Genes within 1Mb (chr6:139059341:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 6.76e-03 -0.37 0.135 0.075 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 6.95e-01 0.0412 0.105 0.075 B L1
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 7.51e-01 0.0333 0.105 0.075 B L1
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 5.44e-02 0.256 0.133 0.075 B L1
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0559 0.118 0.075 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 8.56e-01 0.0126 0.0694 0.075 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.17 0.075 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0521 0.107 0.075 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 7.69e-02 0.21 0.118 0.075 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 9.78e-05 -0.586 0.148 0.075 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0419 0.103 0.075 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 8.87e-01 0.0138 0.0968 0.075 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 5.06e-01 0.0848 0.127 0.075 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00316 0.1 0.075 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 3.98e-02 0.151 0.0728 0.075 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0627 0.125 0.075 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 1.17e-01 -0.194 0.123 0.075 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.63e-01 -0.23 0.164 0.075 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0542 0.108 0.075 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 3.12e-01 -0.111 0.11 0.075 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0393 0.118 0.075 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 1.60e-01 0.156 0.111 0.075 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.11e-03 0.204 0.0618 0.075 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0209 0.12 0.075 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 1.63e-02 -0.349 0.144 0.075 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.02e-02 -0.431 0.166 0.074 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 3.71e-01 -0.106 0.119 0.074 DC L1
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 8.19e-01 0.0319 0.139 0.074 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 5.07e-01 0.103 0.155 0.074 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0179 0.137 0.074 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 6.14e-01 0.0678 0.134 0.074 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0589 0.159 0.074 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0815 0.162 0.074 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 6.93e-05 -0.481 0.119 0.075 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 7.33e-01 0.0291 0.0851 0.075 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0849 0.112 0.075 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 2.27e-01 -0.194 0.16 0.075 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 3.26e-02 0.2 0.0932 0.075 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.18e-01 0.191 0.122 0.075 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.14e-01 0.0654 0.13 0.075 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 4.46e-01 -0.128 0.167 0.075 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 2.60e-02 -0.325 0.145 0.075 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 5.47e-01 -0.078 0.129 0.075 NK L1
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0926 0.11 0.075 NK L1
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 6.93e-01 0.0502 0.127 0.075 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 6.73e-01 -0.051 0.121 0.075 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 2.09e-04 0.322 0.0853 0.075 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.97e-01 0.0456 0.117 0.075 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.12e-01 -0.28 0.175 0.075 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 8.06e-01 -0.028 0.114 0.075 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 3.20e-01 -0.14 0.14 0.075 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 1.02e-02 0.326 0.126 0.075 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0226 0.137 0.075 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 9.28e-03 0.232 0.0885 0.075 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.31e-01 0.126 0.105 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 6.93e-01 0.0786 0.199 0.071 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.96e-01 -0.119 0.174 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0798 0.0904 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 2.12e-01 0.236 0.189 0.071 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 9.89e-01 0.00286 0.198 0.071 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 4.76e-01 -0.128 0.179 0.071 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0859 0.154 0.071 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.89e-01 0.205 0.193 0.071 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 6.10e-02 0.361 0.191 0.071 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.94e-01 -0.223 0.171 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0891 0.119 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 8.45e-01 0.0297 0.151 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0877 0.149 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 2.10e-01 0.201 0.16 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.24e-01 0.21 0.136 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0159 0.167 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 3.35e-01 -0.148 0.154 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 3.33e-01 0.161 0.166 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.76e-01 -0.237 0.175 0.075 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 1.40e-01 0.195 0.132 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0706 0.165 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 2.62e-01 0.17 0.151 0.075 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 4.19e-01 -0.133 0.164 0.075 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00805 0.13 0.075 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 7.55e-01 0.0519 0.166 0.075 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 3.72e-01 0.136 0.152 0.075 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 5.96e-01 0.0996 0.187 0.075 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.38e-01 -0.242 0.162 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 2.97e-01 0.12 0.115 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 8.20e-02 -0.27 0.155 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 1.79e-02 0.335 0.141 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0787 0.132 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 5.41e-01 0.0564 0.0921 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000628 0.173 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 5.51e-01 -0.075 0.125 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 6.97e-01 0.0643 0.165 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 3.09e-02 -0.344 0.158 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 7.48e-01 0.0352 0.109 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 9.82e-02 0.217 0.131 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 1.25e-01 0.231 0.15 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 2.97e-01 0.15 0.143 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0739 0.106 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 9.30e-01 0.0147 0.168 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0389 0.171 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 3.36e-01 0.151 0.157 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.97e-01 -0.222 0.171 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00328 0.149 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 7.01e-01 0.0696 0.181 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.77e-01 0.0493 0.174 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 1.60e-01 -0.237 0.168 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 9.16e-01 0.0162 0.154 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 7.66e-01 0.046 0.154 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 2.72e-02 -0.35 0.157 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.28e-04 -0.605 0.155 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0342 0.1 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 2.91e-01 0.14 0.132 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 5.86e-01 0.0681 0.125 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 8.97e-01 0.0144 0.111 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 4.22e-01 0.0599 0.0744 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.91e-01 -0.134 0.126 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 9.11e-02 -0.216 0.127 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 2.94e-02 -0.34 0.155 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0565 0.117 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 2.45e-01 -0.17 0.146 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 8.17e-01 0.0291 0.125 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0274 0.119 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 4.31e-03 0.259 0.0897 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 4.18e-01 0.11 0.136 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0522 0.147 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 4.76e-02 -0.357 0.179 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 9.25e-01 0.0116 0.123 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0418 0.143 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 5.50e-01 0.0841 0.141 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 1.31e-01 0.231 0.152 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 7.45e-02 0.194 0.108 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 5.43e-02 0.275 0.142 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 2.11e-01 -0.188 0.15 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0369 0.182 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 9.37e-01 0.0102 0.13 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 4.29e-02 -0.327 0.16 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.76e-01 0.0377 0.132 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 5.99e-01 0.0746 0.142 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.72e-04 0.424 0.111 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 1.69e-01 0.183 0.133 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 9.67e-02 -0.265 0.159 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 2.66e-01 -0.193 0.173 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0983 0.111 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0483 0.133 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0382 0.134 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0575 0.134 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.13e-01 0.111 0.07 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.48e-01 -0.164 0.142 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 2.68e-01 -0.18 0.162 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 4.04e-01 -0.164 0.196 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0817 0.138 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0438 0.182 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.91e-01 0.0381 0.144 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 3.59e-02 0.312 0.147 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 3.67e-02 0.309 0.147 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 7.96e-01 0.0396 0.153 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 6.21e-01 0.0798 0.161 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 4.44e-01 -0.136 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.27e-01 0.128 0.161 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 5.22e-02 -0.356 0.182 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 4.49e-01 -0.126 0.166 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0921 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 2.45e-02 0.299 0.132 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 4.15e-01 0.118 0.145 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 7.18e-02 -0.296 0.164 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 4.22e-01 -0.154 0.191 0.074 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 2.84e-01 -0.142 0.132 0.074 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 3.92e-02 -0.361 0.174 0.074 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 1.36e-01 0.216 0.145 0.074 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0823 0.156 0.074 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 4.55e-01 0.086 0.115 0.074 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 1.52e-01 0.194 0.135 0.074 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.56e-01 -0.25 0.176 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.71e-01 -0.109 0.15 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0922 0.161 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 6.19e-01 0.0798 0.16 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0302 0.149 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.52e-01 0.197 0.137 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.53e-01 0.0665 0.148 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 2.62e-01 -0.178 0.159 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0295 0.141 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0937 0.127 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 5.02e-01 0.0919 0.137 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0151 0.13 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 7.62e-04 0.292 0.0855 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00846 0.117 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 6.26e-01 0.0922 0.189 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.84e-01 -0.113 0.161 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 1.83e-01 0.191 0.143 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 5.30e-01 -0.111 0.177 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 5.64e-03 -0.479 0.171 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 9.15e-02 0.242 0.143 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0193 0.153 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 9.01e-03 -0.428 0.163 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.48e-01 -0.108 0.142 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0917 0.132 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 4.12e-01 0.117 0.142 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00999 0.147 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 3.40e-02 0.2 0.0936 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.38e-01 0.146 0.123 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 4.22e-01 0.177 0.219 0.063 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 5.29e-01 -0.123 0.195 0.063 PB L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0318 0.149 0.063 PB L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 1.45e-01 0.348 0.237 0.063 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 3.72e-02 -0.44 0.209 0.063 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.18e-02 0.371 0.145 0.063 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 9.24e-01 0.0209 0.217 0.063 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.10e-01 0.205 0.163 0.063 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 8.91e-01 0.0301 0.22 0.063 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 2.84e-01 -0.194 0.18 0.076 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 2.63e-01 0.162 0.144 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 5.81e-01 0.0736 0.133 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 3.03e-03 0.418 0.139 0.076 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 1.72e-01 0.229 0.167 0.076 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.62e-03 0.338 0.106 0.076 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 3.71e-01 0.115 0.129 0.076 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.44e-02 -0.419 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.118 0.075 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 8.51e-01 0.0349 0.185 0.075 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.95e-01 0.0373 0.143 0.075 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0234 0.148 0.075 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 3.59e-01 0.116 0.126 0.075 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 5.99e-01 0.0741 0.141 0.075 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -180312 sc-eQTL 2.48e-01 0.186 0.161 0.075 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.28e-02 -0.411 0.163 0.076 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0894 0.119 0.076 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.65e-01 0.0473 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 7.93e-01 0.0405 0.155 0.076 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0674 0.178 0.076 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 2.43e-01 0.17 0.145 0.076 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0199 0.154 0.076 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0637 0.171 0.076 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.75e-02 -0.312 0.13 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 6.88e-01 -0.038 0.0947 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 2.30e-01 -0.131 0.109 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 8.68e-01 0.0264 0.159 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 1.04e-02 0.36 0.139 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 8.79e-02 0.203 0.118 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 5.58e-01 0.073 0.124 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 3.10e-01 -0.169 0.166 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 3.38e-03 -0.441 0.149 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 3.90e-01 0.0894 0.104 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00636 0.128 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 4.29e-01 -0.129 0.162 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 3.08e-01 -0.157 0.153 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 2.05e-01 0.169 0.133 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.08e-01 0.167 0.132 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 2.74e-01 -0.195 0.178 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 5.68e-01 0.11 0.192 0.088 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 5.53e-01 0.109 0.183 0.088 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 7.01e-01 0.0653 0.17 0.088 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 1.24e-01 0.28 0.181 0.088 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 4.65e-01 -0.138 0.188 0.088 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 8.94e-01 -0.019 0.142 0.088 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.58e-01 0.0724 0.163 0.088 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 5.04e-03 -0.488 0.172 0.076 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 5.00e-01 0.0795 0.118 0.076 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0488 0.144 0.076 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 1.31e-01 -0.24 0.158 0.076 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 3.12e-01 0.166 0.164 0.076 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 3.07e-01 0.153 0.149 0.076 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 9.48e-02 0.242 0.144 0.076 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 3.87e-01 -0.154 0.178 0.076 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.62e-01 -0.231 0.164 0.075 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 8.29e-02 -0.171 0.0978 0.075 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.11e-01 0.0561 0.151 0.075 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0482 0.159 0.075 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00396 0.12 0.075 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 7.47e-04 0.48 0.14 0.075 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 2.25e-01 0.148 0.122 0.075 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 9.16e-01 0.0187 0.176 0.075 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.47e-01 -0.283 0.194 0.071 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0708 0.152 0.071 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0322 0.166 0.071 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 2.26e-01 0.183 0.151 0.071 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 5.19e-01 0.0991 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 3.49e-01 -0.157 0.167 0.071 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 7.40e-01 0.0654 0.197 0.071 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 2.98e-01 -0.158 0.152 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.42e-01 -0.239 0.162 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 8.88e-01 0.0159 0.113 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 8.46e-01 0.0289 0.149 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 9.57e-01 0.00786 0.145 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 9.88e-01 0.00227 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 9.14e-01 0.0113 0.104 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 4.97e-01 0.117 0.172 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 9.19e-01 0.0148 0.146 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 3.37e-02 0.36 0.169 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 1.37e-02 -0.373 0.15 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 3.31e-01 0.103 0.105 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 3.23e-01 -0.153 0.155 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 1.47e-02 0.345 0.14 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 5.50e-01 0.0727 0.121 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0161 0.0851 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -232657 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0404 0.178 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 3.30e-01 -0.126 0.129 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 sc-eQTL 4.12e-01 0.125 0.152 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 4.58e-04 -0.423 0.119 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 6.94e-01 0.0358 0.0911 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 3.08e-01 -0.112 0.109 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0639 0.16 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 1.65e-01 0.183 0.131 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.05e-01 0.189 0.117 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 1.51e-01 -0.246 0.171 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 3.28e-03 -0.479 0.161 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0845 0.0876 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 7.37e-01 0.0471 0.14 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 366770 sc-eQTL 1.50e-01 -0.224 0.155 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 3.41e-01 0.0924 0.0969 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 7.76e-03 0.376 0.14 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.48e-02 0.226 0.121 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 366793 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00722 0.173 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 sc-eQTL 3.15e-02 -0.327 0.151 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 655810 sc-eQTL 4.14e-01 -0.108 0.132 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 951922 sc-eQTL 3.38e-01 -0.107 0.112 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75739 sc-eQTL 6.61e-01 0.0571 0.13 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71080 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0601 0.127 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 30596 sc-eQTL 1.30e-04 0.309 0.0793 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -315307 sc-eQTL 6.90e-01 0.0474 0.119 0.075 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 eQTL 3.17e-10 -0.196 0.0309 0.0 0.0 0.0638
ENSG00000112406 HECA -75739 eQTL 9.03e-06 0.0831 0.0186 0.0 0.0 0.0638
ENSG00000146386 ABRACL 30596 eQTL 2.65e-06 0.214 0.0453 0.0 0.0 0.0638
ENSG00000226571 AL592429.2 -212021 eQTL 1.04e-02 0.169 0.0659 0.00131 0.0 0.0638


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 285832 1.28e-06 9.82e-07 3.2e-07 5.88e-07 2.28e-07 4.11e-07 1.15e-06 3.45e-07 1.16e-06 3.77e-07 1.37e-06 5.98e-07 1.67e-06 2.9e-07 4.38e-07 7.17e-07 7.74e-07 5.8e-07 6.18e-07 6.44e-07 3.39e-07 1.2e-06 7.52e-07 5.01e-07 1.97e-06 3.63e-07 7.27e-07 7.25e-07 1.05e-06 1.12e-06 5.2e-07 3.9e-08 1.79e-07 4.57e-07 4.49e-07 3.92e-07 3.65e-07 1.24e-07 1.56e-07 9.81e-09 1.95e-07 1.62e-06 5.94e-08 1.41e-07 2.22e-07 1.38e-07 1.9e-07 8.87e-08 9.42e-08
ENSG00000112406 HECA -75739 5.75e-06 7.73e-06 6.59e-07 3.51e-06 1.65e-06 1.53e-06 8.23e-06 1.25e-06 4.65e-06 2.85e-06 7.56e-06 2.99e-06 9.42e-06 2.33e-06 9.51e-07 3.82e-06 2.96e-06 3.71e-06 1.63e-06 1.63e-06 2.75e-06 6.58e-06 4.68e-06 1.93e-06 8.91e-06 2.08e-06 2.68e-06 1.8e-06 6.12e-06 6.51e-06 3.32e-06 4.16e-07 6.68e-07 2.02e-06 1.97e-06 1.17e-06 9.91e-07 5.45e-07 8.58e-07 5.77e-07 4.4e-07 8.15e-06 6.91e-07 1.61e-07 7.66e-07 7.62e-07 1.11e-06 6.9e-07 4.83e-07
ENSG00000146386 ABRACL 30596 1.3e-05 1.48e-05 2.58e-06 8.32e-06 2.34e-06 5.83e-06 1.78e-05 2.25e-06 1.28e-05 6.24e-06 1.64e-05 6.6e-06 2.13e-05 4.95e-06 4.25e-06 8.06e-06 7.11e-06 1.12e-05 3.64e-06 3.36e-06 6.46e-06 1.27e-05 1.21e-05 3.85e-06 2.26e-05 4.45e-06 7.15e-06 5.51e-06 1.48e-05 1.19e-05 8.99e-06 1.06e-06 1.27e-06 3.72e-06 5.59e-06 2.82e-06 1.76e-06 2.15e-06 1.99e-06 1.27e-06 1.04e-06 1.67e-05 1.87e-06 2.07e-07 9.15e-07 2.28e-06 1.82e-06 6.27e-07 4.78e-07