logo

Genes within 1Mb (chr6:139096281:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 9.79e-01 0.00276 0.106 0.145 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000754 0.0808 0.145 B L1
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 9.89e-01 0.00115 0.0807 0.145 B L1
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0121 0.103 0.145 B L1
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 6.82e-01 0.0374 0.091 0.145 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 3.50e-01 -0.05 0.0534 0.145 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 3.40e-01 0.125 0.131 0.145 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 7.11e-01 0.0306 0.0825 0.145 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0469 0.0917 0.145 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0344 0.114 0.145 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 5.08e-01 0.0506 0.0762 0.145 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 7.60e-01 -0.022 0.0719 0.145 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 4.21e-01 0.0763 0.0947 0.145 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0178 0.0745 0.145 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0595 0.0545 0.145 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 6.41e-01 0.0435 0.0933 0.145 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0192 0.092 0.145 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 6.94e-01 0.0493 0.125 0.145 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 2.51e-01 0.0942 0.0818 0.145 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0533 0.0835 0.145 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 2.56e-01 0.102 0.0894 0.145 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0885 0.0841 0.145 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 8.13e-02 -0.0835 0.0477 0.145 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 7.62e-01 0.0277 0.0911 0.145 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 9.61e-02 -0.184 0.11 0.145 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 1.98e-01 0.16 0.124 0.137 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 6.96e-01 0.0343 0.0875 0.137 DC L1
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 3.44e-01 0.097 0.102 0.137 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 2.35e-02 0.257 0.113 0.137 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 3.09e-01 -0.103 0.101 0.137 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 8.28e-01 0.0215 0.0989 0.137 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00183 0.117 0.137 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 1.91e-01 -0.156 0.119 0.137 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0678 0.09 0.145 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0705 0.0622 0.145 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0102 0.0822 0.145 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 9.00e-02 0.199 0.117 0.145 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.94e-01 0.0894 0.0687 0.145 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 7.62e-01 0.0272 0.0898 0.145 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00264 0.095 0.145 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 7.44e-01 0.0401 0.122 0.145 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 9.75e-01 0.00351 0.113 0.144 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0771 0.0991 0.144 NK L1
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0237 0.0842 0.144 NK L1
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 3.21e-01 0.0966 0.0971 0.144 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.86e-01 0.123 0.0924 0.144 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 1.43e-01 -0.099 0.0673 0.144 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 1.98e-01 0.116 0.0897 0.144 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0456 0.132 0.145 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0056 0.0853 0.145 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0941 0.105 0.145 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 4.54e-02 0.191 0.0947 0.145 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 3.78e-01 0.0907 0.103 0.145 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 9.08e-01 0.00777 0.0673 0.145 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 7.07e-01 0.0296 0.0788 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0696 0.154 0.148 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0012 0.135 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0167 0.0701 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 9.70e-01 0.00551 0.147 0.148 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 2.32e-01 -0.183 0.153 0.148 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 8.71e-01 0.0225 0.139 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 2.00e-01 -0.192 0.149 0.148 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 8.94e-01 0.0199 0.15 0.148 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 5.58e-01 0.0756 0.129 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 6.70e-01 -0.038 0.0891 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 8.08e-01 0.0276 0.113 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 2.61e-01 0.135 0.12 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0228 0.102 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0923 0.125 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0997 0.115 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 7.98e-01 0.0321 0.125 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 2.68e-01 0.146 0.132 0.147 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 8.43e-01 0.0197 0.0994 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0426 0.124 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0442 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0992 0.124 0.147 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 7.80e-01 0.0274 0.098 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 6.96e-01 0.0489 0.125 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 2.99e-01 -0.119 0.115 0.147 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 4.69e-01 0.102 0.141 0.147 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0832 0.124 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 3.15e-01 0.0878 0.0873 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 6.89e-01 0.0435 0.108 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 6.90e-01 0.0401 0.1 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0737 0.0701 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 9.05e-01 0.0157 0.132 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 3.70e-01 0.0857 0.0955 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 4.18e-01 -0.102 0.125 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 8.73e-02 0.207 0.12 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 1.31e-01 -0.125 0.0824 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 7.28e-01 0.0347 0.0996 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 7.27e-01 0.04 0.114 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0511 0.109 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0296 0.0801 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 1.68e-02 0.302 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 9.65e-01 0.00564 0.129 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0913 0.119 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 4.94e-01 0.088 0.128 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 9.09e-01 0.0128 0.111 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 4.92e-01 -0.093 0.135 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0254 0.13 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0615 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0731 0.115 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 8.93e-01 0.0156 0.115 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 2.74e-01 0.13 0.119 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0366 0.12 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 2.45e-01 0.0868 0.0745 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 6.30e-01 0.0476 0.0986 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 5.22e-01 0.0597 0.093 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0176 0.0826 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0178 0.0556 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 7.87e-01 0.0256 0.0944 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 9.03e-01 0.0117 0.0955 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 7.23e-01 0.0416 0.117 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0201 0.0874 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 1.16e-01 -0.172 0.109 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 8.41e-01 0.0189 0.0939 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 3.87e-01 0.0771 0.0889 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0959 0.0682 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0101 0.102 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 1.82e-01 -0.147 0.11 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 2.13e-01 0.168 0.135 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 9.56e-01 0.00509 0.0921 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 9.85e-01 0.00203 0.107 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 8.31e-01 0.0225 0.105 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 3.68e-01 0.103 0.114 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0368 0.0817 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 5.74e-01 0.0604 0.107 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 4.25e-01 0.0896 0.112 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 9.20e-02 0.227 0.134 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 7.31e-01 0.0332 0.0965 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00818 0.12 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 5.50e-02 0.188 0.0975 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0575 0.105 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0789 0.085 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 3.58e-01 0.0912 0.099 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 7.70e-01 0.0348 0.119 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 1.99e-01 -0.167 0.13 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 7.01e-01 0.032 0.0833 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 4.66e-02 -0.198 0.0992 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 1.81e-01 0.134 0.1 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0388 0.101 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00673 0.0529 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 2.38e-01 0.126 0.107 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 5.55e-02 0.272 0.141 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 6.54e-01 0.045 0.1 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0746 0.132 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 8.26e-01 0.0229 0.104 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0075 0.109 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 5.12e-02 -0.21 0.107 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 2.17e-01 -0.137 0.111 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 4.34e-03 -0.332 0.115 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 6.12e-02 0.246 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 2.56e-01 0.136 0.119 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 3.77e-01 -0.121 0.136 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 1.78e-01 0.166 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 9.88e-01 0.00195 0.128 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0419 0.0988 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 2.60e-01 -0.121 0.107 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 3.92e-01 -0.105 0.122 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 6.22e-01 0.0712 0.144 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 1.91e-01 -0.131 0.0995 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 5.86e-01 0.0721 0.132 0.141 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 9.39e-02 0.183 0.109 0.141 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.79e-01 0.0179 0.118 0.141 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 3.48e-01 0.0814 0.0865 0.141 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0947 0.102 0.141 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 2.93e-01 0.138 0.131 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 1.48e-01 -0.162 0.111 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 7.95e-01 0.0312 0.12 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 5.21e-01 0.0764 0.119 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.41e-01 0.163 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 2.70e-02 -0.225 0.101 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0662 0.122 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0519 0.109 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 7.57e-01 0.0301 0.0973 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.01e-03 0.324 0.0972 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 2.43e-02 -0.151 0.0667 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 1.26e-01 0.138 0.0896 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 6.24e-01 0.0678 0.138 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 5.56e-01 0.0693 0.118 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00803 0.105 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 1.57e-01 0.183 0.129 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.49e-01 -0.184 0.127 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 4.18e-01 -0.085 0.105 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 2.15e-02 0.256 0.111 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0153 0.127 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0952 0.109 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 9.83e-01 0.00216 0.102 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0573 0.109 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.55e-01 0.0207 0.113 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 1.61e-01 -0.102 0.0724 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 3.07e-01 0.0969 0.0947 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 4.87e-01 0.105 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 7.47e-01 0.0433 0.134 0.137 PB L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 2.20e-02 0.232 0.0998 0.137 PB L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0197 0.164 0.137 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0295 0.146 0.137 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0435 0.102 0.137 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 4.19e-01 0.121 0.149 0.137 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0515 0.112 0.137 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0441 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 4.82e-02 -0.265 0.133 0.146 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0574 0.107 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 1.04e-01 -0.161 0.0986 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 5.26e-01 0.0673 0.106 0.146 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0469 0.125 0.146 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 6.24e-01 0.0396 0.0805 0.146 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 5.56e-01 0.0565 0.0959 0.146 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0207 0.129 0.145 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0889 0.0879 0.145 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 4.09e-01 0.114 0.138 0.145 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 1.10e-01 0.171 0.107 0.145 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 2.71e-02 -0.244 0.11 0.145 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0254 0.0945 0.145 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0355 0.105 0.145 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -143372 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0818 0.12 0.145 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 2.55e-01 0.146 0.128 0.139 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 9.91e-02 -0.152 0.0914 0.139 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 2.46e-01 0.141 0.122 0.139 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 1.21e-02 0.298 0.117 0.139 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0572 0.138 0.139 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0465 0.113 0.139 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 6.27e-01 -0.058 0.119 0.139 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 2.79e-01 -0.143 0.131 0.139 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 7.29e-01 -0.034 0.0978 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0948 0.07 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 9.28e-01 0.00727 0.0809 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 1.24e-01 0.181 0.117 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.29e-01 0.159 0.105 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 7.45e-01 0.0287 0.0884 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0132 0.0925 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00202 0.123 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0697 0.113 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0661 0.0771 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 8.69e-01 0.0158 0.0954 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 5.22e-01 0.0775 0.121 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0443 0.114 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 5.16e-01 0.0647 0.0994 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0698 0.0984 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 6.79e-01 0.055 0.132 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 2.48e-02 0.366 0.162 0.139 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 8.81e-01 0.0235 0.157 0.139 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 2.14e-01 0.181 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 1.75e-01 0.212 0.155 0.139 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.77e-01 0.0251 0.162 0.139 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 3.25e-01 -0.12 0.121 0.139 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 4.05e-02 0.286 0.138 0.139 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0455 0.13 0.142 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 4.33e-01 0.0684 0.087 0.142 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0569 0.107 0.142 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0171 0.118 0.142 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0322 0.121 0.142 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 4.42e-01 0.0853 0.111 0.142 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 8.51e-01 0.0203 0.108 0.142 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 2.33e-01 -0.157 0.131 0.142 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 3.21e-01 -0.123 0.124 0.138 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 1.26e-01 -0.113 0.0738 0.138 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 7.13e-01 0.0419 0.114 0.138 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 5.95e-01 0.0635 0.119 0.138 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 9.03e-01 0.011 0.09 0.138 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0153 0.108 0.138 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 7.88e-01 0.0248 0.0921 0.138 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 3.83e-01 0.116 0.132 0.138 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0331 0.149 0.133 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 7.07e-01 0.0437 0.116 0.133 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0796 0.126 0.133 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0581 0.115 0.133 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0367 0.117 0.133 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 4.25e-01 0.102 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 5.16e-01 0.0978 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 2.10e-01 -0.145 0.115 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 2.06e-01 0.158 0.125 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 7.85e-01 0.0236 0.0866 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 9.10e-01 0.0129 0.114 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 8.35e-01 0.0232 0.111 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0398 0.115 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 6.64e-01 0.0348 0.0799 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0549 0.132 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 2.70e-01 -0.124 0.112 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00188 0.131 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 5.17e-01 0.0755 0.116 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 6.52e-01 0.0364 0.0806 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 8.34e-02 -0.205 0.118 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 6.09e-01 0.0557 0.109 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.46e-01 0.0181 0.0928 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0366 0.065 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -195717 sc-eQTL 1.13e-01 0.216 0.135 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 5.95e-01 0.0526 0.0989 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -175081 sc-eQTL 1.23e-01 -0.179 0.116 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0574 0.0903 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0807 0.0671 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0318 0.081 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 7.61e-02 0.21 0.118 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.42e-01 0.143 0.097 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 4.44e-01 0.0663 0.0866 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0489 0.0949 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00983 0.127 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0554 0.122 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0206 0.0649 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 7.37e-01 0.0349 0.104 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 403710 sc-eQTL 5.73e-01 0.0651 0.115 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 8.27e-01 0.0157 0.0719 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0244 0.105 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 6.56e-01 0.0404 0.0906 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 403733 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0323 0.128 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322772 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0233 0.118 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692750 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0555 0.102 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 988862 sc-eQTL 8.62e-01 -0.015 0.0865 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -38799 sc-eQTL 6.18e-01 0.0504 0.101 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 108020 sc-eQTL 1.63e-01 0.137 0.0981 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 67536 sc-eQTL 3.43e-02 -0.134 0.0629 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -278367 sc-eQTL 1.59e-01 0.129 0.0914 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 108020 eQTL 1.46e-08 -0.125 0.0218 0.00347 0.00182 0.146

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 108020 5.46e-06 5.38e-06 6.54e-07 3.41e-06 1.61e-06 1.52e-06 6.63e-06 1.19e-06 4.54e-06 3.05e-06 7.34e-06 2.94e-06 8.85e-06 1.89e-06 9.52e-07 3.93e-06 2.72e-06 3.91e-06 1.57e-06 1.55e-06 2.61e-06 6.08e-06 4.74e-06 1.93e-06 8.48e-06 2.07e-06 2.72e-06 1.76e-06 5.61e-06 5.03e-06 2.63e-06 4.74e-07 8.25e-07 2.3e-06 1.97e-06 1.32e-06 1.03e-06 5.42e-07 9.61e-07 7.19e-07 8.36e-07 7.23e-06 6.47e-07 1.68e-07 7.12e-07 9.83e-07 1.04e-06 6.91e-07 5.96e-07