Genes within 1Mb (chr6:137927704:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 5.77e-01 0.051 0.0912 0.188 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 3.07e-01 0.0907 0.0886 0.188 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 2.36e-02 0.157 0.0688 0.188 B L1
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 3.89e-01 -0.06 0.0694 0.188 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0293 0.056 0.188 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 5.04e-01 0.059 0.0881 0.188 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 9.29e-01 0.00912 0.102 0.188 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000197 0.0595 0.188 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.30e-02 0.168 0.0672 0.188 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0402 0.0643 0.188 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.22e-01 -0.093 0.0599 0.188 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 4.91e-01 0.0523 0.0758 0.188 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0493 0.11 0.188 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 5.06e-01 0.0448 0.0673 0.188 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.43e-03 0.227 0.0704 0.188 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 3.56e-01 0.0677 0.0733 0.188 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0488 0.0566 0.188 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0106 0.0832 0.188 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 4.43e-01 0.0863 0.112 0.18 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 4.78e-01 0.0592 0.0832 0.18 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 7.01e-01 0.0303 0.0789 0.18 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.44e-01 -0.13 0.0886 0.18 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0168 0.103 0.18 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0888 0.107 0.18 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0909 0.0905 0.18 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0799 0.0819 0.188 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0187 0.07 0.188 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 6.90e-01 0.0227 0.0568 0.188 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.50e-02 -0.144 0.0585 0.188 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 2.70e-01 0.118 0.107 0.188 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0119 0.112 0.188 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0875 0.0733 0.188 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 4.18e-01 0.0805 0.0991 0.187 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.82e-02 -0.134 0.0758 0.187 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.94e-01 0.113 0.0871 0.187 NK L1
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 9.23e-01 0.00715 0.0742 0.187 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00773 0.0635 0.187 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 8.21e-01 0.0204 0.09 0.187 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 4.58e-02 0.229 0.114 0.188 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0529 0.07 0.188 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.43e-01 0.109 0.0739 0.188 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 3.37e-02 -0.194 0.0907 0.188 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.03e-01 -0.071 0.0433 0.188 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0581 0.0864 0.188 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 4.17e-01 0.111 0.136 0.186 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 4.97e-01 0.083 0.122 0.186 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 3.94e-01 -0.102 0.12 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0938 0.0618 0.186 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0765 0.121 0.186 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0342 0.105 0.186 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 1.78e-01 0.154 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 8.43e-01 0.0209 0.106 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.11e-01 0.126 0.0787 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 3.32e-01 0.0977 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.66e-01 -0.109 0.0787 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 4.71e-01 0.0809 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 4.64e-02 0.233 0.116 0.188 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0567 0.116 0.188 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.71e-03 0.274 0.0863 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0376 0.11 0.188 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 3.76e-03 -0.218 0.0743 0.188 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 1.41e-01 0.166 0.112 0.188 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 9.23e-01 0.0106 0.109 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 6.89e-01 0.036 0.09 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 2.24e-02 0.174 0.0757 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 6.02e-01 0.0542 0.104 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0167 0.0603 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 7.96e-01 0.0245 0.0944 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0577 0.105 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 3.51e-01 0.102 0.109 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.35e-01 0.108 0.0718 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 9.58e-01 0.00456 0.0867 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 8.95e-01 0.0114 0.0867 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 5.46e-01 0.0677 0.112 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 1.11e-01 0.18 0.112 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 8.65e-01 -0.018 0.106 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 2.20e-02 0.223 0.0965 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 2.60e-02 -0.264 0.118 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 4.16e-02 -0.141 0.0688 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0585 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 8.45e-01 0.021 0.107 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 4.25e-01 0.0452 0.0566 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.33e-02 0.165 0.0659 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 9.82e-01 0.00203 0.0884 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 9.02e-02 -0.105 0.0616 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 5.08e-01 0.0532 0.0802 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0975 0.105 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0204 0.0792 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.48e-02 0.19 0.0773 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0585 0.0982 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0762 0.0568 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 4.59e-01 0.0593 0.0799 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0114 0.118 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0212 0.0893 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 7.84e-02 0.141 0.0798 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 6.72e-01 0.0396 0.0934 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 3.90e-01 -0.051 0.0593 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 2.20e-01 0.117 0.0948 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0395 0.121 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 1.36e-01 -0.122 0.0813 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 4.84e-02 0.17 0.0859 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 5.08e-01 0.0716 0.108 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0203 0.0688 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 2.71e-01 -0.107 0.0964 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0402 0.115 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 6.42e-01 0.0373 0.0801 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.31e-01 0.111 0.073 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 7.69e-01 0.0259 0.0882 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0748 0.0624 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 7.18e-01 0.0335 0.0926 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0147 0.128 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 8.18e-01 0.0243 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 2.41e-01 0.106 0.0898 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 4.78e-01 0.0844 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 6.91e-02 -0.104 0.0569 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 6.88e-01 0.0422 0.105 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 1.07e-01 0.192 0.118 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.86e-02 0.181 0.102 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 9.54e-04 0.353 0.105 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0375 0.123 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0785 0.0758 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0266 0.113 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 1.05e-01 0.205 0.126 0.186 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00661 0.0822 0.186 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 5.37e-02 0.169 0.087 0.186 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 7.42e-02 -0.207 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0812 0.055 0.186 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0994 0.102 0.186 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 6.16e-01 0.058 0.115 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0413 0.09 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0485 0.0982 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0974 0.105 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0488 0.0669 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 8.57e-01 0.0192 0.107 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0148 0.107 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0997 0.0701 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 2.44e-01 0.111 0.0948 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 4.74e-01 0.0611 0.0851 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0503 0.0662 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 7.76e-01 0.0284 0.0993 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 2.12e-01 0.157 0.125 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.95e-02 -0.162 0.0919 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0538 0.107 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0825 0.0952 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0654 0.0732 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 4.97e-01 0.0803 0.118 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 1.50e-01 0.158 0.109 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0876 0.0738 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 5.19e-02 0.183 0.0938 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0601 0.0881 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00949 0.0661 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 7.85e-01 0.0272 0.0996 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0194 0.138 0.178 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0147 0.146 0.178 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 2.11e-01 0.153 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 9.89e-01 0.00133 0.0934 0.178 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0226 0.113 0.178 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 6.00e-01 0.0715 0.136 0.178 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0747 0.12 0.189 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 8.89e-01 0.0129 0.0917 0.189 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 3.28e-01 0.0938 0.0956 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 7.75e-02 -0.156 0.0879 0.189 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0557 0.0557 0.189 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 3.47e-01 -0.102 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0782 0.113 0.188 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 3.33e-01 -0.103 0.106 0.188 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 5.51e-02 0.148 0.0768 0.188 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0236 0.122 0.188 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 9.57e-02 -0.113 0.0674 0.188 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0978 0.103 0.188 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 5.94e-01 0.0602 0.113 0.185 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 2.83e-01 0.0984 0.0915 0.185 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 4.53e-01 0.0607 0.0807 0.185 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.83e-01 -0.12 0.09 0.185 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0426 0.105 0.185 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0567 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 1.44e-01 -0.172 0.117 0.185 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0834 0.0891 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00194 0.0651 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 9.64e-01 0.0029 0.0641 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 2.42e-03 -0.21 0.0685 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 6.58e-01 0.0476 0.107 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0155 0.112 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 1.33e-01 -0.112 0.0744 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0204 0.103 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0288 0.0753 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 2.42e-01 0.0821 0.0699 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.28e-02 -0.166 0.066 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 1.47e-01 0.159 0.109 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 1.50e-01 -0.173 0.12 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0759 0.096 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 2.28e-01 0.162 0.134 0.2 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 2.59e-01 -0.122 0.107 0.2 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.18e-01 0.2 0.127 0.2 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 2.34e-01 0.142 0.119 0.2 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 3.73e-02 -0.137 0.0653 0.2 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 2.78e-02 0.263 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 9.53e-01 0.00693 0.118 0.178 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 1.13e-01 0.126 0.0791 0.178 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 8.94e-01 0.0106 0.0794 0.178 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 2.11e-01 -0.086 0.0685 0.178 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 1.22e-01 -0.165 0.106 0.178 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 7.77e-01 0.034 0.12 0.178 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 9.81e-01 0.00241 0.102 0.178 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 3.94e-02 0.226 0.109 0.186 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 1.92e-01 -0.122 0.0935 0.186 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.02e-02 0.168 0.0647 0.186 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 9.93e-01 0.000744 0.0831 0.186 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 9.60e-01 0.00529 0.106 0.186 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 1.40e-01 0.174 0.117 0.186 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 7.86e-01 0.0282 0.104 0.186 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 3.35e-01 0.125 0.129 0.189 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 3.64e-02 -0.228 0.108 0.189 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0642 0.1 0.189 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 2.56e-02 -0.225 0.1 0.189 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 9.77e-01 0.00289 0.1 0.189 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00415 0.1 0.189 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0674 0.103 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 1.39e-02 0.268 0.108 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 5.79e-01 0.0521 0.0937 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.40e-02 0.186 0.075 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 8.47e-01 0.0194 0.1 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0883 0.0659 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 5.97e-02 0.21 0.111 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 9.77e-01 0.00296 0.101 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 6.50e-01 0.0431 0.0947 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 3.21e-02 0.15 0.0696 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 6.45e-01 0.0476 0.103 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 7.56e-01 0.0169 0.0543 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 6.15e-01 0.0487 0.0966 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 3.11e-01 -0.084 0.0826 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0248 0.0659 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 6.25e-01 0.0302 0.0617 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.34e-02 -0.15 0.0601 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 1.36e-01 0.162 0.108 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0914 0.116 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 1.34e-01 -0.11 0.0727 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 7.46e-01 0.0353 0.109 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0267 0.0762 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 1.43e-01 0.0851 0.0579 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0936 0.071 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -764867 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0555 0.103 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -764844 sc-eQTL 2.67e-01 0.127 0.114 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 7.79e-01 0.0268 0.0955 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 sc-eQTL 5.56e-01 0.0607 0.103 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 708255 sc-eQTL 9.56e-02 -0.12 0.0717 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -475827 sc-eQTL 8.40e-02 0.154 0.0889 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -179715 sc-eQTL 7.34e-01 0.0256 0.0755 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 60490 sc-eQTL 9.75e-01 0.00203 0.0658 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 59471 sc-eQTL 6.86e-01 0.0372 0.092 0.185 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -845805 pQTL 0.0305 -0.0894 0.0413 0.0 0.0 0.189
ENSG00000220412 AL356234.1 220503 eQTL 0.00334 -0.0891 0.0303 0.00478 0.00152 0.187
ENSG00000226004 AL591468.1 -18098 eQTL 8.67e-06 -0.126 0.0282 0.0 0.0 0.187


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 AL591468.1 -18098 5.86e-05 1.58e-05 1.89e-06 8.45e-06 2.32e-06 1.09e-05 1.95e-05 2.13e-06 1.24e-05 6.27e-06 1.75e-05 6.75e-06 2.44e-05 5.8e-06 4.27e-06 8.97e-06 8.12e-06 1.59e-05 3.2e-06 2.89e-06 6.98e-06 1.3e-05 1.63e-05 3.47e-06 3e-05 4.58e-06 7.58e-06 4.8e-06 1.43e-05 1.38e-05 8.17e-06 9.93e-07 1.09e-06 3.57e-06 6.5e-06 2.1e-06 1.55e-06 1.49e-06 2.25e-06 1.04e-06 9.12e-07 2.39e-05 3.8e-06 1.68e-07 9.2e-07 1.77e-06 2.21e-06 7.01e-07 5.76e-07