logo

Genes within 1Mb (chr6:137936831:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 8.85e-01 0.0137 0.0944 0.16 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 2.20e-01 0.113 0.0916 0.16 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 2.27e-02 0.163 0.0712 0.16 B L1
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 1.23e-01 -0.111 0.0716 0.16 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0238 0.058 0.16 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 9.64e-01 0.00415 0.0912 0.16 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0407 0.105 0.16 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 6.37e-01 0.029 0.0614 0.16 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 5.62e-03 0.194 0.0692 0.16 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00335 0.0665 0.16 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0365 0.0622 0.16 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 1.42e-01 0.115 0.078 0.16 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 1.63e-01 -0.159 0.114 0.16 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 1.88e-01 0.0917 0.0695 0.16 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.13e-03 0.24 0.0728 0.16 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 4.41e-01 0.0587 0.076 0.16 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0181 0.0587 0.16 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 8.21e-01 0.0195 0.0863 0.16 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.114 0.151 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 5.21e-01 0.0544 0.0845 0.151 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.44e-01 0.117 0.0797 0.151 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 2.44e-01 -0.105 0.09 0.151 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0338 0.104 0.151 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0847 0.109 0.151 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 1.96e-01 -0.119 0.0917 0.151 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0659 0.0843 0.16 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00891 0.0719 0.16 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 2.21e-01 0.0715 0.0582 0.16 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 8.04e-02 -0.106 0.0606 0.16 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 2.97e-01 0.115 0.11 0.16 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 5.87e-01 0.0623 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 2.48e-02 -0.169 0.0747 0.16 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 4.85e-01 0.0716 0.102 0.159 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 1.75e-01 -0.107 0.0784 0.159 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 5.64e-02 0.172 0.0895 0.159 NK L1
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 5.04e-01 0.0512 0.0765 0.159 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 8.52e-01 0.0122 0.0656 0.159 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0385 0.0929 0.159 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 5.07e-02 0.231 0.117 0.16 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0242 0.0722 0.16 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 5.45e-02 0.147 0.0759 0.16 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 1.27e-01 -0.144 0.0939 0.16 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0512 0.0448 0.16 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0816 0.089 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0136 0.139 0.156 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 3.66e-01 0.112 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 9.37e-01 0.00971 0.122 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0797 0.063 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0229 0.123 0.156 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 9.88e-01 0.00159 0.107 0.156 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 1.44e-01 0.169 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0234 0.107 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.62e-01 0.112 0.0801 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 1.17e-01 0.16 0.102 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 1.74e-01 -0.109 0.08 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0422 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 1.63e-02 0.285 0.118 0.159 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0117 0.118 0.159 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.16e-03 0.288 0.0875 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 1.67e-01 -0.155 0.111 0.159 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 1.57e-02 -0.185 0.0759 0.159 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 3.88e-01 0.0989 0.114 0.159 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0306 0.112 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 7.18e-01 0.0333 0.0921 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 2.20e-02 0.179 0.0774 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 9.72e-01 0.0038 0.106 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0327 0.0616 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 9.20e-01 0.00974 0.0966 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 3.04e-01 -0.111 0.108 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 1.67e-01 0.154 0.111 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 2.81e-01 0.0799 0.0738 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0209 0.089 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 8.39e-01 0.0181 0.0889 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 4.52e-01 0.0865 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 7.33e-02 0.204 0.113 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 2.05e-01 0.135 0.106 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 4.29e-02 0.199 0.0976 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 1.50e-02 -0.29 0.118 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 1.97e-02 -0.162 0.0691 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0233 0.109 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0846 0.111 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 4.16e-01 0.0477 0.0585 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 7.33e-03 0.184 0.068 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 2.87e-01 0.0973 0.0911 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0422 0.064 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 9.37e-02 0.139 0.0824 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0946 0.109 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 7.35e-01 0.0277 0.0819 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 8.27e-03 0.213 0.0797 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0266 0.102 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0204 0.059 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 4.06e-01 0.0688 0.0826 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 7.71e-01 0.0353 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 7.05e-01 0.0347 0.0915 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 2.90e-02 0.179 0.0814 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 4.77e-01 0.0681 0.0957 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0321 0.0608 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 1.81e-01 0.13 0.0971 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 8.30e-01 0.0264 0.122 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0222 0.0824 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.46e-02 0.212 0.0862 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 6.49e-01 0.0497 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0086 0.0694 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 2.98e-01 -0.102 0.0973 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 1.14e-01 -0.187 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 5.58e-01 0.0485 0.0826 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.06e-01 0.122 0.0753 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 7.40e-01 0.0303 0.0911 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0157 0.0647 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 3.53e-01 0.0889 0.0954 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0455 0.131 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00178 0.108 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.48e-01 0.133 0.0914 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 6.73e-01 0.0512 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 1.07e-01 -0.094 0.0581 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0205 0.107 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 6.52e-02 0.219 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 3.45e-03 0.299 0.101 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.61e-03 0.338 0.106 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0615 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0605 0.0759 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 8.75e-01 0.0178 0.113 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 2.44e-01 0.15 0.129 0.16 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 4.36e-01 0.0652 0.0836 0.16 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 7.76e-02 0.158 0.0888 0.16 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 3.03e-01 -0.122 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0264 0.0563 0.16 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0979 0.104 0.16 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 2.28e-01 0.141 0.117 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 8.34e-01 0.0192 0.0915 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 7.11e-01 0.0371 0.0998 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00511 0.107 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 9.54e-01 0.00396 0.0681 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 7.66e-01 0.0324 0.109 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 6.47e-01 -0.051 0.111 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0859 0.0728 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 5.34e-02 0.19 0.0978 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 6.20e-01 0.0439 0.0884 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0312 0.0687 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0292 0.103 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 1.67e-01 0.177 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0896 0.0938 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 9.41e-01 0.00811 0.109 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 6.21e-01 -0.048 0.0968 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0412 0.0745 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00274 0.12 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 2.95e-01 0.118 0.112 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0967 0.0756 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 9.38e-02 0.162 0.0963 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0128 0.0904 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 9.98e-01 0.000145 0.0677 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0389 0.102 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 9.23e-01 0.014 0.146 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0481 0.154 0.148 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.48e-01 0.187 0.128 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 8.79e-01 0.0151 0.0987 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 8.55e-01 -0.022 0.12 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 4.80e-01 0.102 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0139 0.123 0.161 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 7.44e-01 0.0307 0.0937 0.161 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 3.26e-01 0.0962 0.0977 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0863 0.0903 0.161 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0478 0.057 0.161 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0847 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0478 0.116 0.16 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0556 0.109 0.16 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.82e-02 0.186 0.0781 0.16 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 7.65e-01 0.0373 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 9.54e-02 -0.115 0.0688 0.16 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 2.39e-01 -0.124 0.105 0.16 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 3.16e-01 0.114 0.113 0.156 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 6.50e-01 0.0419 0.0923 0.156 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.46e-01 0.118 0.0808 0.156 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0876 0.0908 0.156 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0213 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0605 0.116 0.156 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 7.79e-02 -0.208 0.118 0.156 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0806 0.0912 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000734 0.0666 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 3.95e-01 0.0558 0.0655 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 2.25e-02 -0.163 0.0708 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0152 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 7.39e-01 0.0384 0.115 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 1.01e-02 -0.196 0.0753 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 9.30e-01 0.00932 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0351 0.0775 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 2.68e-01 0.08 0.072 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 7.41e-02 -0.123 0.0684 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 8.10e-02 0.197 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 2.59e-01 -0.14 0.123 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0987 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 2.56e-01 0.153 0.134 0.167 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 2.91e-01 -0.113 0.107 0.167 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 3.06e-01 0.131 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 9.53e-02 0.198 0.118 0.167 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 9.37e-02 -0.11 0.0655 0.167 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 1.12e-01 0.19 0.119 0.167 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 4.93e-01 0.0825 0.12 0.151 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 1.92e-01 0.105 0.0806 0.151 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 4.14e-01 0.066 0.0806 0.151 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0826 0.0697 0.151 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.109 0.151 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 4.99e-01 0.0826 0.122 0.151 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0209 0.104 0.151 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 7.81e-02 0.201 0.113 0.158 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0996 0.0969 0.158 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 4.37e-03 0.192 0.0667 0.158 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 6.29e-01 0.0416 0.0859 0.158 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 8.26e-01 0.0241 0.11 0.158 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 6.57e-02 0.223 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0365 0.107 0.158 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 4.29e-01 0.102 0.128 0.158 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 1.84e-01 -0.145 0.108 0.158 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 7.77e-01 0.0283 0.0999 0.158 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 3.83e-02 -0.208 0.0997 0.158 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 6.09e-01 -0.051 0.0994 0.158 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 9.90e-01 0.00125 0.1 0.158 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 2.69e-01 -0.113 0.102 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 1.50e-02 0.274 0.112 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 6.80e-01 0.0399 0.0967 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 1.34e-02 0.193 0.0773 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0422 0.103 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0628 0.0681 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 5.48e-01 0.0694 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0596 0.104 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 4.86e-01 0.0677 0.0971 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 6.11e-02 0.135 0.0715 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0253 0.106 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 7.85e-01 0.0152 0.0556 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 6.55e-01 0.0443 0.099 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0631 0.0849 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0147 0.0677 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 3.27e-01 0.062 0.0632 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 9.98e-02 -0.103 0.0622 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 2.78e-01 0.121 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 6.76e-01 -0.05 0.12 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 1.76e-02 -0.177 0.074 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 7.00e-01 0.0428 0.111 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00462 0.0775 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 3.38e-02 0.125 0.0585 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0879 0.0722 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -755740 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00615 0.105 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -755717 sc-eQTL 1.32e-01 0.175 0.116 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0104 0.0971 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 sc-eQTL 8.97e-01 0.0138 0.107 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 717382 sc-eQTL 1.77e-01 -0.101 0.0746 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -466700 sc-eQTL 2.72e-02 0.204 0.0919 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -170588 sc-eQTL 3.83e-01 0.0684 0.0783 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 69617 sc-eQTL 8.08e-01 0.0167 0.0683 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 68598 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0436 0.0955 0.157 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -836678 pQTL 0.0319 -0.0945 0.044 0.0 0.0 0.154
ENSG00000220412 AL356234.1 229630 eQTL 0.014 -0.0801 0.0325 0.00185 0.0 0.152
ENSG00000226004 AL591468.1 -8971 eQTL 0.000106 -0.118 0.0303 0.0 0.0 0.152

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 AL591468.1 -8971 3.08e-05 2.22e-05 3.99e-06 1.22e-05 3.29e-06 1.17e-05 2.91e-05 3.36e-06 1.84e-05 9.88e-06 2.39e-05 9.14e-06 3.59e-05 8.78e-06 5.5e-06 1.18e-05 1.07e-05 1.84e-05 5.99e-06 4.8e-06 9.59e-06 2.16e-05 2.19e-05 6.73e-06 3.08e-05 5.39e-06 8.23e-06 8.16e-06 2.16e-05 2.14e-05 1.29e-05 1.31e-06 1.91e-06 5.59e-06 8.27e-06 4.46e-06 2.05e-06 2.71e-06 3.56e-06 2.73e-06 1.46e-06 2.75e-05 2.71e-06 2.09e-07 1.97e-06 2.83e-06 3.25e-06 1.26e-06 1.02e-06