Genes within 1Mb (chr6:137921300:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0721 0.141 0.066 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 4.58e-01 -0.102 0.137 0.066 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 7.89e-01 -0.029 0.108 0.066 B L1
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0545 0.108 0.066 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.82e-02 0.204 0.0857 0.066 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0489 0.137 0.066 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 3.73e-01 0.139 0.156 0.066 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0159 0.0912 0.066 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0708 0.105 0.066 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 4.29e-02 -0.199 0.0977 0.066 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.88e-02 0.216 0.0912 0.066 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0933 0.116 0.066 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0692 0.174 0.066 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0158 0.106 0.066 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 3.29e-01 -0.111 0.113 0.066 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0418 0.116 0.066 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 4.01e-02 0.183 0.0885 0.066 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 2.68e-01 -0.145 0.131 0.066 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0483 0.172 0.068 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 4.43e-02 0.256 0.126 0.068 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0797 0.121 0.068 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 7.48e-01 0.0439 0.136 0.068 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 4.30e-01 0.124 0.157 0.068 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0595 0.165 0.068 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 3.52e-01 -0.129 0.139 0.068 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.12e-01 0.0643 0.126 0.066 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 6.78e-02 0.196 0.107 0.066 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0123 0.0875 0.066 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.66e-02 0.218 0.0903 0.066 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 2.35e-01 0.196 0.165 0.066 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 7.01e-02 -0.311 0.171 0.066 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 6.98e-02 0.205 0.112 0.066 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00174 0.155 0.064 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 6.07e-01 0.0615 0.119 0.064 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0385 0.137 0.064 NK L1
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000922 0.116 0.064 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.85e-03 0.307 0.0972 0.064 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0614 0.141 0.064 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 3.51e-01 -0.166 0.177 0.066 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 9.59e-02 0.18 0.108 0.066 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 1.39e-01 -0.17 0.114 0.066 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0863 0.142 0.066 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.21e-03 0.204 0.0659 0.066 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 7.87e-01 0.0362 0.134 0.066 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 1.21e-01 -0.312 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0357 0.18 0.066 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 2.49e-01 0.204 0.176 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0965 0.0915 0.066 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.50e-01 0.204 0.177 0.066 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 4.98e-01 -0.105 0.155 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 2.55e-02 -0.385 0.171 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 3.01e-01 -0.166 0.16 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 2.43e-01 -0.14 0.12 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 4.25e-01 0.122 0.152 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 4.21e-01 0.0965 0.12 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 5.78e-01 0.0947 0.17 0.067 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 4.59e-01 -0.129 0.175 0.067 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.72e-01 0.0279 0.173 0.067 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 5.84e-01 -0.072 0.131 0.067 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 5.07e-01 0.109 0.164 0.067 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.067 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 3.50e-01 0.157 0.168 0.067 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 9.94e-01 0.00132 0.169 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0499 0.14 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0659 0.119 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0544 0.161 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.46e-03 0.294 0.0912 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 3.91e-01 0.125 0.146 0.066 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 2.09e-01 0.208 0.165 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 3.55e-01 -0.158 0.17 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 6.28e-01 0.0548 0.113 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0688 0.136 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 3.35e-02 0.288 0.134 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 2.48e-01 -0.203 0.175 0.067 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 1.43e-01 0.25 0.17 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 2.36e-01 -0.189 0.159 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 3.06e-01 -0.151 0.147 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 1.25e-01 -0.275 0.179 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.90e-02 0.228 0.104 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0365 0.163 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 1.99e-01 0.211 0.164 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0397 0.087 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 1.50e-01 -0.148 0.102 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 3.32e-01 -0.132 0.135 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.73e-02 0.209 0.0941 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0721 0.123 0.066 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.84e-01 0.0651 0.16 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 7.71e-01 0.035 0.12 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 3.09e-01 -0.152 0.149 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.77e-02 0.204 0.0855 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 5.52e-02 -0.232 0.12 0.066 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 7.83e-01 0.0501 0.181 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 5.83e-01 0.0756 0.137 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 1.43e-01 -0.181 0.123 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 8.12e-01 0.0342 0.144 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.63e-03 0.284 0.0891 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 1.16e-01 -0.23 0.145 0.066 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0975 0.185 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 1.68e-01 0.172 0.124 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0193 0.132 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 8.35e-01 0.0344 0.165 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.27e-02 0.238 0.104 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 7.14e-01 0.0542 0.147 0.066 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 9.77e-01 -0.005 0.176 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 1.69e-01 -0.169 0.122 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0949 0.112 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 5.14e-01 0.0885 0.135 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 3.21e-02 0.205 0.095 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 2.62e-01 -0.159 0.142 0.066 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0791 0.192 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0975 0.158 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 5.50e-02 0.258 0.134 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 8.66e-01 -0.03 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.28e-02 0.212 0.0845 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 1.51e-01 -0.226 0.156 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 4.54e-01 0.14 0.187 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 3.40e-01 -0.155 0.162 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 5.56e-01 -0.1 0.17 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 4.23e-01 -0.155 0.193 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.68e-02 0.263 0.118 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 9.85e-01 0.00332 0.177 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 5.06e-01 0.127 0.191 0.067 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 2.97e-01 0.129 0.124 0.067 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 7.42e-02 -0.236 0.131 0.067 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 3.60e-01 -0.16 0.175 0.067 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 4.88e-02 0.164 0.0825 0.067 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 7.84e-01 0.0422 0.154 0.067 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0271 0.18 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.18e-01 0.0325 0.141 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.78e-01 0.0237 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0619 0.164 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 9.74e-02 0.173 0.104 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0691 0.167 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 3.34e-01 0.163 0.168 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 2.01e-01 0.141 0.11 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 4.52e-01 -0.112 0.149 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 4.26e-01 -0.107 0.134 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 4.92e-03 0.29 0.102 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0189 0.156 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 1.81e-01 -0.253 0.189 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 2.13e-01 0.173 0.139 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.68e-01 0.0269 0.162 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 2.32e-01 -0.172 0.143 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.01e-02 0.255 0.109 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 7.86e-01 0.0483 0.178 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.78e-01 0.0711 0.171 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 3.39e-01 0.11 0.115 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0127 0.147 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 6.17e-01 0.0687 0.137 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 8.92e-05 0.397 0.0993 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 8.67e-01 -0.026 0.155 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 5.14e-01 -0.144 0.219 0.067 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 5.51e-01 -0.139 0.232 0.067 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 4.95e-01 0.133 0.195 0.067 PB L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0571 0.149 0.067 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0827 0.18 0.067 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 2.77e-01 0.235 0.216 0.067 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 7.47e-02 -0.339 0.189 0.067 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0129 0.146 0.067 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 1.03e-01 -0.247 0.151 0.067 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 5.27e-01 -0.089 0.14 0.067 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 5.78e-01 0.0494 0.0886 0.067 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 1.61e-01 -0.241 0.171 0.067 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 2.40e-01 -0.205 0.174 0.066 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.81e-01 0.0246 0.164 0.066 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0763 0.119 0.066 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 3.15e-01 -0.189 0.187 0.066 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 3.63e-05 0.423 0.1 0.066 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 2.22e-01 0.195 0.159 0.066 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.91e-01 0.0757 0.19 0.063 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 1.07e-01 0.249 0.154 0.063 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 2.22e-01 0.166 0.136 0.063 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 9.17e-01 0.0159 0.153 0.063 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 5.80e-01 0.098 0.177 0.063 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0846 0.195 0.063 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 1.85e-01 -0.263 0.198 0.063 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 3.38e-01 0.132 0.138 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 1.03e-01 0.164 0.0999 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0169 0.0991 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 4.19e-02 0.219 0.107 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 4.53e-01 0.125 0.166 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 2.03e-01 -0.221 0.173 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 7.42e-03 0.307 0.114 0.066 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 4.38e-01 -0.123 0.159 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 1.62e-01 0.163 0.116 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0164 0.109 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 8.01e-01 0.0261 0.104 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 5.47e-01 0.102 0.17 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 5.56e-01 -0.11 0.186 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 8.56e-01 0.0271 0.149 0.066 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 3.11e-01 -0.203 0.199 0.073 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 6.66e-03 0.43 0.156 0.073 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 9.70e-02 -0.316 0.189 0.073 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00401 0.177 0.073 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.94e-04 0.349 0.0941 0.073 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 5.90e-01 0.0964 0.178 0.073 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 8.64e-02 -0.313 0.182 0.064 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0216 0.123 0.064 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0324 0.123 0.064 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 7.34e-04 0.355 0.103 0.064 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00647 0.166 0.064 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 1.85e-02 -0.435 0.183 0.064 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 3.62e-01 0.144 0.158 0.064 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 3.96e-01 0.144 0.169 0.066 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 1.89e-01 0.189 0.143 0.066 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0534 0.101 0.066 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 2.22e-01 0.155 0.127 0.066 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 5.67e-01 0.0931 0.162 0.066 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 5.56e-01 -0.106 0.18 0.066 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 5.04e-02 -0.311 0.158 0.066 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 3.56e-01 -0.176 0.19 0.068 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 8.19e-02 0.281 0.16 0.068 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 3.94e-01 -0.127 0.148 0.068 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 7.98e-02 0.262 0.149 0.068 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 4.48e-01 -0.112 0.147 0.068 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0433 0.148 0.068 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00253 0.152 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 2.99e-02 -0.359 0.164 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 9.60e-01 0.00719 0.142 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 1.92e-01 -0.15 0.115 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 6.80e-01 0.0625 0.152 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 4.04e-01 0.0837 0.1 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 5.24e-01 0.108 0.169 0.066 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 7.53e-01 0.0495 0.157 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 2.19e-01 -0.18 0.146 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0183 0.109 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0736 0.16 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.81e-03 0.259 0.082 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00257 0.149 0.066 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 6.71e-01 0.0539 0.127 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 5.44e-02 0.194 0.1 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0464 0.0945 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.22e-01 0.144 0.0929 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 3.67e-01 0.15 0.166 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 2.55e-01 -0.203 0.178 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 1.99e-02 0.259 0.111 0.066 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0966 0.172 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 2.45e-01 0.14 0.12 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 8.21e-01 0.0209 0.0921 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 3.76e-02 0.233 0.112 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -771271 sc-eQTL 8.54e-01 0.0301 0.164 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -771248 sc-eQTL 1.29e-01 -0.275 0.18 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 8.48e-01 -0.029 0.151 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -852209 sc-eQTL 7.76e-01 0.0461 0.162 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 sc-eQTL 4.33e-01 0.0887 0.113 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0457 0.14 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -186119 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0457 0.118 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 54086 sc-eQTL 1.11e-03 0.332 0.1 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 53067 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0377 0.144 0.062 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 701851 pQTL 0.0315 -0.0653 0.0303 0.0 0.0 0.0697
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 eQTL 0.0215 -0.0863 0.0375 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000237499 AL357060.1 53067 eQTL 0.0276 0.0536 0.0243 0.0 0.0 0.0643


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -482231 3.02e-07 1.25e-07 5.03e-08 1.82e-07 9.01e-08 9.9e-08 1.49e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.56e-07 7.78e-08 1.41e-07 6.56e-08 5.91e-08 7.3e-08 4.48e-08 1.26e-07 5.75e-08 5.48e-08 1.08e-07 1.27e-07 1.34e-07 3.68e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.1e-07 9.65e-08 1.08e-07 1.1e-07 9.7e-08 3.03e-08 3.43e-08 8.68e-08 7.02e-08 3.93e-08 5.03e-08 9.36e-08 7.2e-08 4.02e-08 5.3e-08 1.46e-07 3.99e-08 1.29e-08 3.07e-08 1.68e-08 1.19e-07 3.8e-09 5.02e-08