.0884 0.0951 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 8.58e-01 0.0205 0.115 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0956 0.0811 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 5.77e-01 0.0645 0.115 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 2.66e-01 0.134 0.12 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 9.15e-02 -0.277 0.163 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0973 0.136 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 6.34e-01 0.0552 0.116 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 2.67e-01 0.169 0.152 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0176 0.0737 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 1.20e-03 -0.401 0.122 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.32e-01 0.106 0.135 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 6.25e-01 0.0743 0.152 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 6.95e-01 0.0516 0.131 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 2.46e-01 -0.16 0.138 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 8.78e-01 0.0241 0.157 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 8.69e-02 0.166 0.0962 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 7.33e-01 0.0505 0.148 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 9.38e-01 0.0111 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0323 0.167 0.097 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 5.48e-01 0.0654 0.109 0.097 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0789 0.116 0.097 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 5.34e-01 0.0956 0.154 0.097 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 8.52e-01 0.0136 0.0731 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 2.05e-01 0.174 0.137 0.097 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0941 0.135 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 4.14e-02 0.3 0.146 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 1.81e-01 0.154 0.115 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 3.08e-01 -0.128 0.125 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 1.90e-01 -0.176 0.134 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0113 0.0858 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 3.52e-02 0.262 0.123 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.83e-01 -0.096 0.137 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 3.87e-01 -0.121 0.139 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0344 0.0916 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0932 0.124 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 8.15e-01 -0.026 0.111 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0688 0.0862 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00604 0.114 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 1.27e-01 -0.197 0.129 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.63e-01 0.0274 0.159 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 8.03e-01 0.0292 0.117 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0159 0.135 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 7.90e-01 -0.032 0.12 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0516 0.0925 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 8.62e-01 0.0256 0.147 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 9.62e-01 0.00711 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 4.26e-01 0.113 0.142 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 6.38e-01 0.0451 0.0956 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 1.50e-01 0.176 0.122 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 4.74e-01 0.0817 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0593 0.0853 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 3.02e-01 -0.13 0.126 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.02e-01 0.108 0.129 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0818 0.168 0.107 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 3.51e-01 0.166 0.177 0.107 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 2.46e-01 0.173 0.148 0.107 PB L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0361 0.114 0.107 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0714 0.138 0.107 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0237 0.162 0.107 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 2.89e-01 -0.175 0.165 0.107 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.44e-01 -0.031 0.157 0.098 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 1.87e-01 0.158 0.119 0.098 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.09e-01 0.103 0.125 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 2.16e-01 0.143 0.115 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.55e-01 0.0831 0.0728 0.098 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 1.69e-01 -0.201 0.145 0.098 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.74e-01 0.102 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 2.19e-01 0.184 0.149 0.098 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 5.66e-02 0.267 0.14 0.098 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00563 0.102 0.098 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 2.56e-01 -0.182 0.16 0.098 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 9.49e-01 0.00573 0.0894 0.098 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0171 0.129 0.098 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.38e-01 0.106 0.136 0.098 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 6.70e-01 0.0636 0.149 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0312 0.121 0.09 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0477 0.107 0.09 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 3.13e-01 -0.121 0.119 0.09 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0886 0.138 0.09 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 8.57e-03 -0.417 0.157 0.09 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0677 0.153 0.09 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0167 0.156 0.09 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0421 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 6.23e-01 0.0417 0.0847 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0467 0.0835 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 1.96e-01 0.118 0.0909 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 4.43e-01 -0.107 0.14 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 4.03e-03 -0.356 0.123 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 6.60e-01 0.0645 0.146 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 3.29e-02 0.207 0.0964 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 7.72e-01 0.039 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 4.27e-01 0.0788 0.099 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0102 0.0923 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 1.09e-01 0.141 0.0875 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 3.97e-01 0.122 0.144 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0699 0.137 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0119 0.158 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 5.70e-01 0.0719 0.126 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0103 0.184 0.094 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 2.07e-01 0.185 0.146 0.094 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0803 0.175 0.094 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0231 0.163 0.094 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0323 0.0904 0.094 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 6.14e-01 -0.091 0.18 0.094 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 1.38e-01 0.243 0.163 0.094 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 3.58e-01 0.142 0.154 0.098 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 1.32e-01 0.157 0.103 0.098 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.91e-01 0.00118 0.104 0.098 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 4.67e-01 0.0654 0.0897 0.098 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 7.69e-01 0.041 0.14 0.098 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 9.16e-02 -0.243 0.143 0.098 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00113 0.157 0.098 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 6.53e-01 0.0603 0.134 0.098 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 9.61e-01 0.0074 0.152 0.093 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 5.31e-01 0.0811 0.129 0.093 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0547 0.0906 0.093 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.83e-01 0.123 0.114 0.093 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 6.30e-01 0.0704 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0276 0.11 0.093 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0108 0.162 0.093 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0607 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 2.39e-01 0.193 0.164 0.096 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 1.93e-01 0.181 0.139 0.096 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 4.21e-01 0.103 0.128 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 3.26e-01 -0.127 0.129 0.096 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 3.43e-01 0.121 0.127 0.096 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 8.60e-01 0.0228 0.129 0.096 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 2.25e-02 0.29 0.126 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 4.17e-01 0.107 0.131 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 4.62e-01 0.106 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 2.59e-01 0.139 0.123 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 2.45e-01 -0.116 0.0996 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 9.04e-01 0.0159 0.132 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 2.20e-01 -0.107 0.0866 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0709 0.133 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 3.79e-01 -0.129 0.147 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 3.86e-01 -0.114 0.132 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0711 0.123 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 1.81e-01 -0.122 0.091 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0767 0.134 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0543 0.0705 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00561 0.105 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 6.75e-01 0.0527 0.126 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.30e-01 -0.023 0.107 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 6.03e-01 0.0444 0.0853 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0293 0.0799 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 1.55e-01 0.112 0.0786 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 9.76e-01 0.00425 0.141 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 4.66e-02 -0.229 0.115 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 9.48e-01 0.00994 0.151 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.80e-02 0.166 0.0939 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0974 0.147 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 6.92e-01 0.0409 0.103 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00783 0.0788 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 6.12e-01 -0.049 0.0964 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -674378 sc-eQTL 3.55e-01 0.13 0.14 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0468 0.0871 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -674355 sc-eQTL 3.87e-01 0.134 0.155 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.66e-01 0.0386 0.129 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755316 sc-eQTL 8.85e-01 0.0193 0.134 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0165 0.0935 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 sc-eQTL 8.39e-01 0.0237 0.116 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -89226 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0164 0.0979 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150979 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0428 0.0852 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970068 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0598 0.111 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149960 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0396 0.119 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 798744 eQTL 0.199 -0.0303 0.0235 0.00375 0.0 0.0996
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 eQTL 0.0368 -0.0698 0.0334 0.0 0.0 0.0996
ENSG00000237499 AL357060.1 149960 eQTL 0.0187 -0.051 0.0217 0.00195 0.0 0.0996

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -385338 1.01e-06 7.46e-07 1.23e-07 4.4e-07 9.45e-08 2.16e-07 6.02e-07 1.45e-07 5.49e-07 2.43e-07 8.58e-07 4.28e-07 9.65e-07 1.59e-07 2.77e-07 2.99e-07 4.3e-07 4.11e-07 2.25e-07 1.82e-07 2.09e-07 4.66e-07 4.13e-07 1.78e-07 1.06e-06 2.74e-07 3.16e-07 3.24e-07 4.88e-07 5.99e-07 3.67e-07 6.63e-08 5.47e-08 1.54e-07 3.42e-07 1.44e-07 1.09e-07 7.75e-08 6.33e-08 2.74e-08 1.01e-07 7.54e-07 2.8e-08 1.06e-08 1.29e-07 1.44e-08 1.21e-07 1.77e-08 5.15e-08