Genes within 1Mb (chr6:137958232:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 7.71e-01 0.0279 0.0957 0.16 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 4.03e-01 0.0779 0.093 0.16 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.20e-02 0.167 0.0721 0.16 B L1
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0907 0.0727 0.16 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0382 0.0587 0.16 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0416 0.0924 0.16 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0429 0.107 0.16 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 8.25e-01 0.0138 0.0625 0.16 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 6.35e-03 0.194 0.0704 0.16 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 8.36e-01 -0.014 0.0675 0.16 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0437 0.0632 0.16 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 2.50e-01 0.0916 0.0794 0.16 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 1.38e-01 -0.172 0.115 0.16 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 3.89e-01 0.0612 0.0708 0.16 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.19e-03 0.23 0.0742 0.16 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 5.81e-01 0.0427 0.0773 0.16 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0237 0.0597 0.16 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 8.54e-01 0.0161 0.0877 0.16 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 5.86e-01 0.063 0.116 0.151 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 4.42e-01 0.066 0.0857 0.151 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.01e-01 0.104 0.081 0.151 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.58e-01 -0.129 0.0912 0.151 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 8.30e-01 0.0228 0.106 0.151 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0919 0.111 0.151 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0903 0.0932 0.151 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 2.41e-01 -0.1 0.0852 0.16 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0201 0.0729 0.16 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.96e-01 0.0764 0.0589 0.16 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 7.82e-02 -0.109 0.0614 0.16 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 7.25e-01 0.0409 0.116 0.16 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 3.00e-02 -0.166 0.0758 0.16 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 6.42e-01 0.0483 0.104 0.159 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 1.01e-01 -0.131 0.0794 0.159 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 6.24e-02 0.17 0.0908 0.159 NK L1
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 7.84e-01 0.0213 0.0777 0.159 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00936 0.0665 0.159 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 6.56e-01 -0.042 0.0942 0.159 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 2.42e-01 0.14 0.12 0.16 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0441 0.073 0.16 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.26e-01 0.118 0.077 0.16 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 2.93e-02 -0.207 0.0945 0.16 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0596 0.0453 0.16 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0655 0.0901 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 9.57e-01 0.00769 0.142 0.156 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 5.97e-01 0.0671 0.127 0.156 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 9.36e-01 0.01 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0771 0.0643 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 9.15e-01 0.0134 0.125 0.156 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0262 0.109 0.156 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 2.33e-01 0.141 0.118 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0306 0.109 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.49e-01 0.118 0.0814 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 1.29e-01 0.158 0.104 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.25e-01 -0.125 0.0812 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0645 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 8.57e-03 0.315 0.119 0.159 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0555 0.119 0.159 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 5.59e-04 0.31 0.0883 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 2.48e-01 -0.131 0.113 0.159 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.04e-02 -0.199 0.0768 0.159 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 4.16e-01 0.0945 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0202 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.23e-01 0.00912 0.0937 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.01e-02 0.204 0.0785 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 9.29e-01 0.00962 0.108 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0501 0.0626 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0247 0.0982 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0825 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 4.89e-01 0.0521 0.0751 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 9.01e-01 0.0113 0.0904 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 6.38e-01 0.0426 0.0903 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 7.63e-01 0.0353 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 6.58e-02 0.213 0.115 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 1.61e-01 0.153 0.108 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 3.45e-02 0.212 0.0994 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 8.75e-03 -0.319 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 2.61e-02 -0.158 0.0705 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0257 0.111 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0637 0.113 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 5.34e-01 0.0371 0.0595 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 7.56e-03 0.186 0.0691 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 4.29e-01 0.0735 0.0927 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0475 0.065 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 1.37e-01 0.125 0.0839 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 2.66e-01 -0.123 0.111 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.41e-01 0.00621 0.0835 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.13e-02 0.208 0.0813 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 5.24e-01 -0.066 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0384 0.0601 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 6.77e-01 0.0352 0.0842 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 6.29e-01 0.0593 0.123 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.13e-01 0.0102 0.093 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.28e-02 0.189 0.0826 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 3.85e-01 0.0846 0.0971 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0384 0.0617 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 3.84e-01 0.0862 0.0988 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 9.85e-01 0.00235 0.124 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0678 0.0835 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.28e-02 0.201 0.0876 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 7.77e-01 0.0313 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0228 0.0703 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 3.08e-01 -0.101 0.0987 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 1.01e-01 -0.197 0.12 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 8.04e-01 0.0209 0.0839 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.08e-01 0.0968 0.0766 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0153 0.0924 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 8.07e-01 -0.016 0.0656 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 3.94e-01 0.0827 0.0969 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 6.03e-01 -0.069 0.133 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0342 0.11 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.40e-01 0.137 0.0927 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 5.98e-01 0.0649 0.123 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0822 0.0591 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 9.68e-01 0.00442 0.109 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 8.97e-02 0.206 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.35e-03 0.272 0.104 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.28e-03 0.352 0.108 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0703 0.126 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0506 0.0777 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 9.89e-01 0.00161 0.115 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 3.47e-01 0.123 0.131 0.16 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 7.00e-01 0.0328 0.085 0.16 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.51e-01 0.13 0.0904 0.16 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 2.03e-01 -0.153 0.12 0.16 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0272 0.0572 0.16 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0701 0.106 0.16 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 1.81e-01 0.159 0.119 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 8.75e-01 0.0146 0.093 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0179 0.101 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0241 0.109 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 8.29e-01 -0.015 0.0692 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 5.52e-01 0.0656 0.11 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0585 0.113 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 1.68e-01 -0.102 0.0737 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 4.49e-02 0.2 0.099 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 7.67e-01 0.0266 0.0896 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0536 0.0696 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0312 0.104 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 1.09e-01 0.209 0.13 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 2.48e-01 -0.111 0.0956 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 8.97e-01 0.0144 0.111 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0731 0.0987 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0819 0.0758 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 9.55e-01 0.00685 0.122 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 4.83e-01 0.0801 0.114 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 1.21e-01 -0.119 0.0765 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 7.94e-02 0.172 0.0976 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0365 0.0915 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0217 0.0686 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0516 0.103 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 8.44e-01 0.0287 0.146 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.148 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.65e-01 0.18 0.128 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0356 0.0987 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0526 0.12 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 4.89e-01 0.0996 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0561 0.125 0.161 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.22e-01 0.00934 0.0951 0.161 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.93e-01 0.104 0.0991 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 1.91e-01 -0.12 0.0915 0.161 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0569 0.0578 0.161 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0635 0.112 0.161 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 4.19e-01 -0.095 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0624 0.111 0.16 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.01e-02 0.186 0.0793 0.16 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 7.63e-01 0.0382 0.126 0.16 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 7.15e-02 -0.126 0.0698 0.16 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 1.77e-01 -0.145 0.107 0.16 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 5.26e-01 0.0731 0.115 0.156 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.49e-01 0.00606 0.0937 0.156 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.13e-01 0.103 0.0822 0.156 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 2.53e-01 -0.106 0.0921 0.156 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 7.96e-01 0.0278 0.107 0.156 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0899 0.118 0.156 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 8.19e-02 -0.209 0.119 0.156 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 2.60e-01 -0.104 0.0925 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0211 0.0676 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 3.92e-01 0.0571 0.0666 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 2.57e-02 -0.162 0.072 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 8.98e-01 0.015 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 1.10e-02 -0.196 0.0766 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0153 0.107 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0328 0.0786 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.27e-01 0.0885 0.073 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.21e-01 -0.108 0.0694 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 9.50e-02 0.191 0.114 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 2.54e-01 -0.143 0.125 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0783 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 3.29e-01 0.134 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 2.50e-01 -0.127 0.11 0.167 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.75e-01 0.143 0.13 0.167 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 1.52e-01 0.174 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 6.63e-02 -0.124 0.0669 0.167 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 7.51e-02 0.217 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 7.18e-01 0.0445 0.123 0.151 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 2.63e-01 0.0924 0.0824 0.151 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 4.43e-01 0.0633 0.0823 0.151 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0867 0.0711 0.151 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 2.62e-01 -0.124 0.111 0.151 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 4.34e-01 0.0975 0.124 0.151 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0378 0.106 0.151 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 1.38e-01 0.173 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0835 0.099 0.158 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.89e-03 0.205 0.068 0.158 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 8.35e-01 0.0183 0.0878 0.158 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 7.28e-01 0.039 0.112 0.158 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 9.76e-02 0.206 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0417 0.11 0.158 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 8.02e-01 0.0333 0.132 0.158 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 4.99e-01 -0.076 0.112 0.158 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 7.31e-01 0.0355 0.103 0.158 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 2.96e-02 -0.225 0.103 0.158 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0374 0.102 0.158 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 6.34e-01 0.049 0.103 0.158 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0501 0.106 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 1.48e-02 0.278 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.50e-01 0.00619 0.098 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 1.09e-02 0.201 0.0782 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0236 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0799 0.0689 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 6.44e-01 0.054 0.117 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 7.27e-01 -0.037 0.106 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 6.68e-01 0.0424 0.0987 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 5.19e-02 0.142 0.0726 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 9.96e-01 0.000535 0.108 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 9.12e-01 0.00626 0.0566 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00293 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0932 0.086 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0298 0.0687 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.82e-01 0.0692 0.0641 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0976 0.0632 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 2.60e-01 0.128 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0719 0.121 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 2.85e-02 -0.166 0.0753 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00597 0.113 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00228 0.079 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 3.36e-02 0.128 0.0596 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 1.39e-01 -0.109 0.0734 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -734339 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00607 0.107 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -734316 sc-eQTL 1.44e-01 0.173 0.118 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0321 0.0989 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00561 0.109 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 738783 sc-eQTL 1.12e-01 -0.12 0.0754 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -445299 sc-eQTL 2.54e-02 0.209 0.093 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -149187 sc-eQTL 6.16e-01 0.0399 0.0793 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 91018 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00443 0.0691 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 89999 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0461 0.0967 0.157 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -815277 pQTL 0.0441 -0.0897 0.0445 0.0 0.0 0.152
ENSG00000220412 AL356234.1 251031 eQTL 0.0146 -0.0804 0.0328 0.00181 0.0 0.15
ENSG00000226004 AL591468.1 12430 eQTL 9.32e-05 -0.12 0.0306 0.0 0.0 0.15


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 AL591468.1 12430 3.86e-05 2.24e-05 5.75e-06 1.32e-05 5.05e-06 1.59e-05 3.46e-05 3.72e-06 2.22e-05 1.13e-05 2.78e-05 1.06e-05 3.98e-05 9.56e-06 5.99e-06 1.48e-05 1.31e-05 2.35e-05 7.51e-06 6.54e-06 1.34e-05 2.57e-05 2.5e-05 1e-05 3.43e-05 7.03e-06 9.89e-06 9.19e-06 2.71e-05 3.11e-05 1.39e-05 1.64e-06 2.9e-06 7.93e-06 9.4e-06 5.77e-06 3.48e-06 3.18e-06 5.2e-06 3.71e-06 1.77e-06 3.02e-05 3.44e-06 4.43e-07 2.79e-06 3.32e-06 3.88e-06 1.6e-06 1.52e-06