logo

Genes within 1Mb (chr6:139064396:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.07e-02 -0.27 0.105 0.139 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 8.39e-01 0.0166 0.0814 0.139 B L1
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 6.59e-01 0.0359 0.0812 0.139 B L1
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 3.85e-01 0.0902 0.104 0.139 B L1
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0728 0.0915 0.139 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 7.18e-01 0.0194 0.0538 0.139 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 6.36e-01 0.0625 0.132 0.139 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0564 0.083 0.139 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 4.28e-02 0.187 0.0915 0.139 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.58e-04 -0.442 0.115 0.139 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0538 0.0796 0.139 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 5.85e-01 -0.041 0.0751 0.139 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 5.11e-01 0.0651 0.0989 0.139 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0555 0.0777 0.139 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 3.82e-06 0.258 0.0543 0.139 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 4.73e-01 -0.07 0.0973 0.139 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 8.82e-02 -0.163 0.0954 0.139 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.72e-02 -0.305 0.127 0.139 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 8.98e-01 0.0108 0.0843 0.139 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 3.61e-02 -0.179 0.085 0.139 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0432 0.0921 0.139 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.13e-01 0.071 0.0865 0.139 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 5.59e-08 0.259 0.046 0.139 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0776 0.0935 0.139 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 5.84e-02 -0.215 0.113 0.139 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.48e-01 -0.189 0.13 0.14 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0492 0.0919 0.14 DC L1
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.02e-01 0.0562 0.108 0.14 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 1.54e-01 0.171 0.119 0.14 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 2.40e-01 -0.125 0.106 0.14 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.40e-02 0.254 0.102 0.14 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 5.16e-01 0.0802 0.123 0.14 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 1.42e-01 -0.184 0.125 0.14 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 3.85e-03 -0.268 0.0917 0.139 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 2.16e-01 0.08 0.0645 0.139 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 4.39e-01 0.0662 0.0853 0.139 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 1.19e-01 -0.19 0.122 0.139 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 9.21e-01 0.0071 0.0716 0.139 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 2.07e-03 0.284 0.0911 0.139 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 8.96e-01 0.0129 0.0986 0.139 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00539 0.127 0.139 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.19e-01 -0.176 0.113 0.139 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0367 0.0997 0.139 NK L1
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0624 0.0846 0.139 NK L1
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 3.58e-01 0.09 0.0977 0.139 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0413 0.0932 0.139 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 3.46e-08 0.362 0.0633 0.139 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0504 0.0904 0.139 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.07e-02 -0.35 0.136 0.139 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0153 0.0891 0.139 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0475 0.11 0.139 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 9.00e-03 0.259 0.0983 0.139 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 9.39e-01 0.0082 0.107 0.139 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 4.51e-06 0.315 0.0669 0.139 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 1.92e-01 0.107 0.082 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 2.67e-01 -0.172 0.155 0.14 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0779 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 2.86e-01 0.0754 0.0704 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 2.72e-01 0.162 0.147 0.14 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 8.60e-01 0.0273 0.155 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 5.71e-01 0.0794 0.14 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 3.42e-01 -0.114 0.12 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 3.56e-01 0.139 0.15 0.14 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 1.40e-02 0.368 0.148 0.14 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 4.55e-01 -0.1 0.134 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0568 0.0926 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 4.74e-01 0.0845 0.118 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.73e-02 -0.211 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 8.81e-01 0.0187 0.125 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 9.84e-03 0.273 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 5.31e-01 0.0817 0.13 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 5.21e-01 -0.077 0.12 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 5.49e-02 0.249 0.129 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 6.46e-02 -0.247 0.133 0.14 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.41e-01 0.0618 0.101 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 9.54e-01 0.00723 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 8.33e-01 0.0245 0.116 0.14 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 6.89e-01 0.0505 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 4.45e-01 0.076 0.0993 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0615 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 5.74e-01 0.0656 0.117 0.14 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0105 0.143 0.14 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 2.96e-01 -0.132 0.126 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 2.62e-01 0.0994 0.0885 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 2.66e-01 -0.134 0.12 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 1.39e-01 0.163 0.109 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0931 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 9.80e-01 0.00175 0.0712 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 6.19e-01 0.0665 0.133 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0465 0.097 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 1.48e-01 0.184 0.127 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 6.13e-02 -0.231 0.123 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0302 0.0846 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 4.07e-02 0.207 0.101 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 1.17e-01 0.182 0.116 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.17e-01 0.0902 0.111 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0787 0.0816 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 8.27e-01 0.0283 0.13 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 4.10e-01 -0.109 0.132 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 2.63e-01 0.136 0.121 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0946 0.133 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 2.14e-01 -0.142 0.114 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 6.96e-01 0.0547 0.14 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 2.44e-01 0.156 0.134 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 9.33e-01 -0.011 0.13 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.21e-01 0.184 0.118 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 6.27e-01 -0.058 0.119 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 2.53e-02 -0.274 0.121 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.00e-05 -0.539 0.119 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0513 0.0777 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0269 0.103 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 5.35e-01 0.0601 0.0968 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.85e-01 -0.06 0.0859 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 4.35e-04 0.201 0.0562 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0841 0.0981 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 9.61e-02 -0.165 0.0987 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 9.51e-02 -0.203 0.121 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00502 0.0906 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 2.19e-01 -0.14 0.113 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0279 0.0973 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.95e-01 0.063 0.0922 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 3.13e-06 0.323 0.0674 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 8.09e-01 0.0256 0.106 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 3.08e-01 -0.116 0.114 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0068 0.139 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 3.14e-01 0.0952 0.0944 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 9.99e-01 0.000152 0.11 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 7.48e-01 0.0347 0.108 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0809 0.118 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.94e-04 0.308 0.0812 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 2.06e-01 0.139 0.11 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0695 0.115 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 5.34e-02 -0.269 0.138 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 4.40e-01 0.0769 0.0995 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 8.57e-02 -0.213 0.123 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 4.72e-01 0.0732 0.101 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 3.24e-01 0.107 0.109 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 2.31e-08 0.474 0.0817 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 4.72e-01 0.0737 0.102 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 7.21e-03 -0.328 0.121 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.25e-01 -0.213 0.138 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00262 0.0888 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 2.48e-01 -0.123 0.106 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.82e-01 -0.044 0.107 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 6.36e-01 -0.051 0.107 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.41e-02 0.138 0.0556 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 2.55e-01 -0.13 0.114 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 2.67e-01 -0.145 0.13 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00557 0.154 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 3.07e-01 -0.11 0.108 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 3.95e-01 0.121 0.143 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 5.69e-01 0.0642 0.112 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 1.28e-01 0.178 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 3.85e-02 0.24 0.115 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 3.79e-01 0.105 0.12 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 5.53e-01 0.0751 0.126 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 3.40e-01 -0.13 0.136 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 1.01e-01 0.202 0.123 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 3.36e-02 -0.299 0.14 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 5.10e-01 -0.084 0.127 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0862 0.133 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.62e-03 0.319 0.0997 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 2.20e-01 0.136 0.111 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 3.80e-01 -0.111 0.126 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.26e-01 -0.23 0.15 0.139 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0695 0.105 0.139 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0672 0.138 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 4.05e-02 0.234 0.113 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.97e-01 -0.084 0.123 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.88e-02 0.212 0.0896 0.139 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 2.95e-02 0.232 0.106 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.46e-01 -0.201 0.137 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 2.71e-01 -0.129 0.117 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 9.57e-01 0.00683 0.126 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.78e-01 0.052 0.125 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 6.22e-01 0.0577 0.117 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.51e-02 0.26 0.106 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0121 0.115 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00955 0.123 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 6.42e-01 0.0507 0.109 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 2.83e-01 -0.105 0.0973 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.40e-01 0.0494 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0758 0.0999 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 6.80e-06 0.298 0.0645 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 1.53e-01 -0.129 0.0899 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 3.30e-01 -0.141 0.145 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 2.60e-01 -0.139 0.123 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 8.95e-01 0.0145 0.11 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0302 0.136 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 1.15e-01 -0.211 0.133 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 6.35e-03 0.298 0.108 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 9.17e-01 0.0123 0.118 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 4.26e-03 -0.358 0.124 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0847 0.109 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 5.87e-01 0.0552 0.101 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 8.94e-02 0.184 0.108 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 3.00e-01 -0.117 0.112 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.20e-05 0.31 0.0691 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 7.73e-01 0.0273 0.0945 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 6.75e-01 -0.07 0.167 0.126 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0478 0.148 0.126 PB L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 1.09e-01 -0.18 0.112 0.126 PB L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 3.24e-02 0.386 0.178 0.126 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 2.52e-01 -0.185 0.161 0.126 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 8.97e-02 0.191 0.112 0.126 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0285 0.165 0.126 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0788 0.124 0.126 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 9.56e-02 0.277 0.165 0.126 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.77e-01 -0.194 0.143 0.137 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 1.85e-01 0.151 0.114 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 3.20e-01 0.105 0.105 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 7.55e-03 0.299 0.111 0.137 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 7.05e-01 0.0503 0.133 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 4.92e-04 0.295 0.0833 0.137 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00398 0.102 0.137 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.25e-01 -0.21 0.136 0.139 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 1.63e-01 -0.13 0.0932 0.139 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 5.60e-01 0.0859 0.147 0.139 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 3.07e-01 -0.116 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 7.25e-01 0.0415 0.118 0.139 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 5.50e-05 0.398 0.0966 0.139 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 6.22e-01 0.0553 0.112 0.139 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -175257 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00696 0.128 0.139 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 2.88e-02 -0.29 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0896 0.0954 0.144 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0676 0.127 0.144 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 3.27e-01 0.122 0.124 0.144 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 7.16e-01 -0.052 0.143 0.144 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 4.85e-03 0.326 0.114 0.144 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 1.80e-01 0.166 0.123 0.144 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 2.49e-01 -0.158 0.136 0.144 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.23e-01 -0.155 0.1 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.44e-01 0.044 0.0724 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0104 0.0833 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0551 0.121 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 4.73e-01 0.0778 0.108 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 3.38e-03 0.265 0.0893 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000148 0.0953 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 8.88e-01 0.0179 0.127 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 4.75e-03 -0.326 0.114 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 4.29e-01 0.0629 0.0795 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 3.35e-01 0.0948 0.0981 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 2.43e-01 -0.145 0.124 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 5.87e-02 -0.222 0.117 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 9.46e-04 0.335 0.0999 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 2.23e-01 0.123 0.101 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 8.68e-02 -0.233 0.136 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 6.63e-01 0.0675 0.154 0.155 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0307 0.147 0.155 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 5.13e-01 0.0895 0.137 0.155 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 1.06e-01 0.236 0.145 0.155 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 1.32e-01 -0.228 0.15 0.155 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 9.56e-02 0.19 0.113 0.155 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 8.33e-01 0.0278 0.132 0.155 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.20e-02 -0.334 0.132 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 1.05e-01 0.146 0.0893 0.14 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0451 0.11 0.14 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0304 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 6.90e-01 0.05 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.92e-02 0.266 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 3.12e-01 0.112 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0619 0.136 0.14 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 2.08e-01 -0.162 0.128 0.133 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0507 0.0766 0.133 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.86e-01 0.0476 0.117 0.133 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0953 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0103 0.093 0.133 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.23e-03 0.358 0.109 0.133 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 4.07e-02 0.194 0.0941 0.133 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 3.30e-01 0.134 0.137 0.133 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.46e-01 -0.217 0.149 0.138 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 5.95e-01 -0.062 0.116 0.138 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 5.70e-01 0.0722 0.127 0.138 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 9.56e-02 0.193 0.115 0.138 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 5.81e-01 -0.065 0.117 0.138 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 4.01e-01 0.108 0.128 0.138 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 5.34e-01 0.0941 0.151 0.138 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0642 0.116 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 9.39e-02 -0.209 0.124 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 9.48e-01 0.00567 0.0865 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 2.61e-01 0.128 0.114 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 2.24e-01 -0.135 0.111 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 9.52e-01 0.00694 0.115 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 5.70e-02 0.152 0.0792 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 6.58e-01 0.0586 0.132 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 7.58e-01 0.0347 0.112 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 2.14e-02 0.299 0.129 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 9.32e-02 -0.198 0.117 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 2.90e-01 0.0866 0.0817 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0649 0.12 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 4.49e-02 0.221 0.109 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0144 0.0941 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0562 0.0659 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -227602 sc-eQTL 7.24e-01 0.049 0.138 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0947 0.1 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -206966 sc-eQTL 1.35e-01 0.176 0.117 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 6.62e-03 -0.251 0.0915 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 3.41e-01 0.0661 0.0693 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 6.44e-01 0.0387 0.0835 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 2.65e-01 -0.136 0.122 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0456 0.1 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 8.84e-04 0.294 0.087 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 6.99e-01 0.0379 0.0978 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0983 0.131 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 2.25e-02 -0.287 0.125 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 8.27e-01 0.0148 0.0676 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 8.02e-01 0.0272 0.108 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 371825 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0984 0.12 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 7.23e-01 0.0265 0.0748 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 1.51e-03 0.344 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 9.19e-02 0.159 0.0937 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 371848 sc-eQTL 2.62e-01 0.149 0.133 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 sc-eQTL 1.37e-01 -0.175 0.117 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 660865 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0236 0.102 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 956977 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0685 0.0861 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -70684 sc-eQTL 3.82e-01 0.0878 0.1 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 76135 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0942 0.098 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 35651 sc-eQTL 4.50e-09 0.357 0.0583 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -310252 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0431 0.0915 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 290887 eQTL 0.00385 -0.0667 0.023 0.0 0.0 0.134
ENSG00000112406 HECA -70684 eQTL 0.00516 0.0386 0.0138 0.0 0.0 0.134
ENSG00000146386 ABRACL 35651 eQTL 1.96e-19 0.297 0.0322 0.0 0.0 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 956977 2.67e-07 1.34e-07 3.88e-08 1.82e-07 9.01e-08 9.8e-08 1.49e-07 5.2e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.73e-07 9e-08 1.53e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.53e-08 3.93e-08 1.26e-07 5.36e-08 4.07e-08 1.08e-07 1.27e-07 1.39e-07 4.05e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.09e-07 1.02e-07 1.06e-07 3.87e-08 3.35e-08 8.44e-08 8.38e-08 3.62e-08 5.05e-08 9.68e-08 7.2e-08 3.98e-08 4.51e-08 1.46e-07 5.2e-08 2.63e-08 5.87e-08 1.83e-08 1.23e-07 3.95e-09 5.09e-08
ENSG00000112406 HECA -70684 1.14e-05 1.29e-05 1.92e-06 7.23e-06 2.57e-06 5.29e-06 1.27e-05 2.18e-06 1.14e-05 5.8e-06 1.66e-05 6.44e-06 2.02e-05 4.06e-06 3.54e-06 7.01e-06 5.51e-06 9.38e-06 3.09e-06 2.73e-06 6.05e-06 1.1e-05 1.01e-05 3.29e-06 1.93e-05 4.43e-06 7.15e-06 4.89e-06 1.22e-05 9.23e-06 8.13e-06 9.91e-07 1.11e-06 3.49e-06 5.21e-06 2.78e-06 1.84e-06 1.95e-06 2.19e-06 9.95e-07 9.41e-07 1.51e-05 1.61e-06 1.88e-07 8.03e-07 1.74e-06 1.79e-06 7.25e-07 4.86e-07
ENSG00000146386 ABRACL 35651 1.8e-05 2.24e-05 3.3e-06 1.17e-05 3.08e-06 8.52e-06 2.48e-05 3.51e-06 1.85e-05 9.53e-06 2.58e-05 9.35e-06 3.42e-05 7.86e-06 5.23e-06 1.09e-05 9.53e-06 1.57e-05 5.1e-06 4.2e-06 8.57e-06 1.94e-05 1.85e-05 5.19e-06 2.99e-05 5.36e-06 8.52e-06 8.03e-06 1.89e-05 1.58e-05 1.29e-05 1.33e-06 1.64e-06 4.84e-06 8.41e-06 4.43e-06 1.95e-06 2.82e-06 3.09e-06 2.27e-06 1.63e-06 2.46e-05 2.6e-06 2.8e-07 1.85e-06 2.68e-06 3.11e-06 1.28e-06 1.01e-06
ENSG00000226571 \N -206966 4.24e-06 4.75e-06 6.25e-07 2e-06 6.09e-07 9.09e-07 2.5e-06 9.05e-07 3.47e-06 1.6e-06 4.84e-06 2.51e-06 6.47e-06 1.35e-06 1.2e-06 2.06e-06 1.56e-06 2.07e-06 1.51e-06 1.45e-06 1.4e-06 3.79e-06 3.36e-06 1.01e-06 4.68e-06 1.23e-06 1.96e-06 1.42e-06 3.22e-06 2.86e-06 2.19e-06 5.07e-07 6.01e-07 1.32e-06 1.68e-06 9.52e-07 8.88e-07 4.46e-07 1.18e-06 3.46e-07 1.96e-07 4.72e-06 3.78e-07 1.99e-07 2.96e-07 3.88e-07 8.27e-07 1.83e-07 1.54e-07