Genes within 1Mb (chr6:137937417:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 7.48e-01 0.0277 0.0859 0.222 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 7.39e-01 0.0279 0.0836 0.222 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 3.55e-02 0.137 0.0649 0.222 B L1
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0968 0.0651 0.222 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0345 0.0527 0.222 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.36e-01 0.00668 0.083 0.222 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 6.85e-01 0.0389 0.0958 0.222 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00325 0.0561 0.222 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.02e-02 0.164 0.0633 0.222 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 8.17e-01 0.014 0.0606 0.222 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0705 0.0566 0.222 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.37e-01 0.0337 0.0715 0.222 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 6.66e-01 -0.045 0.104 0.222 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 4.82e-01 0.045 0.0638 0.222 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.43e-03 0.216 0.0667 0.222 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 3.98e-01 0.0588 0.0695 0.222 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0439 0.0537 0.222 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 7.57e-01 0.0245 0.0789 0.222 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 1.40e-01 0.155 0.105 0.216 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0238 0.0782 0.216 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00962 0.0741 0.216 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 1.88e-01 -0.11 0.0832 0.216 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0224 0.0967 0.216 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 2.07e-01 -0.127 0.101 0.216 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.37e-01 0.00673 0.0852 0.216 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0951 0.0767 0.222 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0652 0.0655 0.222 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00147 0.0533 0.222 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 4.29e-02 -0.112 0.0552 0.222 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 1.69e-01 0.138 0.1 0.222 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0151 0.105 0.222 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 2.64e-01 -0.077 0.0688 0.222 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 2.38e-01 0.11 0.0929 0.221 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 6.00e-02 -0.134 0.0711 0.221 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 9.98e-02 0.135 0.0816 0.221 NK L1
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 9.35e-01 0.00569 0.0697 0.221 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 5.75e-01 0.0335 0.0596 0.221 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.50e-01 0.0385 0.0845 0.221 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 3.54e-01 0.101 0.109 0.222 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.18e-01 -0.043 0.0664 0.222 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.91e-01 0.0921 0.0702 0.222 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 8.25e-03 -0.228 0.0856 0.222 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.91e-02 -0.0851 0.041 0.222 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.25e-01 0.00775 0.0821 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 3.32e-01 0.123 0.126 0.224 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.32e-01 0.0707 0.113 0.224 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0429 0.111 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 5.75e-02 -0.109 0.057 0.224 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 6.44e-01 0.0517 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.02e-01 -0.012 0.0975 0.224 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 5.06e-01 0.0708 0.106 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0556 0.0983 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 7.43e-02 0.131 0.0731 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 5.68e-01 0.0536 0.0937 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.14e-02 -0.158 0.0728 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 3.02e-01 0.108 0.104 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 5.13e-02 0.212 0.108 0.222 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0834 0.107 0.222 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 2.57e-04 0.295 0.0794 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 2.58e-01 -0.116 0.102 0.222 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 1.73e-04 -0.26 0.068 0.222 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 4.04e-01 0.0874 0.105 0.222 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0328 0.102 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000772 0.0841 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 5.65e-02 0.136 0.0709 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 9.95e-01 0.000559 0.097 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0303 0.0562 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0669 0.088 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0808 0.0989 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 2.61e-01 0.115 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 2.16e-01 0.0838 0.0675 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 5.23e-01 0.052 0.0813 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0161 0.0813 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00322 0.105 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 9.26e-02 0.177 0.105 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.61e-01 0.00486 0.0988 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 4.17e-02 0.185 0.0902 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 3.68e-02 -0.231 0.11 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.93e-02 -0.133 0.0641 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00752 0.101 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 5.40e-01 0.0621 0.101 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.66e-01 0.0308 0.0535 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.80e-02 0.149 0.0624 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 6.98e-01 0.0325 0.0835 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0755 0.0583 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 4.56e-01 0.0565 0.0758 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0506 0.099 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.27e-01 0.0471 0.0744 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.10e-02 0.186 0.0726 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 8.54e-01 0.017 0.0924 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0532 0.0536 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.81e-01 0.031 0.0752 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0499 0.111 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0514 0.0839 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 4.35e-02 0.152 0.0748 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 4.45e-01 0.0671 0.0877 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0345 0.0557 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 5.08e-01 0.0592 0.0893 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00567 0.115 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0943 0.0769 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 7.03e-02 0.148 0.0812 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 7.23e-01 0.0362 0.102 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0162 0.0649 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0636 0.0912 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00725 0.109 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0291 0.0763 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 4.41e-02 0.14 0.0693 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0084 0.0841 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0568 0.0596 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.41e-01 0.0412 0.0882 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 8.20e-01 0.0277 0.121 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 4.13e-01 0.0821 0.1 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 4.07e-02 0.174 0.0844 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 1.69e-01 0.155 0.112 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0615 0.0541 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 8.62e-01 0.0173 0.0994 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 3.97e-01 0.0956 0.113 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.09e-02 0.165 0.097 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.76e-04 0.378 0.0989 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00176 0.117 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0578 0.0719 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 8.27e-01 0.0234 0.107 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 4.46e-01 0.0913 0.12 0.223 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 8.60e-01 0.0137 0.0777 0.223 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 8.08e-02 0.145 0.0824 0.223 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 2.29e-01 -0.132 0.109 0.223 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0753 0.052 0.223 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.57e-01 -0.043 0.0966 0.223 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 7.64e-02 0.19 0.107 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0418 0.084 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0568 0.0916 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0455 0.0981 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0324 0.0625 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 2.63e-01 0.112 0.0994 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 5.85e-01 0.055 0.101 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.30e-02 -0.128 0.0656 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.01e-01 0.146 0.0889 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0461 0.0801 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 9.77e-01 0.00182 0.0624 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 8.41e-01 0.0187 0.0934 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 2.46e-01 0.139 0.119 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 7.95e-02 -0.154 0.0872 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 8.60e-01 -0.018 0.102 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 3.89e-01 -0.078 0.0903 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0501 0.0695 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 3.46e-01 0.106 0.112 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 5.25e-01 0.0665 0.104 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 6.70e-02 -0.129 0.0699 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 5.71e-02 0.171 0.0893 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 9.82e-01 0.00186 0.0839 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 7.89e-01 0.0169 0.0629 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 7.17e-01 0.0345 0.0948 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0594 0.127 0.211 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00974 0.135 0.211 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.82e-01 0.151 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0415 0.0861 0.211 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0346 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 8.29e-01 0.0271 0.126 0.211 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 2.69e-01 -0.126 0.113 0.224 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.02e-01 0.0107 0.0867 0.224 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 2.26e-01 0.11 0.0903 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 4.75e-02 -0.165 0.083 0.224 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0513 0.0527 0.224 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 4.53e-01 -0.077 0.102 0.224 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0241 0.107 0.222 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0509 0.1 0.222 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 3.62e-02 0.152 0.0722 0.222 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 5.78e-01 0.0639 0.115 0.222 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0962 0.0635 0.222 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 1.48e-01 -0.141 0.097 0.222 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 3.21e-01 0.106 0.106 0.224 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.38e-01 0.00671 0.0867 0.224 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0245 0.0763 0.224 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0874 0.0852 0.224 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0851 0.0988 0.224 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0803 0.109 0.224 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 1.55e-01 -0.158 0.111 0.224 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0705 0.0838 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0553 0.061 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0256 0.0602 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 8.71e-03 -0.171 0.0648 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 6.10e-01 0.0515 0.101 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0505 0.106 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0969 0.07 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0199 0.0965 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0407 0.0708 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 2.22e-01 0.0806 0.0658 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 2.62e-02 -0.139 0.0623 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 7.33e-02 0.185 0.103 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.113 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0441 0.0904 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 8.65e-01 -0.022 0.13 0.23 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 3.97e-02 -0.212 0.102 0.23 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.53e-01 0.176 0.123 0.23 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 6.44e-01 0.0531 0.115 0.23 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 8.48e-02 -0.11 0.0631 0.23 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 5.52e-02 0.22 0.114 0.23 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 9.23e-01 0.0108 0.112 0.213 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 6.98e-01 0.0292 0.0752 0.213 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00234 0.075 0.213 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0538 0.0648 0.213 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0864 0.101 0.213 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 9.92e-01 0.0011 0.113 0.213 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.14e-01 0.0104 0.0968 0.213 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 2.44e-01 0.122 0.104 0.219 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 2.34e-01 -0.106 0.0885 0.219 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 6.77e-03 0.167 0.0611 0.219 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 5.59e-01 0.046 0.0786 0.219 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 8.69e-01 0.0166 0.1 0.219 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 1.23e-01 0.172 0.111 0.219 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.53e-01 0.0442 0.0983 0.219 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 3.75e-02 0.246 0.117 0.229 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 5.73e-02 -0.191 0.0998 0.229 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0643 0.0924 0.229 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 2.31e-02 -0.211 0.092 0.229 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0186 0.0921 0.229 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0295 0.0925 0.229 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 4.29e-01 0.0752 0.0948 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 3.05e-02 0.221 0.102 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00492 0.0877 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 7.07e-03 0.19 0.0699 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0584 0.0936 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 8.19e-02 -0.107 0.0614 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 7.43e-02 0.186 0.104 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0147 0.0949 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 8.33e-01 0.0187 0.0887 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 1.01e-01 0.108 0.0654 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 7.91e-01 0.0256 0.0966 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 8.77e-01 0.00786 0.0508 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0429 0.0904 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0815 0.0777 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0672 0.0618 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00139 0.058 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 4.76e-02 -0.113 0.0568 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 1.01e-01 0.167 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 4.55e-01 -0.082 0.109 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0866 0.0685 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0436 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0662 0.0714 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 8.26e-02 0.0945 0.0542 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0646 0.0667 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -755154 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00383 0.097 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -755131 sc-eQTL 5.04e-01 0.0717 0.107 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 9.57e-01 0.00483 0.0895 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836092 sc-eQTL 5.40e-01 0.0596 0.0971 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717968 sc-eQTL 6.09e-02 -0.127 0.0674 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466114 sc-eQTL 4.19e-02 0.171 0.0834 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -170002 sc-eQTL 8.26e-01 0.0156 0.0711 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 70203 sc-eQTL 4.92e-01 0.0425 0.0618 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 69184 sc-eQTL 6.78e-01 0.036 0.0866 0.22 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000220412 AL356234.1 230216 eQTL 0.0167 -0.0668 0.0279 0.00181 0.0 0.235
ENSG00000226004 AL591468.1 -8385 eQTL 1.77e-07 -0.136 0.0258 0.0 0.0 0.235


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 AL591468.1 -8385 1.8e-05 2.58e-05 4.32e-06 1.3e-05 3.55e-06 1e-05 3.16e-05 3.51e-06 2.07e-05 1.07e-05 2.86e-05 1.08e-05 3.85e-05 1.05e-05 5.59e-06 1.26e-05 1.2e-05 1.75e-05 6.64e-06 5.35e-06 9.95e-06 2.24e-05 2.27e-05 6.86e-06 3.43e-05 5.9e-06 9.65e-06 9.13e-06 2.5e-05 2.35e-05 1.44e-05 1.67e-06 2.29e-06 5.67e-06 8.83e-06 4.68e-06 2.68e-06 2.98e-06 3.99e-06 2.92e-06 1.63e-06 2.75e-05 2.66e-06 3.24e-07 1.99e-06 2.97e-06 3.43e-06 1.5e-06 1.37e-06