logo

Genes within 1Mb (chr6:137991519:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.89e-01 0.0534 0.133 0.081 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 2.72e-01 0.143 0.13 0.081 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.45e-01 0.0332 0.102 0.081 B L1
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 1.25e-01 0.156 0.101 0.081 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 1.89e-01 -0.108 0.0816 0.081 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 6.70e-01 0.049 0.115 0.081 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 3.62e-01 -0.117 0.129 0.081 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.29e-01 -0.146 0.149 0.081 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 2.89e-01 0.0929 0.0873 0.081 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 9.10e-01 0.0114 0.1 0.081 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 5.94e-01 0.0505 0.0946 0.081 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0645 0.0886 0.081 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 3.27e-02 0.209 0.097 0.081 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0746 0.112 0.081 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 1.89e-01 -0.212 0.16 0.081 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 4.90e-01 0.0681 0.0984 0.081 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0157 0.105 0.081 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 9.58e-01 0.00572 0.107 0.081 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0334 0.0829 0.081 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 6.80e-01 0.0447 0.108 0.081 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 3.53e-01 -0.113 0.121 0.081 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.53e-01 0.156 0.167 0.081 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 5.01e-02 0.243 0.123 0.081 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 3.24e-01 -0.116 0.118 0.081 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 1.27e-01 -0.203 0.132 0.081 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 3.73e-02 0.319 0.152 0.081 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0168 0.136 0.081 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 6.77e-01 0.0672 0.161 0.081 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 4.58e-01 -0.101 0.135 0.081 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.75e-02 -0.241 0.115 0.081 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 8.79e-01 0.0151 0.0993 0.081 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.02e-02 -0.145 0.0799 0.081 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0931 0.084 0.081 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 4.64e-02 -0.302 0.151 0.081 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 7.28e-01 0.031 0.0891 0.081 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 7.52e-01 0.05 0.158 0.081 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.11e-01 -0.166 0.104 0.081 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 1.03e-01 -0.246 0.15 0.082 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.16e-01 0.0123 0.116 0.082 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0158 0.133 0.082 NK L1
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 3.76e-01 0.1 0.113 0.082 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 7.58e-01 0.0298 0.0967 0.082 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 2.11e-01 0.155 0.124 0.082 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 2.16e-01 -0.169 0.137 0.082 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 8.91e-01 0.0239 0.174 0.081 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 5.37e-02 0.203 0.105 0.081 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0248 0.112 0.081 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0888 0.138 0.081 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 6.93e-01 -0.026 0.0658 0.081 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 6.00e-01 0.0709 0.135 0.081 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0957 0.13 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.74e-01 0.0837 0.199 0.084 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.46e-01 0.012 0.178 0.084 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 4.03e-01 0.146 0.174 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0912 0.0903 0.084 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 4.71e-01 -0.127 0.175 0.084 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 9.39e-01 0.0153 0.198 0.084 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 7.11e-01 -0.057 0.153 0.084 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.78e-01 -0.145 0.164 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0154 0.152 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0478 0.114 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 7.78e-01 0.041 0.145 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0065 0.114 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 4.77e-01 -0.109 0.154 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 6.80e-02 0.294 0.16 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.91e-01 0.0675 0.169 0.08 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 3.19e-01 0.167 0.167 0.08 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00366 0.127 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 1.00e-01 0.26 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0479 0.109 0.08 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 3.68e-01 -0.143 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 7.95e-01 0.0423 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0102 0.166 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0174 0.137 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.32e-01 0.0399 0.116 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 7.89e-01 0.0423 0.158 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 8.91e-02 -0.155 0.091 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0373 0.134 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0444 0.144 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 2.48e-01 0.185 0.16 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.38e-01 0.0128 0.165 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 8.47e-02 0.189 0.109 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 2.55e-01 0.15 0.131 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0146 0.132 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 2.89e-01 0.153 0.144 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 7.67e-02 -0.301 0.169 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.73e-02 0.352 0.168 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 4.00e-01 0.134 0.159 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 3.20e-01 -0.146 0.146 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 6.07e-01 -0.092 0.179 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 3.79e-01 0.0917 0.104 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 1.02e-01 0.271 0.165 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 4.29e-01 -0.128 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 7.60e-01 -0.048 0.157 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 3.89e-01 0.0715 0.0829 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 8.31e-01 -0.021 0.0979 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0666 0.129 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0616 0.0906 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 7.05e-02 0.195 0.107 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 9.74e-01 0.00379 0.118 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.15e-02 -0.281 0.15 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 1.14e-01 0.179 0.113 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.66e-01 0.0335 0.112 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 3.08e-01 0.144 0.14 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0469 0.0817 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 3.02e-01 0.118 0.114 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.33e-01 -0.172 0.114 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.39e-02 -0.321 0.172 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 2.07e-01 0.166 0.131 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0366 0.118 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 5.57e-01 0.0809 0.138 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 8.96e-01 0.0114 0.0874 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0218 0.147 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0746 0.14 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 4.09e-01 -0.145 0.175 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 7.74e-01 0.034 0.118 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 9.20e-01 0.0127 0.125 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 5.28e-01 0.0988 0.156 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 3.25e-01 0.0979 0.0993 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0454 0.137 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.02e-01 -0.228 0.139 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 4.39e-01 -0.13 0.167 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 2.88e-01 0.124 0.117 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0855 0.107 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 5.47e-01 0.0777 0.129 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0349 0.0915 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 7.46e-01 0.0421 0.13 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.33e-01 -0.203 0.135 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.52e-01 -0.175 0.187 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 3.38e-01 -0.149 0.155 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 8.95e-01 0.0174 0.132 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 2.20e-01 -0.213 0.174 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 8.97e-01 0.0109 0.084 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0355 0.143 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 8.31e-01 0.0328 0.154 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 4.91e-01 0.12 0.173 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 5.23e-01 0.0962 0.15 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 4.66e-01 -0.115 0.158 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 8.86e-02 0.306 0.179 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0837 0.111 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 8.12e-02 -0.294 0.168 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 8.08e-01 -0.04 0.165 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 2.90e-01 0.196 0.185 0.082 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 3.04e-01 0.124 0.12 0.082 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.84e-01 0.0353 0.129 0.082 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 6.26e-01 -0.083 0.17 0.082 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 5.96e-01 0.043 0.0809 0.082 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 4.86e-01 0.106 0.151 0.082 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0711 0.15 0.082 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.25e-01 0.172 0.174 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 2.91e-02 0.296 0.135 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 3.97e-01 -0.126 0.148 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 5.44e-01 0.0966 0.159 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 2.45e-01 -0.118 0.101 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 4.69e-01 0.107 0.147 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 7.52e-01 0.0511 0.162 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.47e-01 -0.153 0.163 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.42e-01 0.00774 0.107 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 6.06e-01 0.0747 0.145 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0207 0.13 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 8.65e-01 0.0171 0.101 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 5.59e-01 0.0776 0.133 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 4.26e-01 -0.12 0.151 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.03e-01 0.0978 0.188 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.15e-01 0.0147 0.138 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0643 0.16 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 2.11e-01 0.178 0.142 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0815 0.109 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 5.80e-01 0.0961 0.173 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 8.72e-02 -0.301 0.175 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 8.41e-02 -0.29 0.167 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 8.13e-01 0.0268 0.113 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 6.67e-01 0.0625 0.145 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 3.51e-01 0.126 0.135 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 3.27e-01 0.0993 0.101 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 5.76e-01 0.0836 0.149 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 2.34e-01 -0.181 0.152 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 2.92e-01 0.233 0.22 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 3.77e-01 0.206 0.233 0.07 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0576 0.196 0.07 PB L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 3.49e-01 -0.14 0.149 0.07 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0702 0.181 0.07 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 3.17e-01 0.214 0.213 0.07 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 6.02e-01 0.114 0.218 0.07 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00586 0.175 0.08 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 2.80e-01 0.144 0.133 0.08 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0179 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0588 0.129 0.08 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 1.53e-02 -0.196 0.08 0.08 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0599 0.162 0.08 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 7.74e-01 0.0452 0.157 0.08 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 5.71e-01 0.0942 0.166 0.081 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.48e-01 0.0103 0.156 0.081 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0102 0.113 0.081 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 2.50e-01 0.205 0.178 0.081 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 5.53e-01 -0.059 0.0993 0.081 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0566 0.143 0.081 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.26e-01 -0.231 0.151 0.081 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.17 0.076 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 7.28e-01 0.0485 0.139 0.076 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0601 0.122 0.076 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 3.02e-01 -0.142 0.137 0.076 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 5.25e-01 0.101 0.159 0.076 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 3.07e-01 0.187 0.183 0.076 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0788 0.175 0.076 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 4.09e-01 -0.148 0.178 0.076 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 3.81e-02 -0.265 0.127 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0327 0.0936 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 2.61e-01 -0.104 0.092 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0922 0.101 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 1.12e-01 -0.245 0.154 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0142 0.138 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0168 0.162 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 5.78e-01 -0.06 0.108 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 4.43e-01 0.112 0.146 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 7.25e-01 0.038 0.108 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 5.85e-02 -0.189 0.0995 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 5.99e-01 0.0503 0.0956 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 9.14e-01 0.0169 0.157 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 5.65e-01 0.0855 0.148 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0468 0.172 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.35e-02 -0.337 0.135 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 4.46e-01 -0.15 0.196 0.088 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 7.75e-01 0.045 0.157 0.088 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 6.22e-02 -0.347 0.185 0.088 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 3.22e-01 -0.172 0.173 0.088 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 9.21e-01 0.0096 0.0966 0.088 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 4.75e-01 -0.138 0.192 0.088 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 3.42e-01 -0.166 0.174 0.088 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 8.55e-01 -0.031 0.169 0.082 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0354 0.114 0.082 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 3.34e-01 -0.11 0.113 0.082 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0316 0.0983 0.082 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 1.50e-01 -0.22 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 5.95e-02 -0.297 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 3.32e-01 0.167 0.171 0.082 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 5.90e-01 -0.079 0.147 0.082 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 1.78e-01 -0.215 0.159 0.084 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 4.13e-01 0.111 0.135 0.084 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 4.44e-01 0.0728 0.0949 0.084 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 2.89e-01 0.127 0.12 0.084 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 2.19e-01 -0.188 0.152 0.084 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 3.35e-01 0.111 0.115 0.084 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 7.32e-01 0.0582 0.17 0.084 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 9.01e-01 0.0188 0.15 0.084 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0728 0.184 0.082 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 4.02e-01 0.131 0.156 0.082 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0916 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 3.30e-01 -0.141 0.145 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 1.34e-01 0.214 0.142 0.082 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 8.94e-01 0.0193 0.145 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 1.87e-01 0.189 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 8.12e-01 -0.035 0.147 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0604 0.156 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 2.57e-01 0.151 0.133 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0286 0.108 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 1.64e-01 0.198 0.142 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0232 0.094 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0971 0.144 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.78e-02 0.375 0.157 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 8.09e-01 0.0373 0.154 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000988 0.144 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 5.87e-01 0.0582 0.107 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 5.68e-01 0.0899 0.157 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 1.98e-01 -0.106 0.0823 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 6.52e-01 0.0556 0.123 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 3.25e-01 -0.145 0.147 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 1.94e-01 -0.154 0.118 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0151 0.0945 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 1.83e-01 -0.118 0.0881 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0892 0.0872 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 2.56e-01 -0.177 0.155 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0296 0.128 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0249 0.167 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 1.24e-01 -0.161 0.104 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 4.58e-02 -0.309 0.154 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 9.88e-01 0.00158 0.109 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00537 0.083 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 7.59e-01 0.0312 0.102 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -701052 sc-eQTL 7.62e-02 -0.261 0.146 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0327 0.0918 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -701029 sc-eQTL 5.70e-01 0.0926 0.163 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 9.27e-01 0.0125 0.136 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 sc-eQTL 1.29e-01 -0.239 0.157 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 772070 sc-eQTL 7.66e-01 0.0329 0.11 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 sc-eQTL 8.24e-01 0.0305 0.137 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -115900 sc-eQTL 6.07e-01 0.0594 0.115 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124305 sc-eQTL 6.18e-01 0.0503 0.1 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -996742 sc-eQTL 4.30e-01 0.104 0.131 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123286 sc-eQTL 2.66e-01 -0.156 0.14 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 eQTL 0.00755 -0.0852 0.0318 0.0 0.0 0.0599
ENSG00000051620 HEBP2 -412012 eQTL 0.000235 -0.144 0.0389 0.0 0.0 0.0599

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A -781990 2.74e-07 1.25e-07 3.88e-08 1.84e-07 9.01e-08 9.65e-08 1.49e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.74e-08 1.57e-07 8.59e-08 1.45e-07 6.38e-08 6.17e-08 7.53e-08 3.98e-08 1.26e-07 5.36e-08 4.45e-08 1.08e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.68e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.57e-08 1.08e-07 1.02e-07 9.92e-08 3.89e-08 3.35e-08 8.55e-08 8.74e-08 3.62e-08 5.02e-08 9.62e-08 6.56e-08 3.37e-08 3.92e-08 1.36e-07 4.14e-08 1.53e-08 5.19e-08 1.66e-08 1.24e-07 3.92e-09 4.9e-08