logo

Genes within 1Mb (chr6:139087456:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 8.03e-01 0.0265 0.106 0.143 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 8.11e-01 0.0194 0.0809 0.143 B L1
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 9.71e-01 0.00296 0.0808 0.143 B L1
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0698 0.103 0.143 B L1
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 7.85e-01 0.0249 0.0911 0.143 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0473 0.0534 0.143 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 2.40e-01 0.154 0.131 0.143 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 5.54e-01 0.0489 0.0826 0.143 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0344 0.0919 0.143 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 9.62e-01 0.00549 0.114 0.143 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 3.73e-01 0.0682 0.0764 0.143 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0295 0.0722 0.143 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 7.85e-01 0.0259 0.0951 0.143 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0102 0.0748 0.143 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0703 0.0546 0.143 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 5.46e-01 0.0565 0.0936 0.143 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0385 0.0923 0.143 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 5.31e-01 0.0791 0.126 0.143 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 1.84e-01 0.11 0.0823 0.143 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0645 0.084 0.143 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 5.67e-01 0.0518 0.0902 0.143 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0807 0.0848 0.143 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 9.04e-02 -0.0817 0.048 0.143 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 7.01e-01 0.0353 0.0918 0.143 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 7.38e-02 -0.199 0.111 0.143 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 1.40e-01 0.184 0.124 0.135 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 6.67e-01 0.0379 0.0879 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 5.08e-01 0.0682 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 3.00e-02 0.248 0.113 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0931 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 7.38e-01 0.0333 0.0993 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 8.19e-01 0.027 0.118 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 1.62e-01 -0.167 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0489 0.0902 0.143 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0647 0.0623 0.143 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0405 0.0823 0.143 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 6.74e-02 0.215 0.117 0.143 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 2.14e-01 0.0857 0.0688 0.143 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 8.44e-01 0.0177 0.0899 0.143 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 9.19e-01 0.00966 0.0951 0.143 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 6.87e-01 0.0495 0.123 0.143 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 8.46e-01 0.0219 0.113 0.142 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0702 0.0994 0.142 NK L1
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0264 0.0844 0.142 NK L1
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 6.08e-01 0.0501 0.0975 0.142 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 2.00e-01 0.119 0.0926 0.142 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 1.29e-01 -0.103 0.0675 0.142 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 2.04e-01 0.115 0.0898 0.142 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0305 0.133 0.143 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.143 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0736 0.106 0.143 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 1.31e-01 0.145 0.0955 0.143 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.21e-01 0.102 0.103 0.143 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 9.16e-01 0.00715 0.0676 0.143 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 6.97e-01 0.0308 0.0791 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0908 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 8.68e-01 0.0225 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0118 0.0703 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0418 0.147 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.52e-01 -0.143 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0177 0.139 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 2.78e-01 -0.129 0.119 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 1.75e-01 -0.203 0.149 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 3.80e-01 0.113 0.129 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0178 0.0895 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 8.48e-01 0.0219 0.114 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 4.75e-01 0.08 0.112 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.77e-01 0.107 0.121 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0585 0.126 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0885 0.116 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 7.19e-01 0.0452 0.125 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 2.46e-01 0.153 0.132 0.144 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 7.61e-01 0.0303 0.0996 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0483 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0791 0.114 0.144 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 4.11e-01 -0.102 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 9.25e-01 0.00921 0.0982 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 8.69e-01 0.0207 0.125 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.144 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 5.33e-01 0.0883 0.141 0.144 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0745 0.125 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 2.50e-01 0.101 0.0874 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 1.77e-01 -0.16 0.118 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.05e-01 -0.013 0.109 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0581 0.0703 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 8.72e-01 0.0213 0.132 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 2.93e-01 0.101 0.0957 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0934 0.126 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 6.88e-02 0.221 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.0829 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 7.21e-01 0.0357 0.1 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00691 0.115 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0166 0.0804 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 1.21e-02 0.318 0.126 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 9.40e-01 0.00987 0.13 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0875 0.119 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 3.03e-01 0.132 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 8.85e-01 0.016 0.111 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0822 0.135 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0743 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 6.57e-01 -0.056 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 5.77e-01 -0.064 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 8.64e-01 0.0197 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 2.27e-01 0.143 0.118 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 9.66e-01 0.0051 0.12 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 1.75e-01 0.102 0.0747 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 8.59e-01 0.0176 0.0991 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0011 0.0935 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00834 0.0829 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0134 0.0558 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 7.19e-01 0.0341 0.0948 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00722 0.0959 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 5.86e-01 0.0642 0.118 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000605 0.0877 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0276 0.0942 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.81e-01 0.0783 0.0892 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 1.22e-01 -0.106 0.0683 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 9.49e-01 0.00657 0.102 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 1.65e-01 -0.153 0.11 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 2.49e-01 0.156 0.135 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 8.17e-01 0.0214 0.0921 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0101 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0279 0.105 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.13e-01 0.116 0.114 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0579 0.0817 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 6.02e-01 0.056 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 5.63e-01 0.065 0.112 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 7.94e-02 0.238 0.135 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 6.64e-01 0.0422 0.0971 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0313 0.121 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 1.71e-01 0.135 0.0985 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0577 0.106 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0788 0.0856 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 4.49e-01 0.0757 0.0997 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 8.09e-01 0.0291 0.12 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.131 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 5.76e-01 0.0469 0.0838 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 4.76e-02 -0.199 0.0999 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 4.21e-01 0.0815 0.101 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0224 0.102 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0064 0.0533 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 2.09e-01 0.135 0.107 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 1.05e-01 -0.199 0.122 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 4.41e-02 0.287 0.142 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 5.27e-01 0.0637 0.101 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 5.38e-01 -0.082 0.133 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0176 0.105 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 9.46e-01 0.00735 0.109 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 5.54e-02 -0.207 0.108 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 3.20e-01 -0.111 0.111 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 3.96e-03 -0.336 0.115 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 4.13e-02 0.268 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 2.19e-01 0.147 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 3.54e-01 -0.127 0.136 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 2.65e-01 0.138 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 7.79e-01 -0.036 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0408 0.099 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.107 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0936 0.122 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 6.95e-01 0.0567 0.145 0.139 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 3.03e-01 -0.103 0.1 0.139 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 4.26e-01 0.106 0.133 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 1.67e-01 0.152 0.109 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 8.17e-01 0.0274 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0868 0.139 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0868 0.102 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 2.59e-01 0.149 0.131 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 1.75e-01 -0.152 0.112 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 7.51e-01 0.0381 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 5.88e-01 0.0647 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 1.05e-01 0.18 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 4.72e-02 -0.203 0.102 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0101 0.11 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0531 0.123 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0377 0.109 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 8.05e-01 0.0241 0.0976 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.106 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 9.27e-04 0.327 0.0975 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 2.78e-02 -0.148 0.067 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 1.32e-01 0.136 0.0899 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 4.79e-01 0.0984 0.139 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 4.99e-01 0.0801 0.118 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00614 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 2.08e-01 0.163 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 1.15e-01 -0.202 0.127 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 3.29e-01 -0.103 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 1.97e-02 0.261 0.111 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 9.48e-01 0.00824 0.127 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0919 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0123 0.102 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0941 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 9.22e-01 -0.011 0.113 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 1.26e-01 -0.111 0.0724 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 3.63e-01 0.0866 0.0949 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 4.98e-01 0.102 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 7.84e-01 0.0366 0.133 0.133 PB L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 3.47e-02 0.213 0.0997 0.133 PB L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0839 0.163 0.133 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0218 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0325 0.102 0.133 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 2.82e-01 0.16 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0547 0.112 0.133 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00429 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 6.83e-02 -0.245 0.134 0.143 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0408 0.108 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 8.90e-02 -0.169 0.0988 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 7.30e-01 0.0367 0.106 0.143 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0856 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 6.48e-01 0.0369 0.0807 0.143 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 6.12e-01 0.0488 0.0961 0.143 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 9.83e-01 0.00283 0.13 0.143 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0679 0.0884 0.143 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.143 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 2.11e-01 0.135 0.107 0.143 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 3.91e-02 -0.229 0.11 0.143 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0227 0.0948 0.143 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.106 0.143 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152197 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0806 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 1.87e-01 0.17 0.128 0.137 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 1.12e-01 -0.147 0.0919 0.137 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 1.59e-02 0.288 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0352 0.138 0.137 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0412 0.113 0.137 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0235 0.12 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 2.56e-01 -0.15 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0982 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0893 0.0703 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0195 0.0811 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 7.75e-02 0.208 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 1.64e-01 0.147 0.105 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.0887 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 9.54e-01 0.00542 0.0928 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 9.82e-01 0.00279 0.124 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0583 0.113 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0663 0.0774 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00844 0.0958 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 5.71e-01 0.0689 0.121 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0415 0.115 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 5.47e-01 0.0601 0.0998 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0678 0.0988 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 5.87e-01 0.0723 0.133 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 1.64e-02 0.39 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 6.47e-01 0.0717 0.156 0.136 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 2.17e-01 0.179 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 3.32e-01 0.151 0.155 0.136 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 8.58e-01 0.0289 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 2.39e-01 -0.143 0.121 0.136 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 3.86e-02 0.288 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0254 0.13 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 3.48e-01 0.082 0.0871 0.14 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0861 0.107 0.14 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0153 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0253 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 5.12e-01 0.0729 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 7.38e-01 0.0361 0.108 0.14 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 2.59e-01 -0.149 0.132 0.14 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 3.56e-01 -0.115 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 1.74e-01 -0.101 0.0741 0.136 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00888 0.114 0.136 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 6.52e-01 0.0542 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 9.26e-01 0.00843 0.0904 0.136 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 6.35e-01 0.0438 0.0923 0.136 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 2.92e-01 0.14 0.133 0.136 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0331 0.149 0.133 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 7.07e-01 0.0437 0.116 0.133 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0796 0.126 0.133 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0581 0.115 0.133 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0367 0.117 0.133 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 4.25e-01 0.102 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 5.16e-01 0.0978 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 2.10e-01 -0.145 0.115 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 1.39e-01 0.185 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 6.11e-01 0.0441 0.0865 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 9.77e-01 0.00336 0.114 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0262 0.111 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0518 0.115 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 7.25e-01 0.0281 0.0799 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0478 0.132 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 3.22e-01 -0.111 0.112 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0039 0.131 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 4.88e-01 0.081 0.117 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 5.38e-01 0.0498 0.0808 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 8.98e-02 -0.201 0.118 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0124 0.109 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 9.41e-01 0.0069 0.093 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0243 0.0652 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -204542 sc-eQTL 7.50e-02 0.242 0.136 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 4.39e-01 0.0767 0.099 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -183906 sc-eQTL 1.55e-01 -0.166 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 6.83e-01 -0.037 0.0905 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0755 0.0673 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0566 0.0811 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 6.20e-02 0.221 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 1.58e-01 0.138 0.0972 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 5.20e-01 0.0559 0.0867 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0384 0.095 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000343 0.127 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0367 0.122 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00635 0.0652 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00404 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 394885 sc-eQTL 5.61e-01 0.0675 0.116 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 7.77e-01 0.0205 0.0721 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.106 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 5.40e-01 0.0558 0.0909 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 394908 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00806 0.128 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313947 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000308 0.119 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683925 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0459 0.103 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 980037 sc-eQTL 8.09e-01 -0.021 0.0867 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -47624 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0044 0.101 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 99195 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0983 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 58711 sc-eQTL 2.66e-02 -0.141 0.063 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287192 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0917 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 99195 eQTL 1.19e-08 -0.127 0.0221 0.00316 0.00159 0.145

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 99195 5.29e-06 5.69e-06 6.27e-07 3.49e-06 1.62e-06 1.54e-06 6.72e-06 1.09e-06 4.83e-06 2.95e-06 7.57e-06 3.17e-06 9.55e-06 1.91e-06 1.23e-06 3.9e-06 2.01e-06 3.93e-06 1.45e-06 1.33e-06 2.75e-06 5.26e-06 4.77e-06 1.92e-06 9e-06 1.96e-06 2.28e-06 1.63e-06 4.73e-06 6.83e-06 2.89e-06 4.16e-07 5.04e-07 2.1e-06 1.96e-06 1.33e-06 1.02e-06 4.56e-07 9.96e-07 5.79e-07 5.68e-07 8.39e-06 4.37e-07 1.64e-07 4.38e-07 1.32e-06 1.02e-06 6.92e-07 4.38e-07