logo

Genes within 1Mb (chr6:139086667:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 8.03e-01 0.0265 0.106 0.143 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 8.11e-01 0.0194 0.0809 0.143 B L1
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 9.71e-01 0.00296 0.0808 0.143 B L1
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0698 0.103 0.143 B L1
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 7.85e-01 0.0249 0.0911 0.143 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0473 0.0534 0.143 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 2.40e-01 0.154 0.131 0.143 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 5.54e-01 0.0489 0.0826 0.143 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0344 0.0919 0.143 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 9.62e-01 0.00549 0.114 0.143 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 3.73e-01 0.0682 0.0764 0.143 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0295 0.0722 0.143 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 7.85e-01 0.0259 0.0951 0.143 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0102 0.0748 0.143 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0703 0.0546 0.143 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 5.46e-01 0.0565 0.0936 0.143 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0385 0.0923 0.143 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 5.31e-01 0.0791 0.126 0.143 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 1.84e-01 0.11 0.0823 0.143 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0645 0.084 0.143 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 5.67e-01 0.0518 0.0902 0.143 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0807 0.0848 0.143 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 9.04e-02 -0.0817 0.048 0.143 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 7.01e-01 0.0353 0.0918 0.143 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 7.38e-02 -0.199 0.111 0.143 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 1.40e-01 0.184 0.124 0.135 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 6.67e-01 0.0379 0.0879 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 5.08e-01 0.0682 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 3.00e-02 0.248 0.113 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0931 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 7.38e-01 0.0333 0.0993 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 8.19e-01 0.027 0.118 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 1.62e-01 -0.167 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0489 0.0902 0.143 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0647 0.0623 0.143 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0405 0.0823 0.143 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 6.74e-02 0.215 0.117 0.143 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 2.14e-01 0.0857 0.0688 0.143 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 8.44e-01 0.0177 0.0899 0.143 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 9.19e-01 0.00966 0.0951 0.143 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 6.87e-01 0.0495 0.123 0.143 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 8.46e-01 0.0219 0.113 0.142 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0702 0.0994 0.142 NK L1
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0264 0.0844 0.142 NK L1
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 6.08e-01 0.0501 0.0975 0.142 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 2.00e-01 0.119 0.0926 0.142 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 1.29e-01 -0.103 0.0675 0.142 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 2.04e-01 0.115 0.0898 0.142 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0305 0.133 0.143 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.143 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0736 0.106 0.143 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 1.31e-01 0.145 0.0955 0.143 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.21e-01 0.102 0.103 0.143 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 9.16e-01 0.00715 0.0676 0.143 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 6.97e-01 0.0308 0.0791 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0908 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 8.68e-01 0.0225 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0118 0.0703 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0418 0.147 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.52e-01 -0.143 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0177 0.139 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 2.78e-01 -0.129 0.119 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 1.75e-01 -0.203 0.149 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 3.80e-01 0.113 0.129 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0178 0.0895 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 8.48e-01 0.0219 0.114 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 4.75e-01 0.08 0.112 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.77e-01 0.107 0.121 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0585 0.126 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0885 0.116 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 7.19e-01 0.0452 0.125 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 2.46e-01 0.153 0.132 0.144 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 7.61e-01 0.0303 0.0996 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0483 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0791 0.114 0.144 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 4.11e-01 -0.102 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 9.25e-01 0.00921 0.0982 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 8.69e-01 0.0207 0.125 0.144 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.144 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 5.33e-01 0.0883 0.141 0.144 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0745 0.125 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 2.50e-01 0.101 0.0874 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 1.77e-01 -0.16 0.118 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.05e-01 -0.013 0.109 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0581 0.0703 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 8.72e-01 0.0213 0.132 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 2.93e-01 0.101 0.0957 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0934 0.126 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 6.88e-02 0.221 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.0829 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 7.21e-01 0.0357 0.1 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00691 0.115 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0166 0.0804 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 1.21e-02 0.318 0.126 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 9.40e-01 0.00987 0.13 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0875 0.119 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 3.03e-01 0.132 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 8.85e-01 0.016 0.111 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0822 0.135 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0743 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 6.57e-01 -0.056 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 5.77e-01 -0.064 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 8.64e-01 0.0197 0.115 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 2.27e-01 0.143 0.118 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 9.66e-01 0.0051 0.12 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 1.75e-01 0.102 0.0747 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 8.59e-01 0.0176 0.0991 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0011 0.0935 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00834 0.0829 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0134 0.0558 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 7.19e-01 0.0341 0.0948 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00722 0.0959 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 5.86e-01 0.0642 0.118 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000605 0.0877 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0276 0.0942 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.81e-01 0.0783 0.0892 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 1.22e-01 -0.106 0.0683 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 9.49e-01 0.00657 0.102 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 1.65e-01 -0.153 0.11 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 2.49e-01 0.156 0.135 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 8.17e-01 0.0214 0.0921 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0101 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0279 0.105 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.13e-01 0.116 0.114 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0579 0.0817 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 6.02e-01 0.056 0.107 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 5.63e-01 0.065 0.112 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 7.94e-02 0.238 0.135 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 6.64e-01 0.0422 0.0971 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0313 0.121 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 1.71e-01 0.135 0.0985 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0577 0.106 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0788 0.0856 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 4.49e-01 0.0757 0.0997 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 8.09e-01 0.0291 0.12 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.131 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 5.76e-01 0.0469 0.0838 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 4.76e-02 -0.199 0.0999 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 4.21e-01 0.0815 0.101 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0224 0.102 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0064 0.0533 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 2.09e-01 0.135 0.107 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 1.05e-01 -0.199 0.122 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 4.41e-02 0.287 0.142 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 5.27e-01 0.0637 0.101 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 5.38e-01 -0.082 0.133 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0176 0.105 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 9.46e-01 0.00735 0.109 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 5.54e-02 -0.207 0.108 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 3.20e-01 -0.111 0.111 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 3.96e-03 -0.336 0.115 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 4.13e-02 0.268 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 2.19e-01 0.147 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 3.54e-01 -0.127 0.136 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 2.65e-01 0.138 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 7.79e-01 -0.036 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0408 0.099 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.107 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0936 0.122 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 6.95e-01 0.0567 0.145 0.139 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 3.03e-01 -0.103 0.1 0.139 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 4.26e-01 0.106 0.133 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 1.67e-01 0.152 0.109 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 8.17e-01 0.0274 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0868 0.139 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0868 0.102 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 2.59e-01 0.149 0.131 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 1.75e-01 -0.152 0.112 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 7.51e-01 0.0381 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 5.88e-01 0.0647 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 1.05e-01 0.18 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 4.72e-02 -0.203 0.102 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0101 0.11 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0531 0.123 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0377 0.109 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 8.05e-01 0.0241 0.0976 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.106 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 9.27e-04 0.327 0.0975 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 2.78e-02 -0.148 0.067 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 1.32e-01 0.136 0.0899 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 4.79e-01 0.0984 0.139 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 4.99e-01 0.0801 0.118 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00614 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 2.08e-01 0.163 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 1.15e-01 -0.202 0.127 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 3.29e-01 -0.103 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 1.97e-02 0.261 0.111 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 9.48e-01 0.00824 0.127 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0919 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0123 0.102 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0941 0.109 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 9.22e-01 -0.011 0.113 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 1.26e-01 -0.111 0.0724 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 3.63e-01 0.0866 0.0949 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 4.98e-01 0.102 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 7.84e-01 0.0366 0.133 0.133 PB L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 3.47e-02 0.213 0.0997 0.133 PB L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0839 0.163 0.133 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0218 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0325 0.102 0.133 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 2.82e-01 0.16 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0547 0.112 0.133 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00429 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 6.83e-02 -0.245 0.134 0.143 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0408 0.108 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 8.90e-02 -0.169 0.0988 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 7.30e-01 0.0367 0.106 0.143 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0856 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 6.48e-01 0.0369 0.0807 0.143 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 6.12e-01 0.0488 0.0961 0.143 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 9.83e-01 0.00283 0.13 0.143 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0679 0.0884 0.143 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.143 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 2.11e-01 0.135 0.107 0.143 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 3.91e-02 -0.229 0.11 0.143 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0227 0.0948 0.143 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.106 0.143 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -152986 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0806 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 1.87e-01 0.17 0.128 0.137 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 1.12e-01 -0.147 0.0919 0.137 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 1.59e-02 0.288 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0352 0.138 0.137 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0412 0.113 0.137 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0235 0.12 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 2.56e-01 -0.15 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0982 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0893 0.0703 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0195 0.0811 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 7.75e-02 0.208 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 1.64e-01 0.147 0.105 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.0887 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 9.54e-01 0.00542 0.0928 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 9.82e-01 0.00279 0.124 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0583 0.113 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0663 0.0774 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00844 0.0958 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 5.71e-01 0.0689 0.121 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0415 0.115 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 5.47e-01 0.0601 0.0998 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0678 0.0988 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 5.87e-01 0.0723 0.133 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 1.64e-02 0.39 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 6.47e-01 0.0717 0.156 0.136 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 2.17e-01 0.179 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 3.32e-01 0.151 0.155 0.136 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 8.58e-01 0.0289 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 2.39e-01 -0.143 0.121 0.136 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 3.86e-02 0.288 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0254 0.13 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 3.48e-01 0.082 0.0871 0.14 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0861 0.107 0.14 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0153 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0253 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 5.12e-01 0.0729 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 7.38e-01 0.0361 0.108 0.14 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 2.59e-01 -0.149 0.132 0.14 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 3.56e-01 -0.115 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 1.74e-01 -0.101 0.0741 0.136 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00888 0.114 0.136 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 6.52e-01 0.0542 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 9.26e-01 0.00843 0.0904 0.136 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 6.35e-01 0.0438 0.0923 0.136 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 2.92e-01 0.14 0.133 0.136 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0331 0.149 0.133 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 7.07e-01 0.0437 0.116 0.133 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0796 0.126 0.133 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0581 0.115 0.133 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0367 0.117 0.133 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 4.25e-01 0.102 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 5.16e-01 0.0978 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 2.10e-01 -0.145 0.115 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 1.39e-01 0.185 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 6.11e-01 0.0441 0.0865 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 9.77e-01 0.00336 0.114 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0262 0.111 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0518 0.115 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 7.25e-01 0.0281 0.0799 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0478 0.132 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 3.22e-01 -0.111 0.112 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0039 0.131 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 4.88e-01 0.081 0.117 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 5.38e-01 0.0498 0.0808 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 8.98e-02 -0.201 0.118 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0124 0.109 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 9.41e-01 0.0069 0.093 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0243 0.0652 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -205331 sc-eQTL 7.50e-02 0.242 0.136 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 4.39e-01 0.0767 0.099 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -184695 sc-eQTL 1.55e-01 -0.166 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 6.83e-01 -0.037 0.0905 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0755 0.0673 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0566 0.0811 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 6.20e-02 0.221 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 1.58e-01 0.138 0.0972 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 5.20e-01 0.0559 0.0867 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0384 0.095 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000343 0.127 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0367 0.122 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00635 0.0652 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00404 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 394096 sc-eQTL 5.61e-01 0.0675 0.116 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 7.77e-01 0.0205 0.0721 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.106 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 5.40e-01 0.0558 0.0909 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 394119 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00806 0.128 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 313158 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000308 0.119 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 683136 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0459 0.103 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 979248 sc-eQTL 8.09e-01 -0.021 0.0867 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -48413 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0044 0.101 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 98406 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0983 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 57922 sc-eQTL 2.66e-02 -0.141 0.063 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -287981 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0917 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 98406 eQTL 1.44e-08 -0.126 0.022 0.00306 0.00149 0.145

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 98406 5.13e-06 5.64e-06 6.55e-07 3.51e-06 1.73e-06 1.57e-06 7.49e-06 1.19e-06 4.5e-06 2.8e-06 7.41e-06 3.12e-06 9.47e-06 2.02e-06 9.47e-07 4.12e-06 2.24e-06 3.72e-06 1.75e-06 1.69e-06 2.66e-06 5.54e-06 4.69e-06 1.99e-06 9.05e-06 2.29e-06 2.95e-06 1.8e-06 5.98e-06 6.64e-06 2.6e-06 4.86e-07 6.46e-07 2.38e-06 1.96e-06 1.71e-06 1.27e-06 5.41e-07 1.35e-06 8.28e-07 1.02e-06 7.55e-06 4.73e-07 1.35e-07 7.77e-07 1.1e-06 1.03e-06 6.71e-07 6.04e-07