logo

Genes within 1Mb (chr6:137969009:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0407 0.083 0.235 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 8.96e-01 0.0106 0.0808 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.15e-01 0.0998 0.063 0.235 B L1
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0583 0.0632 0.235 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.87e-01 0.0672 0.0508 0.235 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 5.09e-01 -0.053 0.0801 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.60e-01 0.0285 0.0934 0.235 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.77e-01 0.0305 0.0546 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.00e-02 0.145 0.0619 0.235 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0831 0.0588 0.235 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 3.39e-01 0.053 0.0553 0.235 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 6.65e-01 0.0302 0.0697 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 2.83e-01 -0.108 0.101 0.235 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 3.00e-01 0.0641 0.0616 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 7.55e-03 0.175 0.065 0.235 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 6.46e-01 0.031 0.0673 0.235 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 3.25e-01 0.0512 0.0519 0.235 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0553 0.0763 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 3.19e-01 0.101 0.101 0.227 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 1.21e-01 0.117 0.0748 0.227 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 6.43e-01 0.0331 0.0713 0.227 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000696 0.0805 0.227 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 6.43e-01 0.0432 0.093 0.227 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0843 0.0971 0.227 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0693 0.0818 0.227 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.78e-01 -0.021 0.0745 0.235 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 3.58e-01 0.0584 0.0634 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.22e-01 0.0629 0.0514 0.235 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 9.04e-01 0.0065 0.0539 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 1.43e-01 0.142 0.0969 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0391 0.101 0.235 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0762 0.0666 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.85e-01 0.0367 0.0905 0.232 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0412 0.0695 0.232 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.21e-01 0.0976 0.0795 0.232 NK L1
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 8.74e-01 0.0107 0.0677 0.232 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.11e-02 0.146 0.057 0.232 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0323 0.0821 0.232 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 8.96e-01 0.0136 0.104 0.235 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 6.07e-01 0.0326 0.0633 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 3.84e-01 0.0585 0.067 0.235 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 8.83e-02 -0.141 0.0823 0.235 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 4.24e-01 0.0315 0.0394 0.235 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0604 0.0781 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.232 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00362 0.105 0.232 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 5.88e-01 0.056 0.103 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 6.67e-02 -0.0981 0.0531 0.232 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 6.11e-01 0.0531 0.104 0.232 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0768 0.0907 0.232 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.56e-01 0.0456 0.102 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0606 0.0944 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.63e-01 0.0792 0.0706 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 1.21e-01 0.14 0.0897 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0479 0.0707 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0709 0.1 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.80e-02 0.19 0.104 0.235 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 7.50e-01 -0.033 0.103 0.235 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.24e-02 0.179 0.0778 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 1.26e-01 -0.15 0.0976 0.235 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0893 0.0673 0.235 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 3.78e-01 0.0886 0.1 0.235 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0433 0.0975 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0416 0.0805 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 6.53e-02 0.126 0.068 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 6.71e-01 0.0395 0.0929 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 2.73e-01 0.0591 0.0538 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00226 0.0845 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0381 0.0955 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 2.58e-01 0.111 0.0982 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.13e-01 0.0813 0.0651 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 7.40e-01 -0.026 0.0785 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.06e-01 0.126 0.078 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 9.51e-01 0.00621 0.101 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 3.08e-02 0.216 0.0995 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 3.20e-01 0.0937 0.094 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 6.44e-02 0.16 0.0862 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 2.57e-03 -0.316 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0269 0.0618 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 7.57e-01 0.0298 0.0962 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 8.84e-01 0.0145 0.0992 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 4.71e-01 0.0379 0.0524 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 7.38e-02 0.11 0.0614 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0197 0.0817 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 4.47e-01 0.0436 0.0572 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 4.05e-01 0.0618 0.0741 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 2.43e-01 -0.113 0.0968 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.29e-01 0.046 0.073 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.01e-02 0.184 0.0711 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0874 0.0904 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 2.46e-01 0.0611 0.0524 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0603 0.0736 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.32e-01 0.0508 0.106 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 4.55e-01 0.06 0.0802 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.10e-01 0.115 0.0718 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 5.71e-01 0.0477 0.084 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 2.44e-01 0.0621 0.0532 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 9.12e-01 0.00949 0.0855 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 5.73e-01 0.0605 0.107 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 7.40e-01 0.024 0.0722 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.50e-02 0.171 0.0757 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 6.42e-01 0.0445 0.0955 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.43e-01 0.089 0.0605 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0614 0.0854 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 1.19e-01 -0.165 0.105 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0462 0.0737 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.88e-01 0.0719 0.0675 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 6.78e-01 0.0338 0.0813 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 2.80e-01 0.0623 0.0576 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0043 0.0853 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0881 0.115 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 7.04e-01 -0.036 0.0947 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 8.55e-03 0.211 0.0792 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 2.72e-01 0.117 0.106 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 5.82e-01 0.0283 0.0513 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0795 0.0938 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 9.33e-02 0.18 0.107 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 1.12e-01 0.148 0.0924 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.09e-02 0.224 0.0963 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 2.42e-01 -0.13 0.111 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 4.05e-01 0.0572 0.0685 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 8.31e-01 0.0218 0.102 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 5.85e-01 0.0619 0.113 0.236 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 3.18e-01 0.0735 0.0734 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.03e-01 0.1 0.0783 0.236 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 1.94e-01 -0.135 0.104 0.236 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.76e-01 0.0669 0.0493 0.236 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0357 0.0915 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.104 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.01e-01 0.0546 0.0809 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00347 0.0884 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0643 0.0945 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 4.36e-01 0.047 0.0602 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 9.67e-01 0.00401 0.0962 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0164 0.0981 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 8.17e-01 -0.015 0.0645 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.87e-01 0.115 0.0867 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 8.58e-01 0.014 0.0781 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 7.79e-02 0.107 0.0603 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0121 0.091 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.27e-01 0.0393 0.112 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0144 0.0826 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 9.55e-01 0.00535 0.0958 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0998 0.0848 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.44e-01 0.0955 0.0651 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 7.72e-01 0.0306 0.106 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 3.16e-01 0.1 0.0999 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0334 0.0675 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.13e-01 0.107 0.086 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0497 0.0803 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 1.34e-02 0.148 0.0594 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 5.38e-01 -0.056 0.0908 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 9.66e-01 0.00523 0.122 0.219 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.12e-01 -0.085 0.129 0.219 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.42e-01 0.127 0.108 0.219 PB L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 7.70e-01 0.0243 0.0829 0.219 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0675 0.1 0.219 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 6.17e-01 0.0605 0.121 0.219 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 2.75e-01 -0.119 0.109 0.237 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 6.99e-01 0.0323 0.0834 0.237 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0118 0.0872 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 1.96e-01 -0.104 0.0803 0.237 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 9.69e-01 0.00195 0.0509 0.237 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 1.43e-01 -0.144 0.0982 0.237 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0454 0.101 0.235 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00883 0.0954 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 8.03e-02 0.121 0.0688 0.235 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 3.27e-01 -0.107 0.109 0.235 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 4.39e-01 0.047 0.0606 0.235 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0743 0.0924 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 1.18e-01 0.158 0.101 0.229 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.26e-01 0.0523 0.0823 0.229 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 2.67e-01 0.0805 0.0723 0.229 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00127 0.0812 0.229 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 5.65e-01 0.0542 0.0941 0.229 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0607 0.104 0.229 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 5.68e-02 -0.201 0.105 0.229 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0287 0.081 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.25e-01 0.0376 0.059 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 5.14e-01 0.038 0.0581 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0309 0.0635 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 7.85e-01 0.0266 0.0975 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0439 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0809 0.0676 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0082 0.0937 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 6.12e-01 0.035 0.0688 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.63e-01 0.0893 0.0638 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0307 0.0611 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 1.62e-01 0.14 0.0999 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 3.28e-01 -0.108 0.11 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0511 0.0878 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.248 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 8.96e-01 0.0125 0.0953 0.248 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 7.56e-01 0.0353 0.113 0.248 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 1.14e-01 0.166 0.104 0.248 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 5.64e-01 0.0338 0.0585 0.248 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 7.65e-02 0.187 0.105 0.248 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0487 0.107 0.224 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.63e-01 0.0417 0.072 0.224 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 7.10e-01 0.0267 0.0719 0.224 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 3.39e-01 0.0595 0.0621 0.224 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 1.09e-01 -0.155 0.0963 0.224 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000575 0.109 0.224 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 6.05e-01 0.0481 0.0927 0.224 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 2.29e-02 0.232 0.101 0.233 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.36e-01 0.054 0.0871 0.233 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 6.64e-02 0.112 0.0606 0.233 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 2.61e-01 0.0867 0.0769 0.233 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 1.08e-01 0.158 0.0977 0.233 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 7.40e-02 0.195 0.108 0.233 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0611 0.0964 0.233 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.35e-01 0.0391 0.115 0.24 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0124 0.0978 0.24 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0362 0.0896 0.24 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 6.20e-01 -0.045 0.0906 0.24 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0855 0.089 0.24 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0351 0.0896 0.24 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0343 0.092 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 3.88e-01 0.0856 0.0989 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 7.50e-01 -0.027 0.0846 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.15e-01 0.108 0.0682 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0401 0.0904 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0117 0.0597 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 9.64e-01 0.00455 0.101 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0626 0.091 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0302 0.0851 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 9.95e-02 0.104 0.0628 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 9.16e-01 0.00985 0.0928 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 4.56e-02 0.0971 0.0483 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 8.26e-01 0.0191 0.0868 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0205 0.0748 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 4.78e-01 0.0423 0.0595 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 3.55e-01 0.0516 0.0557 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00378 0.0551 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 2.09e-01 0.123 0.0978 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 3.04e-01 -0.108 0.105 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0698 0.0659 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 7.49e-01 0.032 0.0999 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.15e-01 0.0455 0.0699 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.43e-01 0.0781 0.0531 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 8.27e-01 0.0143 0.0653 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -723562 sc-eQTL 6.31e-01 0.0456 0.0948 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -723539 sc-eQTL 3.24e-01 0.103 0.105 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 6.04e-01 0.0455 0.0875 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -804500 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00522 0.0941 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0381 0.0658 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -434522 sc-eQTL 1.22e-01 0.126 0.0812 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -138410 sc-eQTL 8.80e-01 0.0104 0.0689 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 101795 sc-eQTL 7.69e-03 0.159 0.059 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 100776 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0251 0.0839 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 749560 eQTL 0.0321 -0.0337 0.0157 0.0 0.0 0.221
ENSG00000226004 AL591468.1 23207 eQTL 8.84e-07 -0.128 0.0258 0.0 0.0 0.221

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -434522 2.61e-07 1.06e-07 3.62e-08 1.79e-07 1.02e-07 9.36e-08 1.39e-07 5.24e-08 1.37e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.6e-08 1.26e-07 6.07e-08 4.89e-08 8.01e-08 5.1e-08 1.06e-07 5.2e-08 3.59e-08 1.03e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.99e-08 1.29e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.71e-08 9.97e-08 1.09e-07 9.75e-08 3.82e-08 2.74e-08 8.26e-08 9.14e-08 4.12e-08 5.26e-08 9.06e-08 8.3e-08 3.69e-08 4.36e-08 1.35e-07 3.91e-08 0.0 1.09e-07 1.75e-08 1.35e-07 4.6e-09 4.74e-08
ENSG00000226004 AL591468.1 23207 2.26e-05 2.26e-05 3.01e-06 1.15e-05 2.46e-06 7.88e-06 2.26e-05 2.25e-06 1.54e-05 6.86e-06 1.94e-05 7.33e-06 2.95e-05 7.61e-06 4.27e-06 9.01e-06 9.14e-06 1.21e-05 4.18e-06 3.93e-06 7.66e-06 1.65e-05 1.63e-05 3.91e-06 2.75e-05 4.65e-06 7.52e-06 5.64e-06 1.83e-05 1.55e-05 1.08e-05 9.95e-07 1.11e-06 3.72e-06 7.67e-06 2.85e-06 1.79e-06 1.95e-06 2.08e-06 1.08e-06 9.34e-07 2.62e-05 2.48e-06 2.01e-07 9.39e-07 2.28e-06 2.15e-06 7.16e-07 5.93e-07