logo

Genes within 1Mb (chr6:139088521:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 8.03e-01 0.0265 0.106 0.143 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 8.11e-01 0.0194 0.0809 0.143 B L1
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 9.71e-01 0.00296 0.0808 0.143 B L1
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0698 0.103 0.143 B L1
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 7.85e-01 0.0249 0.0911 0.143 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0473 0.0534 0.143 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 2.40e-01 0.154 0.131 0.143 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 5.54e-01 0.0489 0.0826 0.143 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0344 0.0919 0.143 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 9.62e-01 0.00549 0.114 0.143 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 3.73e-01 0.0682 0.0764 0.143 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0295 0.0722 0.143 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 7.85e-01 0.0259 0.0951 0.143 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0102 0.0748 0.143 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0703 0.0546 0.143 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 5.46e-01 0.0565 0.0936 0.143 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0385 0.0923 0.143 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 5.31e-01 0.0791 0.126 0.143 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 1.84e-01 0.11 0.0823 0.143 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0645 0.084 0.143 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 5.67e-01 0.0518 0.0902 0.143 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0807 0.0848 0.143 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 9.04e-02 -0.0817 0.048 0.143 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 7.01e-01 0.0353 0.0918 0.143 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 7.38e-02 -0.199 0.111 0.143 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 1.40e-01 0.184 0.124 0.135 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 6.67e-01 0.0379 0.0879 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 5.08e-01 0.0682 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 3.00e-02 0.248 0.113 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0931 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 7.38e-01 0.0333 0.0993 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 8.19e-01 0.027 0.118 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 1.62e-01 -0.167 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0489 0.0902 0.143 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0647 0.0623 0.143 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0405 0.0823 0.143 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 6.74e-02 0.215 0.117 0.143 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 2.14e-01 0.0857 0.0688 0.143 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 8.44e-01 0.0177 0.0899 0.143 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 9.19e-01 0.00966 0.0951 0.143 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 6.87e-01 0.0495 0.123 0.143 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 8.46e-01 0.0219 0.113 0.142 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0702 0.0994 0.142 NK L1
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0264 0.0844 0.142 NK L1
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 6.08e-01 0.0501 0.0975 0.142 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 2.00e-01 0.119 0.0926 0.142 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 1.29e-01 -0.103 0.0675 0.142 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 2.04e-01 0.115 0.0898 0.142 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0305 0.133 0.143 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.143 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0736 0.106 0.143 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 1.31e-01 0.145 0.0955 0.143 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.21e-01 0.102 0.103 0.143 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 9.16e-01 0.00715 0.0676 0.143 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 6.97e-01 0.0308 0.0791 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0908 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 8.68e-01 0.0225 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0118 0.0703 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0418 0.147 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.52e-01 -0.143 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0177 0.139 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 2.78e-01 -0.129 0.119 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 1.75e-01 -0.203 0.149 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 3.80e-01 0.113 0.129 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0178 0.0895 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 8.48e-01 0.0219 0.114 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 4.75e-01 0.08 0.112 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.77e-01 0.107 0.121 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0585 0.126 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0885 0.116 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 7.19e-01 0.0452 0.125 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 2.46e-01 0.153 0.132 0.144 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 7.61e-01 0.0303 0.0996 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0483 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0791 0.114 0.144 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 4.11e-01 -0.102 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 9.25e-01 0.00921 0.0982 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 8.69e-01 0.0207 0.125 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.144 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 5.33e-01 0.0883 0.141 0.144 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0745 0.125 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 2.50e-01 0.101 0.0874 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 1.77e-01 -0.16 0.118 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.05e-01 -0.013 0.109 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0581 0.0703 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 8.72e-01 0.0213 0.132 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 2.93e-01 0.101 0.0957 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0934 0.126 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 6.88e-02 0.221 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.0829 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 7.21e-01 0.0357 0.1 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00691 0.115 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0166 0.0804 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 1.21e-02 0.318 0.126 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 9.40e-01 0.00987 0.13 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0875 0.119 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 3.03e-01 0.132 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 8.85e-01 0.016 0.111 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0822 0.135 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0743 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 6.57e-01 -0.056 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 5.77e-01 -0.064 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 8.64e-01 0.0197 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 2.27e-01 0.143 0.118 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 9.66e-01 0.0051 0.12 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 1.75e-01 0.102 0.0747 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 8.59e-01 0.0176 0.0991 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0011 0.0935 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00834 0.0829 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0134 0.0558 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 7.19e-01 0.0341 0.0948 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00722 0.0959 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 5.86e-01 0.0642 0.118 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000605 0.0877 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0276 0.0942 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.81e-01 0.0783 0.0892 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 1.22e-01 -0.106 0.0683 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 9.49e-01 0.00657 0.102 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 1.65e-01 -0.153 0.11 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 2.49e-01 0.156 0.135 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 8.17e-01 0.0214 0.0921 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0101 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0279 0.105 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.13e-01 0.116 0.114 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0579 0.0817 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 6.02e-01 0.056 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 5.63e-01 0.065 0.112 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 7.94e-02 0.238 0.135 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 6.64e-01 0.0422 0.0971 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0313 0.121 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 1.71e-01 0.135 0.0985 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0577 0.106 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0788 0.0856 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 4.49e-01 0.0757 0.0997 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 8.09e-01 0.0291 0.12 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.131 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 5.76e-01 0.0469 0.0838 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 4.76e-02 -0.199 0.0999 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 4.21e-01 0.0815 0.101 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0224 0.102 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0064 0.0533 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 2.09e-01 0.135 0.107 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 1.05e-01 -0.199 0.122 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 4.41e-02 0.287 0.142 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 5.27e-01 0.0637 0.101 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 5.38e-01 -0.082 0.133 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0176 0.105 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 9.46e-01 0.00735 0.109 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 5.54e-02 -0.207 0.108 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 3.20e-01 -0.111 0.111 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 3.96e-03 -0.336 0.115 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 4.13e-02 0.268 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 2.19e-01 0.147 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 3.54e-01 -0.127 0.136 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 2.65e-01 0.138 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 7.79e-01 -0.036 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0408 0.099 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.107 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0936 0.122 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 6.95e-01 0.0567 0.145 0.139 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 3.03e-01 -0.103 0.1 0.139 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 4.26e-01 0.106 0.133 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 1.67e-01 0.152 0.109 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 8.17e-01 0.0274 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0868 0.139 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0868 0.102 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 2.59e-01 0.149 0.131 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 1.75e-01 -0.152 0.112 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 7.51e-01 0.0381 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 5.88e-01 0.0647 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 1.05e-01 0.18 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 4.72e-02 -0.203 0.102 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0101 0.11 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0531 0.123 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0377 0.109 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 8.05e-01 0.0241 0.0976 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.106 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 9.27e-04 0.327 0.0975 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 2.78e-02 -0.148 0.067 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 1.32e-01 0.136 0.0899 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 4.79e-01 0.0984 0.139 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 4.99e-01 0.0801 0.118 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00614 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 2.08e-01 0.163 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 1.15e-01 -0.202 0.127 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 3.29e-01 -0.103 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 1.97e-02 0.261 0.111 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 9.48e-01 0.00824 0.127 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0919 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0123 0.102 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0941 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 9.22e-01 -0.011 0.113 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 1.26e-01 -0.111 0.0724 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 3.63e-01 0.0866 0.0949 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 4.98e-01 0.102 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 7.84e-01 0.0366 0.133 0.133 PB L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 3.47e-02 0.213 0.0997 0.133 PB L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0839 0.163 0.133 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0218 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0325 0.102 0.133 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 2.82e-01 0.16 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0547 0.112 0.133 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00429 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 6.83e-02 -0.245 0.134 0.143 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0408 0.108 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 8.90e-02 -0.169 0.0988 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 7.30e-01 0.0367 0.106 0.143 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0856 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 6.48e-01 0.0369 0.0807 0.143 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 6.12e-01 0.0488 0.0961 0.143 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 9.83e-01 0.00283 0.13 0.143 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0679 0.0884 0.143 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.143 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 2.11e-01 0.135 0.107 0.143 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 3.91e-02 -0.229 0.11 0.143 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0227 0.0948 0.143 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.106 0.143 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -151132 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0806 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 1.87e-01 0.17 0.128 0.137 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 1.12e-01 -0.147 0.0919 0.137 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 1.59e-02 0.288 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0352 0.138 0.137 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0412 0.113 0.137 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0235 0.12 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 2.56e-01 -0.15 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0982 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0893 0.0703 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0195 0.0811 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 7.75e-02 0.208 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 1.64e-01 0.147 0.105 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.0887 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 9.54e-01 0.00542 0.0928 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 9.82e-01 0.00279 0.124 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0583 0.113 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0663 0.0774 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00844 0.0958 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 5.71e-01 0.0689 0.121 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0415 0.115 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 5.47e-01 0.0601 0.0998 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0678 0.0988 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 5.87e-01 0.0723 0.133 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 1.64e-02 0.39 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 6.47e-01 0.0717 0.156 0.136 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 2.17e-01 0.179 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 3.32e-01 0.151 0.155 0.136 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 8.58e-01 0.0289 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 2.39e-01 -0.143 0.121 0.136 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 3.86e-02 0.288 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0254 0.13 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 3.48e-01 0.082 0.0871 0.14 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0861 0.107 0.14 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0153 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0253 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 5.12e-01 0.0729 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 7.38e-01 0.0361 0.108 0.14 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 2.59e-01 -0.149 0.132 0.14 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 3.56e-01 -0.115 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 1.74e-01 -0.101 0.0741 0.136 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00888 0.114 0.136 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 6.52e-01 0.0542 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 9.26e-01 0.00843 0.0904 0.136 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 6.35e-01 0.0438 0.0923 0.136 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 2.92e-01 0.14 0.133 0.136 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0331 0.149 0.133 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 7.07e-01 0.0437 0.116 0.133 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0796 0.126 0.133 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0581 0.115 0.133 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0367 0.117 0.133 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 4.25e-01 0.102 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 5.16e-01 0.0978 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 2.10e-01 -0.145 0.115 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 1.39e-01 0.185 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 6.11e-01 0.0441 0.0865 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 9.77e-01 0.00336 0.114 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0262 0.111 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0518 0.115 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 7.25e-01 0.0281 0.0799 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0478 0.132 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 3.22e-01 -0.111 0.112 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0039 0.131 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 4.88e-01 0.081 0.117 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 5.38e-01 0.0498 0.0808 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 8.98e-02 -0.201 0.118 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0124 0.109 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 9.41e-01 0.0069 0.093 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0243 0.0652 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -203477 sc-eQTL 7.50e-02 0.242 0.136 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 4.39e-01 0.0767 0.099 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -182841 sc-eQTL 1.55e-01 -0.166 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 6.83e-01 -0.037 0.0905 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0755 0.0673 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0566 0.0811 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 6.20e-02 0.221 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 1.58e-01 0.138 0.0972 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 5.20e-01 0.0559 0.0867 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0384 0.095 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000343 0.127 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0367 0.122 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00635 0.0652 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00404 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 395950 sc-eQTL 5.61e-01 0.0675 0.116 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 7.77e-01 0.0205 0.0721 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.106 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 5.40e-01 0.0558 0.0909 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 395973 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00806 0.128 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 315012 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000308 0.119 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 684990 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0459 0.103 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 981102 sc-eQTL 8.09e-01 -0.021 0.0867 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -46559 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0044 0.101 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 100260 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0983 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 59776 sc-eQTL 2.66e-02 -0.141 0.063 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -286127 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0917 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 100260 eQTL 1.1e-08 -0.126 0.0218 0.0037 0.002 0.145

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 100260 5.53e-06 5.79e-06 7.43e-07 3.5e-06 1.82e-06 2.02e-06 8.39e-06 1.25e-06 4.77e-06 3.15e-06 8.01e-06 2.78e-06 1.04e-05 2.07e-06 9.83e-07 4.56e-06 2.84e-06 3.77e-06 1.87e-06 1.98e-06 3.04e-06 6.81e-06 4.96e-06 2.18e-06 9.14e-06 2.37e-06 3.44e-06 1.8e-06 6.54e-06 7.18e-06 3.25e-06 5.85e-07 6.46e-07 2.74e-06 1.96e-06 1.91e-06 1.64e-06 6.03e-07 1.27e-06 8.7e-07 1.01e-06 8.09e-06 7.18e-07 1.9e-07 7.66e-07 9.83e-07 1.02e-06 6.96e-07 5.64e-07