logo

Genes within 1Mb (chr6:138001649:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 4.90e-01 0.0797 0.115 0.111 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 1.23e-01 0.173 0.112 0.111 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 6.35e-03 -0.239 0.0866 0.111 B L1
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0684 0.0879 0.111 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 8.09e-01 0.0172 0.0709 0.111 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 9.58e-01 0.00521 0.0993 0.111 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 8.01e-01 0.0282 0.112 0.111 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 5.59e-01 0.0735 0.126 0.111 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 5.91e-01 0.0395 0.0735 0.111 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 4.84e-02 -0.166 0.0835 0.111 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0651 0.0794 0.111 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0333 0.0744 0.111 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 7.99e-01 -0.021 0.0823 0.111 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0591 0.0937 0.111 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 9.35e-01 -0.011 0.135 0.111 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.96e-01 0.0213 0.0825 0.111 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 3.47e-01 -0.083 0.0881 0.111 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0702 0.0898 0.111 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 7.69e-01 0.0204 0.0694 0.111 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 1.93e-02 -0.211 0.0896 0.111 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 7.75e-02 0.18 0.101 0.111 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 3.05e-01 0.143 0.139 0.108 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 5.88e-01 0.056 0.103 0.108 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.32e-01 -0.147 0.0973 0.108 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0656 0.11 0.108 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 2.28e-01 0.154 0.127 0.108 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 8.90e-02 -0.191 0.112 0.108 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 1.91e-01 -0.174 0.133 0.108 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 1.23e-01 -0.173 0.112 0.108 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0126 0.0992 0.111 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.90e-02 0.148 0.084 0.111 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 4.33e-02 -0.138 0.068 0.111 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 4.79e-01 0.0508 0.0717 0.111 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0832 0.13 0.111 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 1.09e-01 -0.121 0.0755 0.111 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 2.08e-02 -0.31 0.133 0.111 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0636 0.0888 0.111 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 8.56e-01 0.022 0.122 0.112 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 6.05e-01 0.0484 0.0935 0.112 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 3.07e-01 -0.11 0.107 0.112 NK L1
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0843 0.0907 0.112 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0408 0.0778 0.112 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 8.44e-01 0.0198 0.1 0.112 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 1.34e-01 0.165 0.11 0.112 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 6.04e-02 0.27 0.143 0.111 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 3.35e-01 0.0848 0.0877 0.111 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 6.46e-02 -0.172 0.0924 0.111 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 3.40e-01 0.11 0.115 0.111 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0299 0.0547 0.111 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 2.64e-01 -0.125 0.112 0.111 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 7.57e-01 0.0337 0.109 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 2.30e-01 0.197 0.164 0.107 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.98e-02 0.257 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 2.33e-01 -0.172 0.144 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 8.41e-01 -0.015 0.0749 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 9.46e-01 0.00991 0.145 0.107 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 4.39e-01 -0.127 0.164 0.107 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0568 0.127 0.107 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 5.61e-01 0.0807 0.138 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0439 0.128 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0883 0.0957 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 4.06e-01 0.102 0.122 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0984 0.0956 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 4.26e-01 -0.103 0.129 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 6.22e-02 -0.253 0.135 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 5.28e-01 0.0899 0.142 0.112 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 4.02e-01 0.118 0.14 0.112 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.61e-02 -0.256 0.106 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 2.82e-01 -0.144 0.133 0.112 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 9.18e-01 0.00941 0.0918 0.112 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0439 0.133 0.112 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 2.64e-01 0.152 0.136 0.112 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 7.82e-02 0.235 0.133 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 1.77e-01 0.149 0.11 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 5.57e-02 -0.179 0.0931 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0496 0.127 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 8.70e-01 0.0121 0.0739 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 6.68e-01 0.0463 0.108 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0271 0.116 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 6.72e-01 0.0556 0.131 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 5.81e-02 0.256 0.134 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.47e-02 -0.218 0.0885 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.64e-01 0.0468 0.108 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 5.92e-01 0.0633 0.118 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 3.32e-02 0.296 0.138 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 1.56e-01 -0.192 0.135 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 6.16e-01 0.0637 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 2.71e-01 -0.129 0.117 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 7.23e-01 0.0506 0.142 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0658 0.083 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 1.06e-01 -0.214 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 3.28e-01 -0.126 0.129 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 1.30e-01 0.199 0.131 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 8.03e-01 0.0173 0.0695 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 7.49e-02 -0.146 0.0814 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 5.24e-01 0.069 0.108 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0225 0.0759 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00873 0.0906 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 6.69e-01 -0.042 0.0983 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00758 0.129 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0283 0.0967 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.20e-01 -0.148 0.0951 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 6.21e-02 -0.223 0.119 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 8.64e-01 0.0119 0.0697 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 4.38e-01 0.0757 0.0973 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0724 0.0975 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 2.91e-01 0.152 0.143 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 4.30e-01 0.0858 0.109 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 2.90e-01 -0.104 0.0976 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0489 0.114 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0479 0.0721 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 6.91e-02 -0.221 0.121 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 5.76e-01 0.0649 0.116 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 2.31e-01 0.179 0.149 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 4.69e-01 0.073 0.101 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 8.80e-01 0.0162 0.107 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 3.60e-01 -0.122 0.133 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 7.82e-01 0.0235 0.0848 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0178 0.117 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 1.91e-02 0.278 0.118 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 7.54e-01 0.0434 0.139 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.41e-01 0.032 0.0967 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 4.19e-02 -0.18 0.0878 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 8.89e-01 -0.015 0.107 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 8.24e-01 0.0168 0.0756 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 1.58e-01 -0.151 0.107 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 4.09e-01 0.0924 0.112 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 6.34e-01 0.073 0.153 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.18e-02 0.227 0.125 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0838 0.107 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 2.87e-01 -0.151 0.142 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 7.86e-01 0.0186 0.0684 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 1.31e-02 -0.287 0.114 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 8.06e-02 0.218 0.124 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 4.66e-01 -0.109 0.149 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 6.04e-01 0.0668 0.129 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 9.76e-01 0.00409 0.135 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 7.27e-02 -0.276 0.153 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.94e-02 0.172 0.0942 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 2.57e-01 0.164 0.144 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 9.53e-01 0.00824 0.141 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 2.62e-01 0.172 0.153 0.113 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 1.25e-01 0.153 0.0991 0.113 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 3.81e-02 -0.22 0.105 0.113 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 6.42e-01 0.0656 0.141 0.113 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0306 0.067 0.113 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 3.31e-01 -0.122 0.125 0.113 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 9.89e-01 0.00179 0.124 0.113 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 2.40e-02 0.317 0.14 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 1.22e-01 0.17 0.11 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 6.06e-02 -0.225 0.119 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0374 0.129 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00786 0.0821 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 6.51e-01 0.0541 0.119 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 3.61e-01 0.12 0.131 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0703 0.131 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 3.69e-01 0.0776 0.0862 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.40e-01 -0.172 0.116 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 8.28e-01 0.0228 0.105 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00171 0.0813 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 3.86e-01 0.093 0.107 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 2.75e-01 0.133 0.121 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 1.97e-01 -0.202 0.156 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 5.92e-01 0.062 0.115 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00136 0.134 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 3.71e-01 -0.106 0.119 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0278 0.0915 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 3.89e-01 -0.125 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 7.78e-01 0.0416 0.147 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 2.79e-01 -0.146 0.134 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 8.40e-01 0.0184 0.0909 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.54e-01 -0.166 0.116 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 1.68e-01 -0.149 0.108 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0622 0.081 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0568 0.12 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 3.65e-01 0.111 0.122 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 6.81e-01 0.0732 0.178 0.093 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 2.13e-01 -0.234 0.187 0.093 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 3.67e-01 0.143 0.158 0.093 PB L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0523 0.12 0.093 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 5.68e-01 0.0836 0.146 0.093 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0659 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 1.01e-01 -0.287 0.173 0.093 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 6.25e-01 0.0738 0.151 0.113 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 8.13e-01 0.0272 0.115 0.113 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 4.24e-02 -0.243 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0814 0.111 0.113 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0424 0.07 0.113 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 2.83e-01 -0.15 0.14 0.113 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 5.59e-01 0.0795 0.136 0.113 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0189 0.138 0.111 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.49e-01 0.0416 0.13 0.111 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.19e-01 -0.147 0.0938 0.111 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0847 0.148 0.111 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 1.59e-01 -0.116 0.0823 0.111 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 5.49e-01 0.0712 0.119 0.111 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 4.64e-02 0.25 0.125 0.111 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000577 0.149 0.105 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 3.28e-01 0.119 0.121 0.105 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0724 0.107 0.105 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0253 0.12 0.105 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 4.50e-01 0.105 0.138 0.105 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0493 0.16 0.105 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 4.08e-01 -0.127 0.153 0.105 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 1.10e-02 -0.393 0.153 0.105 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 6.91e-01 0.0434 0.109 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 1.02e-01 0.13 0.079 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 5.75e-02 -0.148 0.0777 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 7.36e-01 0.0289 0.0856 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 5.28e-01 -0.083 0.131 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 5.04e-02 -0.228 0.116 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 5.10e-02 -0.267 0.136 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00525 0.0914 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0657 0.124 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 8.63e-01 0.0157 0.0909 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0886 0.0845 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 2.88e-01 0.0858 0.0806 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 5.88e-01 -0.072 0.133 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 5.75e-01 0.0704 0.125 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 1.63e-02 -0.347 0.143 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 1.77e-01 -0.156 0.116 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 4.00e-01 0.133 0.158 0.124 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 1.61e-01 0.177 0.126 0.124 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.30e-01 -0.228 0.15 0.124 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 3.85e-02 0.288 0.138 0.124 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0383 0.0779 0.124 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 4.23e-01 -0.125 0.155 0.124 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 9.35e-02 0.236 0.14 0.124 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 2.85e-01 0.156 0.146 0.113 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 2.65e-01 0.11 0.0983 0.113 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.25e-01 -0.15 0.0977 0.113 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0186 0.0851 0.113 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0722 0.132 0.113 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 3.47e-01 -0.129 0.137 0.113 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 2.17e-01 -0.183 0.148 0.113 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 6.99e-01 0.049 0.127 0.113 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 9.55e-01 0.00774 0.138 0.111 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 8.82e-01 0.0175 0.118 0.111 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.10e-01 -0.132 0.082 0.111 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0492 0.104 0.111 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0197 0.133 0.111 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 2.45e-01 -0.116 0.0998 0.111 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0291 0.148 0.111 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 5.00e-01 -0.088 0.13 0.111 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 1.45e-01 0.244 0.167 0.099 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 4.48e-01 0.108 0.142 0.099 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 8.83e-02 -0.222 0.129 0.099 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 2.73e-01 -0.145 0.131 0.099 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 1.91e-01 0.17 0.129 0.099 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0912 0.131 0.099 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 3.60e-01 0.12 0.13 0.099 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0439 0.134 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 4.86e-01 0.0932 0.134 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 7.78e-01 0.0322 0.114 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 1.61e-01 -0.13 0.0922 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0921 0.122 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0587 0.0805 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 5.07e-01 -0.082 0.123 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 2.02e-01 -0.174 0.136 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 7.44e-02 0.221 0.123 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 3.21e-02 0.248 0.115 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 2.34e-02 -0.194 0.0851 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 2.85e-01 -0.135 0.126 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.10e-01 0.034 0.0665 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00526 0.0991 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 4.48e-01 0.0899 0.118 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0244 0.101 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 1.71e-01 0.11 0.0797 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 3.36e-02 -0.159 0.0742 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 3.81e-01 0.0649 0.0739 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0479 0.132 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 1.81e-01 -0.145 0.108 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 1.17e-02 -0.354 0.139 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0545 0.0887 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 8.61e-01 0.0236 0.135 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 2.87e-01 0.101 0.0942 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 3.42e-02 -0.152 0.0713 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0451 0.0882 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -690922 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0809 0.128 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 2.28e-01 -0.096 0.0795 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -690899 sc-eQTL 2.68e-01 -0.157 0.141 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0136 0.118 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -771860 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0608 0.127 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 782200 sc-eQTL 4.44e-01 0.0678 0.0885 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -401882 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0846 0.11 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -105770 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0982 0.0924 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 134435 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0548 0.0806 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -986612 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00219 0.106 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 133416 sc-eQTL 1.53e-01 0.161 0.112 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 -986612 pQTL 0.0406 0.0745 0.0364 0.0 0.0 0.134
ENSG00000237499 AL357060.1 133416 eQTL 0.0511 -0.0341 0.0175 0.0011 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 \N -771860 2.67e-07 1.19e-07 3.72e-08 1.84e-07 8.83e-08 9.65e-08 1.49e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.74e-08 1.62e-07 7.78e-08 1.41e-07 6.38e-08 5.99e-08 7.17e-08 3.94e-08 1.18e-07 5.21e-08 4.42e-08 1.08e-07 1.27e-07 1.39e-07 3.79e-08 1.4e-07 1.16e-07 1.11e-07 9.36e-08 1.09e-07 1.1e-07 9.64e-08 3.87e-08 3.35e-08 8.49e-08 8.74e-08 3.76e-08 5.02e-08 9.22e-08 7.2e-08 3.18e-08 4.36e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.3e-08 6.38e-08 1.99e-08 1.23e-07 3.83e-09 4.79e-08