Genes within 1Mb (chr6:137959832:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 2.17e-01 -0.17 0.137 0.075 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 3.24e-01 -0.132 0.134 0.075 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0703 0.105 0.075 B L1
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 7.95e-01 0.0274 0.105 0.075 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.61e-03 0.264 0.0826 0.075 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0598 0.133 0.075 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 2.79e-01 0.166 0.153 0.075 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 5.49e-01 0.0539 0.0899 0.075 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00948 0.103 0.075 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 4.31e-02 -0.196 0.0963 0.075 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 9.74e-03 0.234 0.0897 0.075 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 3.47e-01 -0.108 0.115 0.075 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 7.18e-01 0.061 0.168 0.075 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 6.34e-01 0.049 0.103 0.075 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.87e-01 0.00185 0.11 0.075 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00411 0.112 0.075 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.58e-02 0.192 0.0857 0.075 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 1.40e-01 -0.188 0.127 0.075 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 3.89e-01 0.145 0.168 0.077 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.46e-01 0.182 0.124 0.077 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 2.75e-01 -0.129 0.118 0.077 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 4.03e-02 0.273 0.132 0.077 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 6.47e-01 0.0708 0.154 0.077 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0374 0.162 0.077 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 9.97e-01 0.000563 0.136 0.077 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 2.22e-01 0.151 0.123 0.075 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 5.43e-02 0.202 0.104 0.075 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 8.74e-01 0.0135 0.0853 0.075 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 5.91e-03 0.243 0.0876 0.075 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 3.66e-01 0.146 0.161 0.075 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 2.52e-01 -0.192 0.167 0.075 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 2.20e-01 0.135 0.11 0.075 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 9.99e-01 0.000238 0.151 0.073 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.63e-01 0.162 0.115 0.073 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0875 0.133 0.073 NK L1
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0151 0.113 0.073 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 6.52e-06 0.425 0.092 0.073 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00102 0.137 0.073 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 1.38e-01 -0.258 0.173 0.075 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 8.11e-02 0.185 0.105 0.075 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0857 0.112 0.075 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 7.61e-01 0.0424 0.139 0.075 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.02e-03 0.214 0.0644 0.075 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0312 0.131 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 1.89e-02 -0.456 0.193 0.077 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 4.31e-01 -0.138 0.175 0.077 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 4.31e-01 0.135 0.171 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 1.66e-01 -0.123 0.0885 0.077 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 4.86e-01 0.121 0.172 0.077 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 2.84e-01 -0.162 0.15 0.077 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 3.24e-01 -0.169 0.171 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 5.04e-01 -0.106 0.158 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0258 0.119 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 6.94e-01 0.0596 0.151 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.76e-01 0.129 0.118 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0631 0.168 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 4.63e-01 -0.128 0.174 0.075 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 8.89e-01 0.024 0.172 0.075 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 2.58e-01 -0.148 0.131 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 3.80e-01 -0.144 0.163 0.075 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.41e-01 0.166 0.112 0.075 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.69e-01 0.0492 0.167 0.075 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0787 0.163 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 3.16e-01 -0.135 0.134 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0687 0.114 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 5.61e-01 0.0901 0.155 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.70e-03 0.267 0.088 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.52e-01 0.0445 0.141 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 6.68e-01 0.0697 0.163 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 8.71e-01 0.0272 0.168 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 2.74e-01 0.122 0.111 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 4.54e-01 -0.1 0.133 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 4.00e-02 0.273 0.132 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0592 0.173 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 3.41e-01 0.163 0.17 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0592 0.16 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.70e-01 0.00548 0.147 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 2.14e-01 -0.223 0.179 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.16e-02 0.263 0.103 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 3.88e-01 0.141 0.163 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 2.95e-01 0.169 0.161 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 7.77e-01 0.0242 0.0853 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0901 0.1 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 1.26e-01 -0.203 0.132 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.17e-02 0.213 0.0921 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0933 0.121 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0506 0.158 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 3.56e-01 0.11 0.119 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 5.67e-01 0.0676 0.118 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0982 0.148 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 4.67e-03 0.241 0.0842 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 5.28e-02 -0.232 0.119 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 9.18e-01 0.0184 0.178 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 2.75e-01 0.147 0.134 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0737 0.121 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0434 0.141 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 4.07e-03 0.254 0.0876 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 2.83e-01 -0.154 0.143 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 3.51e-01 0.17 0.182 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 7.81e-02 0.216 0.122 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 6.43e-01 0.0605 0.13 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 7.07e-01 0.0611 0.163 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.73e-03 0.307 0.101 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.82e-01 0.0403 0.145 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0338 0.173 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.66e-01 -0.167 0.12 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00784 0.111 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 3.59e-01 0.122 0.133 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 3.35e-02 0.2 0.0934 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 1.90e-01 -0.183 0.139 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0972 0.187 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0278 0.155 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 2.85e-02 0.287 0.13 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 2.95e-01 0.182 0.173 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 3.98e-03 0.239 0.082 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 1.50e-01 -0.221 0.153 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 7.53e-01 0.0585 0.186 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 2.32e-01 -0.192 0.161 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 3.78e-01 -0.149 0.169 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 2.39e-01 -0.227 0.192 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.41e-02 0.29 0.117 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.27e-01 0.0617 0.176 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0839 0.188 0.076 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 2.68e-01 0.135 0.122 0.076 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.56e-01 0.00722 0.131 0.076 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0573 0.173 0.076 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 3.06e-03 0.242 0.0806 0.076 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.60e-01 0.0466 0.152 0.076 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0224 0.175 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 3.66e-01 0.123 0.136 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 8.48e-01 0.0286 0.149 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 4.13e-01 -0.13 0.159 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.02e-01 0.165 0.101 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 4.23e-01 -0.13 0.162 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 6.36e-01 0.0771 0.163 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.07e-01 0.172 0.106 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 4.81e-01 -0.102 0.144 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0172 0.13 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 3.98e-05 0.406 0.0968 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 8.32e-01 0.0322 0.151 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 8.84e-02 -0.316 0.184 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.75e-01 0.185 0.136 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0145 0.158 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 3.77e-01 -0.124 0.14 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 5.90e-05 0.426 0.104 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 6.90e-01 0.0697 0.174 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 5.19e-01 0.108 0.167 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.48e-01 0.163 0.112 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0698 0.144 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0599 0.134 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.93e-06 0.459 0.0954 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.67e-01 -0.045 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0452 0.212 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 8.73e-01 -0.036 0.224 0.07 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.95e-01 0.00122 0.189 0.07 PB L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 3.01e-01 0.149 0.143 0.07 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0914 0.174 0.07 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0294 0.209 0.07 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 2.47e-01 -0.21 0.181 0.076 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 6.18e-01 0.0692 0.139 0.076 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 7.81e-02 -0.255 0.144 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0325 0.134 0.076 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.34e-01 0.126 0.084 0.076 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 1.07e-01 -0.264 0.163 0.076 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 6.76e-01 0.0712 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 5.08e-01 0.106 0.16 0.075 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0487 0.116 0.075 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 3.66e-02 -0.381 0.181 0.075 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 7.17e-05 0.397 0.098 0.075 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 5.45e-01 0.0941 0.155 0.075 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 8.72e-02 0.294 0.171 0.073 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 3.25e-01 0.138 0.14 0.073 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.81e-01 0.003 0.124 0.073 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 9.15e-02 0.233 0.137 0.073 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 5.54e-01 0.0949 0.16 0.073 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 8.86e-01 0.0253 0.177 0.073 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 5.25e-01 -0.115 0.18 0.073 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 2.97e-01 0.141 0.134 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.30e-01 0.148 0.0976 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0153 0.0967 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.52e-02 0.255 0.104 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 5.59e-01 0.0948 0.162 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 3.68e-01 -0.153 0.169 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 9.21e-02 0.19 0.112 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 9.49e-01 0.00992 0.156 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.45e-01 0.167 0.114 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 5.78e-01 0.0595 0.107 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.53e-01 0.146 0.102 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0176 0.167 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 9.73e-01 0.00628 0.183 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 8.65e-01 0.025 0.147 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 3.91e-01 -0.171 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 5.85e-02 0.3 0.157 0.082 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 2.89e-01 -0.201 0.189 0.082 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 5.72e-01 0.0996 0.176 0.082 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.23e-04 0.353 0.0933 0.082 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 7.01e-01 0.0681 0.177 0.082 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 1.94e-01 -0.234 0.179 0.073 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0809 0.121 0.073 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0606 0.121 0.073 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 5.87e-04 0.355 0.102 0.073 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 2.94e-01 -0.171 0.163 0.073 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 2.47e-01 -0.212 0.182 0.073 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 1.63e-01 0.218 0.155 0.073 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 1.22e-01 0.255 0.164 0.075 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 2.80e-02 0.307 0.139 0.075 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 2.20e-01 -0.12 0.0979 0.075 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.30e-01 0.188 0.123 0.075 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 3.58e-02 0.331 0.156 0.075 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 5.97e-01 0.0929 0.176 0.075 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0748 0.155 0.075 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 8.48e-01 0.0353 0.184 0.082 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 4.60e-01 0.116 0.156 0.082 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 2.60e-01 -0.162 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 2.55e-02 0.322 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 3.07e-01 -0.146 0.142 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 1.96e-01 -0.185 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 9.48e-01 0.0096 0.147 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 4.01e-02 -0.337 0.163 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0872 0.14 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 3.11e-01 -0.116 0.114 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0622 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.82e-01 0.132 0.0988 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0987 0.168 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0975 0.152 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 2.27e-01 -0.172 0.141 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00469 0.105 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 8.65e-01 0.0263 0.155 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 1.39e-03 0.257 0.0793 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 6.83e-01 0.0592 0.145 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 2.70e-01 0.137 0.124 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 7.04e-02 0.179 0.0983 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0013 0.0927 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 3.50e-02 0.192 0.0906 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 6.45e-01 0.0752 0.163 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 3.93e-01 -0.15 0.175 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 1.65e-01 0.152 0.109 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 5.37e-01 0.104 0.168 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 2.54e-01 0.134 0.117 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0621 0.0898 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 9.65e-03 0.283 0.108 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -732739 sc-eQTL 3.71e-01 0.143 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -732716 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0916 0.177 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 1.74e-01 0.201 0.147 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -813677 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00276 0.156 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 740383 sc-eQTL 1.84e-01 0.145 0.109 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0869 0.136 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -147587 sc-eQTL 6.37e-01 -0.054 0.114 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 92618 sc-eQTL 4.27e-06 0.447 0.0947 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 91599 sc-eQTL 8.49e-01 0.0265 0.139 0.073 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 eQTL 0.00262 -0.108 0.0357 0.0 0.0 0.0697
ENSG00000226004 AL591468.1 14030 eQTL 0.00349 -0.122 0.0418 0.0 0.0 0.0697


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -443699 4.21e-07 1.53e-07 5.49e-08 2.41e-07 9.21e-08 9.05e-08 1.9e-07 5.19e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.57e-07 9e-08 2.13e-07 7.64e-08 5.69e-08 7.5e-08 4.01e-08 1.44e-07 7.18e-08 5.04e-08 1.13e-07 1.25e-07 1.64e-07 3.07e-08 1.68e-07 1.25e-07 1.07e-07 1.06e-07 1.34e-07 1.05e-07 1.09e-07 4.77e-08 3.21e-08 8.89e-08 2.97e-08 3.04e-08 4.28e-08 9.26e-08 4.9e-08 3.12e-08 6.21e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.07e-08 3.66e-08 1.92e-08 1.19e-07 2.16e-09 4.67e-08
ENSG00000226004 AL591468.1 14030 4.35e-05 2.87e-05 4.17e-06 1.3e-05 4.03e-06 1.34e-05 3.84e-05 3.51e-06 2.44e-05 1.02e-05 2.86e-05 1.11e-05 3.98e-05 1e-05 5.5e-06 1.22e-05 1.29e-05 2.05e-05 6.45e-06 4.88e-06 9.96e-06 2.55e-05 2.55e-05 7.06e-06 3.36e-05 6.06e-06 8.21e-06 8.96e-06 2.67e-05 2.03e-05 1.51e-05 1.61e-06 2.02e-06 4.94e-06 8.41e-06 4.22e-06 2.27e-06 2.73e-06 3.61e-06 2.42e-06 1.36e-06 3.1e-05 2.79e-06 2.5e-07 2.11e-06 2.61e-06 2.94e-06 1.24e-06 8.3e-07