logo

Genes within 1Mb (chr6:137992241:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.27e-01 0.0124 0.135 0.079 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.44e-01 0.125 0.131 0.079 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.77e-01 0.0431 0.103 0.079 B L1
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 1.12e-01 0.163 0.103 0.079 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.73e-01 -0.091 0.0829 0.079 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 2.56e-01 0.132 0.116 0.079 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0545 0.131 0.079 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0814 0.151 0.079 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 4.48e-01 0.0671 0.0883 0.079 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00854 0.101 0.079 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 4.27e-01 0.0761 0.0955 0.079 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.47e-01 -0.104 0.0893 0.079 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 1.18e-02 0.248 0.0976 0.079 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0554 0.113 0.079 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 1.45e-01 -0.236 0.162 0.079 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.61e-01 0.0908 0.0991 0.079 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0367 0.106 0.079 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00268 0.108 0.079 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0796 0.0834 0.079 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 5.29e-01 0.0689 0.109 0.079 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.23e-01 -0.189 0.122 0.079 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 6.46e-01 0.0785 0.171 0.079 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 8.34e-02 0.219 0.126 0.079 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 1.25e-01 -0.184 0.119 0.079 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.35e-01 -0.131 0.135 0.079 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 5.51e-02 0.299 0.155 0.079 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 9.20e-01 -0.014 0.138 0.079 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 5.41e-01 0.1 0.164 0.079 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 4.53e-01 -0.104 0.138 0.079 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 2.91e-02 -0.254 0.116 0.079 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 8.12e-01 0.0237 0.0996 0.079 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 8.91e-02 -0.137 0.0803 0.079 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.24e-01 -0.103 0.0842 0.079 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 4.57e-02 -0.304 0.151 0.079 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 5.18e-01 0.0579 0.0894 0.079 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 8.07e-01 0.0389 0.159 0.079 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.104 0.079 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.61e-02 -0.253 0.151 0.079 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 9.54e-01 0.00672 0.117 0.079 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0206 0.134 0.079 NK L1
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 2.32e-01 0.136 0.113 0.079 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 8.95e-01 0.0128 0.0974 0.079 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 3.52e-01 0.117 0.125 0.079 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 4.27e-02 -0.279 0.137 0.079 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.53e-01 0.0103 0.175 0.079 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.21e-02 0.227 0.105 0.079 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0461 0.113 0.079 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 3.76e-01 -0.123 0.139 0.079 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0694 0.0662 0.079 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 8.42e-01 0.0272 0.136 0.079 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.60e-01 -0.185 0.131 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0629 0.2 0.082 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 7.66e-01 0.0533 0.179 0.082 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 4.02e-01 0.147 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0784 0.0907 0.082 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.55e-01 -0.163 0.176 0.082 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0634 0.199 0.082 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 5.07e-01 -0.102 0.154 0.082 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 4.27e-01 -0.131 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 9.86e-01 0.0026 0.153 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00735 0.114 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 6.19e-01 0.0724 0.146 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 8.35e-01 0.0238 0.114 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00739 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.53e-02 0.391 0.16 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00338 0.17 0.078 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 2.92e-01 0.177 0.168 0.078 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0507 0.128 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 1.01e-01 0.261 0.159 0.078 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0607 0.11 0.078 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0891 0.16 0.078 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 9.34e-01 0.0136 0.164 0.078 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 7.03e-01 -0.064 0.168 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0456 0.138 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.68e-01 0.0506 0.118 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 3.87e-01 0.138 0.159 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 1.09e-01 -0.148 0.0921 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00215 0.135 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0304 0.145 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 3.53e-01 0.151 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00103 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 3.63e-02 0.231 0.11 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 6.77e-01 0.0555 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0426 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 1.78e-01 0.196 0.145 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 2.01e-01 -0.22 0.172 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.84e-02 0.281 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 4.45e-01 0.122 0.159 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 2.98e-01 -0.153 0.147 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 4.55e-01 -0.134 0.179 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 7.24e-01 0.037 0.105 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 7.05e-02 0.301 0.166 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0805 0.163 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00208 0.161 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.42e-01 0.0807 0.0847 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0554 0.1 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 9.50e-01 0.0083 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0846 0.0926 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 2.68e-02 0.244 0.109 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 6.34e-01 0.0574 0.12 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.05e-02 -0.259 0.152 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 1.43e-01 0.169 0.115 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 9.45e-01 0.00782 0.114 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 2.75e-01 0.156 0.143 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0904 0.0829 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 1.74e-01 0.158 0.116 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.92e-01 -0.152 0.116 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 1.47e-01 -0.253 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 2.22e-01 0.161 0.132 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.56e-01 -0.053 0.119 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 5.75e-01 0.0775 0.138 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0365 0.0877 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 9.66e-01 0.00635 0.148 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 3.46e-01 -0.133 0.14 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 5.33e-01 -0.111 0.177 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 5.69e-01 0.0682 0.12 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0117 0.127 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 7.22e-01 0.0563 0.158 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 5.53e-01 0.0598 0.101 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0206 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 2.29e-02 -0.321 0.14 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 3.38e-01 -0.162 0.168 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 1.34e-01 0.176 0.117 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0908 0.108 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 2.76e-01 0.141 0.129 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 4.03e-01 -0.077 0.0918 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 6.40e-01 0.0611 0.13 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.23e-01 -0.209 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 2.45e-01 -0.218 0.187 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.80e-01 -0.136 0.154 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0137 0.132 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 2.13e-01 -0.216 0.173 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0591 0.0837 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 9.33e-01 -0.012 0.142 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 6.21e-01 0.0758 0.153 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 7.83e-01 0.0485 0.175 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 4.56e-01 0.113 0.152 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0759 0.16 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 1.59e-01 0.256 0.181 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.35e-01 -0.133 0.112 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 3.48e-01 -0.161 0.171 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0247 0.166 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 3.68e-01 0.167 0.186 0.08 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 1.33e-01 0.181 0.12 0.08 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000776 0.129 0.08 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 4.14e-01 -0.14 0.171 0.08 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 8.79e-01 0.0124 0.0813 0.08 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 4.98e-01 0.103 0.152 0.08 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 3.71e-01 -0.134 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 4.45e-01 0.134 0.175 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 5.87e-02 0.258 0.136 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 5.98e-01 -0.079 0.149 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 6.79e-01 0.0662 0.16 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.68e-01 -0.113 0.102 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 7.39e-01 0.0496 0.148 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0307 0.163 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 3.38e-01 -0.157 0.164 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0116 0.108 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.18e-01 0.0726 0.146 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00872 0.131 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.101 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 6.12e-01 0.0678 0.134 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.25e-01 -0.233 0.151 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.18e-01 0.0195 0.189 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 5.50e-01 0.083 0.139 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 3.16e-01 -0.161 0.16 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 2.26e-01 0.173 0.142 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0809 0.11 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 8.33e-01 0.0368 0.174 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 7.12e-02 -0.319 0.176 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 8.47e-02 -0.29 0.168 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 7.26e-01 0.0399 0.114 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 5.46e-01 0.0879 0.145 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 1.74e-01 0.184 0.135 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 6.91e-01 0.0404 0.102 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 6.39e-01 0.0704 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.04e-01 -0.248 0.152 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 1.43e-01 0.318 0.216 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.56e-01 0.213 0.23 0.07 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0975 0.194 0.07 PB L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 2.22e-01 -0.18 0.147 0.07 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 4.32e-01 -0.141 0.179 0.07 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 1.13e-01 0.333 0.209 0.07 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 9.33e-01 0.0181 0.215 0.07 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0363 0.175 0.078 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.21e-01 0.133 0.133 0.078 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0477 0.14 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 5.62e-01 -0.075 0.129 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 4.66e-03 -0.228 0.0798 0.078 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 3.33e-01 -0.157 0.162 0.078 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0165 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 3.12e-01 0.169 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 9.43e-01 0.0112 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 9.31e-01 0.00994 0.114 0.079 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 2.53e-01 0.205 0.179 0.079 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0933 0.0996 0.079 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0458 0.143 0.079 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.43e-01 -0.223 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 1.05e-01 0.28 0.171 0.073 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 3.43e-01 0.133 0.14 0.073 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0457 0.124 0.073 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0864 0.138 0.073 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 5.87e-01 0.0874 0.161 0.073 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 8.41e-02 0.319 0.184 0.073 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0749 0.177 0.073 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 3.21e-01 -0.179 0.18 0.073 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 4.52e-02 -0.258 0.128 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0456 0.0943 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 2.59e-01 -0.105 0.0927 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0883 0.101 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 8.61e-02 -0.267 0.155 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0159 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 8.59e-01 -0.029 0.163 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0419 0.108 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 6.42e-01 0.0681 0.146 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 7.82e-01 0.0297 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 3.45e-02 -0.211 0.0991 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 6.08e-01 0.049 0.0955 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 7.57e-01 0.0486 0.157 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 3.02e-01 0.153 0.148 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0921 0.172 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 3.83e-02 -0.283 0.136 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 5.34e-01 -0.124 0.199 0.085 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 5.59e-01 0.0934 0.16 0.085 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.00e-02 -0.356 0.188 0.085 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 5.19e-01 -0.114 0.177 0.085 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 8.70e-01 0.0161 0.0983 0.085 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 4.06e-01 -0.163 0.196 0.085 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.98e-01 -0.229 0.177 0.085 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 7.27e-01 -0.06 0.172 0.08 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0783 0.116 0.08 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 3.25e-01 -0.114 0.115 0.08 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00774 0.1 0.08 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 4.49e-01 -0.118 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 8.81e-02 -0.274 0.16 0.08 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 5.62e-01 0.101 0.174 0.08 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 2.63e-01 -0.167 0.149 0.08 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 7.54e-02 -0.284 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 4.04e-01 0.114 0.136 0.081 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.12e-01 0.0486 0.0955 0.081 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.13e-01 0.122 0.12 0.081 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 1.47e-01 -0.223 0.153 0.081 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 2.98e-01 0.121 0.116 0.081 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 5.70e-01 0.0972 0.171 0.081 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 8.36e-01 0.0314 0.151 0.081 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0945 0.184 0.082 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 6.57e-01 0.0695 0.156 0.082 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0963 0.145 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 1.30e-01 0.216 0.142 0.082 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0334 0.144 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 1.88e-01 0.189 0.142 0.082 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 4.50e-01 -0.111 0.147 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 5.09e-01 -0.104 0.157 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 1.75e-01 0.182 0.133 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0224 0.109 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 9.44e-02 0.239 0.142 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 9.81e-01 0.00225 0.0946 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0248 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 6.32e-03 0.433 0.157 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0198 0.157 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 7.95e-01 -0.038 0.146 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 4.96e-01 0.0739 0.108 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 4.01e-01 0.134 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 2.22e-01 -0.102 0.0835 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 3.60e-01 0.114 0.125 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0878 0.149 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 1.54e-01 -0.17 0.119 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0201 0.0949 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 2.23e-01 -0.108 0.0885 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0904 0.0875 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 2.73e-01 -0.171 0.156 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00619 0.129 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0439 0.168 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 1.94e-01 -0.137 0.105 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 2.28e-02 -0.355 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00622 0.11 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0352 0.0836 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 6.68e-01 0.0439 0.102 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -700330 sc-eQTL 1.49e-01 -0.214 0.148 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0253 0.0926 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -700307 sc-eQTL 8.34e-01 0.0345 0.164 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 9.71e-01 0.00493 0.137 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 sc-eQTL 1.17e-01 -0.248 0.158 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772792 sc-eQTL 7.89e-01 0.0297 0.111 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 sc-eQTL 8.70e-01 0.0226 0.138 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -115178 sc-eQTL 3.60e-01 0.106 0.116 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 125027 sc-eQTL 7.69e-01 0.0298 0.101 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996020 sc-eQTL 5.40e-01 0.081 0.132 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 124008 sc-eQTL 6.24e-02 -0.263 0.14 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 eQTL 0.00644 -0.0867 0.0317 0.0 0.0 0.0599
ENSG00000051620 HEBP2 -411290 eQTL 0.000144 -0.148 0.0388 0.0 0.0 0.0599

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A -781268 2.77e-07 1.36e-07 4.48e-08 2.27e-07 9.24e-08 8.45e-08 1.67e-07 5.43e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.73e-07 9e-08 1.69e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.53e-08 4.01e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.8e-08 1.22e-07 1.24e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.63e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.2e-07 1.07e-07 1.08e-07 3.93e-08 3.89e-08 8.7e-08 3.51e-08 3.65e-08 5.8e-08 8.37e-08 6.71e-08 3.67e-08 5.48e-08 1.46e-07 5.21e-08 2.03e-08 4.25e-08 1.8e-08 1.21e-07 1.96e-09 5.02e-08