logo

Genes within 1Mb (chr6:137869547:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 5.71e-01 -0.069 0.122 0.092 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0726 0.118 0.092 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00708 0.093 0.092 B L1
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0343 0.0928 0.092 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.84e-02 0.163 0.074 0.092 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 9.07e-01 0.0138 0.118 0.092 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 6.32e-01 0.0652 0.136 0.092 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00811 0.0795 0.092 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0612 0.0911 0.092 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 9.30e-02 -0.144 0.0854 0.092 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.93e-05 0.33 0.0773 0.092 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0475 0.101 0.092 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 1.76e-01 -0.205 0.151 0.092 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0405 0.0929 0.092 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 2.34e-01 -0.118 0.0992 0.092 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0705 0.101 0.092 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 6.22e-04 0.264 0.0761 0.092 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 3.30e-01 -0.112 0.115 0.092 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 9.71e-01 0.00539 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 3.62e-02 0.228 0.108 0.092 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 8.83e-01 0.0152 0.104 0.092 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 4.99e-01 0.0791 0.117 0.092 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 4.26e-01 0.108 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 8.20e-01 0.0322 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.16e-01 -0.147 0.119 0.092 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 2.51e-01 0.124 0.108 0.092 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 1.11e-01 0.147 0.0919 0.092 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 9.07e-01 0.00878 0.075 0.092 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 3.59e-02 0.164 0.0776 0.092 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 3.12e-01 0.143 0.141 0.092 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 1.48e-01 -0.213 0.147 0.092 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.02e-01 0.124 0.0968 0.092 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0299 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.35e-01 0.122 0.103 0.09 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 9.00e-01 0.0149 0.118 0.09 NK L1
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0313 0.1 0.09 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 6.20e-06 0.38 0.0819 0.09 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0439 0.122 0.09 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 8.98e-01 0.0198 0.154 0.092 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 1.36e-01 0.14 0.0933 0.092 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0623 0.0993 0.092 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 8.49e-01 0.0235 0.123 0.092 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 5.30e-06 0.26 0.0556 0.092 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 6.31e-01 0.0557 0.116 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 2.25e-01 -0.218 0.18 0.089 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 7.44e-01 0.0528 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 4.84e-01 0.111 0.158 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0572 0.0819 0.089 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.03e-01 0.202 0.158 0.089 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.58e-01 -0.157 0.139 0.089 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 9.22e-03 -0.395 0.15 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.50e-01 -0.162 0.141 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 9.48e-03 -0.272 0.104 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 2.94e-01 0.141 0.134 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 8.83e-02 0.18 0.105 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 1.94e-01 0.194 0.149 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0176 0.152 0.093 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0102 0.15 0.093 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0333 0.115 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 2.76e-01 0.156 0.142 0.093 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.99e-02 0.228 0.0971 0.093 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 4.33e-01 0.115 0.146 0.093 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 7.36e-01 -0.05 0.148 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00867 0.122 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0305 0.104 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00382 0.141 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 8.92e-04 0.269 0.0798 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.54e-01 0.146 0.128 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 4.46e-01 0.11 0.144 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 6.40e-02 -0.275 0.148 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 7.21e-01 0.0353 0.0986 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0255 0.119 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 3.94e-03 0.339 0.116 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 1.50e-01 -0.22 0.152 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 5.33e-01 0.0949 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 4.06e-02 -0.291 0.141 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 1.93e-01 -0.171 0.131 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 2.64e-01 -0.179 0.16 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.91e-05 0.383 0.0894 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 6.05e-01 0.0753 0.145 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 5.21e-01 0.0919 0.143 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0611 0.0755 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0946 0.0889 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0801 0.118 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.39e-04 0.31 0.0798 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0534 0.107 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 4.40e-01 0.107 0.139 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0484 0.104 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 8.66e-01 0.0174 0.103 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 4.49e-01 -0.098 0.129 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 8.17e-05 0.291 0.0725 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 1.24e-01 -0.162 0.105 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 8.85e-01 -0.023 0.159 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 5.27e-01 0.0764 0.121 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 2.40e-01 -0.127 0.108 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 9.06e-01 0.015 0.126 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 8.50e-06 0.349 0.0765 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.31e-01 -0.154 0.128 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 2.58e-01 -0.181 0.16 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 5.50e-02 0.206 0.107 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 9.68e-01 0.00453 0.114 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0763 0.143 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.97e-04 0.333 0.0879 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 6.41e-01 0.0595 0.128 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0628 0.154 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 1.15e-01 -0.169 0.107 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 6.26e-01 -0.048 0.0983 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 9.14e-01 0.0128 0.118 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.09e-04 0.32 0.081 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0936 0.124 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 3.46e-01 -0.161 0.171 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 4.64e-01 -0.104 0.141 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 1.40e-01 0.177 0.12 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 9.75e-01 0.00495 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 4.88e-04 0.263 0.0742 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 1.84e-01 -0.186 0.14 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 6.69e-01 0.0705 0.165 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0971 0.143 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 5.22e-01 -0.096 0.15 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 4.26e-01 -0.136 0.171 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 3.99e-04 0.368 0.102 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 3.65e-01 -0.142 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 2.90e-02 0.366 0.167 0.091 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 4.38e-01 0.0849 0.109 0.091 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 2.72e-01 -0.128 0.117 0.091 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 2.87e-01 -0.165 0.154 0.091 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.39e-03 0.233 0.0718 0.091 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 9.83e-01 0.00283 0.136 0.091 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0292 0.156 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.71e-01 0.134 0.121 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 6.40e-01 0.0623 0.133 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 2.08e-01 -0.179 0.142 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 3.24e-02 0.193 0.0896 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 1.88e-01 -0.19 0.144 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 3.45e-01 0.137 0.145 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 8.01e-02 0.167 0.0948 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 9.72e-01 0.00457 0.129 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0849 0.115 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.79e-05 0.369 0.0862 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0519 0.135 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 2.25e-01 -0.199 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 6.53e-01 0.0544 0.121 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 3.55e-01 0.129 0.14 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0599 0.124 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.40e-03 0.288 0.0935 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0561 0.154 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 7.20e-01 0.0526 0.146 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.21e-01 0.121 0.0984 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0241 0.126 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0442 0.118 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.07e-07 0.454 0.0824 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 7.52e-01 -0.042 0.133 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 4.31e-01 -0.137 0.174 0.1 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 6.29e-01 -0.089 0.184 0.1 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 7.68e-01 0.0457 0.155 0.1 PB L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0441 0.118 0.1 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0237 0.143 0.1 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 1.97e-01 0.221 0.171 0.1 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 1.28e-01 -0.244 0.16 0.093 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 6.64e-01 0.0533 0.123 0.093 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0909 0.128 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 8.49e-01 0.0225 0.118 0.093 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.55e-01 0.0851 0.0745 0.093 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0967 0.145 0.093 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 1.89e-01 -0.2 0.152 0.092 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 8.82e-01 0.0214 0.144 0.092 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0173 0.104 0.092 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 4.54e-01 -0.123 0.164 0.092 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.09e-06 0.433 0.0862 0.092 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.42e-01 0.163 0.139 0.092 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 9.93e-01 0.00134 0.158 0.088 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 5.94e-01 0.0687 0.129 0.088 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 1.49e-01 0.163 0.113 0.088 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 6.89e-01 0.0508 0.127 0.088 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 7.22e-01 0.0524 0.147 0.088 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0968 0.162 0.088 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 1.30e-01 -0.25 0.164 0.088 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 3.18e-02 0.253 0.117 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 1.09e-01 0.138 0.0856 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 8.19e-01 0.0195 0.0849 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.13e-01 0.147 0.0921 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 3.65e-01 0.129 0.142 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0645 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 4.47e-02 0.198 0.0981 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0892 0.135 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.71e-01 0.109 0.0991 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0395 0.0925 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 6.44e-01 0.0408 0.0883 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00113 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 4.96e-01 -0.108 0.159 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 8.19e-01 0.029 0.127 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 3.61e-01 -0.171 0.186 0.091 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.16e-02 0.341 0.147 0.091 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 2.06e-01 -0.225 0.177 0.091 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 6.25e-01 -0.081 0.165 0.091 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.41e-07 0.462 0.0834 0.091 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 3.30e-01 0.162 0.166 0.091 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 1.94e-02 -0.362 0.154 0.091 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 5.00e-01 0.0708 0.105 0.091 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 5.55e-01 0.0618 0.105 0.091 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.03e-03 0.294 0.0882 0.091 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0712 0.141 0.091 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 4.53e-02 -0.316 0.157 0.091 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.41e-01 0.158 0.135 0.091 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 5.79e-01 0.0817 0.147 0.09 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 5.02e-01 0.0842 0.125 0.09 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0373 0.0878 0.09 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 1.43e-01 0.162 0.11 0.09 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 5.41e-01 0.0866 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 1.94e-01 -0.204 0.156 0.09 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 5.28e-03 -0.384 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0648 0.178 0.082 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.30e-02 0.342 0.149 0.082 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0631 0.139 0.082 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 5.77e-02 0.265 0.139 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 5.68e-01 -0.079 0.138 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 9.11e-01 0.0155 0.139 0.082 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0457 0.142 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 5.43e-02 -0.283 0.146 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 7.51e-01 0.04 0.126 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 2.22e-02 -0.232 0.101 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 7.05e-01 0.051 0.135 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 8.70e-02 0.152 0.0883 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 2.04e-01 0.191 0.15 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 7.77e-01 -0.039 0.137 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 2.36e-01 -0.152 0.128 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 8.77e-01 0.0148 0.0952 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0191 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 3.09e-03 0.215 0.072 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0199 0.131 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 1.48e-01 0.157 0.108 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 9.55e-02 0.144 0.0859 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0254 0.0809 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.38e-01 0.0942 0.0797 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 4.64e-01 0.104 0.142 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0965 0.153 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 6.10e-02 0.179 0.095 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 2.12e-01 -0.184 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 1.23e-01 0.159 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 3.15e-01 0.0792 0.0786 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 2.67e-02 0.213 0.0954 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -823024 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00208 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -823001 sc-eQTL 1.61e-01 -0.217 0.154 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 3.71e-01 -0.116 0.129 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -903962 sc-eQTL 9.16e-01 0.0148 0.14 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 650098 sc-eQTL 1.73e-01 0.133 0.0973 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -533984 sc-eQTL 9.30e-01 0.0107 0.121 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -237872 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0604 0.102 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 sc-eQTL 5.44e-06 0.396 0.0848 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 1314 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0147 0.125 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118503 TNFAIP3 2333 eQTL 0.0273 0.0515 0.0233 0.0 0.0 0.08
ENSG00000220412 AL356234.1 162346 eQTL 0.0129 0.107 0.043 0.00144 0.0 0.08
ENSG00000237499 AL357060.1 1314 eQTL 0.000126 0.0854 0.0222 0.00263 0.00215 0.08

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -533984 8.85e-07 4.24e-07 3.05e-07 3.19e-07 1.05e-07 3.32e-07 6.08e-07 8.37e-08 2.75e-07 2.43e-07 4.13e-07 3.27e-07 9.44e-07 1.57e-07 4.33e-07 1.75e-07 8.42e-08 4.39e-07 2.57e-07 3.96e-07 2.01e-07 3.8e-07 3.19e-07 4.81e-08 1.2e-06 2.49e-07 3.16e-07 2.73e-07 4.15e-07 2.89e-07 2.83e-07 3.51e-08 6.08e-08 6.95e-07 3.63e-07 5.2e-08 2.14e-07 2.03e-07 7.42e-08 4.17e-08 3.02e-07 5.96e-07 1.22e-07 1.83e-08 8.59e-08 1.26e-07 1.07e-07 3.14e-09 4.61e-08
ENSG00000220412 AL356234.1 162346 5.92e-06 6.47e-06 1.26e-06 3.08e-06 1.74e-06 1.52e-06 7.48e-06 1.04e-06 5.09e-06 2.81e-06 6.44e-06 3.6e-06 9.86e-06 2.82e-06 9.3e-07 3.74e-06 1.85e-06 3.49e-06 1.44e-06 2.62e-06 2.79e-06 5.09e-06 4.69e-06 1.55e-06 8.55e-06 1.48e-06 2.75e-06 1.76e-06 4.42e-06 4.12e-06 2.81e-06 5.84e-07 6.5e-07 3e-06 2.69e-06 1.18e-06 1.01e-06 1.85e-06 9.19e-07 8.57e-07 8.59e-07 8.16e-06 1.8e-06 1.78e-07 7.17e-07 1.8e-06 8.4e-07 6.6e-07 4.38e-07