logo

Genes within 1Mb (chr6:138230517:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0634 0.106 0.139 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 7.78e-03 0.214 0.0797 0.139 B L1
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0695 0.0808 0.139 B L1
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 8.12e-01 0.0246 0.103 0.139 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 7.71e-01 0.019 0.0652 0.139 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 1.25e-01 -0.14 0.0908 0.139 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 5.93e-01 0.0287 0.0536 0.139 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.93e-01 0.0138 0.103 0.139 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.39e-02 0.203 0.117 0.139 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.19e-01 0.0974 0.0789 0.139 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 5.41e-01 0.0457 0.0746 0.139 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 5.38e-01 0.0606 0.0983 0.139 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0383 0.0699 0.139 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 1.59e-01 0.109 0.077 0.139 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.23e-01 0.0873 0.0564 0.139 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0198 0.0881 0.139 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 4.58e-01 0.0945 0.127 0.139 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 6.50e-01 0.0378 0.0833 0.139 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 8.30e-01 0.0183 0.0849 0.139 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 8.46e-01 0.0177 0.0911 0.139 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0344 0.0655 0.139 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0211 0.0857 0.139 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 6.07e-02 0.0912 0.0484 0.139 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 3.17e-01 0.0962 0.096 0.139 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 6.89e-02 0.239 0.131 0.14 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.33e-02 0.196 0.0915 0.14 DC L1
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 6.32e-01 0.0519 0.108 0.14 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0982 0.104 0.14 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0152 0.121 0.14 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 8.70e-01 0.0175 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 2.98e-01 0.109 0.104 0.14 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 7.45e-04 -0.42 0.123 0.14 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 1.11e-01 0.169 0.106 0.14 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 2.60e-01 -0.106 0.0934 0.139 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 7.72e-02 0.114 0.0643 0.139 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 3.18e-01 0.0853 0.0853 0.139 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0502 0.0677 0.139 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 3.25e-01 0.12 0.122 0.139 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0239 0.0717 0.139 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 2.37e-01 0.11 0.093 0.139 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0418 0.127 0.139 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0149 0.084 0.139 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 1.58e-01 0.161 0.113 0.139 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.95e-02 0.206 0.0993 0.139 NK L1
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 5.88e-01 0.0462 0.0851 0.139 NK L1
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 5.00e-01 0.0664 0.0983 0.139 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0463 0.0728 0.139 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 3.31e-01 0.0912 0.0935 0.139 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.68e-02 0.163 0.0675 0.139 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0519 0.103 0.139 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0482 0.135 0.139 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.85e-01 0.0759 0.0871 0.139 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0761 0.108 0.139 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 4.50e-01 0.0739 0.0977 0.139 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.42e-01 0.0313 0.0512 0.139 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 8.61e-03 0.274 0.103 0.139 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 6.00e-02 0.129 0.0683 0.139 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0698 0.102 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 1.94e-02 -0.35 0.148 0.143 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 1.51e-01 0.189 0.131 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 7.78e-01 0.0194 0.0686 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0327 0.144 0.143 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 2.09e-01 -0.167 0.132 0.143 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 7.37e-02 -0.268 0.149 0.143 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.06e-02 0.345 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0648 0.116 0.143 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0455 0.131 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 1.72e-02 0.215 0.0896 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 9.93e-01 0.00101 0.114 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 2.45e-01 0.105 0.0904 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 5.30e-01 0.077 0.122 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 3.53e-01 0.0968 0.104 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 2.94e-01 -0.135 0.128 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 7.15e-01 0.0492 0.135 0.14 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.95e-01 0.0862 0.101 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 4.96e-01 0.0862 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 4.09e-01 0.0962 0.116 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 9.44e-01 0.00612 0.087 0.14 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 1.17e-01 -0.198 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 4.99e-01 0.0675 0.0998 0.14 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0369 0.129 0.14 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00671 0.125 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.04e-03 0.268 0.0858 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 1.67e-01 0.164 0.119 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 5.42e-01 0.0664 0.109 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0212 0.069 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 2.07e-01 -0.127 0.1 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 3.79e-01 0.0621 0.0704 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 3.35e-01 -0.104 0.108 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0188 0.122 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 6.20e-01 0.0414 0.0834 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0564 0.1 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 1.66e-01 0.159 0.114 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.16e-01 0.0652 0.1 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 3.16e-01 -0.11 0.109 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00137 0.0807 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 5.26e-02 0.25 0.128 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 9.04e-01 0.0155 0.129 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.66e-02 0.246 0.11 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 7.80e-01 0.0379 0.136 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0313 0.13 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0305 0.0791 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0328 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.39e-01 0.17 0.115 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 3.92e-02 0.253 0.122 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 3.23e-02 0.265 0.123 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.81e-01 0.0679 0.0774 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 4.61e-01 0.0754 0.102 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 5.43e-01 0.0588 0.0965 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0387 0.0718 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 4.91e-01 0.059 0.0856 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.61e-01 0.0808 0.0574 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00556 0.093 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0213 0.121 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 1.64e-01 0.125 0.0894 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 2.99e-01 0.117 0.112 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 8.14e-01 0.0227 0.0965 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0346 0.0654 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 1.84e-02 0.215 0.0903 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.34e-01 0.105 0.07 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 3.71e-01 0.082 0.0915 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.62e-01 0.0237 0.136 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 8.60e-02 0.159 0.0922 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0183 0.108 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 7.42e-02 0.189 0.105 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 6.46e-02 -0.126 0.068 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 5.80e-01 -0.064 0.115 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0771 0.0822 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0746 0.11 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 5.74e-01 0.0789 0.14 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.23e-01 -0.099 0.0999 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 8.92e-01 -0.017 0.125 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 5.05e-01 0.0681 0.102 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0611 0.0794 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 8.51e-01 0.0206 0.109 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 2.24e-01 0.107 0.0881 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 1.08e-01 0.179 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 2.50e-01 0.153 0.133 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 1.91e-01 0.111 0.0848 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 6.55e-01 0.0458 0.102 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 8.97e-01 0.0133 0.103 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0807 0.0725 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 9.08e-01 0.0119 0.103 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 5.47e-02 0.104 0.0536 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 4.49e-01 0.0814 0.107 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 5.87e-01 0.0807 0.148 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 9.39e-02 0.174 0.104 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0736 0.138 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 2.78e-01 -0.072 0.0662 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 6.99e-01 0.0437 0.113 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0331 0.112 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 5.77e-01 0.0678 0.121 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.13e-01 0.0318 0.134 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 5.20e-01 0.0785 0.122 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 9.84e-01 0.00274 0.139 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0413 0.126 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 1.02e-01 -0.14 0.0851 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0337 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 8.81e-02 0.171 0.1 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00767 0.127 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0327 0.148 0.139 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 8.87e-01 0.0146 0.103 0.139 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 9.21e-01 0.0135 0.136 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 4.12e-01 0.0926 0.113 0.139 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00687 0.0648 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 4.17e-02 0.247 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 8.29e-01 0.0194 0.0894 0.139 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0818 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00203 0.139 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 4.36e-01 0.0922 0.118 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 8.08e-01 0.0308 0.126 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 6.98e-01 0.0488 0.126 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0884 0.0804 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 8.75e-02 0.2 0.116 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 7.84e-03 0.285 0.106 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 5.91e-01 0.0691 0.128 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 1.52e-01 0.176 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.40e-02 0.245 0.108 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 8.06e-01 -0.024 0.0976 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 3.04e-01 0.109 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0307 0.0759 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 4.14e-01 0.0818 0.0999 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.35e-01 0.101 0.0674 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.14e-01 0.0267 0.114 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 3.74e-01 -0.13 0.146 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0174 0.124 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0846 0.11 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.136 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0454 0.085 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0491 0.135 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 6.06e-02 0.207 0.11 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0142 0.137 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 2.30e-01 0.153 0.127 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.41e-01 0.104 0.109 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000918 0.102 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 9.27e-01 0.0101 0.109 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 1.04e-01 -0.124 0.076 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00551 0.113 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.93e-01 0.0946 0.0725 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 2.31e-01 -0.138 0.115 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 2.55e-01 -0.177 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0794 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 1.57e-01 0.148 0.104 0.137 PB L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0924 0.169 0.137 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 9.81e-01 0.0031 0.127 0.137 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 3.17e-01 -0.15 0.149 0.137 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 8.64e-01 0.018 0.105 0.137 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 4.08e-01 -0.127 0.153 0.137 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0306 0.138 0.139 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0453 0.11 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0675 0.102 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 4.49e-01 0.0827 0.109 0.139 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0066 0.0643 0.139 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00883 0.128 0.139 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 2.53e-01 0.0946 0.0825 0.139 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 3.47e-01 -0.117 0.125 0.139 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000252 0.133 0.139 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 7.90e-01 0.0243 0.0912 0.139 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0701 0.143 0.139 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 3.38e-01 -0.106 0.111 0.139 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00144 0.0799 0.139 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 5.94e-01 0.0612 0.115 0.139 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 6.17e-01 -0.049 0.0977 0.139 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 1.51e-01 -0.175 0.121 0.139 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0208 0.137 0.134 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.62e-01 0.11 0.0981 0.134 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 5.43e-01 0.0795 0.13 0.134 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 1.18e-01 -0.172 0.109 0.134 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 7.41e-01 0.0423 0.128 0.134 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 8.84e-01 0.0215 0.147 0.134 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 8.90e-02 0.204 0.119 0.134 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 1.00e-02 -0.36 0.138 0.134 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.08e-01 0.035 0.144 0.134 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 1.41e-01 -0.15 0.102 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.20e-01 0.0901 0.0732 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 2.33e-01 0.101 0.0842 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0654 0.0801 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 3.26e-01 -0.121 0.123 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 7.25e-01 0.0386 0.11 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 6.26e-01 0.0451 0.0924 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 4.37e-01 -0.1 0.129 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0174 0.0857 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0349 0.117 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.29e-01 0.0784 0.0801 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 2.73e-01 0.109 0.0989 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0348 0.0766 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 1.09e-01 0.201 0.125 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 9.61e-02 -0.197 0.118 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 7.79e-02 0.182 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 4.21e-01 -0.111 0.138 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0145 0.11 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00453 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.81e-01 0.133 0.151 0.13 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 3.69e-01 -0.126 0.14 0.13 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 3.11e-01 0.153 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0214 0.0782 0.13 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 9.01e-01 0.0194 0.156 0.13 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 7.27e-01 0.0411 0.117 0.13 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0319 0.142 0.13 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 7.54e-01 0.0431 0.137 0.138 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.21e-01 0.113 0.0919 0.138 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 2.75e-02 -0.247 0.111 0.138 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 6.08e-01 0.041 0.0798 0.138 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 4.13e-03 0.353 0.122 0.138 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0667 0.128 0.138 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 4.63e-01 0.0861 0.117 0.138 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0182 0.139 0.138 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0234 0.119 0.138 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 4.36e-01 -0.102 0.13 0.138 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 9.06e-02 0.131 0.0771 0.138 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 7.17e-01 0.0431 0.119 0.138 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 3.93e-01 0.0839 0.0979 0.138 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 2.08e-01 0.157 0.125 0.138 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 3.91e-01 0.0808 0.0941 0.138 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 6.82e-02 0.207 0.113 0.138 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00499 0.139 0.138 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0219 0.123 0.138 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00198 0.148 0.136 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 1.99e-02 0.266 0.113 0.136 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0619 0.125 0.136 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 3.38e-01 -0.112 0.116 0.136 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 2.19e-01 -0.141 0.114 0.136 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 9.04e-02 0.196 0.115 0.136 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0893 0.127 0.136 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 7.51e-02 -0.205 0.114 0.136 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 4.98e-02 0.231 0.117 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0301 0.126 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 9.51e-03 0.224 0.0858 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 8.90e-02 0.195 0.114 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0159 0.112 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 2.50e-01 0.0872 0.0756 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0962 0.116 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.69e-01 0.111 0.0801 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 2.03e-01 -0.163 0.128 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 7.40e-01 0.0387 0.117 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 7.88e-03 0.213 0.0795 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 1.90e-01 0.156 0.118 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 2.17e-01 0.135 0.109 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 9.49e-01 0.00402 0.0624 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 1.20e-01 -0.144 0.0924 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 3.79e-01 0.0573 0.0651 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 6.99e-01 0.043 0.111 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 9.77e-02 -0.156 0.0936 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 2.30e-01 0.0842 0.07 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 1.91e-01 0.111 0.0841 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 8.18e-01 -0.016 0.0694 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 7.37e-01 0.0415 0.123 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 2.69e-01 -0.112 0.101 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 2.44e-01 0.105 0.0901 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0747 0.132 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 8.69e-01 0.0138 0.0831 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 7.27e-01 0.045 0.129 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 1.22e-01 0.106 0.0684 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0491 0.11 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 6.66e-01 0.0363 0.0842 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 sc-eQTL 2.19e-03 0.371 0.12 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 8.78e-01 0.0117 0.0761 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 1.29e-01 0.169 0.111 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -462031 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0278 0.135 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0073 0.113 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -542992 sc-eQTL 1.97e-01 0.153 0.118 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -173014 sc-eQTL 3.42e-02 0.217 0.102 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 123098 sc-eQTL 8.58e-01 0.0155 0.0867 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -904563 sc-eQTL 7.48e-01 0.0325 0.101 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 363303 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0455 0.0755 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -757744 sc-eQTL 3.86e-01 0.0858 0.0986 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -798228 sc-eQTL 8.87e-02 0.108 0.0633 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 362284 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0795 0.106 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA -904563 eQTL 0.0398 -0.0273 0.0132 0.0 0.0 0.157
ENSG00000135540 NHSL1 -462054 eQTL 0.00861 0.0897 0.0341 0.0 0.0 0.157

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220412 \N 523316 6.09e-07 5.18e-07 7.76e-08 3.62e-07 1.38e-07 2.95e-07 6.08e-07 7.52e-08 3.94e-07 2.34e-07 4.74e-07 3.62e-07 9.79e-07 1.59e-07 2.14e-07 2.1e-07 2.98e-07 4.2e-07 1.69e-07 9.01e-08 2.09e-07 2.76e-07 4.06e-07 1.63e-07 4.88e-07 2e-07 1.83e-07 1.85e-07 4.39e-07 4.61e-07 1.93e-07 1.58e-07 5.86e-08 2.31e-07 3.07e-07 3.71e-07 1.45e-07 1.69e-07 7.63e-08 2.65e-08 5.77e-08 3.85e-07 1.68e-07 1.1e-08 7.93e-08 7.84e-08 8.94e-08 8.37e-08 1.58e-07