logo

Genes within 1Mb (chr6:137991238:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 7.20e-01 0.0474 0.132 0.083 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 3.27e-01 0.126 0.128 0.083 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.03e-01 0.0252 0.101 0.083 B L1
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 1.01e-01 0.165 0.1 0.083 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 1.65e-01 -0.113 0.0807 0.083 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 5.23e-01 0.0726 0.113 0.083 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 4.11e-01 -0.105 0.127 0.083 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 3.11e-01 -0.149 0.147 0.083 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 3.20e-01 0.0858 0.0861 0.083 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0245 0.0989 0.083 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 5.71e-01 0.0529 0.0932 0.083 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0925 0.0872 0.083 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 1.72e-02 0.229 0.0953 0.083 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0675 0.11 0.083 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 1.49e-01 -0.229 0.158 0.083 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.07e-01 0.0807 0.0971 0.083 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0408 0.104 0.083 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0133 0.106 0.083 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0698 0.0817 0.083 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.00e-01 0.0562 0.107 0.083 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 2.96e-01 -0.126 0.12 0.083 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 4.92e-01 0.114 0.166 0.083 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 3.22e-02 0.262 0.122 0.083 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 2.41e-01 -0.137 0.116 0.083 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 2.28e-01 -0.158 0.131 0.083 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 4.99e-02 0.297 0.15 0.083 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 9.55e-01 0.00767 0.134 0.083 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 7.78e-01 0.0448 0.159 0.083 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 4.53e-01 -0.101 0.134 0.083 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 1.93e-02 -0.268 0.114 0.083 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00293 0.0981 0.083 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 7.34e-02 -0.142 0.079 0.083 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0929 0.083 0.083 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 3.40e-02 -0.317 0.149 0.083 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 5.89e-01 0.0476 0.088 0.083 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 9.90e-01 0.00189 0.156 0.083 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 2.44e-01 -0.12 0.103 0.083 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 7.06e-02 -0.269 0.148 0.084 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.97e-01 0.000395 0.115 0.084 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 9.76e-01 0.00393 0.131 0.084 NK L1
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 3.34e-01 0.108 0.111 0.084 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 9.19e-01 0.00976 0.0955 0.084 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 1.62e-01 0.171 0.122 0.084 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.16e-01 -0.212 0.135 0.084 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0186 0.171 0.083 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.81e-02 0.205 0.103 0.083 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0354 0.11 0.083 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 4.33e-01 -0.107 0.136 0.083 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0491 0.0646 0.083 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.69e-01 0.0569 0.133 0.083 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.12e-01 -0.13 0.128 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 8.81e-01 0.0292 0.196 0.087 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.50e-01 0.011 0.175 0.087 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 4.25e-01 0.137 0.171 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0867 0.0889 0.087 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 4.61e-01 -0.127 0.173 0.087 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00511 0.195 0.087 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0879 0.151 0.087 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 3.67e-01 -0.146 0.162 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00799 0.15 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0337 0.112 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 5.63e-01 0.0828 0.143 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0042 0.112 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0653 0.152 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.34e-02 0.337 0.158 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 8.28e-01 0.0362 0.167 0.082 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 2.29e-01 0.198 0.164 0.082 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.23e-01 -0.028 0.125 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 7.28e-02 0.28 0.155 0.082 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0586 0.108 0.082 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 4.33e-01 -0.122 0.156 0.082 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 8.59e-01 0.0284 0.16 0.082 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0221 0.164 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0403 0.135 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 7.06e-01 0.0435 0.115 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 7.40e-01 0.0519 0.156 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 6.40e-02 -0.167 0.0899 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0226 0.132 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0562 0.142 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 2.67e-01 0.176 0.158 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0151 0.164 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 6.83e-02 0.197 0.108 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 3.20e-01 0.13 0.13 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0289 0.13 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 3.04e-01 0.147 0.142 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.21e-01 -0.261 0.168 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 7.89e-02 0.294 0.167 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.66e-01 0.115 0.157 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 3.40e-01 -0.139 0.145 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 4.31e-01 -0.139 0.176 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 6.90e-01 0.0411 0.103 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 9.09e-02 0.278 0.163 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0748 0.16 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0582 0.155 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.39e-01 0.0634 0.0818 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0544 0.0966 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 6.11e-01 -0.065 0.128 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0833 0.0894 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 4.02e-02 0.218 0.106 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 9.79e-01 0.00299 0.116 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 6.37e-02 -0.276 0.148 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 1.10e-01 0.179 0.112 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00222 0.111 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 3.37e-01 0.134 0.139 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0769 0.0807 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 1.85e-01 0.15 0.113 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.66e-01 -0.157 0.113 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 5.41e-02 -0.33 0.17 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 1.79e-01 0.175 0.13 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0885 0.117 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 7.34e-01 0.0462 0.136 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0264 0.0864 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0118 0.146 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0894 0.138 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 4.60e-01 -0.129 0.174 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 6.84e-01 0.0478 0.117 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0129 0.125 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 7.70e-01 0.0454 0.155 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 5.37e-01 0.061 0.0988 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0368 0.136 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 6.67e-02 -0.254 0.138 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 3.48e-01 -0.155 0.165 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 2.78e-01 0.125 0.115 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 3.19e-01 -0.105 0.106 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 3.74e-01 0.113 0.127 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0635 0.0901 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.04e-01 0.0664 0.128 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.35e-01 -0.199 0.133 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 2.99e-01 -0.193 0.185 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.08e-01 -0.127 0.153 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 9.69e-01 -0.005 0.13 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 1.68e-01 -0.237 0.171 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 5.71e-01 -0.047 0.083 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00912 0.141 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 7.09e-01 0.0568 0.152 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 6.22e-01 0.0844 0.171 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.68e-01 0.108 0.148 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0879 0.156 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 1.46e-01 0.258 0.177 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 1.87e-01 -0.144 0.109 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 1.52e-01 -0.239 0.166 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0431 0.162 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 3.66e-01 0.165 0.182 0.084 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 2.41e-01 0.139 0.118 0.084 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.11e-01 0.0304 0.127 0.084 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0791 0.168 0.084 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 8.77e-01 0.0123 0.0798 0.084 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 5.19e-01 0.0966 0.149 0.084 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0863 0.147 0.084 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 3.17e-01 0.172 0.171 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.08e-02 0.273 0.133 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0917 0.146 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 6.23e-01 0.0769 0.156 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 1.31e-01 -0.151 0.0992 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 7.79e-01 0.0409 0.145 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 9.07e-01 0.0186 0.159 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 2.41e-01 -0.189 0.161 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00839 0.106 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 4.81e-01 0.101 0.143 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0116 0.128 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00895 0.0998 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 4.21e-01 0.106 0.131 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.10e-01 -0.152 0.149 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 6.21e-01 0.0916 0.185 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.26e-01 0.0126 0.136 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0385 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 2.13e-01 0.174 0.14 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0957 0.108 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.74e-01 0.072 0.171 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 5.48e-02 -0.333 0.172 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 7.26e-02 -0.297 0.165 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 8.74e-01 0.0177 0.112 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 5.83e-01 0.0785 0.143 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 3.72e-01 0.119 0.133 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 5.27e-01 0.0632 0.0998 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 4.57e-01 0.11 0.147 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.13e-01 -0.238 0.15 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 2.34e-01 0.257 0.215 0.074 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 2.67e-01 0.253 0.227 0.074 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0472 0.192 0.074 PB L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 2.81e-01 -0.158 0.146 0.074 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.074 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 1.47e-01 0.302 0.207 0.074 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 8.00e-01 0.0541 0.213 0.074 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0444 0.171 0.083 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 2.59e-01 0.147 0.13 0.083 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0188 0.136 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0636 0.126 0.083 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 9.73e-03 -0.204 0.0783 0.083 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0995 0.159 0.083 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 8.71e-01 0.0251 0.154 0.083 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 4.56e-01 0.122 0.163 0.083 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 7.67e-01 0.0457 0.154 0.083 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0161 0.112 0.083 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 2.62e-01 0.197 0.175 0.083 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0891 0.0977 0.083 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0603 0.141 0.083 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.87e-01 -0.197 0.149 0.083 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 1.40e-01 0.249 0.168 0.078 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 5.41e-01 0.084 0.137 0.078 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0451 0.121 0.078 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 4.49e-01 -0.103 0.135 0.078 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 5.20e-01 0.101 0.157 0.078 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 1.82e-01 0.241 0.18 0.078 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 5.20e-01 -0.112 0.173 0.078 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.14e-01 -0.178 0.176 0.078 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 3.18e-02 -0.271 0.126 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 5.38e-01 -0.057 0.0925 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 1.90e-01 -0.119 0.0908 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0816 0.0995 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 7.36e-02 -0.273 0.152 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 9.59e-01 0.00709 0.136 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0644 0.16 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0177 0.106 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 5.84e-01 0.0791 0.144 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 8.90e-01 0.0147 0.106 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 3.86e-02 -0.203 0.0977 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 5.06e-01 0.0627 0.094 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0134 0.154 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 5.05e-01 0.0975 0.146 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0916 0.169 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.34e-02 -0.286 0.134 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 4.46e-01 -0.15 0.196 0.088 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 7.75e-01 0.045 0.157 0.088 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 6.22e-02 -0.347 0.185 0.088 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 3.22e-01 -0.172 0.173 0.088 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 9.21e-01 0.0096 0.0966 0.088 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 4.75e-01 -0.138 0.192 0.088 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.42e-01 -0.166 0.174 0.088 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0646 0.168 0.084 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0607 0.113 0.084 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 3.27e-01 -0.111 0.113 0.084 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00458 0.0978 0.084 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 4.31e-01 -0.12 0.152 0.084 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 7.91e-02 -0.275 0.156 0.084 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 4.60e-01 0.126 0.17 0.084 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.95e-01 -0.124 0.145 0.084 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 9.43e-02 -0.263 0.156 0.086 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.34e-01 0.105 0.134 0.086 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 4.68e-01 0.0681 0.0937 0.086 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 2.28e-01 0.143 0.118 0.086 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 2.05e-01 -0.191 0.15 0.086 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 3.89e-01 0.0982 0.114 0.086 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 9.52e-01 0.0101 0.168 0.086 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 7.21e-01 0.0529 0.148 0.086 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 4.89e-01 -0.126 0.181 0.085 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 4.41e-01 0.119 0.154 0.085 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 4.27e-01 -0.112 0.141 0.085 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0917 0.143 0.085 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 1.66e-01 0.194 0.14 0.085 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 7.91e-01 0.0377 0.142 0.085 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 2.43e-01 0.165 0.141 0.085 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0272 0.145 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 5.86e-01 -0.084 0.154 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 2.10e-01 0.165 0.131 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0435 0.107 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 8.42e-02 0.242 0.14 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0212 0.0928 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0627 0.142 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.28e-02 0.388 0.155 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 8.54e-01 0.0281 0.153 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0308 0.143 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 6.13e-01 0.0538 0.106 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 5.38e-01 0.0959 0.156 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 1.63e-01 -0.114 0.0815 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 5.70e-01 0.0693 0.122 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 3.64e-01 -0.132 0.146 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 1.42e-01 -0.172 0.117 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0392 0.0932 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 1.58e-01 -0.123 0.0869 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0801 0.0861 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 1.73e-01 -0.209 0.153 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00604 0.126 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0806 0.165 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 2.65e-01 -0.115 0.103 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 1.82e-02 -0.361 0.152 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0111 0.108 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0213 0.0821 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 5.78e-01 0.0559 0.1 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -701333 sc-eQTL 1.83e-01 -0.194 0.145 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0361 0.0908 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -701310 sc-eQTL 9.30e-01 0.0143 0.161 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 8.23e-01 0.0302 0.135 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 sc-eQTL 8.47e-02 -0.268 0.155 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 771789 sc-eQTL 8.34e-01 0.0229 0.109 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 sc-eQTL 7.13e-01 0.0497 0.135 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -116181 sc-eQTL 5.41e-01 0.0699 0.114 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 124024 sc-eQTL 7.84e-01 0.0272 0.0993 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -997023 sc-eQTL 3.04e-01 0.134 0.13 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 123005 sc-eQTL 1.55e-01 -0.197 0.138 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 eQTL 0.00755 -0.0852 0.0318 0.0 0.0 0.0599
ENSG00000051620 HEBP2 -412293 eQTL 0.000235 -0.144 0.0389 0.0 0.0 0.0599

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A -782271 2.8e-07 1.34e-07 5.03e-08 1.9e-07 1.01e-07 9.05e-08 1.67e-07 5.43e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.05e-07 1.69e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.23e-08 4.12e-08 1.44e-07 6.32e-08 4.78e-08 1.26e-07 1.25e-07 1.44e-07 2.87e-08 1.65e-07 1.22e-07 1.13e-07 9.92e-08 1.22e-07 9.49e-08 1.06e-07 2.93e-08 3.73e-08 8.72e-08 4.92e-08 3.14e-08 5.45e-08 8.72e-08 6.57e-08 4.47e-08 5.24e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.24e-08 3.83e-08 1.89e-08 1.21e-07 1.88e-09 5e-08