logo

Genes within 1Mb (chr6:137974711:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 6.73e-01 0.0404 0.0955 0.162 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 3.77e-01 0.0822 0.0928 0.162 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 2.57e-02 0.162 0.0721 0.162 B L1
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0891 0.0726 0.162 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0337 0.0586 0.162 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0168 0.0923 0.162 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0325 0.107 0.162 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 7.27e-01 0.0218 0.0625 0.162 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 5.53e-03 0.197 0.0704 0.162 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0105 0.0676 0.162 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0457 0.0632 0.162 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 2.18e-01 0.098 0.0794 0.162 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.17e-01 -0.181 0.115 0.162 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 2.81e-01 0.0763 0.0706 0.162 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.59e-03 0.237 0.074 0.162 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 5.53e-01 0.0458 0.0771 0.162 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0238 0.0595 0.162 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.39e-01 0.0291 0.0874 0.162 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 4.23e-01 0.0926 0.115 0.153 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 4.95e-01 0.0586 0.0857 0.153 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.81e-01 0.109 0.0809 0.153 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 2.39e-01 -0.108 0.0914 0.153 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 9.41e-01 0.00784 0.106 0.153 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 3.64e-01 -0.101 0.111 0.153 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0976 0.0932 0.153 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0931 0.0854 0.162 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0258 0.073 0.162 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 2.45e-01 0.0688 0.059 0.162 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0968 0.0616 0.162 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 2.96e-01 0.117 0.112 0.162 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 8.25e-01 0.0258 0.116 0.162 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 2.70e-02 -0.169 0.0758 0.162 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 5.10e-01 0.0684 0.104 0.161 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 1.13e-01 -0.126 0.0793 0.161 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 6.56e-02 0.168 0.0907 0.161 NK L1
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 6.39e-01 0.0364 0.0775 0.161 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 8.84e-01 0.00968 0.0664 0.161 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0311 0.0941 0.161 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.72e-01 0.163 0.119 0.162 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0273 0.073 0.162 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 9.16e-02 0.13 0.0769 0.162 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 6.00e-02 -0.179 0.0947 0.162 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0584 0.0453 0.162 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 5.13e-01 -0.059 0.0901 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 9.41e-01 0.0105 0.142 0.158 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 5.40e-01 0.0779 0.127 0.158 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 9.33e-01 0.0104 0.125 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0817 0.0644 0.158 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 9.16e-01 0.0132 0.125 0.158 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0323 0.11 0.158 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.74e-01 0.16 0.117 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0421 0.109 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.48e-01 0.118 0.0812 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 9.26e-02 0.174 0.103 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.72e-01 -0.111 0.0812 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0453 0.116 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.21e-02 0.302 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0327 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 7.54e-04 0.303 0.0885 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 1.90e-01 -0.149 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.05e-02 -0.199 0.0768 0.162 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 4.87e-01 0.0808 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 9.67e-01 0.0047 0.113 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 9.69e-01 0.00363 0.0935 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.43e-02 0.194 0.0785 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0125 0.108 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0467 0.0625 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00473 0.0981 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0957 0.11 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 2.00e-01 0.145 0.113 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 4.88e-01 0.0521 0.075 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 9.62e-01 0.00435 0.0903 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 7.01e-01 0.0347 0.0902 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 5.71e-01 0.0662 0.117 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 6.73e-02 0.212 0.115 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 1.78e-01 0.146 0.108 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 3.46e-02 0.211 0.0993 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 8.88e-03 -0.318 0.12 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.76e-02 -0.168 0.0704 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0227 0.111 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0558 0.113 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 4.71e-01 0.043 0.0595 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 7.43e-03 0.187 0.0692 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 4.82e-01 0.0654 0.0928 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 4.52e-01 -0.049 0.0651 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 1.54e-01 0.12 0.084 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 3.30e-01 -0.108 0.111 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 8.60e-01 0.0147 0.0834 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 9.63e-03 0.212 0.0812 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0414 0.103 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0355 0.0601 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 5.86e-01 0.0459 0.0842 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 8.02e-01 0.0308 0.123 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 8.19e-01 0.0213 0.0929 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.74e-02 0.198 0.0825 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 4.19e-01 0.0786 0.097 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0287 0.0617 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 2.98e-01 0.103 0.0987 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 8.80e-01 0.0187 0.124 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0478 0.0834 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.96e-02 0.205 0.0873 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 7.78e-01 0.0312 0.11 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0118 0.0702 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0962 0.0985 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 6.65e-02 -0.221 0.12 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 7.25e-01 0.0296 0.0841 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.65e-01 0.107 0.0767 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0097 0.0926 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0181 0.0657 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 3.19e-01 0.0969 0.097 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0722 0.133 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0197 0.11 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.13e-01 0.148 0.093 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 5.49e-01 0.0742 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0933 0.0592 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00847 0.109 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 7.77e-02 0.213 0.12 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 5.27e-03 0.29 0.103 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 9.85e-04 0.359 0.107 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0694 0.126 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0572 0.0773 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 8.99e-01 0.0147 0.115 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 4.32e-01 0.103 0.131 0.162 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 4.72e-01 0.0611 0.0848 0.162 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 9.90e-02 0.149 0.0902 0.162 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 3.73e-01 -0.107 0.12 0.162 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0149 0.0571 0.162 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0742 0.106 0.162 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.55e-01 0.169 0.118 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 8.46e-01 0.0181 0.0928 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0012 0.101 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00848 0.108 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000577 0.0691 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 5.44e-01 0.067 0.11 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0372 0.113 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 1.67e-01 -0.102 0.0736 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 5.58e-02 0.191 0.0991 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 6.72e-01 0.038 0.0895 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0302 0.0696 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0235 0.104 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.30e-01 0.196 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 2.44e-01 -0.111 0.0953 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 8.87e-01 0.0158 0.111 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0677 0.0984 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0592 0.0756 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0151 0.122 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 4.24e-01 0.0911 0.114 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 1.12e-01 -0.122 0.0763 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 9.84e-02 0.162 0.0975 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0353 0.0914 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000514 0.0686 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0312 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 7.63e-01 0.0437 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0778 0.153 0.152 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.72e-01 0.176 0.128 0.152 PB L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 9.03e-01 -0.012 0.0981 0.152 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0345 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 5.16e-01 0.093 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0359 0.124 0.163 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 8.19e-01 0.0218 0.0949 0.163 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 3.11e-01 0.101 0.099 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 2.02e-01 -0.117 0.0914 0.163 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0483 0.0578 0.163 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0461 0.112 0.163 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0822 0.118 0.162 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0454 0.111 0.162 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.45e-02 0.196 0.0794 0.162 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 8.01e-01 0.032 0.127 0.162 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 8.54e-02 -0.121 0.07 0.162 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 2.34e-01 -0.128 0.107 0.162 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 3.93e-01 0.0982 0.115 0.159 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 8.27e-01 0.0205 0.0937 0.159 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 2.08e-01 0.104 0.0821 0.159 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0881 0.0921 0.159 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 8.73e-01 0.0171 0.107 0.159 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0897 0.118 0.159 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 6.57e-02 -0.221 0.119 0.159 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 2.53e-01 -0.106 0.0924 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0235 0.0676 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 4.73e-01 0.0479 0.0665 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 3.39e-02 -0.154 0.072 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00839 0.112 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00962 0.117 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 9.63e-03 -0.2 0.0765 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 9.64e-01 0.00486 0.107 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0404 0.0786 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 2.85e-01 0.0784 0.0731 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0971 0.0696 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 1.16e-01 0.18 0.114 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 2.59e-01 -0.142 0.125 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0859 0.1 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 3.29e-01 0.134 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 2.50e-01 -0.127 0.11 0.167 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 2.75e-01 0.143 0.13 0.167 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 1.52e-01 0.174 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 6.63e-02 -0.124 0.0669 0.167 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.51e-02 0.217 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 6.79e-01 0.0506 0.122 0.153 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 2.96e-01 0.0861 0.0821 0.153 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 4.80e-01 0.0579 0.082 0.153 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0795 0.0709 0.153 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.11 0.153 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 4.35e-01 0.097 0.124 0.153 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0341 0.106 0.153 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.16e-01 0.182 0.115 0.161 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0897 0.0985 0.161 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 4.33e-03 0.196 0.0678 0.161 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 5.58e-01 0.0513 0.0873 0.161 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 7.08e-01 0.0418 0.111 0.161 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 1.24e-01 0.19 0.123 0.161 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0376 0.109 0.161 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 5.38e-01 0.0813 0.132 0.161 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 3.30e-01 -0.109 0.112 0.161 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 7.49e-01 0.0329 0.103 0.161 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 5.63e-02 -0.197 0.103 0.161 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 6.31e-01 -0.049 0.102 0.161 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 8.15e-01 0.0241 0.103 0.161 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0587 0.105 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 1.49e-02 0.277 0.113 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 9.13e-01 0.0107 0.0978 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 1.16e-02 0.199 0.0781 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0311 0.105 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0728 0.0688 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 6.37e-01 0.0551 0.117 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 8.28e-01 -0.023 0.106 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 6.79e-01 0.0408 0.0986 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 6.46e-02 0.135 0.0726 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0268 0.107 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 8.83e-01 0.00829 0.0565 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.71e-01 0.0292 0.101 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0826 0.0861 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 6.20e-01 -0.034 0.0686 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 3.65e-01 0.0583 0.0642 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0892 0.0632 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 2.89e-01 0.12 0.113 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0913 0.121 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 2.28e-02 -0.172 0.0752 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 9.69e-01 0.00442 0.113 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0144 0.0787 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 3.92e-02 0.123 0.0595 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0829 0.0733 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -717860 sc-eQTL 9.95e-01 0.000634 0.107 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -717837 sc-eQTL 1.74e-01 0.16 0.118 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0229 0.0986 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -798798 sc-eQTL 9.26e-01 0.0101 0.109 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 755262 sc-eQTL 1.11e-01 -0.121 0.0755 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -428820 sc-eQTL 2.80e-02 0.206 0.0931 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -132708 sc-eQTL 4.99e-01 0.0538 0.0794 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 107497 sc-eQTL 8.37e-01 0.0143 0.0692 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 106478 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0367 0.0968 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000220412 AL356234.1 267510 eQTL 0.023 -0.0755 0.0332 0.00137 0.0 0.152
ENSG00000226004 AL591468.1 28909 eQTL 0.000302 -0.112 0.0309 0.0 0.0 0.152

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 AL591468.1 28909 2.06e-05 2.01e-05 3.18e-06 1.15e-05 3.55e-06 9.8e-06 2.58e-05 3.51e-06 1.81e-05 9.31e-06 2.39e-05 9.08e-06 3.3e-05 8.09e-06 5.19e-06 1.07e-05 1.02e-05 1.69e-05 5.56e-06 4.8e-06 9.16e-06 2e-05 1.91e-05 5.78e-06 3.08e-05 5.73e-06 8.26e-06 8.17e-06 2.04e-05 1.81e-05 1.25e-05 1.49e-06 1.89e-06 5.21e-06 8.09e-06 4.22e-06 2.37e-06 2.73e-06 3.56e-06 2.5e-06 1.67e-06 2.55e-05 2.66e-06 3.62e-07 2.12e-06 2.68e-06 3.25e-06 1.36e-06 1.06e-06
ENSG00000237499 \N 106478 4.9e-06 5.16e-06 7.32e-07 3.21e-06 1.62e-06 1.5e-06 6.01e-06 1.12e-06 4.95e-06 2.67e-06 6.14e-06 3.32e-06 7.57e-06 1.71e-06 1.33e-06 3.71e-06 1.92e-06 3.85e-06 1.47e-06 1.19e-06 2.87e-06 4.83e-06 4.63e-06 1.42e-06 8.19e-06 2.01e-06 2.33e-06 1.52e-06 4.47e-06 4.87e-06 2.89e-06 4.38e-07 5.4e-07 1.59e-06 2.13e-06 9.71e-07 1.07e-06 4.58e-07 8.09e-07 4.57e-07 6.35e-07 7.11e-06 5.26e-07 1.68e-07 7.57e-07 9.16e-07 1.05e-06 4.28e-07 3.43e-07