Genes within 1Mb (chr6:137977165:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 5.48e-01 0.0558 0.0927 0.171 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 2.84e-01 0.0968 0.0901 0.171 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.46e-02 0.172 0.0698 0.171 B L1
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0786 0.0705 0.171 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0269 0.057 0.171 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 8.93e-01 0.0121 0.0896 0.171 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0321 0.104 0.171 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 6.37e-01 0.0286 0.0606 0.171 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 3.56e-03 0.201 0.0681 0.171 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 8.07e-01 0.016 0.0655 0.171 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0472 0.0613 0.171 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 1.14e-01 0.122 0.0769 0.171 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 1.08e-01 -0.18 0.111 0.171 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 2.88e-01 0.0728 0.0684 0.171 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.28e-03 0.234 0.0716 0.171 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 6.51e-01 0.0338 0.0747 0.171 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0147 0.0577 0.171 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 3.23e-01 0.0838 0.0845 0.171 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.162 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 7.73e-01 0.024 0.0832 0.162 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 6.29e-02 0.146 0.0782 0.162 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 2.34e-01 -0.106 0.0886 0.162 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 7.98e-01 0.0264 0.103 0.162 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0883 0.107 0.162 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0872 0.0905 0.162 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.13e-01 -0.103 0.0826 0.171 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 9.88e-01 0.00102 0.0707 0.171 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.63e-01 0.0799 0.0571 0.171 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0653 0.0598 0.171 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 3.64e-01 0.0983 0.108 0.171 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 7.65e-01 0.0337 0.113 0.171 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 4.03e-02 -0.152 0.0735 0.171 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 4.50e-01 0.0763 0.101 0.17 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 1.20e-01 -0.12 0.0771 0.17 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 2.12e-02 0.204 0.0878 0.17 NK L1
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 6.09e-01 0.0386 0.0754 0.17 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 8.28e-01 0.014 0.0646 0.17 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 9.07e-01 0.0107 0.0915 0.17 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 5.50e-02 0.223 0.116 0.171 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0346 0.0709 0.171 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 4.35e-02 0.151 0.0745 0.171 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 4.54e-02 -0.185 0.092 0.171 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0576 0.044 0.171 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0494 0.0876 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 5.08e-01 0.0903 0.136 0.168 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 3.53e-01 0.113 0.122 0.168 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 5.34e-01 0.0744 0.119 0.168 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0768 0.0618 0.168 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00607 0.12 0.168 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0647 0.105 0.168 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.68e-01 0.127 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 8.88e-01 -0.015 0.106 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.75e-01 0.108 0.0793 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 1.19e-01 0.158 0.101 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0662 0.0794 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0236 0.113 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 3.78e-03 0.337 0.115 0.17 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0353 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 6.48e-04 0.297 0.0858 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0903 0.11 0.17 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 1.98e-02 -0.175 0.0747 0.17 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 2.72e-01 0.124 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 9.35e-01 0.00901 0.11 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 7.98e-01 0.0233 0.0911 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.43e-02 0.189 0.0764 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00134 0.105 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0496 0.0609 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 9.46e-01 0.00648 0.0955 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0575 0.107 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 1.20e-01 0.17 0.109 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 3.14e-01 0.0734 0.0728 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00531 0.0877 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 8.96e-01 0.0114 0.0876 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 5.68e-01 0.0647 0.113 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 1.89e-01 0.148 0.112 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 1.74e-01 0.144 0.105 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 5.01e-02 0.19 0.0966 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 2.00e-02 -0.275 0.117 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 3.94e-02 -0.142 0.0686 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 8.96e-01 0.0141 0.108 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0428 0.109 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 6.81e-01 0.0238 0.0578 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 6.21e-03 0.185 0.067 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 3.56e-01 0.083 0.0898 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0573 0.063 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 9.04e-02 0.138 0.0813 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.98e-01 -0.111 0.106 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 7.57e-01 0.0249 0.0803 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 8.12e-03 0.209 0.0781 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0328 0.0996 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0413 0.0578 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 2.74e-01 0.0886 0.0808 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 7.21e-01 0.0426 0.119 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 4.71e-01 0.0652 0.0903 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.03e-02 0.207 0.0801 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 4.72e-01 0.0682 0.0945 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0334 0.06 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 2.82e-01 0.104 0.0961 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 8.30e-01 0.026 0.12 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0502 0.0811 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.45e-02 0.209 0.0849 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.107 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00367 0.0683 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0337 0.096 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 9.57e-02 -0.194 0.116 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 9.20e-01 0.00824 0.0816 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.06e-01 0.12 0.0743 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00515 0.0899 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000466 0.0638 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 2.37e-01 0.111 0.094 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0344 0.13 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0156 0.107 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.06e-01 0.147 0.0907 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 5.38e-01 0.0744 0.12 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 2.28e-01 -0.07 0.0579 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 5.31e-01 0.0666 0.106 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.05e-01 0.149 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 8.77e-03 0.265 0.1 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.84e-03 0.33 0.104 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0649 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0411 0.0752 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 8.04e-01 0.0277 0.112 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 1.74e-01 0.172 0.127 0.171 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 4.93e-01 0.0566 0.0824 0.171 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 6.99e-02 0.159 0.0875 0.171 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 1.89e-01 -0.153 0.116 0.171 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0185 0.0555 0.171 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0732 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 9.32e-02 0.194 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 7.01e-01 0.0348 0.0905 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0153 0.0988 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0737 0.106 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000818 0.0674 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 6.88e-01 0.0431 0.107 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00945 0.109 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 1.63e-01 -0.1 0.0715 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 9.42e-03 0.25 0.0955 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 6.53e-01 0.0392 0.087 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0222 0.0677 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00433 0.101 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 3.04e-01 0.13 0.126 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0925 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 7.35e-01 0.0365 0.107 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0244 0.0956 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0813 0.0733 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00635 0.118 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.70e-01 0.123 0.111 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 1.44e-01 -0.109 0.0745 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 6.38e-02 0.177 0.095 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 5.60e-01 -0.052 0.0891 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 8.50e-01 0.0127 0.0669 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 8.06e-01 0.0248 0.101 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0139 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 6.30e-01 -0.073 0.151 0.152 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.86e-01 0.168 0.126 0.152 PB L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0316 0.0969 0.152 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0474 0.117 0.152 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 6.34e-01 0.0673 0.141 0.152 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0187 0.121 0.172 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 8.04e-01 0.0229 0.0921 0.172 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 2.74e-01 0.105 0.096 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 1.64e-01 -0.124 0.0886 0.172 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0494 0.056 0.172 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0344 0.109 0.172 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0639 0.114 0.171 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00551 0.108 0.171 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.70e-02 0.185 0.077 0.171 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 7.10e-01 0.0458 0.123 0.171 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 8.69e-02 -0.117 0.0679 0.171 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 2.79e-01 -0.113 0.104 0.171 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.28e-01 0.135 0.112 0.168 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0101 0.0913 0.168 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.24e-01 0.123 0.0799 0.168 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0874 0.0898 0.168 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 6.80e-01 0.043 0.104 0.168 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 3.11e-01 -0.117 0.115 0.168 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 9.84e-02 -0.193 0.116 0.168 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 1.92e-01 -0.117 0.0896 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 8.70e-01 0.0108 0.0656 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 3.73e-01 0.0576 0.0645 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 7.42e-02 -0.126 0.0701 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0191 0.108 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 8.92e-01 0.0153 0.113 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 2.30e-02 -0.171 0.0745 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0217 0.104 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0327 0.0765 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.62e-01 0.0996 0.0709 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0614 0.0678 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 1.36e-01 0.166 0.111 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 1.65e-01 -0.17 0.122 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0688 0.0975 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.21e-01 0.164 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 1.61e-01 -0.15 0.106 0.176 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 2.58e-01 0.144 0.127 0.176 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 8.28e-02 0.205 0.117 0.176 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 4.23e-02 -0.133 0.065 0.176 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 6.58e-02 0.219 0.118 0.176 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 6.73e-01 0.0499 0.118 0.162 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 2.29e-01 0.0957 0.0793 0.162 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 3.20e-01 0.079 0.0792 0.162 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0713 0.0686 0.162 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 2.83e-01 -0.115 0.107 0.162 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 3.04e-01 0.123 0.12 0.162 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 6.33e-01 -0.049 0.102 0.162 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 8.75e-02 0.192 0.112 0.17 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 2.81e-01 -0.103 0.0956 0.17 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 1.27e-03 0.214 0.0654 0.17 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 2.39e-01 0.0998 0.0846 0.17 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 8.46e-01 0.0211 0.108 0.17 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 1.08e-01 0.193 0.119 0.17 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0313 0.106 0.17 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 6.94e-01 0.0508 0.129 0.169 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0843 0.109 0.169 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 5.97e-01 0.053 0.1 0.169 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 6.30e-02 -0.188 0.1 0.169 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0603 0.0996 0.169 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 6.00e-01 0.0525 0.1 0.169 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0555 0.103 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 7.19e-03 0.296 0.109 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 8.19e-01 0.0217 0.0948 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 6.18e-03 0.209 0.0755 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 8.93e-01 0.0137 0.101 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0503 0.0668 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 3.69e-01 0.102 0.113 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00466 0.103 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 4.99e-01 0.0651 0.0961 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 4.69e-02 0.141 0.0707 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0218 0.105 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 9.95e-01 0.000347 0.0551 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 6.28e-01 0.0476 0.0981 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0993 0.0833 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00401 0.0665 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 2.69e-01 0.0688 0.0621 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0654 0.0614 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 3.38e-01 0.105 0.109 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0909 0.117 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 4.75e-02 -0.146 0.0731 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 8.32e-01 0.0232 0.109 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0121 0.0764 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 7.87e-03 0.154 0.0573 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0509 0.0713 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -715406 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0223 0.104 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -715383 sc-eQTL 9.70e-02 0.19 0.114 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0221 0.0957 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -796344 sc-eQTL 8.07e-01 0.0258 0.105 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 757716 sc-eQTL 1.36e-01 -0.11 0.0733 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -426366 sc-eQTL 5.67e-03 0.251 0.0897 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -130254 sc-eQTL 3.15e-01 0.0775 0.0769 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 109951 sc-eQTL 7.97e-01 0.0173 0.0671 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 108932 sc-eQTL 8.84e-01 0.0137 0.0939 0.168 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 \N 31363 1.92e-05 1.96e-05 2.98e-06 9.42e-06 2.45e-06 7.76e-06 2.17e-05 2.14e-06 1.66e-05 7.64e-06 2.06e-05 7.98e-06 2.89e-05 6.61e-06 4.78e-06 9.24e-06 8.09e-06 1.35e-05 4.19e-06 3.86e-06 7.68e-06 1.55e-05 1.63e-05 4.48e-06 2.59e-05 5.29e-06 7.96e-06 6.29e-06 1.66e-05 1.54e-05 1.16e-05 1e-06 1.47e-06 3.69e-06 6.37e-06 3.37e-06 1.71e-06 2.43e-06 2.49e-06 1.5e-06 9.79e-07 2.02e-05 2.6e-06 2.07e-07 1.29e-06 1.95e-06 2.33e-06 7.33e-07 6.24e-07
ENSG00000237499 \N 108932 5.49e-06 5.49e-06 6.27e-07 3.15e-06 1.51e-06 1.56e-06 6.72e-06 9.54e-07 4.91e-06 2.44e-06 6.53e-06 3.37e-06 8.85e-06 1.95e-06 1.27e-06 3.71e-06 1.92e-06 3.81e-06 1.49e-06 1.14e-06 2.96e-06 4.75e-06 4.52e-06 1.36e-06 8.07e-06 1.96e-06 2.35e-06 1.69e-06 4.47e-06 5.36e-06 2.64e-06 6.26e-07 5.29e-07 1.9e-06 2.03e-06 9.21e-07 9.56e-07 4.21e-07 1.08e-06 3.98e-07 3.2e-07 6.65e-06 6.59e-07 1.82e-07 4.54e-07 3.58e-07 1.02e-06 3.18e-07 3.24e-07