logo

Genes within 1Mb (chr6:139099116:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 8.03e-01 0.0265 0.106 0.143 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 8.11e-01 0.0194 0.0809 0.143 B L1
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 9.71e-01 0.00296 0.0808 0.143 B L1
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0698 0.103 0.143 B L1
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 7.85e-01 0.0249 0.0911 0.143 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0473 0.0534 0.143 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 2.40e-01 0.154 0.131 0.143 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 5.54e-01 0.0489 0.0826 0.143 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0344 0.0919 0.143 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 9.62e-01 0.00549 0.114 0.143 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 3.73e-01 0.0682 0.0764 0.143 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0295 0.0722 0.143 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 7.85e-01 0.0259 0.0951 0.143 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0102 0.0748 0.143 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0703 0.0546 0.143 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 5.46e-01 0.0565 0.0936 0.143 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0385 0.0923 0.143 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 5.31e-01 0.0791 0.126 0.143 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 1.84e-01 0.11 0.0823 0.143 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0645 0.084 0.143 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 5.67e-01 0.0518 0.0902 0.143 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0807 0.0848 0.143 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 9.04e-02 -0.0817 0.048 0.143 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 7.01e-01 0.0353 0.0918 0.143 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 7.38e-02 -0.199 0.111 0.143 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 1.40e-01 0.184 0.124 0.135 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 6.67e-01 0.0379 0.0879 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 5.08e-01 0.0682 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 3.00e-02 0.248 0.113 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0931 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 7.38e-01 0.0333 0.0993 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 8.19e-01 0.027 0.118 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 1.62e-01 -0.167 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0489 0.0902 0.143 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0647 0.0623 0.143 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0405 0.0823 0.143 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 6.74e-02 0.215 0.117 0.143 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 2.14e-01 0.0857 0.0688 0.143 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 8.44e-01 0.0177 0.0899 0.143 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 9.19e-01 0.00966 0.0951 0.143 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 6.87e-01 0.0495 0.123 0.143 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 8.46e-01 0.0219 0.113 0.142 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0702 0.0994 0.142 NK L1
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0264 0.0844 0.142 NK L1
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 6.08e-01 0.0501 0.0975 0.142 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 2.00e-01 0.119 0.0926 0.142 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 1.29e-01 -0.103 0.0675 0.142 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 2.04e-01 0.115 0.0898 0.142 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0305 0.133 0.143 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.143 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0736 0.106 0.143 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 1.31e-01 0.145 0.0955 0.143 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.21e-01 0.102 0.103 0.143 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 9.16e-01 0.00715 0.0676 0.143 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 6.97e-01 0.0308 0.0791 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0908 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 8.68e-01 0.0225 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0118 0.0703 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0418 0.147 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.52e-01 -0.143 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0177 0.139 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 2.78e-01 -0.129 0.119 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 1.75e-01 -0.203 0.149 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 3.80e-01 0.113 0.129 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0178 0.0895 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 8.48e-01 0.0219 0.114 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 4.75e-01 0.08 0.112 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.77e-01 0.107 0.121 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0585 0.126 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0885 0.116 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 7.19e-01 0.0452 0.125 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 2.46e-01 0.153 0.132 0.144 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 7.61e-01 0.0303 0.0996 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0483 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0791 0.114 0.144 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 4.11e-01 -0.102 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 9.25e-01 0.00921 0.0982 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 8.69e-01 0.0207 0.125 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.144 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 5.33e-01 0.0883 0.141 0.144 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0745 0.125 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 2.50e-01 0.101 0.0874 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 1.77e-01 -0.16 0.118 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.05e-01 -0.013 0.109 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0581 0.0703 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 8.72e-01 0.0213 0.132 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 2.93e-01 0.101 0.0957 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0934 0.126 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 6.88e-02 0.221 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.0829 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 7.21e-01 0.0357 0.1 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00691 0.115 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0166 0.0804 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 1.21e-02 0.318 0.126 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 9.40e-01 0.00987 0.13 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0875 0.119 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 3.03e-01 0.132 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 8.85e-01 0.016 0.111 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0822 0.135 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0743 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 6.57e-01 -0.056 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 5.77e-01 -0.064 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 8.64e-01 0.0197 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 2.27e-01 0.143 0.118 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 9.66e-01 0.0051 0.12 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 1.75e-01 0.102 0.0747 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 8.59e-01 0.0176 0.0991 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0011 0.0935 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00834 0.0829 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0134 0.0558 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 7.19e-01 0.0341 0.0948 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00722 0.0959 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 5.86e-01 0.0642 0.118 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000605 0.0877 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0276 0.0942 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.81e-01 0.0783 0.0892 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 1.22e-01 -0.106 0.0683 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 9.49e-01 0.00657 0.102 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 1.65e-01 -0.153 0.11 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 2.49e-01 0.156 0.135 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 8.17e-01 0.0214 0.0921 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0101 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0279 0.105 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.13e-01 0.116 0.114 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0579 0.0817 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 6.02e-01 0.056 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 5.63e-01 0.065 0.112 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 7.94e-02 0.238 0.135 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 6.64e-01 0.0422 0.0971 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0313 0.121 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 1.71e-01 0.135 0.0985 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0577 0.106 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0788 0.0856 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 4.49e-01 0.0757 0.0997 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 8.09e-01 0.0291 0.12 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.131 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 5.76e-01 0.0469 0.0838 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 4.76e-02 -0.199 0.0999 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 4.21e-01 0.0815 0.101 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0224 0.102 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0064 0.0533 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 2.09e-01 0.135 0.107 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 1.05e-01 -0.199 0.122 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 4.41e-02 0.287 0.142 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 5.27e-01 0.0637 0.101 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 5.38e-01 -0.082 0.133 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0176 0.105 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 9.46e-01 0.00735 0.109 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 5.54e-02 -0.207 0.108 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 3.20e-01 -0.111 0.111 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 3.96e-03 -0.336 0.115 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 4.13e-02 0.268 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 2.19e-01 0.147 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 3.54e-01 -0.127 0.136 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 2.65e-01 0.138 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 7.79e-01 -0.036 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0408 0.099 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.107 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0936 0.122 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 6.95e-01 0.0567 0.145 0.139 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 3.03e-01 -0.103 0.1 0.139 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 4.26e-01 0.106 0.133 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 1.67e-01 0.152 0.109 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 8.17e-01 0.0274 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0868 0.139 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0868 0.102 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 2.59e-01 0.149 0.131 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 1.75e-01 -0.152 0.112 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 7.51e-01 0.0381 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 5.88e-01 0.0647 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 1.05e-01 0.18 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 4.72e-02 -0.203 0.102 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0101 0.11 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0531 0.123 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0377 0.109 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 8.05e-01 0.0241 0.0976 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.106 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 9.27e-04 0.327 0.0975 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 2.78e-02 -0.148 0.067 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 1.32e-01 0.136 0.0899 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 4.79e-01 0.0984 0.139 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 4.99e-01 0.0801 0.118 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00614 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 2.08e-01 0.163 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 1.15e-01 -0.202 0.127 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 3.29e-01 -0.103 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 1.97e-02 0.261 0.111 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 9.48e-01 0.00824 0.127 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0919 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0123 0.102 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0941 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 9.22e-01 -0.011 0.113 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 1.26e-01 -0.111 0.0724 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 3.63e-01 0.0866 0.0949 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 4.98e-01 0.102 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 7.84e-01 0.0366 0.133 0.133 PB L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 3.47e-02 0.213 0.0997 0.133 PB L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0839 0.163 0.133 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0218 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0325 0.102 0.133 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 2.82e-01 0.16 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0547 0.112 0.133 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00429 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 6.83e-02 -0.245 0.134 0.143 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0408 0.108 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 8.90e-02 -0.169 0.0988 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 7.30e-01 0.0367 0.106 0.143 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0856 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 6.48e-01 0.0369 0.0807 0.143 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 6.12e-01 0.0488 0.0961 0.143 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 9.83e-01 0.00283 0.13 0.143 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0679 0.0884 0.143 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.143 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 2.11e-01 0.135 0.107 0.143 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 3.91e-02 -0.229 0.11 0.143 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0227 0.0948 0.143 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.106 0.143 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140537 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0806 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 1.87e-01 0.17 0.128 0.137 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 1.12e-01 -0.147 0.0919 0.137 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 1.59e-02 0.288 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0352 0.138 0.137 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0412 0.113 0.137 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0235 0.12 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 2.56e-01 -0.15 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0982 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0893 0.0703 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0195 0.0811 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 7.75e-02 0.208 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 1.64e-01 0.147 0.105 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.0887 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 9.54e-01 0.00542 0.0928 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 9.82e-01 0.00279 0.124 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0583 0.113 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0663 0.0774 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00844 0.0958 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 5.71e-01 0.0689 0.121 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0415 0.115 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 5.47e-01 0.0601 0.0998 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0678 0.0988 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 5.87e-01 0.0723 0.133 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 1.64e-02 0.39 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 6.47e-01 0.0717 0.156 0.136 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 2.17e-01 0.179 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 3.32e-01 0.151 0.155 0.136 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 8.58e-01 0.0289 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 2.39e-01 -0.143 0.121 0.136 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 3.86e-02 0.288 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0254 0.13 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 3.48e-01 0.082 0.0871 0.14 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0861 0.107 0.14 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0153 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0253 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 5.12e-01 0.0729 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 7.38e-01 0.0361 0.108 0.14 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 2.59e-01 -0.149 0.132 0.14 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 3.56e-01 -0.115 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 1.74e-01 -0.101 0.0741 0.136 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00888 0.114 0.136 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 6.52e-01 0.0542 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 9.26e-01 0.00843 0.0904 0.136 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 6.35e-01 0.0438 0.0923 0.136 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 2.92e-01 0.14 0.133 0.136 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0331 0.149 0.133 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 7.07e-01 0.0437 0.116 0.133 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0796 0.126 0.133 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0581 0.115 0.133 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0367 0.117 0.133 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 4.25e-01 0.102 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 5.16e-01 0.0978 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 2.10e-01 -0.145 0.115 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 1.39e-01 0.185 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 6.11e-01 0.0441 0.0865 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 9.77e-01 0.00336 0.114 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0262 0.111 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0518 0.115 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 7.25e-01 0.0281 0.0799 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0478 0.132 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 3.22e-01 -0.111 0.112 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0039 0.131 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 4.88e-01 0.081 0.117 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 5.38e-01 0.0498 0.0808 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 8.98e-02 -0.201 0.118 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0124 0.109 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 9.41e-01 0.0069 0.093 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0243 0.0652 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -192882 sc-eQTL 7.50e-02 0.242 0.136 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 4.39e-01 0.0767 0.099 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -172246 sc-eQTL 1.55e-01 -0.166 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 6.83e-01 -0.037 0.0905 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0755 0.0673 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0566 0.0811 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 6.20e-02 0.221 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 1.58e-01 0.138 0.0972 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 5.20e-01 0.0559 0.0867 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0384 0.095 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000343 0.127 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0367 0.122 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00635 0.0652 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00404 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 406545 sc-eQTL 5.61e-01 0.0675 0.116 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 7.77e-01 0.0205 0.0721 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.106 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 5.40e-01 0.0558 0.0909 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 406568 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00806 0.128 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325607 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000308 0.119 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695585 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0459 0.103 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 991697 sc-eQTL 8.09e-01 -0.021 0.0867 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -35964 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0044 0.101 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110855 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0983 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70371 sc-eQTL 2.66e-02 -0.141 0.063 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275532 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0917 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 110855 eQTL 7.58e-09 -0.128 0.022 0.00417 0.00249 0.145

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 110855 4.25e-06 5e-06 4.85e-07 2.44e-06 6.22e-07 1.29e-06 3.33e-06 7.94e-07 2.98e-06 1.45e-06 4.29e-06 2.52e-06 7.58e-06 2.16e-06 9.75e-07 2.08e-06 2.06e-06 2.34e-06 1.54e-06 1.3e-06 1.4e-06 3.5e-06 3.46e-06 1.6e-06 5.85e-06 1.03e-06 1.51e-06 1.79e-06 4.15e-06 4.18e-06 1.98e-06 3.05e-07 5.7e-07 1.67e-06 2.01e-06 1.02e-06 8.71e-07 4.46e-07 1.3e-06 3.46e-07 1.83e-07 5.79e-06 5.97e-07 1.67e-07 3.22e-07 3.66e-07 6.75e-07 2.41e-07 2.47e-07