logo

Genes within 1Mb (chr6:139095603:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 9.79e-01 0.00276 0.106 0.145 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000754 0.0808 0.145 B L1
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 9.89e-01 0.00115 0.0807 0.145 B L1
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0121 0.103 0.145 B L1
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 6.82e-01 0.0374 0.091 0.145 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 3.50e-01 -0.05 0.0534 0.145 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 3.40e-01 0.125 0.131 0.145 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 7.11e-01 0.0306 0.0825 0.145 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0469 0.0917 0.145 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0344 0.114 0.145 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 5.08e-01 0.0506 0.0762 0.145 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 7.60e-01 -0.022 0.0719 0.145 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 4.21e-01 0.0763 0.0947 0.145 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0178 0.0745 0.145 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0595 0.0545 0.145 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 6.41e-01 0.0435 0.0933 0.145 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0192 0.092 0.145 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 6.94e-01 0.0493 0.125 0.145 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 2.51e-01 0.0942 0.0818 0.145 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0533 0.0835 0.145 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 2.56e-01 0.102 0.0894 0.145 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0885 0.0841 0.145 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 8.13e-02 -0.0835 0.0477 0.145 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 7.62e-01 0.0277 0.0911 0.145 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 9.61e-02 -0.184 0.11 0.145 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 1.98e-01 0.16 0.124 0.137 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 6.96e-01 0.0343 0.0875 0.137 DC L1
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 3.44e-01 0.097 0.102 0.137 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 2.35e-02 0.257 0.113 0.137 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 3.09e-01 -0.103 0.101 0.137 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 8.28e-01 0.0215 0.0989 0.137 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00183 0.117 0.137 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 1.91e-01 -0.156 0.119 0.137 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0678 0.09 0.145 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0705 0.0622 0.145 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0102 0.0822 0.145 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 9.00e-02 0.199 0.117 0.145 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.94e-01 0.0894 0.0687 0.145 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 7.62e-01 0.0272 0.0898 0.145 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00264 0.095 0.145 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 7.44e-01 0.0401 0.122 0.145 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 9.75e-01 0.00351 0.113 0.144 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0771 0.0991 0.144 NK L1
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0237 0.0842 0.144 NK L1
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 3.21e-01 0.0966 0.0971 0.144 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.86e-01 0.123 0.0924 0.144 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 1.43e-01 -0.099 0.0673 0.144 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 1.98e-01 0.116 0.0897 0.144 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0456 0.132 0.145 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0056 0.0853 0.145 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0941 0.105 0.145 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 4.54e-02 0.191 0.0947 0.145 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 3.78e-01 0.0907 0.103 0.145 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 9.08e-01 0.00777 0.0673 0.145 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 7.07e-01 0.0296 0.0788 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0696 0.154 0.148 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0012 0.135 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0167 0.0701 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 9.70e-01 0.00551 0.147 0.148 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 2.32e-01 -0.183 0.153 0.148 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 8.71e-01 0.0225 0.139 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.148 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 2.00e-01 -0.192 0.149 0.148 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 8.94e-01 0.0199 0.15 0.148 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 5.58e-01 0.0756 0.129 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 6.70e-01 -0.038 0.0891 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 8.08e-01 0.0276 0.113 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 2.61e-01 0.135 0.12 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0228 0.102 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0923 0.125 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0997 0.115 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 7.98e-01 0.0321 0.125 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 2.68e-01 0.146 0.132 0.147 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 8.43e-01 0.0197 0.0994 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0426 0.124 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0442 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0992 0.124 0.147 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 7.80e-01 0.0274 0.098 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 6.96e-01 0.0489 0.125 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 2.99e-01 -0.119 0.115 0.147 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 4.69e-01 0.102 0.141 0.147 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0832 0.124 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 3.15e-01 0.0878 0.0873 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 6.89e-01 0.0435 0.108 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 6.90e-01 0.0401 0.1 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0737 0.0701 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 9.05e-01 0.0157 0.132 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 3.70e-01 0.0857 0.0955 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 4.18e-01 -0.102 0.125 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 8.73e-02 0.207 0.12 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 1.31e-01 -0.125 0.0824 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 7.28e-01 0.0347 0.0996 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 7.27e-01 0.04 0.114 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0511 0.109 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0296 0.0801 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 1.68e-02 0.302 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 9.65e-01 0.00564 0.129 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0913 0.119 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 4.94e-01 0.088 0.128 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 9.09e-01 0.0128 0.111 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 4.92e-01 -0.093 0.135 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0254 0.13 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0615 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0731 0.115 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 8.93e-01 0.0156 0.115 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 2.74e-01 0.13 0.119 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0366 0.12 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 2.45e-01 0.0868 0.0745 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 6.30e-01 0.0476 0.0986 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 5.22e-01 0.0597 0.093 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0176 0.0826 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0178 0.0556 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 7.87e-01 0.0256 0.0944 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 9.03e-01 0.0117 0.0955 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 7.23e-01 0.0416 0.117 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0201 0.0874 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 1.16e-01 -0.172 0.109 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 8.41e-01 0.0189 0.0939 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 3.87e-01 0.0771 0.0889 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0959 0.0682 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0101 0.102 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 1.82e-01 -0.147 0.11 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 2.13e-01 0.168 0.135 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 9.56e-01 0.00509 0.0921 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 9.85e-01 0.00203 0.107 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 8.31e-01 0.0225 0.105 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 3.68e-01 0.103 0.114 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0368 0.0817 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 5.74e-01 0.0604 0.107 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 4.25e-01 0.0896 0.112 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 9.20e-02 0.227 0.134 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 7.31e-01 0.0332 0.0965 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00818 0.12 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 5.50e-02 0.188 0.0975 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0575 0.105 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0789 0.085 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 3.58e-01 0.0912 0.099 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 7.70e-01 0.0348 0.119 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 1.99e-01 -0.167 0.13 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 7.01e-01 0.032 0.0833 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 4.66e-02 -0.198 0.0992 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 1.81e-01 0.134 0.1 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0388 0.101 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00673 0.0529 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 2.38e-01 0.126 0.107 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 5.55e-02 0.272 0.141 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 6.54e-01 0.045 0.1 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0746 0.132 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 8.26e-01 0.0229 0.104 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0075 0.109 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 5.12e-02 -0.21 0.107 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 2.17e-01 -0.137 0.111 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 4.34e-03 -0.332 0.115 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 6.12e-02 0.246 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 2.56e-01 0.136 0.119 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 3.77e-01 -0.121 0.136 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 1.78e-01 0.166 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 9.88e-01 0.00195 0.128 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0419 0.0988 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 2.60e-01 -0.121 0.107 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 3.92e-01 -0.105 0.122 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 6.22e-01 0.0712 0.144 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 1.91e-01 -0.131 0.0995 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 5.86e-01 0.0721 0.132 0.141 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 9.39e-02 0.183 0.109 0.141 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.79e-01 0.0179 0.118 0.141 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 3.48e-01 0.0814 0.0865 0.141 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0947 0.102 0.141 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 2.93e-01 0.138 0.131 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 1.48e-01 -0.162 0.111 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 7.95e-01 0.0312 0.12 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 5.21e-01 0.0764 0.119 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.41e-01 0.163 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 2.70e-02 -0.225 0.101 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0662 0.122 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0519 0.109 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 7.57e-01 0.0301 0.0973 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.01e-03 0.324 0.0972 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 2.43e-02 -0.151 0.0667 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 1.26e-01 0.138 0.0896 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 6.24e-01 0.0678 0.138 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 5.56e-01 0.0693 0.118 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00803 0.105 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 1.57e-01 0.183 0.129 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.49e-01 -0.184 0.127 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 4.18e-01 -0.085 0.105 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 2.15e-02 0.256 0.111 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0153 0.127 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0952 0.109 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 9.83e-01 0.00216 0.102 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0573 0.109 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.55e-01 0.0207 0.113 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 1.61e-01 -0.102 0.0724 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 3.07e-01 0.0969 0.0947 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 4.87e-01 0.105 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 7.47e-01 0.0433 0.134 0.137 PB L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 2.20e-02 0.232 0.0998 0.137 PB L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0197 0.164 0.137 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0295 0.146 0.137 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0435 0.102 0.137 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 4.19e-01 0.121 0.149 0.137 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0515 0.112 0.137 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0441 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 4.82e-02 -0.265 0.133 0.146 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0574 0.107 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 1.04e-01 -0.161 0.0986 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 5.26e-01 0.0673 0.106 0.146 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0469 0.125 0.146 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 6.24e-01 0.0396 0.0805 0.146 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 5.56e-01 0.0565 0.0959 0.146 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0207 0.129 0.145 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0889 0.0879 0.145 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 4.09e-01 0.114 0.138 0.145 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 1.10e-01 0.171 0.107 0.145 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 2.71e-02 -0.244 0.11 0.145 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0254 0.0945 0.145 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0355 0.105 0.145 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -144050 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0818 0.12 0.145 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 2.55e-01 0.146 0.128 0.139 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 9.91e-02 -0.152 0.0914 0.139 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 2.46e-01 0.141 0.122 0.139 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 1.21e-02 0.298 0.117 0.139 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0572 0.138 0.139 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0465 0.113 0.139 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 6.27e-01 -0.058 0.119 0.139 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 2.79e-01 -0.143 0.131 0.139 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 7.29e-01 -0.034 0.0978 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0948 0.07 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 9.28e-01 0.00727 0.0809 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 1.24e-01 0.181 0.117 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.29e-01 0.159 0.105 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 7.45e-01 0.0287 0.0884 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0132 0.0925 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00202 0.123 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0697 0.113 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0661 0.0771 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 8.69e-01 0.0158 0.0954 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 5.22e-01 0.0775 0.121 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0443 0.114 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 5.16e-01 0.0647 0.0994 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0698 0.0984 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 6.79e-01 0.055 0.132 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 2.48e-02 0.366 0.162 0.139 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 8.81e-01 0.0235 0.157 0.139 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 2.14e-01 0.181 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 1.75e-01 0.212 0.155 0.139 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.77e-01 0.0251 0.162 0.139 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 3.25e-01 -0.12 0.121 0.139 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 4.05e-02 0.286 0.138 0.139 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0455 0.13 0.142 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 4.33e-01 0.0684 0.087 0.142 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0569 0.107 0.142 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0171 0.118 0.142 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0322 0.121 0.142 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 4.42e-01 0.0853 0.111 0.142 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 8.51e-01 0.0203 0.108 0.142 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 2.33e-01 -0.157 0.131 0.142 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 3.21e-01 -0.123 0.124 0.138 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 1.26e-01 -0.113 0.0738 0.138 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 7.13e-01 0.0419 0.114 0.138 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 5.95e-01 0.0635 0.119 0.138 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 9.03e-01 0.011 0.09 0.138 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0153 0.108 0.138 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 7.88e-01 0.0248 0.0921 0.138 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 3.83e-01 0.116 0.132 0.138 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0331 0.149 0.133 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 7.07e-01 0.0437 0.116 0.133 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0796 0.126 0.133 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0581 0.115 0.133 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0367 0.117 0.133 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 4.25e-01 0.102 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 5.16e-01 0.0978 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 2.10e-01 -0.145 0.115 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 2.06e-01 0.158 0.125 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 7.85e-01 0.0236 0.0866 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 9.10e-01 0.0129 0.114 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 8.35e-01 0.0232 0.111 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0398 0.115 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 6.64e-01 0.0348 0.0799 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0549 0.132 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 2.70e-01 -0.124 0.112 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00188 0.131 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 5.17e-01 0.0755 0.116 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 6.52e-01 0.0364 0.0806 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 8.34e-02 -0.205 0.118 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 6.09e-01 0.0557 0.109 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.46e-01 0.0181 0.0928 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0366 0.065 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -196395 sc-eQTL 1.13e-01 0.216 0.135 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 5.95e-01 0.0526 0.0989 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -175759 sc-eQTL 1.23e-01 -0.179 0.116 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0574 0.0903 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0807 0.0671 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0318 0.081 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 7.61e-02 0.21 0.118 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.42e-01 0.143 0.097 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 4.44e-01 0.0663 0.0866 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0489 0.0949 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00983 0.127 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0554 0.122 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0206 0.0649 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 7.37e-01 0.0349 0.104 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 403032 sc-eQTL 5.73e-01 0.0651 0.115 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 8.27e-01 0.0157 0.0719 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0244 0.105 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 6.56e-01 0.0404 0.0906 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 403055 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0323 0.128 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 322094 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0233 0.118 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 692072 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0555 0.102 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 988184 sc-eQTL 8.62e-01 -0.015 0.0865 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -39477 sc-eQTL 6.18e-01 0.0504 0.101 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 107342 sc-eQTL 1.63e-01 0.137 0.0981 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 66858 sc-eQTL 3.43e-02 -0.134 0.0629 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -279045 sc-eQTL 1.59e-01 0.129 0.0914 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 107342 eQTL 1.41e-08 -0.125 0.0218 0.00353 0.00183 0.146

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 107342 5.62e-06 6.19e-06 8.35e-07 3.6e-06 1.1e-06 1.52e-06 4.25e-06 1.07e-06 5.13e-06 2.59e-06 6.15e-06 3.3e-06 7.73e-06 1.92e-06 1.33e-06 3.71e-06 1.82e-06 3.79e-06 1.36e-06 1e-06 2.9e-06 4.93e-06 4.66e-06 1.55e-06 7.08e-06 1.74e-06 2.43e-06 1.87e-06 4.28e-06 4.07e-06 2.85e-06 5.26e-07 8.14e-07 1.75e-06 1.89e-06 9.61e-07 9.88e-07 4.26e-07 1.32e-06 4.27e-07 2.23e-07 7.04e-06 4.37e-07 2.07e-07 3.63e-07 7.09e-07 9.76e-07 4.43e-07 2.87e-07