logo

Genes within 1Mb (chr6:139093687:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 7.46e-01 0.042 0.129 0.09 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0606 0.0987 0.09 B L1
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00462 0.0986 0.09 B L1
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0639 0.126 0.09 B L1
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 3.78e-01 -0.098 0.111 0.09 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.21e-01 -0.101 0.0649 0.09 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 3.79e-01 0.141 0.16 0.09 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 2.12e-01 0.126 0.1 0.09 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 2.69e-01 -0.124 0.112 0.09 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 7.57e-01 -0.044 0.142 0.09 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 8.56e-01 0.0173 0.0953 0.09 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 5.78e-01 -0.05 0.0898 0.09 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.38e-01 0.00922 0.118 0.09 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.91e-01 0.0247 0.0931 0.09 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 6.26e-01 0.0333 0.0683 0.09 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 1.66e-01 0.161 0.116 0.09 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 4.26e-01 0.0916 0.115 0.09 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 6.63e-01 0.0669 0.154 0.09 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 5.89e-01 0.0544 0.1 0.09 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0861 0.102 0.09 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 8.74e-01 0.0175 0.11 0.09 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0865 0.103 0.09 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.26e-01 -0.09 0.0586 0.09 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.52e-01 0.0842 0.112 0.09 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 7.90e-02 -0.238 0.135 0.09 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 8.60e-02 0.282 0.163 0.081 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0143 0.116 0.081 DC L1
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 5.62e-01 0.0785 0.135 0.081 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 2.24e-01 0.183 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 2.00e-02 -0.308 0.131 0.081 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 7.95e-01 0.034 0.13 0.081 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.32e-01 0.033 0.155 0.081 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 2.79e-01 -0.17 0.157 0.081 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0701 0.115 0.09 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 3.98e-01 -0.067 0.0792 0.09 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 6.22e-01 0.0516 0.105 0.09 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 4.21e-02 0.303 0.148 0.09 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00622 0.0878 0.09 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 8.88e-02 0.194 0.113 0.09 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 7.39e-01 0.0403 0.121 0.09 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 5.96e-01 0.0827 0.156 0.09 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.05e-01 0.116 0.139 0.088 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0327 0.122 0.088 NK L1
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 2.36e-01 -0.123 0.104 0.088 NK L1
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 5.39e-01 0.0739 0.12 0.088 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00508 0.114 0.088 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 7.82e-01 0.0231 0.0835 0.088 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 5.29e-01 0.0699 0.111 0.088 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 2.92e-01 -0.171 0.161 0.09 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0946 0.104 0.09 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0385 0.129 0.09 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.76e-02 0.194 0.116 0.09 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.98e-01 0.0323 0.126 0.09 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.26e-01 0.126 0.0821 0.09 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0156 0.0966 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 6.86e-02 -0.327 0.178 0.097 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0292 0.158 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0461 0.0819 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 8.08e-01 0.0417 0.172 0.097 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 4.14e-01 -0.147 0.179 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 3.52e-01 -0.151 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 9.15e-02 -0.234 0.138 0.097 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.04e-01 0.0436 0.175 0.097 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 9.51e-01 0.0109 0.175 0.097 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.61e-01 0.116 0.158 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0891 0.109 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 6.41e-01 0.065 0.139 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 7.44e-01 0.0448 0.137 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0549 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 5.77e-01 0.0701 0.125 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0129 0.154 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 6.63e-01 0.0617 0.141 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0187 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 9.05e-01 0.0193 0.161 0.091 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00499 0.121 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 9.53e-01 0.00886 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 5.77e-01 0.078 0.139 0.091 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 1.60e-01 -0.212 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.12e-01 0.19 0.119 0.091 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 8.87e-01 0.0218 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0547 0.14 0.091 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 3.07e-01 0.176 0.172 0.091 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.65e-01 -0.111 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.39e-01 0.0502 0.107 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0759 0.145 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0363 0.132 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0462 0.122 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 5.73e-02 -0.162 0.0849 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0895 0.16 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 1.99e-01 0.15 0.116 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 4.14e-01 -0.125 0.153 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 5.43e-02 0.286 0.148 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 1.59e-01 -0.144 0.101 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 9.03e-01 0.0149 0.123 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0523 0.14 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 3.86e-01 -0.116 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.08e-02 -0.25 0.0971 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 3.22e-03 0.456 0.153 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 7.17e-01 0.0579 0.159 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 4.14e-01 -0.12 0.146 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 8.26e-01 0.0341 0.155 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 3.48e-01 -0.126 0.134 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 2.50e-01 -0.188 0.163 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.80e-01 0.00388 0.157 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 3.28e-01 -0.149 0.152 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0174 0.139 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.40e-02 -0.279 0.138 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00351 0.144 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0775 0.149 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 5.96e-01 0.0495 0.0931 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 6.85e-01 0.05 0.123 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0399 0.116 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.43e-01 0.0337 0.103 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 6.42e-01 0.0323 0.0693 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.40e-01 0.0909 0.118 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 4.42e-01 0.0915 0.119 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 7.15e-01 0.0532 0.146 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0645 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 3.24e-01 -0.134 0.136 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0501 0.116 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 5.41e-01 0.0676 0.11 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 7.85e-01 0.0231 0.0849 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.52e-01 0.095 0.126 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 1.57e-01 -0.193 0.136 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.40e-02 0.327 0.161 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.23e-01 0.0547 0.111 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 6.72e-01 0.0547 0.129 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 4.50e-01 0.0958 0.127 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 5.87e-01 0.0752 0.138 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 6.52e-01 0.0445 0.0985 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 5.83e-01 0.0711 0.129 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 7.74e-02 0.238 0.134 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 1.20e-01 0.26 0.167 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0176 0.12 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 7.18e-01 0.0541 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 1.58e-01 0.172 0.122 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0904 0.131 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0947 0.106 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 3.80e-01 0.108 0.123 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0816 0.148 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.90e-01 -0.11 0.158 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00469 0.101 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 1.19e-01 -0.19 0.121 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 4.43e-01 0.0939 0.122 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0634 0.123 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0234 0.0644 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.87e-01 0.0905 0.13 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 1.83e-01 -0.198 0.148 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.80e-01 0.124 0.175 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 3.31e-01 0.12 0.123 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 7.86e-01 0.0443 0.163 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 2.01e-01 -0.164 0.128 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 2.43e-01 -0.156 0.133 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 3.38e-02 -0.281 0.131 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0338 0.137 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 1.07e-01 -0.232 0.143 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 2.91e-01 0.169 0.159 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 2.55e-01 0.165 0.145 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 6.59e-02 -0.304 0.164 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 1.64e-01 0.208 0.149 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 6.65e-01 0.0676 0.156 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 9.48e-01 0.00789 0.12 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.12e-01 -0.107 0.13 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0914 0.148 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 5.46e-01 0.107 0.177 0.089 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 1.22e-01 -0.19 0.122 0.089 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 3.53e-01 0.151 0.162 0.089 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 1.02e-01 0.22 0.134 0.089 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.86e-01 0.0394 0.145 0.089 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.22e-01 0.165 0.106 0.089 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 2.35e-01 -0.149 0.125 0.089 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 7.97e-01 0.0431 0.167 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 4.69e-01 -0.103 0.142 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 3.28e-01 0.149 0.152 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 4.87e-01 0.105 0.151 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 5.46e-01 0.0853 0.141 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.13e-01 -0.206 0.129 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 9.15e-01 0.0149 0.14 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0399 0.153 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0571 0.135 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0604 0.121 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 3.85e-01 0.114 0.131 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 2.01e-02 0.288 0.123 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0534 0.0842 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 6.06e-01 0.0581 0.112 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 7.83e-01 0.0482 0.175 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 5.66e-01 0.0856 0.149 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 2.36e-01 -0.157 0.132 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000944 0.163 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 2.45e-01 -0.187 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0139 0.133 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 1.93e-01 0.184 0.141 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 3.98e-01 0.134 0.158 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 7.80e-01 0.0381 0.136 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 8.23e-01 0.0286 0.127 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0512 0.136 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0875 0.141 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0271 0.0907 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.21e-01 0.0955 0.118 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.44e-01 0.141 0.183 0.093 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.02e-01 0.0852 0.163 0.093 PB L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 1.31e-01 0.187 0.123 0.093 PB L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 6.59e-01 0.0884 0.2 0.093 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0375 0.177 0.093 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 2.89e-01 -0.132 0.124 0.093 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 6.80e-01 0.075 0.181 0.093 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.07e-01 0.0334 0.137 0.093 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 2.28e-01 -0.221 0.182 0.093 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 2.16e-01 -0.21 0.169 0.089 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0705 0.135 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 1.66e-01 -0.173 0.125 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 4.93e-01 0.0919 0.134 0.089 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.82e-01 0.0437 0.158 0.089 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 9.01e-01 0.0127 0.102 0.089 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 3.58e-01 0.111 0.121 0.089 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0167 0.161 0.09 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 2.80e-01 -0.119 0.11 0.09 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 4.58e-01 -0.129 0.173 0.09 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 3.00e-01 0.138 0.133 0.09 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 2.21e-01 -0.169 0.138 0.09 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 3.18e-01 0.118 0.117 0.09 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 3.47e-01 0.124 0.131 0.09 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -145966 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0407 0.15 0.09 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 1.62e-01 0.242 0.172 0.078 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 1.14e-01 -0.196 0.123 0.078 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0606 0.165 0.078 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 8.81e-02 0.274 0.16 0.078 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 5.41e-01 -0.114 0.185 0.078 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0894 0.152 0.078 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0285 0.161 0.078 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 3.75e-01 -0.158 0.177 0.078 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0123 0.124 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0986 0.089 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 4.58e-01 0.0763 0.102 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 2.08e-01 0.188 0.149 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 1.10e-01 0.213 0.133 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 6.52e-02 0.206 0.111 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.39e-01 0.0239 0.117 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 8.57e-01 0.0283 0.156 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.13e-01 -0.117 0.143 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0219 0.098 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.26e-01 0.0112 0.121 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 7.28e-01 0.0534 0.153 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 5.51e-02 -0.278 0.144 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.35e-01 0.189 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 3.39e-01 -0.119 0.125 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 5.06e-01 0.112 0.168 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 5.89e-01 0.107 0.198 0.085 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0909 0.189 0.085 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 1.81e-01 0.235 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 1.50e-01 0.271 0.187 0.085 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 4.20e-01 -0.157 0.195 0.085 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 3.21e-01 0.146 0.146 0.085 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 1.33e-01 0.253 0.168 0.085 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 3.65e-01 -0.151 0.167 0.087 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.14e-01 0.0567 0.112 0.087 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.53e-01 0.00813 0.137 0.087 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 8.85e-01 0.022 0.151 0.087 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0994 0.156 0.087 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 2.04e-02 0.329 0.141 0.087 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 9.21e-01 0.0138 0.138 0.087 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 1.43e-01 -0.248 0.169 0.087 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 1.85e-01 -0.22 0.166 0.079 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 1.20e-02 -0.248 0.0977 0.079 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 6.86e-01 0.0615 0.152 0.079 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 4.53e-01 0.12 0.16 0.079 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0625 0.12 0.079 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 9.09e-01 0.0165 0.145 0.079 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 7.71e-01 0.0359 0.123 0.079 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 6.73e-01 0.0751 0.177 0.079 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 9.41e-01 0.0137 0.186 0.082 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 6.16e-01 0.0728 0.145 0.082 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0138 0.158 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0511 0.144 0.082 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 2.41e-01 -0.171 0.145 0.082 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 1.85e-01 0.211 0.159 0.082 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00314 0.188 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0935 0.145 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 6.54e-01 0.0694 0.154 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0322 0.107 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 5.77e-01 0.0788 0.141 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.35e-01 0.0112 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 1.23e-01 -0.22 0.142 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 2.26e-01 0.12 0.0984 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0481 0.164 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.96e-01 0.0182 0.139 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00952 0.161 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 2.44e-01 0.166 0.142 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 9.29e-01 0.0089 0.0991 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 4.06e-01 -0.121 0.145 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0252 0.134 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0327 0.114 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 4.44e-02 -0.16 0.0791 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -198311 sc-eQTL 1.02e-01 0.273 0.166 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 6.97e-01 0.0473 0.121 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -177675 sc-eQTL 1.38e-01 -0.211 0.142 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0943 0.115 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 2.19e-01 -0.106 0.0857 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 8.95e-01 0.0136 0.103 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 1.32e-01 0.227 0.15 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 8.37e-01 0.0257 0.124 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 3.58e-02 0.231 0.11 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0236 0.121 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 6.06e-01 0.0838 0.162 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0726 0.159 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 1.52e-01 -0.121 0.0844 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 5.11e-01 0.0893 0.135 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 401116 sc-eQTL 3.22e-01 0.149 0.151 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0662 0.0938 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 3.55e-01 0.127 0.137 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 7.92e-01 0.0313 0.118 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 401139 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0772 0.167 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 320178 sc-eQTL 5.48e-01 0.0887 0.147 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 690156 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00664 0.128 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 986268 sc-eQTL 1.59e-01 -0.152 0.107 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -41393 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000704 0.126 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 105426 sc-eQTL 7.13e-01 0.0453 0.123 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 64942 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0458 0.0792 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -280961 sc-eQTL 4.58e-01 0.0852 0.114 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 105426 eQTL 1.72e-05 -0.131 0.0304 0.00229 0.0 0.079

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina