logo

Genes within 1Mb (chr6:139098917:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 9.73e-01 0.00361 0.108 0.135 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 8.46e-01 -0.016 0.0828 0.135 B L1
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 9.02e-01 0.0102 0.0826 0.135 B L1
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 9.00e-01 0.0133 0.105 0.135 B L1
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.62e-01 0.085 0.093 0.135 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 1.59e-01 -0.077 0.0545 0.135 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 4.32e-01 0.105 0.134 0.135 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 2.85e-01 0.0903 0.0843 0.135 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0773 0.0938 0.135 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0384 0.116 0.135 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.41e-01 0.0475 0.0777 0.135 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0168 0.0733 0.135 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 1.71e-01 0.132 0.0961 0.135 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 9.04e-01 0.00921 0.0759 0.135 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0459 0.0556 0.135 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 3.41e-01 0.0906 0.0948 0.135 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 6.03e-01 0.0488 0.0937 0.135 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 9.98e-01 0.000257 0.128 0.135 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 3.05e-01 0.0858 0.0835 0.135 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0644 0.0851 0.135 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 1.02e-01 0.149 0.0909 0.135 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0651 0.086 0.135 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 8.08e-02 -0.0853 0.0486 0.135 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 2.95e-01 0.0975 0.0928 0.135 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 6.78e-02 -0.206 0.112 0.135 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 2.71e-01 0.14 0.127 0.126 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 8.14e-01 0.0212 0.0896 0.126 DC L1
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 3.65e-01 0.0953 0.105 0.126 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 5.42e-02 0.224 0.116 0.126 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.01e-02 -0.187 0.103 0.126 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0441 0.101 0.126 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 9.34e-01 -0.01 0.12 0.126 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.122 0.126 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0863 0.0915 0.135 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0581 0.0633 0.135 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 8.43e-01 0.0166 0.0837 0.135 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 7.59e-02 0.212 0.119 0.135 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.65e-01 0.0636 0.07 0.135 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 2.99e-01 0.0948 0.0911 0.135 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 6.27e-01 0.047 0.0965 0.135 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 4.07e-01 0.103 0.124 0.135 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00175 0.116 0.133 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0651 0.102 0.133 NK L1
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0234 0.0867 0.133 NK L1
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.26e-01 0.121 0.0999 0.133 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.68e-01 0.086 0.0953 0.133 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 2.62e-01 -0.078 0.0695 0.133 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 4.70e-02 0.183 0.0918 0.133 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 4.42e-01 -0.104 0.135 0.135 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0194 0.0873 0.135 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 2.68e-01 -0.119 0.107 0.135 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 1.08e-02 0.248 0.0964 0.135 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 4.21e-01 0.0847 0.105 0.135 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 4.89e-01 0.0478 0.0689 0.135 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 6.19e-01 0.0401 0.0807 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0486 0.159 0.135 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0487 0.14 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00172 0.0725 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 7.97e-01 0.0391 0.152 0.135 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0994 0.159 0.135 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.36e-01 0.0681 0.144 0.135 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 1.25e-01 -0.189 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 2.93e-01 -0.163 0.154 0.135 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 8.25e-01 0.0342 0.155 0.135 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 5.61e-01 0.0767 0.132 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 6.86e-01 -0.037 0.0912 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 7.78e-01 0.0327 0.116 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 1.59e-01 0.161 0.114 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.14e-01 0.124 0.123 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0238 0.105 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 4.35e-01 -0.1 0.128 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0831 0.118 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 6.32e-01 0.0614 0.128 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 4.73e-01 0.0968 0.135 0.136 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00323 0.101 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0329 0.126 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0672 0.116 0.136 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0492 0.126 0.136 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 5.17e-01 0.0648 0.0997 0.136 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 7.10e-01 0.0474 0.127 0.136 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0767 0.117 0.136 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 5.45e-01 0.0871 0.144 0.136 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0598 0.127 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.86e-01 0.0488 0.0894 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 3.49e-01 -0.114 0.121 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 5.07e-01 0.0736 0.111 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 5.63e-01 0.0595 0.103 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 1.38e-01 -0.106 0.0715 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 9.08e-01 0.0155 0.135 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 1.25e-01 0.15 0.0973 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 2.91e-01 -0.135 0.128 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 1.49e-01 0.178 0.123 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 1.25e-01 -0.13 0.0841 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 8.79e-01 0.0155 0.102 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 7.04e-01 0.0443 0.116 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0326 0.111 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 2.12e-01 -0.102 0.0815 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 7.92e-02 0.227 0.129 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 6.80e-01 0.0546 0.132 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 3.75e-01 -0.108 0.121 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 6.66e-01 0.0563 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0015 0.113 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0979 0.137 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0711 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000516 0.128 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0452 0.116 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 9.35e-01 0.00959 0.117 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 3.09e-01 0.123 0.12 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0439 0.122 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 3.32e-01 0.0736 0.0757 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 4.47e-01 0.0762 0.1 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.09e-01 0.119 0.0942 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.97e-01 0.0216 0.0838 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0138 0.0564 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 4.89e-01 0.0664 0.0957 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 3.86e-01 0.0841 0.0968 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 9.51e-01 0.00728 0.119 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0271 0.0889 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 8.70e-02 -0.19 0.111 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 4.53e-01 0.0717 0.0954 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.25e-01 0.0892 0.0904 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0842 0.0694 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 5.27e-01 0.0656 0.104 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 2.43e-01 -0.131 0.112 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 7.12e-02 0.248 0.137 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00625 0.0938 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 9.23e-01 0.0106 0.109 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 3.89e-01 0.0924 0.107 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 4.58e-01 0.0867 0.117 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.78e-01 0.0347 0.0832 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 3.63e-01 0.0995 0.109 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 2.93e-01 0.12 0.114 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 1.56e-01 0.196 0.138 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 7.44e-01 0.0323 0.0988 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 9.60e-01 0.0062 0.123 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.23e-02 0.229 0.0995 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0497 0.108 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 4.56e-01 -0.065 0.0871 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 1.34e-01 0.152 0.101 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 9.38e-01 0.00952 0.122 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 5.97e-02 -0.248 0.131 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 8.59e-01 0.015 0.0843 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 4.06e-02 -0.207 0.1 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 8.56e-02 0.175 0.101 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0196 0.102 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0183 0.0536 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 8.40e-02 0.187 0.108 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 1.39e-01 -0.183 0.123 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 5.22e-02 0.28 0.144 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 3.94e-01 0.0869 0.102 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0482 0.134 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 9.80e-01 0.00269 0.106 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.30e-01 -0.038 0.11 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 5.97e-03 -0.299 0.108 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0898 0.113 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 7.40e-03 -0.316 0.117 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 5.72e-02 0.254 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 1.98e-01 0.156 0.121 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 1.79e-01 -0.186 0.138 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 1.55e-01 0.178 0.125 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00812 0.13 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0225 0.1 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 2.85e-01 -0.117 0.109 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 3.46e-01 -0.117 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 8.90e-01 0.0204 0.147 0.13 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.95e-02 -0.192 0.101 0.13 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0179 0.135 0.13 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.82e-02 0.244 0.111 0.13 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 8.19e-01 0.0277 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 2.60e-01 0.0997 0.0883 0.13 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0738 0.104 0.13 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 3.40e-01 0.129 0.135 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 1.43e-01 -0.168 0.114 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 8.94e-01 0.0164 0.123 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.58e-01 0.139 0.122 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.85e-01 0.0992 0.114 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 2.57e-02 -0.234 0.104 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 6.39e-01 0.053 0.113 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0497 0.126 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0421 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 6.63e-01 0.0436 0.0999 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.01e-01 0.138 0.108 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 1.83e-03 0.316 0.1 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.49e-02 -0.128 0.0688 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 2.09e-02 0.213 0.0913 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 7.05e-01 0.0535 0.141 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 8.03e-01 0.03 0.12 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0375 0.107 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.13e-01 0.164 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 1.05e-01 -0.21 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0362 0.107 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 1.56e-02 0.275 0.113 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 6.78e-01 -0.054 0.13 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0661 0.112 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 9.25e-01 0.00982 0.104 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0335 0.112 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0248 0.116 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 1.75e-01 -0.101 0.0741 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 1.67e-01 0.134 0.0968 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 3.18e-01 0.153 0.152 0.126 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 9.65e-01 0.00606 0.136 0.126 PB L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 2.46e-02 0.231 0.101 0.126 PB L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 8.75e-01 0.0263 0.166 0.126 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0581 0.148 0.126 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0162 0.104 0.126 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 3.47e-01 0.142 0.151 0.126 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0329 0.114 0.126 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0876 0.152 0.126 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 7.13e-02 -0.245 0.135 0.135 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0646 0.108 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 9.60e-02 -0.167 0.0997 0.135 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 5.50e-01 0.0641 0.107 0.135 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0397 0.126 0.135 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 3.52e-01 0.0759 0.0813 0.135 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 2.81e-01 0.105 0.0968 0.135 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0681 0.132 0.135 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0707 0.0903 0.135 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 5.05e-01 0.095 0.142 0.135 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 1.00e-01 0.181 0.109 0.135 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.37e-02 -0.203 0.113 0.135 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0154 0.097 0.135 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 8.90e-01 0.015 0.108 0.135 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -140736 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0322 0.124 0.135 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 2.42e-01 0.155 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 1.50e-01 -0.137 0.0948 0.127 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 2.98e-01 0.132 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 1.75e-02 0.292 0.122 0.127 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 2.87e-01 -0.152 0.142 0.127 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0607 0.116 0.127 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 3.46e-01 -0.117 0.123 0.127 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 4.54e-01 -0.102 0.136 0.127 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0463 0.0997 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0927 0.0714 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 8.42e-01 0.0164 0.0824 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 8.62e-02 0.205 0.119 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 1.97e-01 0.138 0.107 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 3.23e-01 0.089 0.0899 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 7.91e-01 0.025 0.0942 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 8.81e-01 0.0189 0.126 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0595 0.115 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0498 0.0784 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 5.41e-01 0.0593 0.0969 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 3.91e-01 0.105 0.123 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.80e-01 -0.102 0.116 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 1.64e-01 0.141 0.101 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0261 0.1 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 4.30e-01 0.106 0.134 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 4.73e-02 0.329 0.164 0.13 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 8.49e-01 0.0303 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 1.11e-01 0.235 0.146 0.13 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 5.15e-02 0.306 0.156 0.13 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.11e-01 0.0606 0.164 0.13 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0628 0.123 0.13 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 7.44e-02 0.252 0.14 0.13 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 3.13e-01 -0.134 0.133 0.131 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 5.19e-01 0.0577 0.0894 0.131 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0386 0.109 0.131 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 6.91e-01 -0.048 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0486 0.125 0.131 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 7.13e-02 0.205 0.113 0.131 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 8.15e-01 0.0258 0.11 0.131 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 3.69e-01 -0.122 0.135 0.131 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 1.12e-01 -0.204 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 1.40e-01 -0.113 0.0761 0.127 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00553 0.117 0.127 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 4.13e-01 0.101 0.123 0.127 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0376 0.0928 0.127 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 7.57e-01 0.0346 0.112 0.127 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 3.96e-01 0.0806 0.0948 0.127 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 1.08e-01 0.22 0.136 0.127 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0172 0.151 0.127 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 9.25e-01 0.011 0.117 0.127 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0582 0.127 0.127 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0855 0.116 0.127 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0389 0.118 0.127 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 6.98e-01 0.0502 0.129 0.127 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 4.61e-01 0.112 0.151 0.127 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 2.41e-01 -0.137 0.117 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 2.02e-01 0.164 0.128 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 9.23e-01 0.00865 0.0889 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 8.06e-01 0.0288 0.117 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 7.00e-01 0.044 0.114 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00746 0.118 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 4.88e-01 0.057 0.082 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0336 0.136 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0876 0.115 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 8.65e-01 0.0229 0.134 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 4.65e-01 0.0869 0.119 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 8.14e-01 0.0194 0.0825 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 1.81e-01 -0.162 0.121 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 4.59e-01 0.0824 0.111 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 5.90e-01 0.0512 0.0948 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0836 0.0663 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -193081 sc-eQTL 2.16e-01 0.172 0.139 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 2.31e-01 0.121 0.101 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -172445 sc-eQTL 9.14e-02 -0.2 0.118 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0619 0.0918 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 3.35e-01 -0.066 0.0683 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00645 0.0824 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 4.30e-02 0.243 0.119 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 3.48e-01 0.093 0.0989 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 1.42e-01 0.129 0.0877 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00271 0.0965 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 7.99e-01 0.033 0.129 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 2.58e-01 -0.141 0.124 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0255 0.0666 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 8.16e-01 0.0249 0.106 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 406346 sc-eQTL 7.34e-01 0.0402 0.118 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0135 0.0737 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 5.45e-01 0.0654 0.108 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 3.51e-01 0.0867 0.0927 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 406369 sc-eQTL 6.69e-01 0.056 0.131 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 325408 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0292 0.122 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 695386 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0403 0.105 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 991498 sc-eQTL 8.40e-01 -0.018 0.089 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -36163 sc-eQTL 5.05e-01 0.0693 0.104 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 110656 sc-eQTL 2.41e-01 0.119 0.101 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 70172 sc-eQTL 8.09e-02 -0.114 0.0649 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -275731 sc-eQTL 3.60e-02 0.197 0.0936 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 110656 eQTL 2.77e-08 -0.127 0.0226 0.00437 0.00228 0.139

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 110656 6.15e-06 9.42e-06 1.33e-06 4.85e-06 1.8e-06 3.28e-06 9.65e-06 1.45e-06 7.89e-06 4.73e-06 1.08e-05 4.99e-06 1.34e-05 3.88e-06 1.91e-06 6.06e-06 3.69e-06 4.69e-06 2.56e-06 2.81e-06 4.48e-06 7.96e-06 6.91e-06 2.56e-06 1.19e-05 2.55e-06 4.55e-06 3.14e-06 7.11e-06 7.8e-06 4.49e-06 6.3e-07 1.12e-06 2.63e-06 2.89e-06 2.66e-06 1.63e-06 1.08e-06 1.37e-06 8.57e-07 4.96e-07 1.17e-05 9.29e-07 1.67e-07 7.65e-07 1.07e-06 9.51e-07 6.21e-07 4.53e-07