logo

Genes within 1Mb (chr6:137946907:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0278 0.0842 0.239 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0173 0.082 0.239 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.38e-01 0.0953 0.064 0.239 B L1
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 3.04e-01 -0.066 0.064 0.239 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 1.70e-01 0.0709 0.0515 0.239 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0454 0.0813 0.239 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 6.76e-01 0.0395 0.0944 0.239 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 9.58e-01 0.0029 0.0552 0.239 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.83e-02 0.138 0.0626 0.239 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0769 0.0595 0.239 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 1.17e-01 0.0875 0.0557 0.239 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.84e-01 0.0287 0.0704 0.239 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 2.17e-01 -0.126 0.102 0.239 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.32e-01 0.0393 0.0627 0.239 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.48e-02 0.163 0.0663 0.239 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 5.98e-01 0.0361 0.0684 0.239 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 1.69e-01 0.0726 0.0526 0.239 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0607 0.0775 0.239 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 4.50e-01 0.0774 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 1.85e-01 0.101 0.0757 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 6.01e-01 0.0377 0.072 0.232 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00108 0.0813 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 5.91e-01 0.0506 0.0939 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0549 0.0982 0.232 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0672 0.0827 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0142 0.0755 0.239 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 4.76e-01 0.0459 0.0643 0.239 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.54e-01 0.0595 0.0521 0.239 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 9.97e-01 0.000212 0.0546 0.239 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 1.31e-01 0.149 0.0981 0.239 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0451 0.103 0.239 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0829 0.0674 0.239 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 5.72e-01 0.0517 0.0913 0.236 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0446 0.0702 0.236 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.09e-01 0.101 0.0802 0.236 NK L1
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00415 0.0683 0.236 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 7.08e-03 0.156 0.0575 0.236 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0509 0.0828 0.236 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 6.53e-01 0.0474 0.105 0.239 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 7.53e-01 0.0202 0.0641 0.239 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 4.35e-01 0.0531 0.0679 0.239 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 1.34e-01 -0.125 0.0835 0.239 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 3.60e-01 0.0365 0.0398 0.239 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0593 0.0791 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 1.92e-01 -0.156 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 8.42e-01 0.0214 0.107 0.235 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 7.29e-01 0.0364 0.105 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 5.72e-02 -0.103 0.0539 0.235 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 6.11e-01 0.0538 0.106 0.235 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0848 0.092 0.235 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 7.87e-01 0.028 0.103 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 2.53e-01 -0.109 0.0953 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 5.11e-01 0.0471 0.0715 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 8.37e-02 0.157 0.0905 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0316 0.0715 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0469 0.101 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 6.46e-02 0.195 0.105 0.239 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0687 0.104 0.239 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.59e-02 0.191 0.0785 0.239 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 2.53e-01 -0.113 0.0989 0.239 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0625 0.0682 0.239 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 3.12e-01 0.103 0.101 0.239 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0458 0.0988 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.01e-01 -0.055 0.0816 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 9.49e-02 0.116 0.069 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 6.58e-01 0.0418 0.0942 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 1.32e-01 0.0822 0.0544 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 9.22e-01 0.00844 0.0856 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0443 0.0965 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.20e-01 0.0641 0.0995 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.52e-01 0.0757 0.0658 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0234 0.0793 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 6.25e-02 0.147 0.0786 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 7.98e-01 0.0263 0.103 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 4.45e-02 0.203 0.101 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.35e-01 0.059 0.095 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 8.41e-02 0.151 0.0871 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 4.87e-03 -0.298 0.105 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 9.14e-01 0.00671 0.0624 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 5.98e-01 0.0513 0.097 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 8.24e-01 0.0223 0.1 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 8.57e-01 0.00954 0.053 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 8.07e-02 0.109 0.0621 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0216 0.0826 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 2.12e-01 0.0723 0.0577 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 4.58e-01 0.0558 0.0749 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0892 0.0971 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 8.73e-01 0.0117 0.0732 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.60e-02 0.173 0.0714 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0843 0.0907 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 1.31e-01 0.0795 0.0525 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0515 0.0739 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 5.26e-01 0.0682 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 6.20e-01 0.0405 0.0814 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.92e-01 0.0954 0.073 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 6.34e-01 0.0406 0.0851 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 1.59e-01 0.0761 0.0538 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000837 0.0867 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 7.46e-01 0.0353 0.108 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 8.06e-01 0.0179 0.0731 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 3.08e-02 0.167 0.0767 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 4.95e-01 0.066 0.0966 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 8.20e-02 0.107 0.0611 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0728 0.0864 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 1.01e-01 -0.176 0.107 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0408 0.0749 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.74e-01 0.0751 0.0685 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 8.66e-01 0.014 0.0825 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 9.03e-02 0.099 0.0582 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 9.14e-01 0.00938 0.0866 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 3.03e-01 -0.12 0.116 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0794 0.096 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 9.92e-03 0.21 0.0805 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 3.27e-01 0.106 0.108 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 5.48e-01 0.0313 0.0521 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 2.99e-01 -0.099 0.0951 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 1.18e-01 0.169 0.108 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 1.33e-01 0.141 0.0935 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.04e-02 0.228 0.0974 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 2.35e-01 -0.134 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 2.36e-01 0.0821 0.0691 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 9.22e-01 0.01 0.103 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.114 0.24 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 2.88e-01 0.0792 0.0743 0.24 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.91e-01 0.0841 0.0794 0.24 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 2.01e-01 -0.135 0.105 0.24 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 1.67e-01 0.0691 0.0499 0.24 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0223 0.0927 0.24 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 2.49e-01 0.121 0.105 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.91e-01 0.0442 0.0821 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 9.38e-01 0.00703 0.0896 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0693 0.0958 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 3.41e-01 0.0583 0.061 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00741 0.0975 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 9.48e-01 0.0065 0.0992 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0206 0.0652 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.35e-01 0.104 0.0878 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 8.59e-01 0.014 0.0789 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 6.68e-02 0.112 0.0609 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0469 0.0919 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 6.92e-01 0.0451 0.114 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0131 0.0836 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 8.60e-01 0.0171 0.0969 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0966 0.0859 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 7.08e-02 0.119 0.0657 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 8.36e-01 0.0221 0.107 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 2.12e-01 0.126 0.101 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0433 0.0683 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.90e-01 0.114 0.087 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0678 0.0813 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 9.21e-03 0.158 0.06 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.02e-01 -0.048 0.0919 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 6.07e-01 0.0649 0.126 0.226 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0729 0.133 0.226 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.226 PB L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 6.77e-01 0.0356 0.0851 0.226 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0867 0.103 0.226 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 8.07e-01 0.0304 0.124 0.226 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 2.44e-01 -0.129 0.111 0.241 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 7.08e-01 0.0318 0.0847 0.241 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00775 0.0886 0.241 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 3.05e-01 -0.084 0.0817 0.241 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 9.77e-01 0.00151 0.0517 0.241 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 1.40e-01 -0.148 0.0997 0.241 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 5.85e-01 -0.056 0.102 0.239 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0465 0.0964 0.239 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.03e-01 0.114 0.0696 0.239 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0854 0.11 0.239 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 3.37e-01 0.0589 0.0612 0.239 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0587 0.0935 0.239 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 7.78e-02 0.181 0.102 0.234 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 7.18e-01 0.0304 0.0839 0.234 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.90e-01 0.0967 0.0736 0.234 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 9.60e-01 0.00418 0.0828 0.234 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 5.31e-01 0.0602 0.0958 0.234 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0251 0.106 0.234 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.10e-02 -0.201 0.107 0.234 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00616 0.082 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 7.18e-01 0.0216 0.0598 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 5.16e-01 0.0382 0.0588 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0496 0.0643 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 7.98e-01 0.0252 0.0987 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0501 0.103 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0925 0.0684 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000447 0.0946 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.69e-01 0.0396 0.0694 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.15e-01 0.0802 0.0645 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0437 0.0617 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 1.63e-01 0.141 0.101 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.111 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0437 0.0886 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 7.57e-01 0.0379 0.122 0.248 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 9.24e-01 0.00941 0.098 0.248 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 7.53e-01 0.0367 0.117 0.248 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 1.55e-01 0.154 0.108 0.248 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 6.09e-01 0.0309 0.0602 0.248 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.64e-02 0.2 0.108 0.248 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0803 0.109 0.229 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 6.81e-01 0.0302 0.0734 0.229 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 6.28e-01 0.0355 0.0731 0.229 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 2.78e-01 0.0688 0.0632 0.229 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 1.23e-01 -0.152 0.0981 0.229 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0221 0.111 0.229 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 5.18e-01 0.0611 0.0944 0.229 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 4.66e-02 0.205 0.102 0.238 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 9.88e-01 0.00132 0.0879 0.238 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 8.90e-02 0.104 0.0611 0.238 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 4.43e-01 0.0597 0.0777 0.238 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 1.37e-01 0.147 0.0986 0.238 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 8.66e-02 0.188 0.109 0.238 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 2.38e-01 -0.115 0.0969 0.238 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 8.53e-01 0.0219 0.118 0.24 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00554 0.1 0.24 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0139 0.0918 0.24 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0338 0.0928 0.24 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0905 0.0911 0.24 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0408 0.0917 0.24 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0224 0.0942 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 4.51e-01 0.0759 0.101 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0378 0.0859 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 2.60e-01 0.0785 0.0695 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0326 0.0918 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 8.08e-01 0.0147 0.0606 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 8.10e-01 0.0247 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0636 0.0919 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0582 0.0859 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.25e-01 0.0978 0.0635 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 9.04e-01 0.0113 0.0937 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 3.11e-02 0.106 0.0487 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 8.00e-01 0.0222 0.0877 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00351 0.0758 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.69e-01 0.0344 0.0603 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 4.28e-01 0.0449 0.0564 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0134 0.0558 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 1.81e-01 0.133 0.099 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0982 0.107 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 2.82e-01 -0.072 0.0668 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0171 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.92e-01 0.0379 0.0706 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.10e-01 0.086 0.0536 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00966 0.066 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -745664 sc-eQTL 6.48e-01 0.0439 0.0958 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -745641 sc-eQTL 3.81e-01 0.0929 0.106 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 9.10e-01 0.01 0.0885 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -826602 sc-eQTL 8.86e-01 0.0136 0.0951 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 727458 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0396 0.0664 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -456624 sc-eQTL 1.22e-01 0.127 0.082 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -160512 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00229 0.0696 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 79693 sc-eQTL 5.08e-03 0.168 0.0595 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 78674 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0426 0.0847 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000226004 AL591468.1 1105 eQTL 7.97e-07 -0.127 0.0256 0.0 0.0 0.229

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -456624 5.14e-07 1.7e-07 6.41e-08 2.45e-07 1.02e-07 1.25e-07 2.5e-07 5.56e-08 1.75e-07 1.03e-07 1.69e-07 1.31e-07 2.94e-07 8.55e-08 6.12e-08 9.35e-08 5.42e-08 2.04e-07 7.09e-08 5.61e-08 1.33e-07 1.98e-07 1.75e-07 3.51e-08 2.99e-07 1.26e-07 1.31e-07 1.42e-07 1.37e-07 1.38e-07 1.22e-07 3.9e-08 4.34e-08 9.81e-08 7.55e-08 3.05e-08 3.91e-08 8.51e-08 6.28e-08 3.82e-08 6.21e-08 2.41e-07 3.35e-08 1.11e-08 3.41e-08 9.86e-09 7.12e-08 2.2e-09 4.98e-08
ENSG00000226004 AL591468.1 1105 8.07e-05 5.73e-05 9.9e-06 2.53e-05 1.03e-05 2.67e-05 7.39e-05 1.02e-05 6.25e-05 3.18e-05 7.93e-05 3.17e-05 8.9e-05 2.57e-05 1.24e-05 4.66e-05 3.45e-05 4.77e-05 1.34e-05 1.31e-05 2.83e-05 7.56e-05 5.7e-05 1.74e-05 8.19e-05 1.81e-05 2.93e-05 2.43e-05 5.59e-05 4.5e-05 4e-05 3.79e-06 6.83e-06 1.07e-05 2.01e-05 1.01e-05 5.94e-06 6.43e-06 8.83e-06 5.87e-06 2.59e-06 6.17e-05 7.02e-06 6.17e-07 5.6e-06 7.37e-06 8.77e-06 3.62e-06 3.26e-06