Genes within 1Mb (chr6:137947589:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 7.55e-01 -0.026 0.083 0.241 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 9.11e-01 -0.009 0.0808 0.241 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.54e-01 0.0901 0.0631 0.241 B L1
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0582 0.0631 0.241 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 2.16e-01 0.063 0.0508 0.241 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0496 0.0801 0.241 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 6.83e-01 0.038 0.0929 0.241 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 8.84e-01 0.00793 0.0544 0.241 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.82e-02 0.136 0.0617 0.241 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0767 0.0586 0.241 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.35e-01 0.0823 0.0548 0.241 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.88e-01 0.0376 0.0694 0.241 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 2.50e-01 -0.116 0.101 0.241 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.17e-01 0.0401 0.0618 0.241 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.51e-02 0.16 0.0653 0.241 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 6.31e-01 0.0325 0.0674 0.241 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 2.27e-01 0.0629 0.0519 0.241 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0638 0.0764 0.241 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 4.01e-01 0.0849 0.101 0.234 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 1.46e-01 0.109 0.0745 0.234 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 6.99e-01 0.0274 0.071 0.234 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00596 0.0801 0.234 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 5.92e-01 0.0497 0.0925 0.234 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0557 0.0967 0.234 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0693 0.0815 0.234 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 8.83e-01 -0.011 0.0743 0.241 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 3.91e-01 0.0544 0.0632 0.241 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.30e-01 0.0617 0.0512 0.241 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00511 0.0537 0.241 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 1.46e-01 0.141 0.0966 0.241 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 7.66e-01 -0.03 0.101 0.241 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0882 0.0663 0.241 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 5.68e-01 0.0515 0.0899 0.238 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0366 0.0691 0.238 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.15e-01 0.0983 0.079 0.238 NK L1
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00289 0.0673 0.238 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 9.49e-03 0.148 0.0567 0.238 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0511 0.0815 0.238 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 7.39e-01 0.0347 0.104 0.241 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 7.64e-01 0.019 0.0632 0.241 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 4.08e-01 0.0555 0.067 0.241 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 1.67e-01 -0.114 0.0824 0.241 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 4.03e-01 0.033 0.0393 0.241 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0554 0.0781 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 2.00e-01 -0.151 0.117 0.237 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 7.69e-01 0.0309 0.105 0.237 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 7.84e-01 0.0282 0.103 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 5.75e-02 -0.101 0.0529 0.237 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 6.97e-01 0.0404 0.104 0.237 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0883 0.0903 0.237 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 7.53e-01 0.0321 0.102 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0928 0.094 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 5.11e-01 0.0465 0.0705 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 7.45e-02 0.16 0.0892 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0404 0.0705 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0456 0.1 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 6.80e-02 0.19 0.104 0.241 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0694 0.103 0.241 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.94e-02 0.183 0.0775 0.241 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 2.44e-01 -0.114 0.0976 0.241 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0764 0.0672 0.241 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 3.71e-01 0.0898 0.1 0.241 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0402 0.0974 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.51e-01 -0.048 0.0804 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 9.10e-02 0.115 0.068 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 5.69e-01 0.0529 0.0928 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.76e-01 0.0728 0.0536 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 9.54e-01 0.00492 0.0844 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0413 0.0952 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 4.84e-01 0.0688 0.0981 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.99e-01 0.0676 0.065 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00654 0.0783 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 6.55e-02 0.144 0.0776 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 8.97e-01 0.0131 0.101 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 5.04e-02 0.195 0.0992 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 4.62e-01 0.069 0.0937 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 7.65e-02 0.153 0.0858 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 3.75e-03 -0.303 0.103 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 9.64e-01 0.00274 0.0615 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.48e-01 0.0576 0.0956 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 8.31e-01 0.0211 0.0987 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 7.38e-01 0.0175 0.0522 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 7.82e-02 0.108 0.0611 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0143 0.0813 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 2.18e-01 0.0702 0.0569 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 3.41e-01 0.0704 0.0737 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 3.70e-01 -0.086 0.0957 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 8.45e-01 0.0142 0.0721 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.88e-02 0.167 0.0704 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 3.54e-01 -0.083 0.0893 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.65e-01 0.0721 0.0517 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0496 0.0728 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 5.13e-01 0.0694 0.106 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.79e-01 0.0446 0.0802 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.95e-01 0.0935 0.0719 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 6.43e-01 0.0389 0.0839 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.67e-01 0.0736 0.0531 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 9.37e-01 0.00675 0.0855 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 6.61e-01 0.047 0.107 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 8.25e-01 0.0159 0.0721 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.66e-02 0.169 0.0756 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 5.38e-01 0.0588 0.0953 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.05e-01 0.0982 0.0603 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0847 0.0851 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 1.02e-01 -0.173 0.105 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0459 0.0737 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.98e-01 0.0703 0.0675 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 7.94e-01 0.0213 0.0813 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.03e-01 0.0939 0.0573 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 8.26e-01 0.0188 0.0853 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 3.02e-01 -0.119 0.115 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0639 0.0948 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 8.03e-03 0.212 0.0793 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 2.44e-01 0.124 0.106 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 6.00e-01 0.027 0.0514 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0797 0.0939 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 1.27e-01 0.163 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 1.20e-01 0.144 0.0922 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.51e-02 0.217 0.0961 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 2.45e-01 -0.129 0.111 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 3.00e-01 0.0709 0.0682 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 9.49e-01 0.00645 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.113 0.242 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 2.96e-01 0.0767 0.0733 0.242 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.53e-01 0.0898 0.0783 0.242 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 2.37e-01 -0.123 0.104 0.242 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.86e-01 0.0654 0.0492 0.242 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0277 0.0914 0.242 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 2.53e-01 0.119 0.103 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.44e-01 0.0492 0.0809 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 9.70e-01 0.00331 0.0884 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0694 0.0944 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 3.60e-01 0.0551 0.0602 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00525 0.0961 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 9.47e-01 0.00651 0.0977 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0139 0.0642 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.19e-01 0.106 0.0864 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0777 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 8.08e-02 0.105 0.06 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0454 0.0905 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 6.33e-01 0.0535 0.112 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00767 0.0823 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 8.80e-01 0.0144 0.0954 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 2.36e-01 -0.1 0.0845 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 7.56e-02 0.116 0.0647 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 8.48e-01 0.0202 0.105 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 2.33e-01 0.119 0.0996 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0373 0.0673 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.07e-01 0.108 0.0857 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0687 0.0801 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 1.19e-02 0.15 0.0592 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.59e-01 -0.053 0.0905 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 6.77e-01 0.0509 0.122 0.23 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0981 0.129 0.23 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 3.50e-01 0.101 0.108 0.23 PB L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 6.85e-01 0.0336 0.0825 0.23 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0797 0.0999 0.23 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.89e-01 0.065 0.12 0.23 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 2.71e-01 -0.12 0.109 0.243 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 7.38e-01 0.028 0.0835 0.243 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00267 0.0873 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0838 0.0805 0.243 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 9.90e-01 0.000647 0.0509 0.243 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0984 0.243 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0593 0.101 0.241 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0376 0.0952 0.241 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 9.85e-02 0.114 0.0687 0.241 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0895 0.109 0.241 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 3.37e-01 0.0581 0.0604 0.241 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0548 0.0923 0.241 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 8.06e-02 0.177 0.101 0.237 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.89e-01 0.0447 0.0826 0.237 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.60e-01 0.0819 0.0725 0.237 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 9.70e-01 0.0031 0.0815 0.237 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 5.20e-01 0.0607 0.0943 0.237 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0241 0.104 0.237 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.94e-02 -0.199 0.105 0.237 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 9.86e-01 0.00142 0.0807 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.83e-01 0.0323 0.0588 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 4.57e-01 0.0432 0.0579 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0515 0.0632 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0971 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0354 0.102 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0936 0.0673 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00301 0.0932 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.58e-01 0.0402 0.0684 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.18e-01 0.0786 0.0636 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0473 0.0608 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 1.59e-01 0.14 0.0994 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0878 0.109 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0509 0.0873 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 8.50e-01 0.0227 0.12 0.252 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00276 0.096 0.252 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 8.16e-01 0.0267 0.114 0.252 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 1.18e-01 0.166 0.105 0.252 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 5.94e-01 0.0315 0.059 0.252 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 4.59e-02 0.212 0.105 0.252 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0874 0.107 0.231 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 6.13e-01 0.0365 0.0721 0.231 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 6.71e-01 0.0306 0.072 0.231 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 3.76e-01 0.0552 0.0622 0.231 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 1.04e-01 -0.157 0.0964 0.231 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.109 0.231 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 6.40e-01 0.0435 0.0929 0.231 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 5.07e-02 0.198 0.101 0.24 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 8.98e-01 0.0111 0.0865 0.24 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 9.84e-02 0.0999 0.0602 0.24 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 4.86e-01 0.0534 0.0764 0.24 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 1.33e-01 0.146 0.097 0.24 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 8.06e-02 0.189 0.108 0.24 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 2.71e-01 -0.105 0.0954 0.24 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 7.47e-01 0.0374 0.116 0.243 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0135 0.0981 0.243 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0218 0.0899 0.243 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 6.37e-01 -0.043 0.0909 0.243 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0903 0.0892 0.243 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0407 0.0899 0.243 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0248 0.0923 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 4.37e-01 0.0771 0.0991 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0304 0.0847 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 2.65e-01 0.0765 0.0685 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0301 0.0905 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 9.99e-01 -7.16e-05 0.0598 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 8.77e-01 0.0157 0.101 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0587 0.0906 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0513 0.0847 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.31e-01 0.0949 0.0626 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 7.69e-01 0.0272 0.0924 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 4.41e-02 0.0974 0.0481 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 8.65e-01 0.0148 0.0865 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 9.79e-01 0.00197 0.0746 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 4.83e-01 0.0417 0.0594 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 3.77e-01 0.0492 0.0555 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0179 0.0549 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 2.06e-01 0.124 0.0975 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 4.24e-01 -0.084 0.105 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 2.48e-01 -0.076 0.0657 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 8.49e-01 -0.019 0.0995 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 5.08e-01 0.0462 0.0696 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.26e-01 0.0812 0.0528 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0141 0.0651 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -744982 sc-eQTL 6.64e-01 0.0411 0.0944 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -744959 sc-eQTL 3.30e-01 0.102 0.104 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 9.45e-01 0.00602 0.0872 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -825920 sc-eQTL 8.79e-01 0.0143 0.0936 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 728140 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0324 0.0654 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -455942 sc-eQTL 1.24e-01 0.125 0.0807 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -159830 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00195 0.0685 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 80375 sc-eQTL 6.87e-03 0.16 0.0586 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 79356 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0431 0.0834 0.237 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000226004 AL591468.1 1787 eQTL 1.04e-06 -0.125 0.0254 0.0 0.0 0.23


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -455942 8.35e-07 5.33e-07 1.05e-07 3.57e-07 9.26e-08 2.08e-07 5.54e-07 1.37e-07 4.18e-07 2.34e-07 6.56e-07 3.65e-07 7.53e-07 1.1e-07 2.14e-07 2.1e-07 2.98e-07 3.74e-07 1.77e-07 1.28e-07 1.91e-07 3.71e-07 3.3e-07 1.36e-07 7.71e-07 2.55e-07 2.56e-07 2.57e-07 3.83e-07 4.72e-07 2.93e-07 7.33e-08 4.28e-08 1.36e-07 3e-07 6.73e-08 1.05e-07 7.53e-08 4.55e-08 3.05e-08 8.81e-08 4.42e-07 2.63e-08 1.07e-08 1.19e-07 1.59e-08 1.1e-07 3.35e-09 5.15e-08
ENSG00000226004 AL591468.1 1787 5.89e-05 4.06e-05 8.23e-06 1.84e-05 7.7e-06 2.03e-05 6.08e-05 6.2e-06 4.13e-05 1.78e-05 5.1e-05 2.18e-05 6.54e-05 1.84e-05 8.96e-06 2.63e-05 2.51e-05 3.53e-05 1.17e-05 1.03e-05 2.37e-05 4.41e-05 4.31e-05 1.41e-05 5.75e-05 1.15e-05 1.85e-05 1.55e-05 4.44e-05 5.35e-05 2.65e-05 2.63e-06 4.66e-06 9.11e-06 1.61e-05 8.29e-06 4.59e-06 4.48e-06 6.87e-06 4.3e-06 2.06e-06 5.11e-05 5.36e-06 5.62e-07 3.92e-06 5.2e-06 5.05e-06 2.27e-06 1.91e-06