logo

Genes within 1Mb (chr6:137978089:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 5.81e-02 -0.201 0.105 0.15 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 4.16e-02 -0.21 0.102 0.15 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0416 0.0809 0.15 B L1
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00118 0.0809 0.15 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 6.65e-02 0.119 0.0646 0.15 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0512 0.102 0.15 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 7.49e-01 0.0374 0.117 0.15 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 7.14e-02 -0.123 0.0678 0.15 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 9.21e-01 0.00782 0.0784 0.15 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0671 0.0738 0.15 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 6.04e-02 0.13 0.0687 0.15 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0368 0.0872 0.15 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0549 0.13 0.15 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0486 0.0795 0.15 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 8.19e-01 0.0195 0.0851 0.15 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 1.98e-01 -0.111 0.0864 0.15 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 1.84e-01 0.0889 0.0667 0.15 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0582 0.0983 0.15 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 9.05e-01 0.0158 0.132 0.151 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 4.30e-03 0.276 0.0957 0.151 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0918 0.0923 0.151 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 2.83e-02 0.228 0.103 0.151 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 8.55e-01 0.022 0.121 0.151 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 2.69e-01 0.139 0.126 0.151 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 9.08e-01 0.0123 0.106 0.151 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 3.23e-01 0.0929 0.0938 0.15 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 6.53e-01 0.0361 0.0801 0.15 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 7.28e-01 0.0227 0.065 0.15 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 8.04e-02 0.119 0.0675 0.15 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 3.54e-01 0.114 0.123 0.15 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0899 0.128 0.15 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 2.21e-01 0.103 0.084 0.15 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 3.09e-02 -0.246 0.113 0.148 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 7.13e-01 0.0324 0.0879 0.148 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0319 0.101 0.148 NK L1
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 8.06e-02 -0.149 0.0849 0.148 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 4.98e-02 0.143 0.0725 0.148 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 9.25e-01 0.00979 0.104 0.148 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 8.44e-03 -0.353 0.133 0.15 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0536 0.0822 0.15 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00623 0.0872 0.15 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 5.30e-01 0.0677 0.108 0.15 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 7.29e-02 0.0916 0.0508 0.15 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00475 0.102 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 4.27e-01 -0.12 0.151 0.153 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 4.56e-01 -0.101 0.135 0.153 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 8.67e-02 0.226 0.131 0.153 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 8.44e-01 0.0136 0.0687 0.153 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 7.23e-01 0.0474 0.133 0.153 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 8.85e-01 0.0169 0.116 0.153 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 9.07e-01 0.0154 0.131 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0276 0.121 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00464 0.0909 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 4.13e-01 0.0947 0.115 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 5.71e-01 0.0515 0.0907 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0906 0.129 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 7.53e-02 -0.238 0.133 0.151 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.57e-01 -0.187 0.132 0.151 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0878 0.101 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 4.48e-01 0.0956 0.126 0.151 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 2.57e-01 0.0982 0.0864 0.151 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 3.84e-01 0.112 0.129 0.151 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 1.95e-01 -0.162 0.125 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 8.26e-02 -0.179 0.103 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0845 0.088 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 5.58e-01 0.0701 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 1.73e-03 0.215 0.0677 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 6.43e-01 0.0504 0.109 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0872 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 2.50e-01 -0.146 0.126 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 5.51e-01 -0.05 0.0839 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 7.99e-01 0.0257 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 7.53e-03 0.267 0.0991 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 3.35e-01 -0.126 0.13 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 8.67e-01 0.0213 0.127 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.45e-01 -0.174 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 7.03e-01 0.0419 0.11 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 1.24e-01 -0.206 0.133 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 7.40e-02 0.139 0.0776 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 7.62e-01 0.0374 0.123 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0221 0.0651 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 9.06e-01 0.00906 0.0768 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 2.46e-01 -0.118 0.101 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 5.26e-02 0.137 0.0705 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0242 0.0922 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 6.97e-01 -0.047 0.12 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.03e-01 -0.148 0.0901 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 8.37e-01 0.0184 0.0897 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 6.62e-01 0.0492 0.112 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 3.88e-03 0.187 0.064 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 2.32e-01 -0.109 0.0912 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 3.28e-01 0.133 0.136 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.48e-01 -0.149 0.102 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 7.36e-02 -0.165 0.0918 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0284 0.108 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 3.24e-02 0.146 0.0676 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 3.03e-02 -0.236 0.108 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 3.41e-01 -0.135 0.141 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 8.59e-01 0.017 0.0953 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 6.39e-01 0.0475 0.101 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0677 0.126 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 3.09e-02 0.172 0.0793 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 2.03e-01 0.143 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0312 0.132 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0774 0.0921 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 9.55e-01 0.00478 0.0846 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0783 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 2.22e-01 0.088 0.0719 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0575 0.107 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 1.94e-01 -0.19 0.146 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0527 0.121 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 1.79e-01 0.138 0.103 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 5.29e-01 0.0858 0.136 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 9.20e-03 0.169 0.0644 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0587 0.12 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0585 0.14 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 9.15e-03 -0.313 0.119 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 2.94e-01 -0.133 0.127 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 6.94e-02 -0.262 0.144 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 1.23e-01 0.137 0.0887 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00636 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 9.01e-02 -0.246 0.144 0.147 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 7.46e-02 -0.168 0.0937 0.147 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0349 0.101 0.147 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 9.61e-01 0.00661 0.134 0.147 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 3.44e-01 0.0601 0.0634 0.147 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 4.28e-01 0.0932 0.117 0.147 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0551 0.132 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 9.76e-01 0.00307 0.103 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0647 0.113 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0485 0.12 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 4.90e-01 0.0531 0.0767 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 8.19e-01 0.028 0.122 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 7.70e-02 -0.217 0.122 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 4.97e-01 0.055 0.0808 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0224 0.109 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 6.17e-01 0.049 0.0979 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 7.81e-02 0.134 0.0756 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 9.68e-01 0.00463 0.114 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 2.54e-02 -0.314 0.139 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0828 0.104 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 5.96e-01 0.0637 0.12 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 6.84e-03 -0.287 0.105 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 5.44e-02 0.158 0.0814 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0814 0.132 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 1.74e-01 -0.172 0.126 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 6.54e-01 0.0383 0.0853 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0093 0.109 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 1.56e-01 -0.144 0.101 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 9.89e-02 0.125 0.0757 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 8.90e-01 0.016 0.115 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0591 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0863 0.158 0.156 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 4.43e-01 -0.103 0.133 0.156 PB L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00509 0.102 0.156 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 3.88e-01 -0.107 0.123 0.156 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 4.80e-01 0.105 0.148 0.156 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 1.98e-01 -0.179 0.138 0.152 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 5.97e-01 -0.056 0.106 0.152 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0557 0.11 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 8.88e-01 0.0143 0.102 0.152 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 2.43e-02 0.144 0.0636 0.152 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0794 0.125 0.152 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 9.34e-01 0.0108 0.13 0.15 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.41e-01 -0.18 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0414 0.0891 0.15 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 1.31e-01 -0.211 0.14 0.15 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 3.32e-03 0.227 0.0765 0.15 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 2.43e-01 0.139 0.119 0.15 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 4.38e-01 0.107 0.138 0.146 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.68e-01 0.155 0.112 0.146 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 2.96e-01 0.103 0.0985 0.146 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 3.36e-02 0.234 0.109 0.146 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 3.56e-01 0.118 0.128 0.146 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 1.81e-01 0.189 0.141 0.146 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0828 0.144 0.146 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 4.22e-01 0.0817 0.102 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0278 0.0741 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0466 0.073 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 1.19e-02 0.199 0.0786 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 2.60e-01 0.138 0.122 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 9.31e-01 0.0111 0.128 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 6.59e-02 0.156 0.0845 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 8.86e-01 0.0171 0.119 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.16e-01 0.137 0.0867 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 7.69e-01 0.0239 0.0812 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 8.50e-02 0.133 0.077 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 3.53e-01 -0.118 0.127 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0435 0.139 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000155 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 1.45e-01 -0.221 0.151 0.161 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 1.48e-01 0.176 0.121 0.161 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0747 0.145 0.161 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0509 0.135 0.161 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 8.59e-04 0.245 0.0721 0.161 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 5.41e-01 -0.083 0.136 0.161 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 1.99e-02 -0.323 0.138 0.151 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0552 0.0939 0.151 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 6.37e-01 0.0442 0.0936 0.151 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 2.28e-04 0.294 0.0784 0.151 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 3.41e-01 0.12 0.126 0.151 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 2.31e-01 -0.169 0.141 0.151 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 6.70e-02 0.221 0.12 0.151 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 4.31e-01 0.098 0.124 0.152 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 9.89e-02 0.175 0.105 0.152 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0595 0.0742 0.152 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 4.57e-01 0.0699 0.0937 0.152 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 6.21e-01 0.0592 0.12 0.152 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 8.88e-01 0.0188 0.133 0.152 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 1.91e-01 -0.153 0.117 0.152 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 5.99e-01 0.0793 0.151 0.155 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 3.96e-02 0.262 0.126 0.155 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 1.81e-01 -0.157 0.116 0.155 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 8.07e-03 0.311 0.116 0.155 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 7.35e-02 -0.208 0.115 0.155 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0838 0.117 0.155 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 6.35e-01 0.0571 0.12 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 1.96e-01 -0.163 0.126 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 3.28e-01 -0.106 0.108 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0902 0.0874 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 3.70e-01 0.103 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 9.41e-01 0.00561 0.0762 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0211 0.129 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 3.32e-02 -0.25 0.116 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 8.58e-03 -0.287 0.108 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0476 0.0816 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 4.73e-01 0.0861 0.12 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 2.55e-02 0.14 0.0623 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 8.94e-01 -0.015 0.112 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 2.11e-01 0.118 0.0942 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 8.16e-01 0.0175 0.0753 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00576 0.0705 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 6.05e-02 0.13 0.0691 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 5.38e-01 0.0764 0.124 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0534 0.133 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 1.35e-01 0.125 0.083 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0276 0.127 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 3.75e-01 0.0789 0.0888 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0156 0.0679 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 4.62e-02 0.165 0.0823 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -714482 sc-eQTL 2.55e-01 0.137 0.12 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -714459 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0866 0.133 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 7.22e-01 0.0397 0.111 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 sc-eQTL 2.60e-02 -0.263 0.117 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 758640 sc-eQTL 6.85e-01 0.0336 0.0828 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -425442 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0204 0.103 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -129330 sc-eQTL 3.28e-02 -0.184 0.0858 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 110875 sc-eQTL 4.81e-02 0.149 0.0748 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 109856 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00233 0.106 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -795420 pQTL 0.014 0.106 0.043 0.0 0.0 0.159
ENSG00000237499 AL357060.1 109856 eQTL 0.0275 0.0366 0.0166 0.0 0.0 0.153

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina