logo

Genes within 1Mb (chr6:137964450:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 4.76e-01 0.0905 0.127 0.09 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 1.10e-01 -0.197 0.123 0.09 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 7.54e-01 0.0303 0.0967 0.09 B L1
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0153 0.0966 0.09 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 8.75e-01 0.0123 0.0778 0.09 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 8.93e-01 0.0164 0.122 0.09 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.09 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 6.45e-02 -0.151 0.0811 0.09 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 8.07e-01 0.0229 0.0937 0.09 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 1.36e-01 0.132 0.0879 0.09 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 2.95e-01 0.0868 0.0826 0.09 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 2.57e-01 0.118 0.104 0.09 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0267 0.155 0.09 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 9.44e-01 0.00667 0.0947 0.09 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 7.25e-01 0.0357 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 9.20e-01 0.0104 0.103 0.09 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 5.29e-01 0.0502 0.0796 0.09 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.90e-01 0.153 0.117 0.09 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00896 0.159 0.09 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 7.13e-02 0.212 0.117 0.09 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 7.13e-01 0.041 0.112 0.09 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 4.97e-01 0.0856 0.126 0.09 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0988 0.145 0.09 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 5.16e-01 0.0989 0.152 0.09 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 4.83e-01 0.09 0.128 0.09 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 3.43e-01 0.105 0.11 0.09 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.31e-01 -0.113 0.0938 0.09 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 7.47e-01 0.0247 0.0764 0.09 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0816 0.0797 0.09 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 6.37e-01 0.0682 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0947 0.15 0.09 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0319 0.0989 0.09 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 3.86e-01 -0.119 0.137 0.09 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.00e-01 0.135 0.105 0.09 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 5.69e-01 0.0687 0.121 0.09 NK L1
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0547 0.102 0.09 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 6.83e-01 0.0359 0.0877 0.09 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.11e-01 0.198 0.124 0.09 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 6.75e-01 0.0677 0.162 0.09 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0245 0.0984 0.09 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 4.15e-01 0.085 0.104 0.09 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 1.40e-01 0.19 0.128 0.09 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 7.71e-01 0.0178 0.0612 0.09 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.58e-01 0.171 0.121 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 1.56e-02 0.426 0.174 0.099 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00784 0.159 0.099 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 6.44e-01 0.0719 0.155 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 3.34e-01 0.078 0.0805 0.099 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0792 0.156 0.099 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 8.32e-02 0.236 0.136 0.099 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 8.42e-02 0.271 0.156 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 6.23e-01 0.0715 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0178 0.109 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0327 0.138 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 3.32e-01 0.105 0.108 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.88e-01 0.203 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0659 0.159 0.091 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 1.15e-01 -0.247 0.156 0.091 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0331 0.12 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 1.23e-01 0.23 0.149 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 8.26e-01 0.0226 0.103 0.091 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 8.95e-01 0.0203 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 4.95e-01 0.101 0.148 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0952 0.122 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 5.08e-01 -0.069 0.104 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 3.96e-01 0.12 0.141 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 1.74e-01 0.111 0.0815 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0448 0.128 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0326 0.146 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 1.62e-01 -0.211 0.15 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0579 0.1 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0598 0.12 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 3.89e-01 0.104 0.12 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.57e-01 -0.22 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 2.38e-01 -0.181 0.153 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0666 0.143 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0156 0.132 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 4.26e-01 -0.128 0.161 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 3.63e-02 0.196 0.093 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.98e-01 0.188 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 3.16e-01 0.148 0.147 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0811 0.0777 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 5.68e-01 0.0525 0.0918 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0201 0.121 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 1.83e-01 0.113 0.0848 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 3.37e-01 0.106 0.11 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 4.73e-01 0.103 0.143 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.14e-01 -0.134 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0209 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 3.60e-02 0.28 0.133 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 2.79e-01 0.0842 0.0776 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 8.73e-02 0.186 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 7.18e-01 0.0581 0.16 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 5.68e-02 -0.231 0.12 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 1.15e-01 -0.172 0.109 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 4.19e-01 -0.103 0.127 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 6.93e-01 0.0319 0.0807 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.48e-01 -0.187 0.129 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 2.63e-01 -0.189 0.168 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00537 0.114 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00904 0.121 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 5.40e-01 0.0922 0.15 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 4.78e-02 0.189 0.0948 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 2.44e-02 0.301 0.133 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 7.57e-01 0.0487 0.157 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.94e-01 0.115 0.109 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 2.54e-01 0.115 0.1 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 5.08e-01 -0.08 0.121 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 5.74e-01 0.0482 0.0857 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 8.81e-01 -0.019 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 2.42e-01 -0.209 0.178 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0901 0.147 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 1.21e-01 -0.194 0.125 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 1.61e-01 -0.232 0.165 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 3.65e-01 0.0724 0.0798 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 9.61e-01 0.00721 0.146 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 8.70e-02 -0.282 0.164 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 3.88e-01 -0.124 0.143 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 4.67e-01 -0.109 0.15 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 5.99e-01 0.0903 0.171 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 7.35e-01 0.0358 0.106 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 7.99e-01 -0.04 0.157 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 9.22e-01 0.0171 0.175 0.089 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0786 0.114 0.089 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00634 0.122 0.089 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 6.50e-01 0.0731 0.161 0.089 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 8.81e-01 0.0115 0.0766 0.089 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 2.23e-01 0.172 0.141 0.089 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 5.39e-01 0.0992 0.161 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 6.72e-01 0.0533 0.126 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0993 0.137 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 5.57e-01 0.0864 0.147 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 4.11e-01 0.077 0.0935 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.38e-01 0.221 0.149 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0893 0.146 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 4.65e-01 0.0701 0.0958 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 5.15e-01 0.0844 0.129 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 4.89e-01 0.0803 0.116 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 4.97e-01 0.0614 0.0902 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 3.52e-01 0.126 0.135 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 2.32e-01 -0.201 0.168 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 3.17e-01 -0.124 0.123 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0236 0.143 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 3.90e-01 -0.11 0.127 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 6.58e-01 0.0434 0.098 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 2.86e-01 -0.169 0.158 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 3.32e-01 -0.147 0.151 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 3.31e-01 0.0992 0.102 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 6.60e-01 0.0573 0.13 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 1.28e-01 -0.185 0.121 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 8.04e-01 0.0226 0.091 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 6.65e-02 0.251 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 7.63e-01 -0.047 0.155 0.115 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.54e-01 0.187 0.163 0.115 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0986 0.138 0.115 PB L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0613 0.105 0.115 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.128 0.115 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 4.01e-01 0.129 0.153 0.115 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 9.61e-01 0.00792 0.164 0.091 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 3.58e-01 -0.115 0.125 0.091 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 5.39e-01 0.0801 0.13 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 3.79e-01 0.106 0.12 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 1.71e-01 0.104 0.0757 0.091 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 5.38e-01 0.091 0.147 0.091 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 2.86e-01 0.164 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.85e-01 -0.155 0.144 0.09 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0409 0.105 0.09 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 5.57e-01 0.097 0.165 0.09 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 3.64e-01 0.0834 0.0917 0.09 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 2.23e-01 0.171 0.14 0.09 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0145 0.158 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 3.08e-01 0.131 0.128 0.09 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 2.54e-01 0.129 0.113 0.09 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 6.06e-01 0.0655 0.127 0.09 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 8.46e-01 0.0286 0.147 0.09 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 2.06e-01 0.205 0.162 0.09 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0607 0.165 0.09 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 3.10e-01 0.122 0.12 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 1.74e-01 -0.119 0.0873 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0317 0.0864 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0411 0.0944 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 4.30e-01 0.114 0.145 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 9.08e-01 0.0175 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 8.26e-01 0.0222 0.101 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 3.79e-01 0.121 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 7.96e-01 0.0262 0.101 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0156 0.0945 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 9.48e-01 0.00588 0.0902 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 3.83e-01 -0.129 0.148 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0697 0.162 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0551 0.129 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 9.19e-01 0.02 0.195 0.085 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 5.85e-01 0.0855 0.156 0.085 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 9.14e-01 0.02 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0351 0.173 0.085 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 7.50e-02 0.171 0.0951 0.085 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 4.43e-01 -0.134 0.174 0.085 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0161 0.161 0.093 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.02e-01 -0.138 0.108 0.093 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 2.50e-01 0.124 0.108 0.093 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 5.59e-01 0.0549 0.0937 0.093 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 1.63e-02 0.348 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 1.39e-01 -0.242 0.163 0.093 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.81e-01 0.187 0.139 0.093 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 2.31e-01 -0.182 0.152 0.09 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0262 0.13 0.09 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 4.58e-01 0.0675 0.0908 0.09 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00164 0.115 0.09 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 6.76e-02 -0.267 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 5.38e-01 -0.1 0.163 0.09 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.92e-01 -0.187 0.143 0.09 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 4.83e-01 0.124 0.177 0.093 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 1.54e-01 0.214 0.149 0.093 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 3.21e-01 0.137 0.137 0.093 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 2.62e-01 0.156 0.139 0.093 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 7.71e-02 -0.241 0.136 0.093 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 3.20e-01 -0.137 0.137 0.093 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 5.71e-01 0.0802 0.141 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 5.13e-02 0.292 0.149 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0753 0.128 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0119 0.104 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 3.09e-01 0.14 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00641 0.0907 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.03e-01 0.249 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0324 0.14 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 1.09e-01 -0.209 0.13 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0287 0.097 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 4.26e-01 0.113 0.142 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000487 0.0749 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 4.02e-01 -0.112 0.133 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 1.71e-01 0.152 0.111 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.23e-01 -0.108 0.0883 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00536 0.0829 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0616 0.0818 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 7.16e-01 0.0531 0.146 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0551 0.157 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0198 0.0982 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0451 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0718 0.104 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 2.59e-01 0.0899 0.0795 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 9.43e-01 0.00697 0.0976 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -728121 sc-eQTL 7.45e-01 0.0462 0.142 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -728098 sc-eQTL 1.63e-01 -0.218 0.156 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 4.40e-01 -0.101 0.131 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 sc-eQTL 2.60e-01 -0.16 0.141 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 745001 sc-eQTL 2.14e-01 0.123 0.0987 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -439081 sc-eQTL 5.87e-01 0.0667 0.123 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -142969 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0443 0.104 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 97236 sc-eQTL 6.83e-01 0.0368 0.0902 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 96217 sc-eQTL 1.81e-01 0.169 0.126 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -809059 eQTL 0.0103 0.0605 0.0235 0.0 0.0 0.125
ENSG00000237499 AL357060.1 96217 eQTL 0.0032 0.0553 0.0187 0.00243 0.0 0.125

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000237499 AL357060.1 96217 4.83e-06 5.13e-06 6.2e-07 3.2e-06 1.64e-06 1.56e-06 6.35e-06 9.78e-07 5.08e-06 2.67e-06 5.57e-06 3.34e-06 7.38e-06 1.92e-06 1.27e-06 3.98e-06 2.07e-06 3.85e-06 1.54e-06 1.21e-06 2.88e-06 4.9e-06 4.56e-06 1.71e-06 8.07e-06 1.98e-06 2.32e-06 1.63e-06 4.46e-06 4.94e-06 2.75e-06 4.46e-07 7.39e-07 1.84e-06 2.01e-06 1.35e-06 1.08e-06 4.51e-07 8.53e-07 5.91e-07 6.15e-07 6.25e-06 5.98e-07 1.59e-07 8.03e-07 1.32e-06 1.16e-06 6.85e-07 6.01e-07