Genes within 1Mb (chr6:137874929:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 6.15e-01 -0.07 0.139 0.068 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 4.06e-01 -0.113 0.135 0.068 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 7.63e-01 -0.032 0.106 0.068 B L1
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0426 0.106 0.068 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.07e-02 0.217 0.0841 0.068 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0409 0.134 0.068 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 3.25e-01 0.151 0.153 0.068 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0274 0.0898 0.068 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0725 0.103 0.068 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 3.71e-02 -0.202 0.0961 0.068 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 9.32e-03 0.235 0.0896 0.068 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0812 0.114 0.068 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 5.78e-01 -0.096 0.172 0.068 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0253 0.105 0.068 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.98e-01 -0.145 0.112 0.068 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0433 0.115 0.068 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.83e-02 0.208 0.0876 0.068 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 2.71e-01 -0.143 0.13 0.068 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0784 0.169 0.07 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 8.35e-02 0.217 0.125 0.07 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0871 0.119 0.07 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 7.76e-01 0.0382 0.134 0.07 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 5.61e-01 0.0902 0.155 0.07 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0986 0.162 0.07 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 3.13e-01 -0.138 0.136 0.07 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 4.38e-01 0.0964 0.124 0.068 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.09e-01 0.169 0.105 0.068 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0103 0.0859 0.068 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 3.36e-02 0.19 0.0888 0.068 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 1.91e-01 0.212 0.162 0.068 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 7.85e-02 -0.296 0.167 0.068 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 1.79e-01 0.149 0.111 0.068 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00782 0.153 0.067 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 5.19e-01 0.0761 0.118 0.067 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0323 0.135 0.067 NK L1
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 5.98e-01 0.0604 0.115 0.067 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 5.47e-04 0.335 0.0954 0.067 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 9.55e-01 0.00784 0.139 0.067 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 5.36e-01 -0.108 0.175 0.068 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.30e-01 0.161 0.106 0.068 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.50e-01 -0.163 0.113 0.068 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 4.15e-01 -0.114 0.139 0.068 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 3.67e-03 0.191 0.0651 0.068 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 6.67e-01 0.0568 0.132 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 1.17e-01 -0.31 0.197 0.069 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0585 0.177 0.069 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 2.73e-01 0.191 0.173 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0971 0.0899 0.069 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.19e-01 0.215 0.174 0.069 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 4.09e-01 -0.126 0.153 0.069 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 3.15e-02 -0.366 0.169 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.99e-01 -0.164 0.157 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.24e-01 -0.182 0.118 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 2.97e-01 0.157 0.15 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 3.97e-01 0.1 0.118 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 4.91e-01 0.115 0.167 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 4.52e-01 -0.13 0.172 0.069 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 7.81e-01 0.0473 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0512 0.13 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.49e-01 0.0737 0.162 0.069 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.61e-01 0.156 0.111 0.069 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 2.41e-01 0.194 0.165 0.069 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00726 0.166 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0509 0.137 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0638 0.117 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0685 0.159 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 5.74e-04 0.313 0.0894 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 3.49e-01 0.135 0.144 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 1.59e-01 0.229 0.162 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.15e-01 -0.208 0.167 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 7.64e-01 0.0334 0.111 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0298 0.134 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.75e-02 0.293 0.132 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 2.64e-01 -0.193 0.172 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 1.35e-01 0.254 0.169 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.39e-01 -0.188 0.159 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 2.94e-01 -0.154 0.147 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 9.51e-02 -0.298 0.178 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.51e-02 0.233 0.103 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 8.30e-01 -0.035 0.163 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 1.77e-01 0.218 0.161 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0524 0.0855 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.42e-01 -0.148 0.1 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 2.58e-01 -0.151 0.133 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.46e-02 0.227 0.0922 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0642 0.121 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 5.24e-01 0.1 0.157 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.00e+00 2.29e-05 0.118 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 6.95e-01 0.0461 0.117 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 2.27e-01 -0.177 0.147 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 9.12e-03 0.221 0.084 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 7.03e-02 -0.216 0.119 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 9.71e-01 0.00644 0.179 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 5.98e-01 0.0715 0.136 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.31e-01 -0.184 0.121 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.80e-01 0.0585 0.142 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 4.38e-04 0.313 0.0875 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 2.18e-01 -0.178 0.144 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0734 0.182 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.17e-01 0.192 0.122 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0329 0.13 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0514 0.163 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 8.58e-03 0.27 0.102 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 5.62e-01 0.0845 0.145 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00166 0.174 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.44e-01 -0.177 0.121 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 2.45e-01 -0.129 0.111 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 4.73e-01 0.0958 0.133 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.62e-02 0.226 0.0934 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 2.77e-01 -0.152 0.14 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 5.86e-01 -0.103 0.189 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0812 0.156 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 7.11e-02 0.239 0.132 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 8.96e-01 -0.023 0.176 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 3.52e-03 0.245 0.0828 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 1.97e-01 -0.2 0.154 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 4.54e-01 0.14 0.187 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 3.40e-01 -0.155 0.162 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 5.56e-01 -0.1 0.17 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 4.23e-01 -0.155 0.193 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.68e-02 0.263 0.118 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 9.85e-01 0.00332 0.177 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 2.86e-01 0.201 0.188 0.069 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 3.39e-01 0.117 0.122 0.069 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.05e-01 -0.212 0.13 0.069 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 1.46e-01 -0.252 0.172 0.069 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 3.02e-02 0.178 0.0815 0.069 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 8.61e-01 0.0268 0.152 0.069 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0464 0.181 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 8.21e-01 0.032 0.141 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 8.92e-01 0.021 0.154 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.02e-01 -0.086 0.165 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.44e-01 0.153 0.104 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0901 0.167 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 3.45e-01 0.157 0.165 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.21e-01 0.133 0.109 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 4.62e-01 -0.108 0.147 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0593 0.132 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.86e-03 0.303 0.1 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0487 0.154 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 1.97e-01 -0.245 0.189 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.66e-01 0.155 0.139 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 8.98e-01 0.0208 0.162 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 2.55e-01 -0.164 0.143 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.07e-02 0.254 0.109 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 6.96e-01 0.0696 0.178 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 5.51e-01 0.101 0.168 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.25e-01 0.138 0.113 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 9.02e-01 -0.018 0.145 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 4.18e-01 0.11 0.135 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 6.79e-06 0.446 0.0966 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 7.72e-01 0.0444 0.153 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 4.93e-01 -0.145 0.211 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 5.62e-01 -0.13 0.223 0.07 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 5.27e-01 0.119 0.188 0.07 PB L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0635 0.143 0.07 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 8.45e-01 -0.034 0.174 0.07 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 3.76e-01 0.185 0.208 0.07 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 7.54e-02 -0.334 0.187 0.07 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0114 0.143 0.07 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.04e-01 -0.243 0.149 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 4.60e-01 -0.103 0.138 0.07 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 5.55e-01 0.0517 0.0873 0.07 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 1.57e-01 -0.24 0.169 0.07 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 1.63e-01 -0.239 0.171 0.068 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00505 0.161 0.068 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 8.38e-01 -0.024 0.117 0.068 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 1.51e-01 -0.264 0.184 0.068 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 6.52e-06 0.452 0.0978 0.068 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 2.75e-01 0.171 0.156 0.068 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 8.17e-01 0.043 0.185 0.066 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.77e-01 0.204 0.15 0.066 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 2.57e-01 0.151 0.132 0.066 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 9.07e-01 0.0175 0.149 0.066 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 7.04e-01 0.0656 0.172 0.066 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 5.12e-01 -0.125 0.19 0.066 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 1.67e-01 -0.268 0.193 0.066 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 1.85e-01 0.179 0.135 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.50e-01 0.142 0.0982 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0284 0.0973 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 5.89e-02 0.2 0.105 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 3.74e-01 0.145 0.163 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 2.11e-01 -0.213 0.17 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 1.94e-02 0.264 0.112 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0859 0.156 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.36e-01 0.136 0.114 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00806 0.107 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 8.52e-01 0.019 0.102 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 4.29e-01 0.132 0.167 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 5.84e-01 -0.1 0.183 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00951 0.146 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 2.88e-01 -0.211 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.37e-02 0.389 0.156 0.076 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 8.33e-02 -0.327 0.187 0.076 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0155 0.176 0.076 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.27e-04 0.366 0.0929 0.076 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 6.81e-01 0.0729 0.177 0.076 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 4.33e-02 -0.362 0.178 0.067 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0343 0.121 0.067 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 9.74e-01 0.00387 0.121 0.067 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 9.13e-04 0.342 0.102 0.067 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0408 0.162 0.067 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 9.32e-03 -0.471 0.179 0.067 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 6.13e-01 0.0788 0.155 0.067 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 3.96e-01 0.144 0.169 0.066 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.89e-01 0.189 0.143 0.066 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0534 0.101 0.066 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.22e-01 0.155 0.127 0.066 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 5.67e-01 0.0931 0.162 0.066 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 5.56e-01 -0.106 0.18 0.066 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 5.04e-02 -0.311 0.158 0.066 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 3.56e-01 -0.176 0.19 0.068 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 8.19e-02 0.281 0.16 0.068 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 3.94e-01 -0.127 0.148 0.068 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 7.98e-02 0.262 0.149 0.068 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 4.48e-01 -0.112 0.147 0.068 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0433 0.148 0.068 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00253 0.152 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 3.28e-02 -0.348 0.162 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000527 0.14 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 1.43e-01 -0.166 0.113 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.82e-01 0.0614 0.149 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 3.79e-01 0.0868 0.0985 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 3.99e-01 0.141 0.167 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 7.31e-01 0.0532 0.154 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 1.71e-01 -0.198 0.144 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0229 0.107 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0747 0.157 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 8.49e-04 0.272 0.0805 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 9.64e-01 0.00657 0.147 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 4.21e-01 0.1 0.124 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 9.48e-02 0.166 0.0986 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0482 0.0929 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 1.68e-01 0.126 0.0914 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 2.83e-01 0.175 0.163 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 2.53e-01 -0.201 0.175 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 4.84e-02 0.216 0.109 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 3.50e-01 -0.158 0.169 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 2.97e-01 0.123 0.118 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 7.49e-01 0.0289 0.0904 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.51e-02 0.247 0.109 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -817642 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0196 0.161 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -817619 sc-eQTL 1.64e-01 -0.247 0.177 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 4.48e-01 -0.113 0.148 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -898580 sc-eQTL 7.10e-01 0.0594 0.16 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 655480 sc-eQTL 3.61e-01 0.102 0.111 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 sc-eQTL 7.24e-01 -0.049 0.138 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -232490 sc-eQTL 9.08e-01 0.0134 0.117 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 7715 sc-eQTL 2.41e-04 0.368 0.0985 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 6696 sc-eQTL 7.89e-01 0.0381 0.142 0.065 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 eQTL 0.0232 -0.0843 0.0371 0.0 0.0 0.0658
ENSG00000220412 AL356234.1 167728 eQTL 0.0432 0.094 0.0464 0.0 0.0 0.0658
ENSG00000237499 AL357060.1 6696 eQTL 0.016 0.0581 0.0241 0.0 0.0 0.0658


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -528602 2.56e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.66e-07 1.03e-07 8.95e-08 1.31e-07 5.29e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.55e-07 7.4e-08 1.19e-07 6.1e-08 4.77e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.88e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.08e-07 9.43e-08 3.19e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.23e-08 4.7e-08 8e-08 8.39e-08 3.87e-08 3.18e-08 1.42e-07 4.36e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.5e-07 4.96e-09 4.72e-08