logo

Genes within 1Mb (chr6:138017891:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 1.24e-01 0.142 0.0918 0.177 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0957 0.0896 0.177 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0427 0.0704 0.177 B L1
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 6.62e-01 0.0308 0.0703 0.177 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 6.50e-01 0.0257 0.0567 0.177 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 6.86e-01 0.0321 0.0793 0.177 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 6.71e-01 -0.038 0.0892 0.177 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0284 0.102 0.177 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0421 0.0597 0.177 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 1.66e-02 -0.163 0.0676 0.177 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0224 0.0646 0.177 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 7.32e-01 0.0208 0.0605 0.177 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 2.38e-02 0.151 0.0661 0.177 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 5.85e-02 -0.144 0.0756 0.177 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 2.61e-01 0.125 0.111 0.177 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 7.77e-02 -0.119 0.0674 0.177 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 2.91e-02 -0.158 0.0719 0.177 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 6.31e-01 0.0356 0.074 0.177 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 6.91e-01 0.0227 0.0571 0.177 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 6.98e-01 0.0291 0.0747 0.177 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0858 0.0837 0.177 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 2.61e-01 -0.127 0.113 0.18 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 5.14e-02 -0.163 0.0832 0.18 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0366 0.0796 0.18 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 4.37e-01 0.0698 0.0896 0.18 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 3.03e-01 -0.107 0.104 0.18 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 1.83e-01 -0.122 0.0914 0.18 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 2.07e-01 -0.137 0.108 0.18 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0407 0.0915 0.18 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 4.91e-01 -0.056 0.0811 0.177 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 5.50e-02 -0.132 0.0686 0.177 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 4.61e-01 0.0414 0.0561 0.177 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 8.04e-01 0.0146 0.0587 0.177 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 5.99e-01 0.0558 0.106 0.177 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 4.12e-01 0.0509 0.062 0.177 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 2.26e-01 -0.133 0.11 0.177 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.90e-01 0.0626 0.0726 0.177 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 9.98e-01 0.00028 0.0996 0.178 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0181 0.0765 0.178 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0521 0.0876 0.178 NK L1
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 5.12e-02 0.145 0.0738 0.178 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 4.24e-01 0.051 0.0636 0.178 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 1.02e-01 0.134 0.0814 0.178 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 5.23e-01 0.0578 0.0902 0.178 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 3.25e-01 -0.115 0.117 0.177 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 5.46e-01 0.0431 0.0713 0.177 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 7.20e-02 -0.136 0.075 0.177 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 8.29e-01 0.0202 0.0933 0.177 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 9.90e-01 0.000569 0.0444 0.177 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 3.47e-01 0.0858 0.091 0.177 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.15e-01 0.0886 0.0879 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.44e-01 0.0637 0.138 0.171 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0286 0.123 0.171 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 1.57e-01 0.171 0.12 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0251 0.0627 0.171 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 2.46e-01 0.141 0.121 0.171 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0162 0.137 0.171 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.05e-01 0.109 0.106 0.171 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 4.31e-01 0.0898 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 2.61e-01 -0.118 0.105 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0464 0.0789 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 2.45e-01 -0.117 0.1 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 7.18e-01 0.0285 0.0788 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0919 0.106 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 8.96e-02 0.189 0.111 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 8.09e-01 -0.028 0.116 0.179 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0322 0.114 0.179 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0786 0.0869 0.179 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0585 0.108 0.179 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00599 0.0747 0.179 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000423 0.108 0.179 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0494 0.111 0.179 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 4.10e-02 0.223 0.108 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 2.66e-01 -0.101 0.0902 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0881 0.0768 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0829 0.104 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 8.30e-01 0.013 0.0606 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 5.64e-01 0.051 0.0883 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0785 0.0947 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0689 0.109 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 8.34e-01 0.0236 0.112 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 5.91e-01 -0.04 0.0743 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 7.55e-01 -0.028 0.0893 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 9.04e-01 0.0108 0.0893 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 7.75e-01 -0.028 0.0977 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 2.19e-01 -0.142 0.115 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 9.00e-01 0.014 0.111 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 9.62e-02 -0.172 0.103 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 1.46e-02 -0.232 0.094 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0592 0.116 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0295 0.0678 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 4.46e-01 0.0825 0.108 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00507 0.106 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0149 0.107 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 9.23e-01 0.00545 0.0564 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 6.97e-02 -0.12 0.0661 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0141 0.0879 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 4.64e-01 0.0452 0.0616 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 4.02e-02 0.15 0.0729 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 2.70e-02 -0.176 0.079 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.54e-01 0.0472 0.105 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0505 0.0792 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 2.94e-02 -0.17 0.0775 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 7.74e-01 0.0283 0.0983 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 6.58e-01 0.0253 0.0571 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 8.33e-01 0.0168 0.0799 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0803 0.0798 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00856 0.118 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 2.43e-02 -0.2 0.088 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 2.46e-02 -0.179 0.0792 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0765 0.093 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 1.32e-01 0.0889 0.0588 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 1.66e-01 0.138 0.0992 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0758 0.0947 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 4.33e-01 0.096 0.122 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0653 0.0823 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 1.04e-01 -0.142 0.0868 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 5.47e-02 0.209 0.108 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 9.75e-01 0.00214 0.0693 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 5.10e-01 0.0628 0.0952 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0294 0.0974 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0042 0.116 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 7.31e-02 -0.144 0.0802 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 1.27e-01 -0.113 0.0736 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0816 0.0888 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 6.26e-01 0.0308 0.0631 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 8.84e-01 0.0131 0.0896 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 2.22e-01 -0.114 0.0931 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 5.15e-01 0.0846 0.13 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 9.91e-01 0.00127 0.107 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 2.04e-01 -0.116 0.0907 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 9.97e-02 -0.198 0.119 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 7.06e-01 0.0219 0.058 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 3.85e-02 0.203 0.0975 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0452 0.106 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0469 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 7.73e-01 0.0295 0.102 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 2.15e-01 -0.133 0.107 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0732 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0566 0.0753 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 9.17e-01 0.012 0.115 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 5.28e-01 0.0707 0.112 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0556 0.127 0.177 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 6.10e-01 0.042 0.0821 0.177 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 2.38e-02 -0.198 0.0868 0.177 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0439 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 1.40e-01 0.0814 0.055 0.177 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 4.80e-01 0.0733 0.104 0.177 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.80e-01 0.0897 0.102 0.177 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 5.07e-01 0.0772 0.116 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 9.50e-01 0.00573 0.0908 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0115 0.099 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 3.16e-01 -0.106 0.106 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 8.31e-01 0.0145 0.0676 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 8.08e-01 0.0239 0.0983 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.73e-01 0.0961 0.108 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0486 0.108 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0179 0.0709 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0103 0.0958 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 2.06e-01 0.109 0.0856 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 1.32e-01 0.101 0.0664 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 8.44e-01 0.0173 0.088 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.10e-01 0.102 0.0998 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 8.54e-01 -0.023 0.125 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0745 0.0914 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 4.33e-01 0.0832 0.106 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 1.65e-02 0.225 0.093 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0117 0.0726 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 1.15e-02 0.289 0.113 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.98e-01 -0.099 0.117 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0426 0.11 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0639 0.0741 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 1.59e-01 -0.134 0.0944 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 3.09e-03 0.259 0.0866 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 1.59e-01 0.0933 0.066 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 3.15e-01 0.0983 0.0977 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 9.62e-01 0.00477 0.0999 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0929 0.137 0.178 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 7.39e-02 -0.258 0.143 0.178 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 3.86e-01 -0.106 0.121 0.178 PB L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0767 0.0926 0.178 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 3.37e-01 0.108 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0617 0.133 0.178 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 5.06e-01 0.0902 0.135 0.178 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 2.26e-02 -0.281 0.122 0.178 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0409 0.0943 0.178 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0221 0.0986 0.178 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 1.27e-01 0.139 0.0907 0.178 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 4.40e-01 0.0445 0.0574 0.178 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 9.89e-01 0.00152 0.115 0.178 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0564 0.112 0.178 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0847 0.114 0.177 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 6.78e-01 0.0447 0.108 0.177 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 4.97e-01 -0.053 0.078 0.177 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 2.38e-02 -0.276 0.121 0.177 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 4.61e-01 0.0504 0.0683 0.177 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 8.35e-02 0.17 0.0976 0.177 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 8.11e-01 0.025 0.104 0.177 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 1.58e-01 -0.16 0.113 0.185 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 6.26e-02 -0.171 0.0915 0.185 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 9.19e-01 0.00828 0.0813 0.185 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 5.08e-01 0.0603 0.091 0.185 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 4.37e-02 -0.212 0.104 0.185 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 1.46e-01 -0.177 0.121 0.185 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0909 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.36e-01 -0.114 0.118 0.185 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 1.57e-01 -0.125 0.0882 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 4.97e-02 -0.126 0.064 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 6.82e-01 0.0261 0.0637 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 5.92e-01 0.0373 0.0695 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 6.91e-01 0.0425 0.107 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 5.12e-01 0.0626 0.0951 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 3.33e-01 -0.108 0.111 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 7.92e-01 0.0196 0.0743 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.56e-01 0.0455 0.102 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 6.88e-02 -0.136 0.0743 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0431 0.0697 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0206 0.0665 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0605 0.109 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 7.28e-01 0.036 0.103 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 6.95e-01 -0.047 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 4.82e-01 0.0671 0.0954 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0587 0.138 0.182 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 7.43e-01 0.0363 0.11 0.182 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 3.25e-01 -0.129 0.131 0.182 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 1.73e-01 -0.166 0.121 0.182 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 8.13e-01 0.0161 0.0679 0.182 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 2.63e-01 0.152 0.135 0.182 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.64e-01 -0.112 0.123 0.182 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0777 0.118 0.182 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0856 0.079 0.182 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 7.06e-01 0.0299 0.079 0.182 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 4.05e-01 0.057 0.0683 0.182 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 6.16e-01 0.0534 0.106 0.182 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 3.68e-02 0.229 0.109 0.182 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 2.60e-01 -0.135 0.119 0.182 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0218 0.102 0.182 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 1.01e-01 -0.184 0.112 0.176 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 4.90e-01 -0.066 0.0955 0.176 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0212 0.067 0.176 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 1.98e-01 0.109 0.0842 0.176 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 4.66e-01 0.0787 0.108 0.176 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00386 0.0813 0.176 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 2.99e-01 -0.124 0.119 0.176 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 4.95e-01 0.0722 0.106 0.176 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 2.28e-01 -0.151 0.124 0.184 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0317 0.106 0.184 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00517 0.0973 0.184 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 3.54e-01 0.0913 0.0981 0.184 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 9.75e-01 0.00299 0.0968 0.184 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 5.68e-01 0.056 0.098 0.184 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 1.27e-01 -0.148 0.0965 0.184 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 9.08e-01 0.0116 0.0999 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 1.11e-01 0.175 0.109 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 1.82e-01 -0.125 0.0934 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0439 0.076 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0968 0.1 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 9.22e-01 0.00651 0.0661 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0699 0.101 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 2.41e-01 0.12 0.102 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 2.43e-01 -0.112 0.0955 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0723 0.0709 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 6.67e-01 -0.045 0.104 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 7.76e-01 0.0156 0.0548 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 7.03e-01 0.0311 0.0817 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 1.88e-01 -0.129 0.0973 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0396 0.0817 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 4.69e-02 -0.129 0.0645 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 7.05e-01 0.0231 0.0609 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 6.38e-01 0.0283 0.0602 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00194 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 4.27e-01 0.0701 0.088 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 3.77e-01 -0.102 0.115 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 4.28e-01 0.0572 0.072 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 2.23e-01 -0.133 0.109 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 5.48e-02 -0.147 0.0759 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0142 0.0584 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 3.66e-02 0.149 0.0708 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -674680 sc-eQTL 1.22e-01 0.16 0.103 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 3.98e-01 0.0546 0.0646 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -674657 sc-eQTL 1.19e-01 -0.179 0.114 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 9.75e-01 0.00296 0.0959 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0515 0.103 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 798442 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0461 0.0721 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0561 0.0894 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -89528 sc-eQTL 1.61e-02 0.181 0.0744 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 150677 sc-eQTL 3.00e-01 0.0682 0.0656 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -970370 sc-eQTL 1.74e-01 0.117 0.0856 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 149658 sc-eQTL 5.81e-01 0.0508 0.0919 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -755618 pQTL 0.0449 -0.0867 0.0432 0.0 0.0 0.184
ENSG00000051620 HEBP2 -385640 eQTL 0.04 -0.0522 0.0254 0.0 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina