Genes within 1Mb (chr6:139085596:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 9.93e-01 0.000958 0.105 0.145 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0636 0.0802 0.145 B L1
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0572 0.0801 0.145 B L1
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 3.54e-01 0.0949 0.102 0.145 B L1
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0881 0.0902 0.145 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 9.05e-01 0.00634 0.0531 0.145 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 5.76e-01 0.0729 0.13 0.145 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0968 0.0817 0.145 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0514 0.0911 0.145 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 9.95e-01 0.000692 0.117 0.145 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0928 0.0782 0.145 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 2.98e-01 -0.077 0.0738 0.145 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 5.71e-01 0.0552 0.0974 0.145 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 2.62e-01 0.0858 0.0764 0.145 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.60e-02 0.135 0.0554 0.145 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0553 0.0959 0.145 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 7.80e-01 0.0264 0.0946 0.145 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 3.54e-01 -0.118 0.127 0.145 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 1.68e-01 -0.115 0.0831 0.145 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 3.72e-01 0.0759 0.0849 0.145 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0362 0.0912 0.145 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.60e-01 0.00428 0.0858 0.145 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 3.55e-02 0.102 0.0484 0.145 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0589 0.0927 0.145 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 8.80e-02 -0.192 0.112 0.145 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 7.44e-02 -0.228 0.127 0.149 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.67e-01 0.0037 0.0899 0.149 DC L1
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0855 0.105 0.149 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 6.31e-01 0.0563 0.117 0.149 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00138 0.104 0.149 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.31e-02 0.25 0.1 0.149 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 6.24e-02 -0.224 0.119 0.149 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000646 0.123 0.149 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 5.39e-01 0.0573 0.0932 0.145 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00818 0.0646 0.145 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 6.87e-01 0.0343 0.0851 0.145 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0138 0.122 0.145 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 6.98e-01 0.0278 0.0714 0.145 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 5.23e-03 0.257 0.0912 0.145 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00737 0.0983 0.145 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0305 0.127 0.145 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0307 0.113 0.146 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0331 0.0999 0.146 NK L1
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0846 0.0846 0.146 NK L1
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 1.65e-01 -0.136 0.0976 0.146 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0121 0.0933 0.146 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.05e-03 0.221 0.0664 0.146 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 2.47e-01 -0.105 0.0903 0.146 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0786 0.136 0.145 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0735 0.0876 0.145 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 3.00e-02 -0.234 0.107 0.145 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 4.74e-01 0.0705 0.0982 0.145 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 8.79e-01 0.0161 0.106 0.145 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 3.33e-01 0.0671 0.0691 0.145 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 1.48e-01 -0.117 0.0807 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 8.39e-01 -0.03 0.148 0.156 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 4.27e-02 -0.262 0.128 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0448 0.0672 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 1.63e-01 -0.197 0.14 0.156 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.46e-01 0.00997 0.148 0.156 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 6.41e-01 0.0624 0.133 0.156 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 5.37e-03 0.315 0.112 0.156 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 9.60e-02 0.239 0.143 0.156 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 2.80e-01 -0.155 0.143 0.156 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 9.73e-01 0.0045 0.131 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.42e-02 0.151 0.0899 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0285 0.115 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 2.04e-02 0.261 0.112 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0132 0.122 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000934 0.104 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 1.09e-01 -0.204 0.127 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 2.97e-01 -0.122 0.117 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0975 0.127 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0811 0.134 0.147 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0855 0.101 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 7.94e-01 -0.033 0.126 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 4.67e-01 0.0846 0.116 0.147 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 8.07e-01 0.0308 0.126 0.147 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 2.36e-01 0.118 0.0993 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0277 0.127 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 7.82e-02 0.205 0.116 0.147 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 4.68e-01 0.104 0.143 0.147 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 8.99e-01 0.0158 0.124 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0881 0.0871 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 5.63e-01 0.0685 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 4.21e-01 0.0872 0.108 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0883 0.1 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0238 0.0701 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 1.99e-01 0.169 0.131 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 5.44e-02 -0.183 0.0947 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 3.16e-01 -0.126 0.125 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 2.08e-01 -0.153 0.121 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00274 0.0832 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 8.47e-01 0.0193 0.0999 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 9.53e-01 0.00671 0.114 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 3.58e-01 -0.1 0.109 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00498 0.0804 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 5.83e-01 0.0699 0.127 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 3.24e-01 -0.128 0.13 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 2.86e-01 -0.127 0.119 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 3.16e-01 -0.128 0.127 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 3.91e-01 0.0945 0.11 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0575 0.134 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00632 0.129 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0476 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 5.63e-01 0.066 0.114 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0345 0.114 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 1.37e-01 -0.175 0.117 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 7.33e-01 0.042 0.123 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 7.20e-02 -0.138 0.0761 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0591 0.101 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 3.28e-01 0.0935 0.0953 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 2.20e-01 0.104 0.0844 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.64e-01 0.0793 0.0568 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0777 0.0967 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 3.79e-01 0.0862 0.0978 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0806 0.12 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0569 0.0894 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 7.17e-01 0.0407 0.112 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 5.99e-01 0.0506 0.0961 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 8.86e-02 0.155 0.0906 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 3.14e-02 0.15 0.0694 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 5.72e-01 -0.059 0.104 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0425 0.113 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0553 0.135 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 8.98e-01 0.0118 0.0921 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 8.37e-01 0.0221 0.107 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 9.42e-02 0.176 0.104 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 4.00e-02 -0.235 0.113 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 9.25e-02 0.137 0.0812 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 8.70e-01 0.0176 0.107 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0749 0.112 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0737 0.142 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 1.17e-01 -0.159 0.101 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 4.53e-01 0.0953 0.127 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0657 0.104 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0116 0.111 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 9.08e-02 0.152 0.0893 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 5.04e-01 -0.07 0.105 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 1.42e-01 -0.184 0.125 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0048 0.132 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0649 0.0843 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0863 0.101 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 6.33e-01 0.0487 0.102 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0364 0.102 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 6.11e-01 0.0273 0.0536 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 2.05e-01 -0.137 0.108 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 1.67e-01 -0.171 0.123 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 4.27e-01 0.119 0.149 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00604 0.105 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 7.28e-01 0.0482 0.139 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 4.59e-01 -0.081 0.109 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 8.88e-01 0.016 0.114 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.31e-01 0.171 0.113 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00505 0.116 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 2.84e-01 -0.132 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 1.04e-01 -0.221 0.135 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 3.21e-01 -0.123 0.124 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 6.02e-01 0.0738 0.141 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 9.25e-01 -0.012 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 4.69e-01 0.0962 0.133 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 6.50e-01 0.0464 0.102 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0686 0.111 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 2.81e-01 0.136 0.126 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000746 0.145 0.147 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.35e-01 0.00821 0.101 0.147 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 2.69e-02 -0.293 0.131 0.147 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 6.04e-02 0.206 0.109 0.147 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 3.15e-01 0.119 0.118 0.147 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0457 0.0871 0.147 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 2.44e-01 -0.119 0.102 0.147 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 2.41e-02 -0.293 0.129 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 2.84e-01 0.119 0.111 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0653 0.119 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 4.42e-01 0.091 0.118 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 1.26e-01 -0.168 0.11 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 5.88e-02 0.192 0.101 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 8.99e-01 0.0138 0.109 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 4.12e-01 0.0995 0.121 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0238 0.108 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0783 0.0964 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 3.13e-01 -0.105 0.104 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.53e-01 0.00579 0.099 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.91e-02 0.156 0.0661 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 9.99e-02 -0.147 0.0888 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 3.56e-01 0.129 0.139 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 3.51e-01 -0.111 0.119 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00167 0.106 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 2.87e-01 -0.139 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.20e-02 0.217 0.128 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 2.68e-02 0.234 0.105 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 4.80e-02 -0.223 0.112 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 7.66e-02 -0.219 0.123 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00206 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 1.29e-01 0.151 0.099 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0627 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 8.05e-01 0.0273 0.11 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 4.71e-04 0.245 0.069 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0684 0.0926 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 8.12e-01 0.0375 0.157 0.133 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0292 0.14 0.133 PB L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0488 0.106 0.133 PB L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 1.12e-01 -0.272 0.169 0.133 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 3.63e-01 -0.139 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0309 0.106 0.133 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 9.94e-01 0.00107 0.155 0.133 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00588 0.117 0.133 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 2.85e-01 -0.168 0.156 0.133 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 7.11e-01 0.0514 0.138 0.148 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 5.38e-01 -0.068 0.11 0.148 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 1.10e-01 -0.163 0.101 0.148 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0319 0.109 0.148 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 2.96e-01 0.134 0.128 0.148 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0665 0.0827 0.148 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 1.94e-02 -0.229 0.0974 0.148 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 3.53e-01 0.121 0.13 0.145 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 5.82e-01 -0.049 0.0889 0.145 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 4.33e-01 -0.11 0.14 0.145 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0612 0.108 0.145 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.49e-01 0.00723 0.112 0.145 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 8.87e-02 0.162 0.0947 0.145 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 6.38e-01 0.0501 0.106 0.145 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -154057 sc-eQTL 1.16e-01 -0.191 0.121 0.145 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 9.35e-01 0.0109 0.132 0.149 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 8.60e-01 0.0167 0.0949 0.149 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 2.34e-01 -0.15 0.125 0.149 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 3.31e-01 0.12 0.123 0.149 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00875 0.142 0.149 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 5.83e-02 0.219 0.115 0.149 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 9.78e-02 -0.203 0.122 0.149 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 6.94e-01 0.0535 0.136 0.149 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 4.65e-01 0.0743 0.102 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0325 0.073 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00844 0.0841 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0519 0.122 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 2.93e-01 0.115 0.109 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 6.34e-02 0.17 0.0912 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 6.48e-01 0.044 0.0961 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 2.39e-01 -0.151 0.128 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 7.92e-01 0.0311 0.118 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0215 0.0805 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 5.57e-01 0.0584 0.0993 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 8.76e-01 0.0198 0.126 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.119 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 5.07e-03 0.288 0.102 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 8.80e-01 0.0155 0.103 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 6.62e-01 0.0604 0.138 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 6.91e-01 -0.06 0.151 0.155 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 6.84e-01 0.0586 0.144 0.155 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 2.47e-02 -0.298 0.131 0.155 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 1.12e-01 0.227 0.142 0.155 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 4.26e-01 -0.118 0.148 0.155 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 4.69e-01 0.0809 0.111 0.155 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 2.99e-01 -0.134 0.128 0.155 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 2.01e-01 0.172 0.134 0.144 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0331 0.0903 0.144 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 9.09e-01 0.0127 0.111 0.144 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 9.72e-01 0.00433 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 1.06e-01 -0.203 0.125 0.144 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.69e-01 0.158 0.114 0.144 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 8.41e-01 0.0225 0.112 0.144 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0806 0.137 0.144 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0588 0.124 0.149 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.52e-01 0.00442 0.0741 0.149 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 8.19e-01 -0.026 0.113 0.149 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00271 0.119 0.149 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 3.84e-01 0.0783 0.0897 0.149 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 1.18e-01 0.169 0.108 0.149 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 4.46e-01 -0.07 0.0918 0.149 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0897 0.132 0.149 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 3.31e-01 -0.139 0.143 0.153 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.65e-01 0.00485 0.111 0.153 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 6.25e-01 0.0593 0.121 0.153 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0461 0.111 0.153 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00747 0.112 0.153 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 4.77e-03 0.342 0.119 0.153 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 4.51e-01 -0.109 0.144 0.153 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0656 0.111 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0491 0.126 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.58e-01 0.00461 0.0871 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0914 0.115 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 3.05e-02 0.241 0.111 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 6.77e-01 0.0483 0.116 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0117 0.0804 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 8.04e-01 0.033 0.133 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 6.54e-01 0.0507 0.113 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0276 0.131 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0155 0.116 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0687 0.0804 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 4.09e-01 0.0978 0.118 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 7.25e-01 0.0383 0.109 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 2.47e-01 -0.107 0.0923 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0148 0.0649 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -206402 sc-eQTL 1.24e-01 0.209 0.135 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 3.69e-02 -0.205 0.0978 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -185766 sc-eQTL 3.11e-01 -0.118 0.116 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 7.50e-01 0.03 0.0941 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 5.99e-01 -0.037 0.0701 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 8.31e-01 0.018 0.0844 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0626 0.123 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 5.64e-01 0.0586 0.101 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 8.05e-03 0.238 0.0888 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 7.59e-01 0.0303 0.0988 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0373 0.132 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 9.18e-01 0.0129 0.126 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 9.96e-01 0.000349 0.0671 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 7.51e-01 0.034 0.107 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 393025 sc-eQTL 3.93e-01 0.102 0.119 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0657 0.0742 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 2.64e-02 0.24 0.107 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0594 0.0936 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 393048 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0875 0.132 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 312087 sc-eQTL 8.53e-01 0.0218 0.117 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 682065 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0333 0.102 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 978177 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0256 0.0858 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -49484 sc-eQTL 9.99e-02 -0.164 0.0994 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 97335 sc-eQTL 6.33e-01 0.0467 0.0977 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 56851 sc-eQTL 6.03e-04 0.214 0.0613 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -289052 sc-eQTL 1.66e-01 -0.126 0.0908 0.144 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA -49484 eQTL 0.0109 -0.0313 0.0123 0.0 0.0 0.171
ENSG00000146386 ABRACL 56851 eQTL 8.09e-08 0.16 0.0295 0.0 0.0 0.171


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA -49484 8.08e-06 9.5e-06 9.68e-07 4.32e-06 1.87e-06 3.65e-06 9.65e-06 1.49e-06 6.53e-06 4.26e-06 1.04e-05 4.98e-06 1.17e-05 4.05e-06 2.13e-06 5.06e-06 3.76e-06 4.19e-06 2.27e-06 2.44e-06 3.45e-06 7.65e-06 6.68e-06 2.42e-06 1.18e-05 2.82e-06 3.74e-06 2.51e-06 6.95e-06 7.75e-06 4.46e-06 5.03e-07 6.91e-07 2.74e-06 3.62e-06 1.73e-06 1.38e-06 1.46e-06 1.31e-06 8.21e-07 7.18e-07 1.01e-05 1.32e-06 1.59e-07 7.7e-07 1.03e-06 9.61e-07 7.14e-07 4.53e-07
ENSG00000146386 ABRACL 56851 7.55e-06 8.97e-06 6.56e-07 4.01e-06 1.66e-06 2.55e-06 8.88e-06 1.31e-06 5.25e-06 3.4e-06 9.01e-06 3.84e-06 1.12e-05 3.42e-06 1.55e-06 4.01e-06 3.58e-06 3.75e-06 1.81e-06 1.76e-06 2.61e-06 7.11e-06 5.31e-06 1.95e-06 9.69e-06 2.25e-06 3.08e-06 1.76e-06 5.97e-06 7.02e-06 3.94e-06 4.18e-07 7.87e-07 2.26e-06 2.91e-06 1.32e-06 1.12e-06 6.8e-07 1.12e-06 6.69e-07 6.35e-07 8.07e-06 9.01e-07 1.56e-07 6.1e-07 9.89e-07 1.16e-06 6.6e-07 3.58e-07