Genes within 1Mb (chr6:137905965:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0143 0.1 0.143 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0888 0.0973 0.143 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0136 0.0764 0.143 B L1
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0333 0.0763 0.143 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 7.82e-02 0.108 0.061 0.143 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 4.56e-01 0.0721 0.0966 0.143 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 6.52e-01 0.0508 0.113 0.143 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 6.82e-01 -0.027 0.0659 0.143 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0596 0.0755 0.143 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 8.62e-02 -0.122 0.0708 0.143 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.46e-03 0.21 0.0652 0.143 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 5.48e-01 0.0506 0.084 0.143 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 1.81e-01 -0.167 0.124 0.143 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0904 0.0759 0.143 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0575 0.0814 0.143 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0743 0.0829 0.143 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.07e-03 0.195 0.0627 0.143 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 3.16e-01 0.0943 0.0939 0.143 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 3.06e-01 0.125 0.122 0.146 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.01e-01 0.0229 0.0908 0.146 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0808 0.0859 0.146 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 6.07e-01 0.05 0.097 0.146 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 4.20e-01 0.0906 0.112 0.146 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 9.83e-01 0.0025 0.117 0.146 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0489 0.0989 0.146 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 2.51e-01 0.103 0.0893 0.143 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 1.24e-01 0.117 0.0759 0.143 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0724 0.0618 0.143 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.19e-01 0.0796 0.0646 0.143 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 7.09e-01 0.0437 0.117 0.143 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 3.98e-02 -0.249 0.121 0.143 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 1.04e-02 0.204 0.079 0.143 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 7.57e-01 0.0335 0.108 0.142 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0125 0.0832 0.142 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 7.91e-01 0.0253 0.0954 0.142 NK L1
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.88e-01 -0.086 0.0807 0.142 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.16e-06 0.32 0.0657 0.142 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 1.96e-01 0.127 0.0978 0.142 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 4.11e-01 0.105 0.127 0.143 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 6.67e-01 0.0335 0.0777 0.143 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0857 0.0822 0.143 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.79e-01 -0.11 0.101 0.143 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 4.27e-05 0.194 0.0465 0.143 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 3.46e-02 0.202 0.095 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0563 0.142 0.148 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0176 0.127 0.148 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 3.41e-01 0.118 0.124 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0567 0.0644 0.148 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.08e-01 0.128 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.24e-01 -0.133 0.109 0.148 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 4.84e-02 -0.244 0.123 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 2.73e-01 -0.126 0.114 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 3.64e-02 -0.179 0.0851 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0121 0.109 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.43e-01 0.125 0.0854 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 7.58e-02 0.216 0.121 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0562 0.125 0.144 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0716 0.123 0.144 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0199 0.0941 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.00e-01 0.15 0.117 0.144 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.83e-01 0.0867 0.0805 0.144 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.12 0.144 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0211 0.119 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0227 0.0987 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0323 0.084 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0437 0.114 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 5.26e-03 0.183 0.0649 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.65e-01 0.115 0.103 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 2.25e-01 0.143 0.118 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 4.84e-02 -0.24 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 8.85e-01 0.0117 0.0808 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0188 0.097 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 9.49e-02 0.162 0.0963 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 3.03e-01 -0.129 0.125 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 7.36e-01 0.041 0.121 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 2.46e-03 -0.34 0.111 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 1.69e-01 -0.144 0.104 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0929 0.128 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.07e-06 0.344 0.0703 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 4.32e-01 0.0912 0.116 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 2.87e-01 0.126 0.118 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0587 0.0625 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0682 0.0738 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0369 0.0976 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.78e-03 0.197 0.0671 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 7.82e-01 0.0246 0.0887 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 9.30e-01 0.0101 0.115 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0119 0.0868 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0132 0.0859 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 3.20e-01 -0.107 0.107 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.44e-03 0.197 0.0611 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 6.79e-01 0.0363 0.0876 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 8.22e-01 -0.03 0.133 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 5.17e-01 0.0655 0.101 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 1.59e-01 -0.128 0.0905 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00576 0.106 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 5.40e-05 0.266 0.0646 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0477 0.108 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 1.45e-01 -0.194 0.133 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 6.89e-01 0.0361 0.0899 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0108 0.0954 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0727 0.119 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.00e-04 0.27 0.0734 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 9.33e-02 0.178 0.106 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 9.15e-01 0.0138 0.129 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 9.03e-02 -0.153 0.0897 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0521 0.0827 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0464 0.0994 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.64e-03 0.203 0.0692 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 4.28e-01 0.0827 0.104 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0792 0.146 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 9.25e-01 0.0113 0.12 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 9.79e-02 0.169 0.102 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 7.40e-01 0.045 0.135 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.13e-03 0.21 0.0635 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0472 0.119 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 3.88e-01 -0.115 0.132 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 5.86e-02 -0.217 0.114 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 5.82e-01 0.0664 0.121 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 3.29e-01 -0.134 0.137 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.72e-04 0.313 0.0817 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00659 0.126 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 4.69e-03 0.398 0.139 0.141 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 9.91e-01 0.00099 0.092 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 1.30e-01 -0.149 0.0978 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 4.50e-02 -0.26 0.129 0.141 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.53e-02 0.13 0.0613 0.141 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 1.49e-01 0.165 0.114 0.141 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0786 0.127 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.47e-01 0.0192 0.0993 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 9.02e-01 0.0133 0.108 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.83e-01 -0.124 0.116 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.07e-02 0.17 0.073 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.118 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 7.74e-02 0.208 0.117 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.37e-01 0.016 0.0775 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 7.27e-01 0.0366 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.02e-01 -0.12 0.0935 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.71e-05 0.307 0.0698 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 6.63e-01 0.0477 0.109 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 8.27e-03 -0.35 0.131 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0633 0.098 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 4.55e-01 0.085 0.114 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.81e-01 -0.109 0.101 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.70e-04 0.273 0.0753 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 3.23e-01 0.124 0.125 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 5.61e-01 0.0693 0.119 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 7.14e-01 0.0294 0.0803 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 6.85e-01 0.0417 0.103 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0627 0.0955 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.18e-07 0.36 0.0672 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.46e-01 0.125 0.108 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 2.74e-01 -0.155 0.141 0.163 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 4.14e-01 -0.123 0.15 0.163 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 4.37e-01 0.0983 0.126 0.163 PB L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0282 0.0962 0.163 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0371 0.117 0.163 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.17e-01 0.173 0.139 0.163 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 1.14e-01 -0.21 0.132 0.146 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0306 0.102 0.146 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0676 0.106 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 1.61e-01 -0.137 0.0977 0.146 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 4.99e-01 0.0419 0.0618 0.146 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0703 0.12 0.146 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 1.11e-01 -0.204 0.127 0.143 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 9.88e-01 0.00175 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 5.92e-01 -0.047 0.0875 0.143 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 1.39e-01 -0.204 0.137 0.143 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.47e-06 0.353 0.0728 0.143 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 4.20e-02 0.237 0.116 0.143 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00243 0.129 0.137 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0407 0.105 0.137 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00265 0.0926 0.137 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00436 0.104 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 7.40e-01 0.04 0.12 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 3.72e-01 -0.118 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.34e-01 -0.161 0.135 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 3.02e-02 0.21 0.0963 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 9.36e-02 0.119 0.0705 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0763 0.0698 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 5.15e-01 0.0498 0.0764 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 2.39e-01 0.138 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 2.27e-01 -0.148 0.122 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.15e-03 0.248 0.0798 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 2.29e-01 -0.136 0.112 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 1.42e-01 0.121 0.0823 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 4.44e-01 -0.059 0.077 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00801 0.0735 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 2.86e-01 -0.129 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 3.29e-01 -0.129 0.132 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.22e-01 0.129 0.105 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 2.06e-01 -0.192 0.151 0.145 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 2.27e-01 0.147 0.121 0.145 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 2.49e-01 -0.167 0.144 0.145 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.46e-01 -0.156 0.134 0.145 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.24e-05 0.302 0.0703 0.145 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 1.17e-01 0.212 0.134 0.145 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 1.84e-02 -0.304 0.128 0.142 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0182 0.0873 0.142 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0587 0.0869 0.142 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.26e-02 0.187 0.0742 0.142 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0636 0.117 0.142 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 3.32e-02 -0.279 0.13 0.142 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.142 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 1.25e-01 0.193 0.126 0.136 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0559 0.107 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0708 0.0752 0.136 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.03e-01 0.121 0.0947 0.136 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 9.52e-01 0.00733 0.121 0.136 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 1.37e-01 -0.2 0.134 0.136 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 5.85e-02 -0.224 0.118 0.136 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 3.01e-01 0.15 0.145 0.13 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 6.23e-01 0.0607 0.123 0.13 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 1.15e-01 -0.178 0.112 0.13 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.68e-01 0.103 0.114 0.13 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00517 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 9.07e-01 0.0132 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 5.43e-01 0.0706 0.116 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 1.48e-01 -0.173 0.119 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0271 0.102 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 1.29e-01 -0.126 0.0825 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 8.20e-01 0.0249 0.109 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 3.98e-01 0.0611 0.0721 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 6.15e-02 0.228 0.121 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 8.72e-01 0.0179 0.111 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 1.96e-01 -0.134 0.103 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00335 0.077 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 7.64e-01 -0.034 0.113 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.47e-02 0.144 0.0586 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 8.48e-01 0.0203 0.106 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 3.11e-01 0.0909 0.0894 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 7.82e-02 0.125 0.0709 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0857 0.0666 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 7.64e-01 0.0198 0.066 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 5.60e-01 0.0685 0.117 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 2.57e-01 -0.143 0.126 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 2.78e-03 0.235 0.0775 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0569 0.123 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 9.49e-01 0.00556 0.0864 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00134 0.066 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 1.82e-02 0.19 0.0797 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -786606 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0921 0.117 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -786583 sc-eQTL 7.52e-02 -0.23 0.129 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0278 0.108 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -867544 sc-eQTL 4.52e-01 0.085 0.113 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 686516 sc-eQTL 9.93e-01 0.000664 0.079 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -497566 sc-eQTL 6.65e-01 0.0425 0.098 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -201454 sc-eQTL 2.12e-01 -0.103 0.0824 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 sc-eQTL 2.39e-06 0.331 0.0683 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 37732 sc-eQTL 1.05e-01 0.163 0.1 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118503 TNFAIP3 38751 eQTL 0.00644 0.0513 0.0188 0.0 0.0 0.133
ENSG00000220412 AL356234.1 198764 eQTL 0.0263 0.0773 0.0347 0.0 0.0 0.133
ENSG00000226004 AL591468.1 -39837 eQTL 0.00251 -0.0982 0.0324 0.0 0.0 0.133
ENSG00000237499 AL357060.1 37732 eQTL 0.00158 0.0569 0.018 0.0 0.0 0.133


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -497566 2.67e-07 1.36e-07 3.72e-08 2.26e-07 9.16e-08 9.05e-08 1.61e-07 5.37e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.57e-07 9e-08 1.71e-07 6.76e-08 6.17e-08 7.37e-08 4.17e-08 1.26e-07 6.32e-08 5.04e-08 1.13e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.16e-07 1e-07 9.92e-08 3.1e-08 3.68e-08 8.89e-08 2.97e-08 3.53e-08 5.62e-08 8.61e-08 6.49e-08 8.09e-08 4.9e-08 1.46e-07 4.7e-08 7.18e-09 5.7e-08 1.99e-08 1.22e-07 3.83e-09 4.81e-08
ENSG00000226004 AL591468.1 -39837 9.82e-06 1.24e-05 1.35e-06 6.84e-06 2.39e-06 5.08e-06 1.19e-05 1.81e-06 9.72e-06 5.39e-06 1.24e-05 5.8e-06 1.82e-05 3.96e-06 2.82e-06 6.49e-06 4.99e-06 7.27e-06 2.74e-06 2.83e-06 5.22e-06 9.58e-06 9.02e-06 3.3e-06 1.66e-05 3.11e-06 4.68e-06 4.45e-06 1.14e-05 9.37e-06 5.88e-06 9.05e-07 1.31e-06 3.29e-06 4.81e-06 2.56e-06 1.78e-06 1.94e-06 2.12e-06 9.75e-07 1.03e-06 1.3e-05 1.28e-06 1.64e-07 6.87e-07 1.62e-06 1.32e-06 6.95e-07 5.39e-07