Genes within 1Mb (chr6:139062850:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 5.60e-03 -0.322 0.115 0.124 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 5.45e-01 0.0542 0.0893 0.124 B L1
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 4.38e-01 0.0692 0.0891 0.124 B L1
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 4.09e-01 0.094 0.114 0.124 B L1
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0664 0.101 0.124 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.66e-01 0.034 0.0591 0.124 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 7.62e-01 0.0439 0.145 0.124 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0879 0.091 0.124 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 6.36e-02 0.188 0.101 0.124 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 2.31e-03 -0.389 0.126 0.124 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0326 0.0864 0.124 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0185 0.0815 0.124 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.62e-01 0.0979 0.107 0.124 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 3.68e-01 -0.076 0.0842 0.124 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.02e-05 0.246 0.0595 0.124 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 1.30e-01 -0.16 0.105 0.124 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 1.81e-01 -0.139 0.104 0.124 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 2.62e-02 -0.312 0.139 0.124 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 7.13e-01 0.0341 0.0923 0.124 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 2.51e-01 -0.108 0.0938 0.124 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0112 0.101 0.124 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 2.10e-01 0.119 0.0946 0.124 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 6.81e-08 0.282 0.0505 0.124 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0907 0.102 0.124 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 2.54e-01 -0.142 0.124 0.124 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 6.37e-02 -0.258 0.138 0.126 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0929 0.0979 0.126 DC L1
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 5.02e-01 0.0772 0.115 0.126 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 2.25e-01 0.155 0.127 0.126 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 2.59e-01 -0.128 0.113 0.126 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 3.36e-02 0.235 0.11 0.126 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 9.91e-01 0.00153 0.132 0.126 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 1.42e-01 -0.196 0.133 0.126 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 3.28e-03 -0.297 0.1 0.124 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 2.64e-01 0.0789 0.0704 0.124 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 7.38e-01 0.0312 0.0931 0.124 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 4.76e-02 -0.263 0.132 0.124 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 8.86e-01 0.0112 0.0781 0.124 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.28e-02 0.252 0.1 0.124 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0116 0.108 0.124 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 3.60e-01 -0.127 0.138 0.124 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.66e-01 -0.171 0.123 0.124 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0395 0.109 0.124 NK L1
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00701 0.0923 0.124 NK L1
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.66e-01 0.0963 0.106 0.124 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0592 0.101 0.124 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 6.67e-08 0.387 0.0691 0.124 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0286 0.0985 0.124 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.74e-02 -0.354 0.148 0.124 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0193 0.0965 0.124 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 9.70e-01 0.00449 0.119 0.124 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 2.31e-02 0.245 0.107 0.124 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 2.49e-01 -0.134 0.116 0.124 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 2.94e-05 0.312 0.0731 0.124 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 2.18e-01 0.11 0.0889 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 4.14e-01 -0.137 0.167 0.125 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 8.69e-01 0.0243 0.147 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 7.31e-01 0.0263 0.0762 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.88e-01 0.138 0.159 0.125 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 8.77e-01 0.026 0.167 0.125 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 9.41e-01 0.0111 0.151 0.125 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 3.74e-01 -0.115 0.129 0.125 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 5.11e-01 0.107 0.163 0.125 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 1.00e-01 0.267 0.162 0.125 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 3.81e-01 -0.126 0.143 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0439 0.0992 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 4.24e-01 0.101 0.126 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 1.67e-01 -0.171 0.124 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.15e-01 0.0872 0.134 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.73e-02 0.27 0.112 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 8.00e-01 0.0354 0.14 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 3.19e-01 -0.128 0.128 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 1.68e-01 0.192 0.138 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.53e-01 -0.209 0.145 0.125 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 6.78e-01 0.0457 0.11 0.125 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 8.47e-01 0.0265 0.137 0.125 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.98e-01 0.107 0.126 0.125 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 8.43e-01 0.0272 0.137 0.125 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.30e-01 0.068 0.108 0.125 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0676 0.138 0.125 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.45e-01 0.0413 0.127 0.125 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0342 0.156 0.125 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.39e-01 -0.206 0.138 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 1.29e-01 0.148 0.0973 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 2.33e-01 -0.158 0.132 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 1.32e-01 0.183 0.121 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0799 0.112 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 9.11e-01 0.0088 0.0786 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 9.36e-01 0.0118 0.147 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0697 0.107 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 9.16e-02 0.236 0.139 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.66e-02 -0.324 0.134 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00809 0.093 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 3.36e-02 0.236 0.111 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 1.33e-01 0.192 0.127 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 3.80e-01 0.107 0.122 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0502 0.0898 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 8.10e-01 0.0342 0.142 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 1.47e-01 -0.21 0.145 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 1.74e-01 0.181 0.133 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0868 0.143 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0869 0.123 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 5.27e-01 0.095 0.15 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.35e-01 0.139 0.144 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 9.09e-01 0.016 0.14 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.02e-01 0.208 0.127 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0224 0.128 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 1.77e-02 -0.312 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 2.30e-04 -0.49 0.131 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 7.31e-01 -0.029 0.0842 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0457 0.111 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.67e-01 0.0947 0.105 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0553 0.093 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 4.14e-03 0.178 0.0615 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 1.15e-01 -0.167 0.106 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 8.48e-02 -0.185 0.107 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 3.83e-01 -0.115 0.132 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0114 0.098 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 3.25e-01 -0.121 0.123 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 8.24e-01 0.0235 0.105 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0431 0.0999 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 2.22e-06 0.355 0.0729 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0388 0.114 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0713 0.123 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 3.45e-01 -0.141 0.15 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 4.94e-01 0.0699 0.102 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0672 0.119 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 7.88e-01 0.0314 0.117 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0108 0.127 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 6.50e-04 0.305 0.0882 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 4.68e-01 0.0863 0.119 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 3.63e-01 -0.113 0.124 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 6.90e-02 -0.276 0.151 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 2.15e-01 0.135 0.108 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 1.26e-01 -0.207 0.135 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 4.82e-01 0.0778 0.11 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 6.07e-01 0.061 0.118 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 9.53e-09 0.53 0.0886 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 2.90e-01 0.118 0.111 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 4.70e-02 -0.265 0.133 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.23e-01 -0.228 0.147 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 9.84e-01 0.00196 0.0947 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0512 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0358 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0282 0.115 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.33e-02 0.148 0.0593 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 1.69e-01 -0.167 0.121 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 4.26e-01 -0.111 0.139 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0998 0.164 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0969 0.115 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 3.35e-01 0.147 0.152 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 2.46e-01 0.14 0.12 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 1.48e-01 0.181 0.124 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.80e-03 0.341 0.122 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 5.50e-01 0.0767 0.128 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 3.96e-01 0.115 0.135 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 4.13e-01 -0.122 0.148 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 1.87e-01 0.178 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 1.02e-01 -0.251 0.153 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.59e-01 -0.127 0.139 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0583 0.145 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.99e-03 0.341 0.109 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 2.57e-01 0.137 0.121 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 1.78e-01 -0.186 0.137 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.32e-01 -0.242 0.16 0.123 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0578 0.111 0.123 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0838 0.147 0.123 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 1.04e-01 0.198 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 1.11e-01 -0.209 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.34e-02 0.186 0.0959 0.123 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.33e-02 0.203 0.113 0.123 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.27e-01 -0.225 0.147 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 3.79e-01 -0.111 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000423 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 7.28e-01 0.0465 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 4.03e-01 0.104 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.48e-02 0.278 0.113 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0228 0.123 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00808 0.134 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 7.30e-01 0.0411 0.119 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 2.56e-01 -0.121 0.106 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 6.15e-01 0.058 0.115 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 1.05e-01 -0.176 0.108 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 8.21e-06 0.322 0.0705 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0887 0.0984 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0904 0.154 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 3.42e-01 -0.125 0.131 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.117 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00183 0.144 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 2.70e-01 -0.157 0.142 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 7.49e-03 0.311 0.115 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0212 0.125 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 8.75e-03 -0.359 0.135 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0756 0.119 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 4.13e-01 0.0906 0.11 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 5.69e-02 0.225 0.118 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0524 0.122 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.09e-05 0.34 0.0753 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 6.47e-01 0.0472 0.103 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0216 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 6.84e-01 0.0669 0.164 0.111 PB L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 1.21e-01 -0.193 0.124 0.111 PB L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 5.17e-02 0.388 0.198 0.111 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.04e-01 -0.119 0.178 0.111 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.51e-02 0.3 0.122 0.111 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 7.51e-01 0.0581 0.182 0.111 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 2.78e-01 -0.149 0.137 0.111 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 2.57e-01 0.209 0.183 0.111 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.77e-01 -0.211 0.156 0.122 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 1.82e-01 0.166 0.124 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 2.67e-01 0.128 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 1.47e-02 0.298 0.121 0.122 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 9.57e-01 0.00791 0.145 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.74e-03 0.29 0.0913 0.122 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.09e-01 0.0417 0.111 0.122 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.72e-01 -0.196 0.143 0.124 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0735 0.0979 0.124 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 4.06e-01 0.128 0.154 0.124 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0863 0.119 0.124 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 4.61e-01 0.091 0.123 0.124 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 2.78e-04 0.377 0.102 0.124 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 5.33e-01 0.0732 0.117 0.124 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -176803 sc-eQTL 4.87e-01 0.0934 0.134 0.124 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.52e-02 -0.34 0.139 0.132 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 2.99e-01 -0.105 0.101 0.132 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 9.78e-01 0.00366 0.134 0.132 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 4.64e-01 0.0962 0.131 0.132 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0687 0.151 0.132 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.21e-02 0.308 0.122 0.132 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 4.36e-01 0.102 0.131 0.132 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 2.25e-01 -0.176 0.144 0.132 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 9.35e-02 -0.183 0.109 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 7.04e-01 0.0299 0.0787 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0382 0.0905 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 4.31e-01 -0.104 0.132 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.93e-01 0.063 0.118 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.55e-03 0.272 0.0972 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0292 0.104 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0755 0.138 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 9.51e-03 -0.329 0.126 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 5.57e-01 0.0514 0.0873 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 4.20e-01 0.0872 0.108 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 1.70e-01 -0.187 0.136 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 1.20e-01 -0.201 0.129 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.16e-02 0.282 0.111 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 2.86e-01 0.119 0.111 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 2.75e-02 -0.329 0.148 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 9.63e-01 0.00757 0.162 0.145 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0626 0.155 0.145 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 6.52e-01 0.0648 0.144 0.145 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 1.74e-01 0.209 0.153 0.145 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 2.01e-01 -0.204 0.158 0.145 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 1.15e-01 0.189 0.119 0.145 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 8.63e-01 0.0239 0.138 0.145 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.90e-02 -0.342 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 2.15e-01 0.122 0.0979 0.124 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 9.34e-01 0.00998 0.12 0.124 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0312 0.133 0.124 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.16e-01 0.089 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 9.50e-02 0.208 0.124 0.124 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 4.45e-01 0.0928 0.121 0.124 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0916 0.149 0.124 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.93e-01 -0.182 0.139 0.122 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0567 0.0834 0.122 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 4.43e-01 0.0982 0.128 0.122 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 2.99e-01 -0.14 0.134 0.122 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 8.36e-01 -0.021 0.101 0.122 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 2.09e-03 0.372 0.119 0.122 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 1.48e-01 0.15 0.103 0.122 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 9.52e-01 0.0089 0.149 0.122 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 3.13e-01 -0.162 0.16 0.127 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 3.90e-01 -0.107 0.125 0.127 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 3.62e-01 0.124 0.136 0.127 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 1.54e-01 0.177 0.123 0.127 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0534 0.126 0.127 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.17e-01 0.0892 0.137 0.127 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.24e-01 0.0571 0.162 0.127 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 3.00e-01 -0.129 0.124 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.16e-01 -0.213 0.135 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 9.37e-01 0.00746 0.0939 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 2.37e-01 0.146 0.123 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0957 0.12 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 8.01e-01 0.0315 0.125 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 7.69e-02 0.153 0.0861 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 8.73e-01 -0.023 0.144 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0358 0.122 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 9.74e-02 0.234 0.141 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 2.30e-02 -0.294 0.128 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 1.57e-01 0.127 0.0897 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0588 0.132 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 4.89e-02 0.239 0.12 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00527 0.104 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0472 0.0726 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -229148 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00487 0.152 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 2.23e-01 -0.135 0.11 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 sc-eQTL 6.98e-02 0.235 0.129 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 7.07e-03 -0.272 0.1 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 3.52e-01 0.0706 0.0757 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 8.84e-01 0.0133 0.0912 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 1.52e-01 -0.191 0.133 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0434 0.11 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.11e-03 0.271 0.0958 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 8.78e-01 0.0164 0.107 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 1.46e-01 -0.208 0.142 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.32e-02 -0.34 0.136 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0076 0.0737 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 6.33e-01 0.0564 0.118 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 370279 sc-eQTL 2.43e-01 -0.153 0.131 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 5.76e-01 0.0456 0.0816 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 5.72e-03 0.328 0.117 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 2.22e-01 0.126 0.103 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 370302 sc-eQTL 7.01e-01 0.0558 0.145 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 sc-eQTL 1.66e-01 -0.178 0.128 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 659319 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0403 0.111 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 955431 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0203 0.0939 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -72230 sc-eQTL 2.98e-01 0.114 0.109 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 74589 sc-eQTL 2.27e-01 -0.129 0.107 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 34105 sc-eQTL 2.03e-08 0.373 0.064 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -311798 sc-eQTL 8.57e-01 -0.018 0.0997 0.125 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 289341 eQTL 0.000833 -0.0804 0.024 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112406 HECA -72230 eQTL 0.00814 0.0381 0.0144 0.0 0.0 0.122
ENSG00000146386 ABRACL 34105 eQTL 4.11e-17 0.29 0.0338 0.0 0.0 0.122
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 eQTL 3.50e-02 0.107 0.0506 0.0 0.0 0.122


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA -72230 4.99e-06 6.3e-06 5.92e-07 3.49e-06 1.5e-06 1.53e-06 8.18e-06 1.26e-06 4.49e-06 3.1e-06 7.42e-06 2.88e-06 9.94e-06 2.33e-06 9.49e-07 4.08e-06 2.72e-06 3.84e-06 1.63e-06 1.68e-06 2.61e-06 5.62e-06 4.87e-06 1.95e-06 8.97e-06 2.16e-06 2.91e-06 1.8e-06 6.08e-06 6.7e-06 2.93e-06 4.81e-07 7.79e-07 2.44e-06 2.1e-06 1.71e-06 1.03e-06 5.41e-07 1.41e-06 7.37e-07 7.73e-07 8.39e-06 6.31e-07 1.51e-07 7.95e-07 9.54e-07 9.9e-07 6.8e-07 6.04e-07
ENSG00000146386 ABRACL 34105 9.84e-06 1.2e-05 2.27e-06 7.03e-06 2.44e-06 5.13e-06 1.41e-05 2.08e-06 1.05e-05 5.73e-06 1.41e-05 6.09e-06 1.88e-05 4.19e-06 3.54e-06 6.93e-06 5.78e-06 9.51e-06 3.39e-06 3.14e-06 6.5e-06 1.07e-05 1.04e-05 4.06e-06 1.93e-05 4.45e-06 6.35e-06 5.03e-06 1.31e-05 1.22e-05 6.76e-06 1.05e-06 1.21e-06 3.78e-06 5.33e-06 3.11e-06 1.78e-06 2e-06 2.2e-06 1.41e-06 1.12e-06 1.45e-05 1.52e-06 2.52e-07 1.02e-06 1.96e-06 1.93e-06 7.25e-07 6.34e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -208512 1.31e-06 1.29e-06 2.87e-07 1.26e-06 3.75e-07 6.17e-07 1.46e-06 4.11e-07 1.66e-06 6.44e-07 2.08e-06 9.21e-07 2.61e-06 3.39e-07 4.81e-07 9.52e-07 9.41e-07 9.7e-07 7.7e-07 4.42e-07 7.67e-07 1.89e-06 1.12e-06 5.81e-07 2.41e-06 7.32e-07 1.05e-06 8.4e-07 1.57e-06 1.27e-06 7.8e-07 2.8e-07 2.82e-07 5.6e-07 6.47e-07 6.07e-07 6.86e-07 3.07e-07 5.07e-07 2.03e-07 3.59e-07 2.01e-06 1.53e-07 9.66e-08 3.58e-07 2.45e-07 2.47e-07 1.41e-07 1.97e-07