logo

Genes within 1Mb (chr6:137940656:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 7.71e-01 0.0279 0.0957 0.16 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 4.03e-01 0.0779 0.093 0.16 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.20e-02 0.167 0.0721 0.16 B L1
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0907 0.0727 0.16 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0382 0.0587 0.16 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0416 0.0924 0.16 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0429 0.107 0.16 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 8.25e-01 0.0138 0.0625 0.16 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 6.35e-03 0.194 0.0704 0.16 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 8.36e-01 -0.014 0.0675 0.16 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0437 0.0632 0.16 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 2.50e-01 0.0916 0.0794 0.16 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 1.38e-01 -0.172 0.115 0.16 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 3.89e-01 0.0612 0.0708 0.16 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.19e-03 0.23 0.0742 0.16 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 5.81e-01 0.0427 0.0773 0.16 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0237 0.0597 0.16 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 8.54e-01 0.0161 0.0877 0.16 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 5.86e-01 0.063 0.116 0.151 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 4.42e-01 0.066 0.0857 0.151 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.01e-01 0.104 0.081 0.151 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.58e-01 -0.129 0.0912 0.151 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 8.30e-01 0.0228 0.106 0.151 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0919 0.111 0.151 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0903 0.0932 0.151 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 2.41e-01 -0.1 0.0852 0.16 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0201 0.0729 0.16 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.96e-01 0.0764 0.0589 0.16 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 7.82e-02 -0.109 0.0614 0.16 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 7.25e-01 0.0409 0.116 0.16 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 3.00e-02 -0.166 0.0758 0.16 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 6.42e-01 0.0483 0.104 0.159 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 1.01e-01 -0.131 0.0794 0.159 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 6.24e-02 0.17 0.0908 0.159 NK L1
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 7.84e-01 0.0213 0.0777 0.159 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00936 0.0665 0.159 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 6.56e-01 -0.042 0.0942 0.159 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 2.42e-01 0.14 0.12 0.16 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0441 0.073 0.16 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.26e-01 0.118 0.077 0.16 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 2.93e-02 -0.207 0.0945 0.16 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0596 0.0453 0.16 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0655 0.0901 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 9.57e-01 0.00769 0.142 0.156 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 5.97e-01 0.0671 0.127 0.156 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 9.36e-01 0.01 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0771 0.0643 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 9.15e-01 0.0134 0.125 0.156 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0262 0.109 0.156 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 2.33e-01 0.141 0.118 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0306 0.109 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.49e-01 0.118 0.0814 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 1.29e-01 0.158 0.104 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.25e-01 -0.125 0.0812 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0645 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 8.57e-03 0.315 0.119 0.159 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0555 0.119 0.159 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 5.59e-04 0.31 0.0883 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 2.48e-01 -0.131 0.113 0.159 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.04e-02 -0.199 0.0768 0.159 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 4.16e-01 0.0945 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0202 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.23e-01 0.00912 0.0937 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.01e-02 0.204 0.0785 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 9.29e-01 0.00962 0.108 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0501 0.0626 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0247 0.0982 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0825 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 4.89e-01 0.0521 0.0751 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 9.01e-01 0.0113 0.0904 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 6.38e-01 0.0426 0.0903 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 7.63e-01 0.0353 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 6.58e-02 0.213 0.115 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 1.61e-01 0.153 0.108 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 3.45e-02 0.212 0.0994 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 8.75e-03 -0.319 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 2.61e-02 -0.158 0.0705 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0257 0.111 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0637 0.113 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 5.34e-01 0.0371 0.0595 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 7.56e-03 0.186 0.0691 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 4.29e-01 0.0735 0.0927 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0475 0.065 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 1.37e-01 0.125 0.0839 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 2.66e-01 -0.123 0.111 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.41e-01 0.00621 0.0835 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.13e-02 0.208 0.0813 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 5.24e-01 -0.066 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0384 0.0601 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 6.77e-01 0.0352 0.0842 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 6.29e-01 0.0593 0.123 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.13e-01 0.0102 0.093 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.28e-02 0.189 0.0826 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 3.85e-01 0.0846 0.0971 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0384 0.0617 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 3.84e-01 0.0862 0.0988 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 9.85e-01 0.00235 0.124 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0678 0.0835 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.28e-02 0.201 0.0876 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 7.77e-01 0.0313 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0228 0.0703 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 3.08e-01 -0.101 0.0987 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 1.01e-01 -0.197 0.12 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 8.04e-01 0.0209 0.0839 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.08e-01 0.0968 0.0766 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0153 0.0924 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 8.07e-01 -0.016 0.0656 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 3.94e-01 0.0827 0.0969 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 6.03e-01 -0.069 0.133 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0342 0.11 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.40e-01 0.137 0.0927 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 5.98e-01 0.0649 0.123 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0822 0.0591 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 9.68e-01 0.00442 0.109 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 8.97e-02 0.206 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.35e-03 0.272 0.104 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.28e-03 0.352 0.108 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0703 0.126 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0506 0.0777 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 9.89e-01 0.00161 0.115 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 3.47e-01 0.123 0.131 0.16 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 7.00e-01 0.0328 0.085 0.16 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.51e-01 0.13 0.0904 0.16 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 2.03e-01 -0.153 0.12 0.16 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0272 0.0572 0.16 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0701 0.106 0.16 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 1.81e-01 0.159 0.119 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 8.75e-01 0.0146 0.093 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0179 0.101 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0241 0.109 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 8.29e-01 -0.015 0.0692 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 5.52e-01 0.0656 0.11 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0585 0.113 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 1.68e-01 -0.102 0.0737 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 4.49e-02 0.2 0.099 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 7.67e-01 0.0266 0.0896 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0536 0.0696 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0312 0.104 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 1.09e-01 0.209 0.13 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 2.48e-01 -0.111 0.0956 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 8.97e-01 0.0144 0.111 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0731 0.0987 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0819 0.0758 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 9.55e-01 0.00685 0.122 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 4.83e-01 0.0801 0.114 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 1.21e-01 -0.119 0.0765 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 7.94e-02 0.172 0.0976 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0365 0.0915 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0217 0.0686 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0516 0.103 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 8.44e-01 0.0287 0.146 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.148 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.65e-01 0.18 0.128 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0356 0.0987 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0526 0.12 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 4.89e-01 0.0996 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0561 0.125 0.161 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.22e-01 0.00934 0.0951 0.161 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.93e-01 0.104 0.0991 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 1.91e-01 -0.12 0.0915 0.161 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0569 0.0578 0.161 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0635 0.112 0.161 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 4.19e-01 -0.095 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0624 0.111 0.16 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.01e-02 0.186 0.0793 0.16 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 7.63e-01 0.0382 0.126 0.16 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 7.15e-02 -0.126 0.0698 0.16 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 1.77e-01 -0.145 0.107 0.16 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 5.26e-01 0.0731 0.115 0.156 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.49e-01 0.00606 0.0937 0.156 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.13e-01 0.103 0.0822 0.156 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 2.53e-01 -0.106 0.0921 0.156 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 7.96e-01 0.0278 0.107 0.156 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0899 0.118 0.156 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 8.19e-02 -0.209 0.119 0.156 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 2.60e-01 -0.104 0.0925 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0211 0.0676 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 3.92e-01 0.0571 0.0666 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 2.57e-02 -0.162 0.072 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 8.98e-01 0.015 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 1.10e-02 -0.196 0.0766 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0153 0.107 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0328 0.0786 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.27e-01 0.0885 0.073 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.21e-01 -0.108 0.0694 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 9.50e-02 0.191 0.114 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 2.54e-01 -0.143 0.125 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0783 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 3.29e-01 0.134 0.137 0.167 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 2.50e-01 -0.127 0.11 0.167 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.75e-01 0.143 0.13 0.167 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 1.52e-01 0.174 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 6.63e-02 -0.124 0.0669 0.167 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 7.51e-02 0.217 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 7.18e-01 0.0445 0.123 0.151 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 2.63e-01 0.0924 0.0824 0.151 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 4.43e-01 0.0633 0.0823 0.151 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0867 0.0711 0.151 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 2.62e-01 -0.124 0.111 0.151 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 4.34e-01 0.0975 0.124 0.151 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0378 0.106 0.151 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 1.38e-01 0.173 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0835 0.099 0.158 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.89e-03 0.205 0.068 0.158 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 8.35e-01 0.0183 0.0878 0.158 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 7.28e-01 0.039 0.112 0.158 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 9.76e-02 0.206 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0417 0.11 0.158 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 8.02e-01 0.0333 0.132 0.158 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 4.99e-01 -0.076 0.112 0.158 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 7.31e-01 0.0355 0.103 0.158 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 2.96e-02 -0.225 0.103 0.158 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0374 0.102 0.158 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 6.34e-01 0.049 0.103 0.158 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0501 0.106 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 1.48e-02 0.278 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.50e-01 0.00619 0.098 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 1.09e-02 0.201 0.0782 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0236 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0799 0.0689 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 6.44e-01 0.054 0.117 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 7.27e-01 -0.037 0.106 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 6.68e-01 0.0424 0.0987 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 5.19e-02 0.142 0.0726 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 9.96e-01 0.000535 0.108 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 9.12e-01 0.00626 0.0566 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00293 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0932 0.086 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0298 0.0687 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.82e-01 0.0692 0.0641 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0976 0.0632 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 2.60e-01 0.128 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0719 0.121 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 2.85e-02 -0.166 0.0753 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00597 0.113 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00228 0.079 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 3.36e-02 0.128 0.0596 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 1.39e-01 -0.109 0.0734 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -751915 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00607 0.107 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -751892 sc-eQTL 1.44e-01 0.173 0.118 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0321 0.0989 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00561 0.109 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 721207 sc-eQTL 1.12e-01 -0.12 0.0754 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -462875 sc-eQTL 2.54e-02 0.209 0.093 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -166763 sc-eQTL 6.16e-01 0.0399 0.0793 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 73442 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00443 0.0691 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 72423 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0461 0.0967 0.157 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -832853 pQTL 0.0444 -0.0886 0.044 0.0 0.0 0.154
ENSG00000220412 AL356234.1 233455 eQTL 0.00784 -0.0866 0.0325 0.00266 0.0 0.152
ENSG00000226004 AL591468.1 -5146 eQTL 0.000118 -0.117 0.0303 0.0 0.0 0.152

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 AL591468.1 -5146 9.99e-05 2.67e-05 3.79e-06 1.35e-05 4.22e-06 1.95e-05 3.87e-05 3.72e-06 2.29e-05 1.27e-05 2.83e-05 1.08e-05 3.92e-05 1.03e-05 6.5e-06 1.67e-05 1.58e-05 3.22e-05 6.64e-06 5.11e-06 1.4e-05 2.79e-05 3.2e-05 8.06e-06 4.01e-05 7.14e-06 1.12e-05 9.99e-06 2.54e-05 2.47e-05 1.33e-05 1.33e-06 1.88e-06 5.89e-06 9.4e-06 4.07e-06 1.91e-06 2.38e-06 3.64e-06 2.69e-06 1.63e-06 3.84e-05 5.6e-06 1.38e-07 2.66e-06 2.68e-06 3.62e-06 9.83e-07 9.89e-07