Genes within 1Mb (chr6:137956834:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0407 0.083 0.235 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 8.96e-01 0.0106 0.0808 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.15e-01 0.0998 0.063 0.235 B L1
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0583 0.0632 0.235 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.87e-01 0.0672 0.0508 0.235 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 5.09e-01 -0.053 0.0801 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.60e-01 0.0285 0.0934 0.235 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.77e-01 0.0305 0.0546 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.00e-02 0.145 0.0619 0.235 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0831 0.0588 0.235 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 3.39e-01 0.053 0.0553 0.235 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 6.65e-01 0.0302 0.0697 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 2.83e-01 -0.108 0.101 0.235 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 3.00e-01 0.0641 0.0616 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 7.55e-03 0.175 0.065 0.235 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 6.46e-01 0.031 0.0673 0.235 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 3.25e-01 0.0512 0.0519 0.235 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0553 0.0763 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 3.19e-01 0.101 0.101 0.227 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 1.21e-01 0.117 0.0748 0.227 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 6.43e-01 0.0331 0.0713 0.227 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000696 0.0805 0.227 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 6.43e-01 0.0432 0.093 0.227 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0843 0.0971 0.227 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0693 0.0818 0.227 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.78e-01 -0.021 0.0745 0.235 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 3.58e-01 0.0584 0.0634 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.22e-01 0.0629 0.0514 0.235 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 9.04e-01 0.0065 0.0539 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 1.43e-01 0.142 0.0969 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0391 0.101 0.235 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0762 0.0666 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.85e-01 0.0367 0.0905 0.232 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0412 0.0695 0.232 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.21e-01 0.0976 0.0795 0.232 NK L1
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 8.74e-01 0.0107 0.0677 0.232 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.11e-02 0.146 0.057 0.232 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0323 0.0821 0.232 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 8.96e-01 0.0136 0.104 0.235 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 6.07e-01 0.0326 0.0633 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 3.84e-01 0.0585 0.067 0.235 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 8.83e-02 -0.141 0.0823 0.235 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 4.24e-01 0.0315 0.0394 0.235 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0604 0.0781 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.232 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00362 0.105 0.232 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 5.88e-01 0.056 0.103 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 6.67e-02 -0.0981 0.0531 0.232 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 6.11e-01 0.0531 0.104 0.232 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0768 0.0907 0.232 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.56e-01 0.0456 0.102 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0606 0.0944 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.63e-01 0.0792 0.0706 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 1.21e-01 0.14 0.0897 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0479 0.0707 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0709 0.1 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.80e-02 0.19 0.104 0.235 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 7.50e-01 -0.033 0.103 0.235 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.24e-02 0.179 0.0778 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 1.26e-01 -0.15 0.0976 0.235 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0893 0.0673 0.235 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 3.78e-01 0.0886 0.1 0.235 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0433 0.0975 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0416 0.0805 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 6.53e-02 0.126 0.068 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 6.71e-01 0.0395 0.0929 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 2.73e-01 0.0591 0.0538 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00226 0.0845 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0381 0.0955 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 2.58e-01 0.111 0.0982 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.13e-01 0.0813 0.0651 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 7.40e-01 -0.026 0.0785 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.06e-01 0.126 0.078 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 9.51e-01 0.00621 0.101 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 3.08e-02 0.216 0.0995 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 3.20e-01 0.0937 0.094 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 6.44e-02 0.16 0.0862 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 2.57e-03 -0.316 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0269 0.0618 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 7.57e-01 0.0298 0.0962 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 8.84e-01 0.0145 0.0992 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 4.71e-01 0.0379 0.0524 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 7.38e-02 0.11 0.0614 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0197 0.0817 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 4.47e-01 0.0436 0.0572 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 4.05e-01 0.0618 0.0741 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 2.43e-01 -0.113 0.0968 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.29e-01 0.046 0.073 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.01e-02 0.184 0.0711 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0874 0.0904 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 2.46e-01 0.0611 0.0524 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0603 0.0736 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.32e-01 0.0508 0.106 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 4.55e-01 0.06 0.0802 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.10e-01 0.115 0.0718 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 5.71e-01 0.0477 0.084 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 2.44e-01 0.0621 0.0532 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 9.12e-01 0.00949 0.0855 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 5.73e-01 0.0605 0.107 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 7.40e-01 0.024 0.0722 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.50e-02 0.171 0.0757 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 6.42e-01 0.0445 0.0955 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.43e-01 0.089 0.0605 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0614 0.0854 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 1.19e-01 -0.165 0.105 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0462 0.0737 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.88e-01 0.0719 0.0675 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 6.78e-01 0.0338 0.0813 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 2.80e-01 0.0623 0.0576 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0043 0.0853 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0881 0.115 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 7.04e-01 -0.036 0.0947 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 8.55e-03 0.211 0.0792 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 2.72e-01 0.117 0.106 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 5.82e-01 0.0283 0.0513 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0795 0.0938 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 9.33e-02 0.18 0.107 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 1.12e-01 0.148 0.0924 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.09e-02 0.224 0.0963 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 2.42e-01 -0.13 0.111 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 4.05e-01 0.0572 0.0685 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 8.31e-01 0.0218 0.102 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 5.85e-01 0.0619 0.113 0.236 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 3.18e-01 0.0735 0.0734 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.03e-01 0.1 0.0783 0.236 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 1.94e-01 -0.135 0.104 0.236 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.76e-01 0.0669 0.0493 0.236 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0357 0.0915 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.104 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.01e-01 0.0546 0.0809 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00347 0.0884 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0643 0.0945 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 4.36e-01 0.047 0.0602 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 9.67e-01 0.00401 0.0962 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0164 0.0981 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 8.17e-01 -0.015 0.0645 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.87e-01 0.115 0.0867 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 8.58e-01 0.014 0.0781 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 7.79e-02 0.107 0.0603 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0121 0.091 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.27e-01 0.0393 0.112 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0144 0.0826 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 9.55e-01 0.00535 0.0958 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0998 0.0848 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.44e-01 0.0955 0.0651 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 7.72e-01 0.0306 0.106 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 3.16e-01 0.1 0.0999 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0334 0.0675 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.13e-01 0.107 0.086 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0497 0.0803 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 1.34e-02 0.148 0.0594 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 5.38e-01 -0.056 0.0908 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 9.66e-01 0.00523 0.122 0.219 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.12e-01 -0.085 0.129 0.219 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.42e-01 0.127 0.108 0.219 PB L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 7.70e-01 0.0243 0.0829 0.219 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0675 0.1 0.219 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 6.17e-01 0.0605 0.121 0.219 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 2.75e-01 -0.119 0.109 0.237 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 6.99e-01 0.0323 0.0834 0.237 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0118 0.0872 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 1.96e-01 -0.104 0.0803 0.237 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 9.69e-01 0.00195 0.0509 0.237 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 1.43e-01 -0.144 0.0982 0.237 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0454 0.101 0.235 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00883 0.0954 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 8.03e-02 0.121 0.0688 0.235 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 3.27e-01 -0.107 0.109 0.235 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 4.39e-01 0.047 0.0606 0.235 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0743 0.0924 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 1.18e-01 0.158 0.101 0.229 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.26e-01 0.0523 0.0823 0.229 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 2.67e-01 0.0805 0.0723 0.229 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00127 0.0812 0.229 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 5.65e-01 0.0542 0.0941 0.229 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0607 0.104 0.229 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 5.68e-02 -0.201 0.105 0.229 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0287 0.081 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.25e-01 0.0376 0.059 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 5.14e-01 0.038 0.0581 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0309 0.0635 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 7.85e-01 0.0266 0.0975 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0439 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0809 0.0676 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0082 0.0937 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 6.12e-01 0.035 0.0688 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.63e-01 0.0893 0.0638 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0307 0.0611 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 1.62e-01 0.14 0.0999 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 3.28e-01 -0.108 0.11 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0511 0.0878 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.248 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 8.96e-01 0.0125 0.0953 0.248 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 7.56e-01 0.0353 0.113 0.248 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 1.14e-01 0.166 0.104 0.248 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 5.64e-01 0.0338 0.0585 0.248 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 7.65e-02 0.187 0.105 0.248 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0487 0.107 0.224 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.63e-01 0.0417 0.072 0.224 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 7.10e-01 0.0267 0.0719 0.224 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 3.39e-01 0.0595 0.0621 0.224 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 1.09e-01 -0.155 0.0963 0.224 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000575 0.109 0.224 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 6.05e-01 0.0481 0.0927 0.224 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 2.29e-02 0.232 0.101 0.233 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.36e-01 0.054 0.0871 0.233 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 6.64e-02 0.112 0.0606 0.233 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 2.61e-01 0.0867 0.0769 0.233 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 1.08e-01 0.158 0.0977 0.233 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 7.40e-02 0.195 0.108 0.233 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0611 0.0964 0.233 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.35e-01 0.0391 0.115 0.24 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0124 0.0978 0.24 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0362 0.0896 0.24 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 6.20e-01 -0.045 0.0906 0.24 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0855 0.089 0.24 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0351 0.0896 0.24 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0343 0.092 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 3.88e-01 0.0856 0.0989 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 7.50e-01 -0.027 0.0846 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.15e-01 0.108 0.0682 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0401 0.0904 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0117 0.0597 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 9.64e-01 0.00455 0.101 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0626 0.091 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0302 0.0851 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 9.95e-02 0.104 0.0628 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 9.16e-01 0.00985 0.0928 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 4.56e-02 0.0971 0.0483 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 8.26e-01 0.0191 0.0868 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0205 0.0748 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 4.78e-01 0.0423 0.0595 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 3.55e-01 0.0516 0.0557 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00378 0.0551 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 2.09e-01 0.123 0.0978 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 3.04e-01 -0.108 0.105 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0698 0.0659 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 7.49e-01 0.032 0.0999 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.15e-01 0.0455 0.0699 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.43e-01 0.0781 0.0531 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 8.27e-01 0.0143 0.0653 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -735737 sc-eQTL 6.31e-01 0.0456 0.0948 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -735714 sc-eQTL 3.24e-01 0.103 0.105 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 6.04e-01 0.0455 0.0875 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -816675 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00522 0.0941 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0381 0.0658 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -446697 sc-eQTL 1.22e-01 0.126 0.0812 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -150585 sc-eQTL 8.80e-01 0.0104 0.0689 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 89620 sc-eQTL 7.69e-03 0.159 0.059 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 88601 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0251 0.0839 0.231 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 737385 eQTL 0.0494 -0.0308 0.0157 0.0 0.0 0.22
ENSG00000226004 AL591468.1 11032 eQTL 2.68e-07 -0.134 0.0258 0.0 0.0 0.22


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -446697 7.74e-07 8.36e-07 1e-07 3.4e-07 9.29e-08 1.71e-07 4.68e-07 7.65e-08 4.3e-07 2.28e-07 9.92e-07 4.28e-07 1.16e-06 1.56e-07 3.13e-07 2e-07 3.52e-07 3.82e-07 1.69e-07 1.08e-07 2.17e-07 3.76e-07 2.81e-07 1.32e-07 7.42e-07 2.13e-07 2.23e-07 2.69e-07 2.11e-07 4.3e-07 3.67e-07 3.51e-08 5.73e-08 1.79e-07 3.48e-07 3.59e-07 3.14e-07 9.46e-08 6.81e-08 3.03e-08 5.19e-08 6.95e-07 9.42e-08 1.3e-07 1.94e-07 7.09e-08 1.03e-07 8.81e-08 4.97e-08
ENSG00000226004 AL591468.1 11032 4.1e-05 3.64e-05 7.01e-06 1.67e-05 6.98e-06 1.68e-05 5.04e-05 5.69e-06 3.76e-05 1.85e-05 4.69e-05 2.06e-05 5.54e-05 1.64e-05 8.31e-06 2.37e-05 2.08e-05 3e-05 9.49e-06 7.7e-06 1.95e-05 4.03e-05 3.6e-05 1.05e-05 5.14e-05 1.02e-05 1.73e-05 1.56e-05 3.61e-05 3.01e-05 2.46e-05 2.08e-06 3.61e-06 7.93e-06 1.33e-05 6.86e-06 3.67e-06 3.83e-06 5.92e-06 3.81e-06 1.85e-06 4.16e-05 4.52e-06 4.16e-07 2.93e-06 4.96e-06 4.65e-06 2.14e-06 1.56e-06