Genes within 1Mb (chr6:137908131:CACAA:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 1.48e-01 0.178 0.123 0.1 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0419 0.12 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 8.47e-02 -0.162 0.0933 0.1 B L1
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 6.51e-01 0.0425 0.0938 0.1 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 3.57e-01 0.0696 0.0754 0.1 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 9.79e-02 -0.196 0.118 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 4.46e-01 0.104 0.136 0.1 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 4.35e-01 0.0624 0.0798 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 7.81e-02 -0.161 0.0909 0.1 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 8.86e-01 0.0124 0.0864 0.1 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0895 0.0807 0.1 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 1.66e-01 -0.141 0.101 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 4.91e-01 0.103 0.149 0.1 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 2.57e-01 0.104 0.0911 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.37e-01 -0.145 0.0973 0.1 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 7.11e-01 -0.037 0.0996 0.1 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0841 0.0767 0.1 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0752 0.113 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00455 0.149 0.097 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 6.43e-02 -0.204 0.11 0.097 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0759 0.105 0.097 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 6.18e-01 -0.059 0.118 0.097 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 2.75e-01 -0.149 0.136 0.097 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 6.79e-01 0.0591 0.143 0.097 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 9.81e-01 0.00286 0.121 0.097 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 1.01e-02 0.274 0.106 0.1 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0889 0.0912 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.12e-01 -0.118 0.0737 0.1 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0162 0.0775 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 6.48e-01 0.064 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0191 0.146 0.1 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0526 0.096 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0514 0.133 0.101 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 8.61e-01 -0.018 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0976 0.117 0.101 NK L1
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00116 0.0995 0.101 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 9.93e-01 0.000798 0.0852 0.101 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0991 0.121 0.101 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0927 0.156 0.1 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0634 0.095 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 6.63e-01 -0.044 0.101 0.1 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0103 0.124 0.1 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 5.38e-01 0.0365 0.0592 0.1 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00309 0.117 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.51e-01 -0.106 0.178 0.099 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 5.30e-01 -0.1 0.159 0.099 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0204 0.156 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0269 0.081 0.099 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 9.89e-01 0.00224 0.157 0.099 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 3.77e-01 -0.121 0.137 0.099 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 6.44e-02 0.28 0.151 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 3.22e-01 0.139 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 2.00e-01 -0.135 0.105 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 4.17e-01 0.109 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 4.43e-01 0.0806 0.105 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 5.93e-01 0.0796 0.149 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 4.18e-01 -0.125 0.154 0.101 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0831 0.152 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 2.33e-01 -0.138 0.116 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 4.44e-01 -0.111 0.145 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 2.47e-01 0.115 0.0993 0.101 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.57e-01 0.066 0.148 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 9.23e-01 0.0142 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 7.81e-01 0.0334 0.12 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 3.47e-03 -0.297 0.1 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 2.69e-02 -0.306 0.137 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 8.46e-01 0.0157 0.0805 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0625 0.126 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 1.44e-01 0.206 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0795 0.145 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0544 0.0964 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 9.41e-02 -0.194 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0788 0.116 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0858 0.15 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.28e-01 0.0937 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 3.32e-01 -0.135 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0853 0.128 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 4.95e-01 0.106 0.156 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 8.74e-01 0.0144 0.091 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0703 0.142 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0175 0.144 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 4.38e-01 0.0588 0.0758 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.54e-01 -0.128 0.0891 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0191 0.118 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 1.90e-01 -0.109 0.0826 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 2.13e-01 -0.134 0.107 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 1.10e-01 0.228 0.142 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 2.65e-01 0.12 0.107 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 4.13e-02 -0.216 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0575 0.133 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0617 0.0772 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 3.32e-01 -0.105 0.108 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 3.67e-01 0.143 0.158 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 3.63e-01 0.109 0.12 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0919 0.108 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 8.05e-01 0.031 0.125 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 1.74e-01 0.108 0.0793 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0504 0.128 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 4.61e-01 0.122 0.165 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 2.77e-01 0.121 0.111 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 8.85e-01 0.0171 0.118 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0249 0.147 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0931 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0994 0.131 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00897 0.155 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 1.36e-01 0.161 0.108 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.73e-01 -0.135 0.0989 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 9.16e-01 0.0126 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0378 0.0847 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 8.53e-01 0.0232 0.125 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0705 0.176 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 8.28e-01 0.0316 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.65e-01 -0.172 0.123 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 7.45e-02 -0.291 0.162 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0834 0.0786 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0321 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 2.65e-01 0.18 0.161 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 3.71e-01 -0.125 0.139 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 3.66e-03 -0.422 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0236 0.167 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0634 0.103 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 5.71e-01 0.0867 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.34e-01 -0.105 0.168 0.102 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 6.81e-01 -0.045 0.109 0.102 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 2.35e-01 -0.139 0.116 0.102 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 2.82e-01 -0.166 0.154 0.102 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 3.79e-01 0.0648 0.0734 0.102 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0466 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 8.36e-02 -0.276 0.159 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00661 0.125 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 3.13e-01 -0.138 0.136 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 4.02e-01 0.122 0.146 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0126 0.093 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 2.97e-02 -0.321 0.147 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 7.34e-01 0.0498 0.146 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0242 0.0961 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 2.59e-01 -0.146 0.129 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0101 0.116 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0642 0.0904 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0314 0.136 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 9.87e-01 0.00273 0.167 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0127 0.123 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 3.09e-01 -0.145 0.142 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 8.62e-01 -0.022 0.127 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 6.96e-01 0.0381 0.0974 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0261 0.157 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0406 0.149 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0646 0.1 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0504 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 7.97e-01 0.0308 0.12 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 3.95e-01 0.0764 0.0896 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0613 0.135 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.51e-02 0.324 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 6.34e-01 0.0855 0.179 0.111 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0362 0.151 0.111 PB L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 5.14e-01 0.0753 0.115 0.111 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 3.60e-01 0.128 0.139 0.111 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 4.18e-01 -0.136 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.01e-01 0.109 0.162 0.1 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 7.45e-01 0.0402 0.123 0.1 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 2.08e-01 -0.162 0.128 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0716 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 9.29e-01 0.0067 0.0751 0.1 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 7.02e-01 0.0558 0.146 0.1 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 4.05e-01 0.129 0.154 0.1 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 5.73e-01 0.082 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 3.42e-01 -0.1 0.105 0.1 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 1.46e-01 0.241 0.165 0.1 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 9.86e-02 -0.152 0.0919 0.1 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 1.00e+00 -8.7e-05 0.141 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.56e-01 0.0871 0.148 0.102 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 2.97e-01 -0.126 0.12 0.102 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 9.00e-02 -0.179 0.105 0.102 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0922 0.118 0.102 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 3.64e-01 -0.125 0.137 0.102 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 8.47e-01 0.0294 0.152 0.102 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0408 0.155 0.102 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 8.98e-02 0.198 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 2.29e-01 -0.103 0.0851 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 2.17e-01 -0.104 0.0839 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 7.73e-01 0.0266 0.0919 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 3.98e-01 0.119 0.141 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 1.75e-01 -0.2 0.147 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00547 0.0982 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 1.39e-01 0.198 0.133 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0722 0.0984 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 4.50e-02 -0.183 0.0909 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 7.28e-01 0.0305 0.0875 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 3.76e-01 0.127 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 2.89e-01 0.167 0.157 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 4.02e-01 -0.105 0.125 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 7.21e-01 0.0648 0.181 0.106 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 2.55e-01 -0.165 0.144 0.106 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0122 0.173 0.106 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 2.68e-01 0.178 0.16 0.106 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 8.65e-01 0.0152 0.0891 0.106 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 1.09e-01 -0.258 0.16 0.106 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 4.02e-02 0.324 0.157 0.102 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 4.98e-02 -0.208 0.106 0.102 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.48e-01 -0.154 0.106 0.102 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 9.21e-02 -0.155 0.0914 0.102 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0584 0.143 0.102 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0646 0.161 0.102 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0967 0.137 0.102 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0175 0.148 0.1 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.126 0.1 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.75e-01 -0.12 0.0878 0.1 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 2.95e-01 -0.117 0.111 0.1 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 4.60e-01 -0.105 0.142 0.1 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 4.62e-01 0.116 0.158 0.1 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0606 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0944 0.168 0.107 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 4.69e-01 -0.103 0.143 0.107 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0833 0.131 0.107 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 3.05e-01 0.136 0.132 0.107 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 4.30e-01 -0.103 0.13 0.107 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 2.87e-01 0.139 0.13 0.107 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 5.59e-01 0.0786 0.134 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 3.96e-01 0.124 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 8.47e-01 0.0242 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.41e-01 -0.149 0.101 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0627 0.134 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 4.76e-01 0.0629 0.0881 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 9.97e-01 0.000534 0.149 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 1.44e-01 0.197 0.134 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 6.72e-01 0.0534 0.126 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 3.83e-02 -0.193 0.0925 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 2.19e-02 -0.313 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 6.45e-01 0.0332 0.0721 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 2.56e-01 -0.146 0.128 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 2.17e-02 0.247 0.107 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 2.06e-01 -0.109 0.0857 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 7.59e-02 -0.143 0.08 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000942 0.0796 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 3.96e-01 0.12 0.141 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0786 0.152 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0457 0.0953 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 1.02e-01 0.241 0.147 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0721 0.103 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 1.33e-01 -0.118 0.0786 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 2.44e-01 -0.113 0.0964 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -784440 sc-eQTL 2.29e-01 -0.169 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -784417 sc-eQTL 5.19e-01 0.1 0.155 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 3.26e-01 -0.127 0.129 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -865378 sc-eQTL 8.95e-01 0.0184 0.139 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 688682 sc-eQTL 7.98e-01 0.0249 0.0969 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0993 0.12 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -199288 sc-eQTL 8.75e-01 0.016 0.101 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 40917 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0108 0.0883 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 39898 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0539 0.124 0.101 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -495400 eQTL 0.0096 -0.0888 0.0342 0.00128 0.0 0.0888


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina