logo

Genes within 1Mb (chr6:139034021:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 1.19e-01 -0.239 0.152 0.062 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0538 0.117 0.062 B L1
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 2.01e-01 -0.149 0.116 0.062 B L1
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 8.49e-02 0.256 0.148 0.062 B L1
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0604 0.132 0.062 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.02e-01 0.0649 0.0773 0.062 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 9.67e-02 0.314 0.188 0.062 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 8.66e-01 0.0201 0.119 0.062 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 4.22e-01 -0.107 0.133 0.062 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0803 0.167 0.062 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 3.14e-01 -0.113 0.112 0.062 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 8.60e-02 -0.181 0.105 0.062 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 7.42e-01 0.046 0.14 0.062 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0411 0.11 0.062 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 5.46e-01 0.0486 0.0804 0.062 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.38e-01 0.107 0.137 0.062 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0656 0.135 0.062 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 4.35e-01 -0.142 0.181 0.062 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0357 0.119 0.062 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0221 0.121 0.062 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 5.01e-01 0.0875 0.13 0.062 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 1.90e-01 -0.16 0.122 0.062 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.56e-01 0.0519 0.0695 0.062 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 7.93e-01 0.0346 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 6.32e-01 0.0768 0.16 0.062 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0818 0.178 0.063 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.75e-01 0.0896 0.125 0.063 DC L1
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 4.67e-01 -0.107 0.147 0.063 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 8.96e-02 -0.277 0.162 0.063 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0401 0.145 0.063 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 6.79e-01 0.0587 0.142 0.063 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 2.38e-01 0.198 0.168 0.063 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 4.09e-01 -0.141 0.171 0.063 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 1.20e-01 0.202 0.13 0.062 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0749 0.0902 0.062 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 2.63e-01 0.133 0.119 0.062 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 1.47e-02 0.414 0.168 0.062 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.62e-01 0.00471 0.0999 0.062 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 9.19e-01 0.0132 0.13 0.062 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 8.71e-01 0.0223 0.138 0.062 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 1.82e-01 0.236 0.177 0.062 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 5.47e-01 0.0982 0.163 0.062 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 5.23e-01 0.0918 0.143 0.062 NK L1
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 3.38e-01 -0.117 0.122 0.062 NK L1
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 3.50e-01 -0.132 0.141 0.062 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0695 0.134 0.062 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.50e-01 -0.074 0.0978 0.062 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 3.58e-01 0.12 0.13 0.062 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0192 0.191 0.062 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00698 0.123 0.062 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 3.12e-01 -0.154 0.152 0.062 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 6.52e-02 0.254 0.137 0.062 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 2.30e-04 0.539 0.144 0.062 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 2.09e-01 0.122 0.0969 0.062 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0713 0.225 0.061 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.42e-01 -0.152 0.197 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 7.87e-01 0.0277 0.102 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 2.69e-01 -0.237 0.214 0.061 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.93e-01 0.0888 0.224 0.061 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.25e-01 0.162 0.203 0.061 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0985 0.174 0.061 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.93e-01 0.15 0.219 0.061 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 4.61e-01 0.161 0.218 0.061 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 4.01e-01 -0.156 0.185 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0276 0.129 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 4.97e-01 -0.111 0.164 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 9.62e-01 0.00777 0.161 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 4.44e-01 -0.133 0.173 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 7.91e-01 0.0392 0.148 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 1.45e-01 0.263 0.18 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 5.01e-01 0.112 0.166 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 9.56e-01 0.00991 0.18 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 1.04e-01 -0.304 0.186 0.062 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 9.40e-01 0.0107 0.141 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 6.82e-01 0.0722 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0328 0.162 0.062 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0363 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 2.32e-02 0.314 0.137 0.062 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 3.21e-02 0.379 0.175 0.062 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 6.05e-02 0.305 0.162 0.062 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00378 0.2 0.062 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 5.23e-01 -0.115 0.18 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 6.76e-01 -0.053 0.127 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 4.43e-01 -0.132 0.171 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 3.47e-01 0.148 0.157 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 8.32e-01 0.0308 0.145 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0194 0.102 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 4.45e-01 -0.145 0.19 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 9.93e-01 0.0012 0.138 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 5.01e-01 0.122 0.181 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0521 0.176 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0433 0.121 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 1.06e-01 -0.234 0.144 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 1.45e-01 0.242 0.165 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0801 0.158 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 7.97e-02 0.204 0.116 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 6.28e-01 0.0895 0.185 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.37e-02 0.379 0.187 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 4.55e-01 -0.13 0.173 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 1.72e-01 -0.241 0.175 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 5.72e-01 -0.086 0.152 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0758 0.185 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 7.04e-01 0.0677 0.178 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0249 0.173 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 6.76e-01 0.0659 0.157 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 8.75e-01 0.0249 0.158 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 2.99e-01 0.169 0.163 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 5.35e-01 -0.109 0.175 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 3.37e-01 -0.105 0.109 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 8.24e-01 0.0321 0.145 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0409 0.136 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0363 0.121 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 2.35e-01 0.0968 0.0812 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 2.38e-01 0.163 0.138 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 4.17e-01 -0.114 0.14 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0186 0.175 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 8.84e-01 -0.019 0.13 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0378 0.163 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0276 0.14 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 7.09e-01 0.0496 0.133 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0256 0.102 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.36e-01 0.118 0.152 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 7.52e-01 0.0518 0.164 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 5.01e-01 0.129 0.192 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00649 0.131 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 1.15e-01 -0.239 0.151 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 3.87e-02 0.307 0.148 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 4.17e-01 -0.132 0.162 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0196 0.116 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 1.14e-01 0.24 0.151 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 4.08e-01 0.132 0.159 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0767 0.2 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0375 0.143 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 6.01e-01 0.0934 0.178 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 6.17e-01 0.0731 0.146 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0122 0.156 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0793 0.126 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.01e-01 0.124 0.147 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 3.52e-01 0.164 0.176 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00358 0.19 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00367 0.121 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0743 0.146 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 1.10e-01 0.234 0.146 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 4.36e-01 -0.115 0.147 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 1.66e-01 0.107 0.0768 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 6.51e-01 0.0706 0.156 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 9.46e-01 0.012 0.178 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 2.60e-01 -0.232 0.205 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 1.35e-01 -0.216 0.144 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 5.05e-01 -0.127 0.19 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 8.21e-01 0.034 0.15 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.69e-01 0.00613 0.156 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.75e-01 -0.111 0.155 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0198 0.16 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 7.38e-01 0.0565 0.169 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 4.51e-01 0.149 0.197 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.66e-01 0.131 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 2.54e-01 -0.233 0.204 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 4.04e-01 -0.154 0.184 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.41e-01 0.0144 0.192 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 7.00e-01 0.0572 0.148 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0746 0.161 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 4.93e-01 0.126 0.183 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 6.93e-01 0.0805 0.204 0.063 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 8.66e-01 -0.024 0.142 0.063 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 1.52e-01 -0.268 0.186 0.063 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 1.79e-01 0.208 0.154 0.063 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 1.82e-02 0.392 0.165 0.063 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 7.94e-01 0.0321 0.123 0.063 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 5.99e-01 0.0761 0.145 0.063 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0512 0.188 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0975 0.16 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 1.76e-01 -0.232 0.171 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 4.21e-01 -0.137 0.17 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.45e-01 0.011 0.159 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 6.18e-01 0.0731 0.147 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 2.59e-01 0.177 0.157 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 6.53e-02 0.326 0.176 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.48e-01 0.12 0.157 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 9.79e-01 0.00366 0.141 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 5.84e-02 -0.288 0.152 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 8.95e-01 0.0191 0.145 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0802 0.0979 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 6.37e-01 0.0617 0.131 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 6.10e-01 -0.107 0.21 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0412 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 6.92e-01 -0.063 0.159 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 8.24e-02 -0.34 0.195 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 5.60e-01 -0.113 0.193 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.30e-01 0.126 0.159 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.84e-01 0.119 0.17 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0213 0.18 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 3.75e-01 0.137 0.155 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0937 0.144 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 7.41e-01 0.0513 0.155 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0845 0.16 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 7.56e-01 0.032 0.103 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 3.53e-01 0.125 0.134 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 3.22e-01 -0.198 0.2 0.063 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0613 0.159 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0313 0.147 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 1.69e-01 0.217 0.157 0.063 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 1.83e-01 0.247 0.185 0.063 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 5.34e-01 0.0745 0.12 0.063 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.92e-01 0.098 0.142 0.063 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 6.33e-01 0.0913 0.191 0.062 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 2.06e-01 -0.165 0.13 0.062 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 7.71e-02 -0.362 0.204 0.062 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 4.82e-01 0.112 0.158 0.062 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.66e-01 0.071 0.164 0.062 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0876 0.14 0.062 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 8.07e-01 0.0382 0.156 0.062 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -205632 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0252 0.179 0.062 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0968 0.177 0.068 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.72e-01 0.0915 0.127 0.068 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 4.18e-01 -0.136 0.168 0.068 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 2.25e-02 -0.374 0.163 0.068 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0917 0.19 0.068 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 7.40e-01 0.0516 0.155 0.068 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 4.22e-01 0.133 0.164 0.068 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 4.41e-01 -0.14 0.182 0.068 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 1.63e-01 0.199 0.142 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0406 0.102 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 2.53e-01 0.135 0.118 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 1.48e-01 0.248 0.171 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.32e-01 0.0736 0.153 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 5.56e-01 -0.076 0.129 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 8.83e-01 0.0198 0.135 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 4.02e-01 0.151 0.18 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0255 0.166 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0199 0.113 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 8.93e-01 0.0189 0.14 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 3.69e-02 0.369 0.176 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0834 0.168 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 5.76e-01 0.0817 0.146 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 5.57e-01 -0.085 0.144 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 4.35e-01 0.152 0.194 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 2.35e-01 -0.269 0.225 0.064 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 2.73e-01 0.237 0.215 0.064 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 9.09e-01 0.023 0.201 0.064 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 5.94e-01 0.115 0.215 0.064 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 8.61e-01 0.039 0.222 0.064 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.76e-01 0.12 0.167 0.064 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0445 0.193 0.064 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 9.24e-01 0.0183 0.191 0.062 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0958 0.128 0.062 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0584 0.156 0.062 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 4.86e-01 0.12 0.172 0.062 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.34e-01 0.0148 0.178 0.062 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 2.85e-01 0.174 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 3.70e-01 0.142 0.158 0.062 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0342 0.193 0.062 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0278 0.18 0.061 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 2.68e-01 -0.119 0.107 0.061 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00268 0.165 0.061 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 2.10e-01 0.217 0.173 0.061 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0644 0.131 0.061 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 4.39e-01 0.122 0.157 0.061 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 8.41e-03 0.349 0.131 0.061 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 5.96e-01 0.102 0.192 0.061 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 8.61e-01 0.0349 0.2 0.068 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 6.82e-02 0.282 0.154 0.068 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0886 0.169 0.068 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 4.83e-01 -0.109 0.154 0.068 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 4.91e-01 0.108 0.156 0.068 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00659 0.171 0.068 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 9.68e-02 0.333 0.199 0.068 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 4.72e-01 0.112 0.155 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 1.81e-01 -0.238 0.177 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 9.80e-01 0.00313 0.123 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0148 0.162 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0565 0.158 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00468 0.164 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 3.28e-01 0.111 0.114 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 3.79e-03 0.541 0.185 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 1.41e-01 0.235 0.159 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0637 0.186 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 5.48e-01 -0.101 0.168 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0505 0.116 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 2.02e-01 -0.218 0.17 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 1.46e-01 0.228 0.156 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0475 0.134 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 2.08e-01 0.118 0.0934 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -257977 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0848 0.196 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 6.17e-01 0.0714 0.143 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -237341 sc-eQTL 8.90e-01 0.0232 0.168 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 2.81e-01 0.141 0.131 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0718 0.0977 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 3.27e-01 0.115 0.117 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 1.82e-02 0.404 0.17 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0169 0.142 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 9.39e-01 0.00961 0.126 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 9.71e-01 0.0051 0.138 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 2.31e-01 0.221 0.184 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 5.80e-01 0.0982 0.177 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0756 0.0947 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 8.37e-01 0.0312 0.152 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 341450 sc-eQTL 8.37e-02 0.291 0.167 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0319 0.105 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 3.85e-01 0.133 0.153 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 1.27e-02 0.328 0.13 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 341473 sc-eQTL 7.57e-01 0.0577 0.186 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 260512 sc-eQTL 4.95e-01 0.116 0.169 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 630490 sc-eQTL 2.51e-01 0.169 0.147 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 926602 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0616 0.124 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -101059 sc-eQTL 3.58e-01 -0.133 0.144 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 45760 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0906 0.141 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 5276 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0315 0.0911 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -340627 sc-eQTL 3.82e-01 0.115 0.132 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 341450 eQTL 0.0252 -0.119 0.0532 0.00153 0.0 0.053
ENSG00000279968 GVQW2 260369 eQTL 0.0373 -0.202 0.0971 0.0 0.0 0.053

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N 630490 3.62e-07 2.5e-07 1.23e-07 2.66e-07 1.06e-07 9.31e-08 2.95e-07 6.57e-08 1.94e-07 1.15e-07 2.98e-07 1.62e-07 2.94e-07 8.66e-08 1.68e-07 1.46e-07 4.63e-08 2.56e-07 2.42e-07 9.01e-08 1.76e-07 2.96e-07 2.11e-07 1.03e-07 2.74e-07 1.31e-07 1.74e-07 1.46e-07 1.58e-07 2.19e-07 1.35e-07 5.82e-08 3.8e-08 1.02e-07 8.75e-08 7.56e-08 6.77e-08 5.36e-08 5.8e-08 6.43e-08 6e-08 2.74e-07 6.04e-08 1.87e-08 1.94e-07 8.94e-09 9.07e-08 2.38e-08 5.4e-08
ENSG00000112406 \N -101059 9.28e-06 1.27e-05 1.98e-06 6.41e-06 2.42e-06 3.93e-06 1.04e-05 2.13e-06 1.02e-05 5.49e-06 1.31e-05 5.9e-06 1.62e-05 3.63e-06 3.46e-06 7.31e-06 5.78e-06 7.74e-06 3.05e-06 3.06e-06 6.26e-06 1.21e-05 8.65e-06 3.23e-06 1.66e-05 4.12e-06 5.93e-06 4.61e-06 1.02e-05 8.95e-06 6.13e-06 1.01e-06 1.21e-06 3.28e-06 5.47e-06 2.8e-06 1.76e-06 1.96e-06 1.79e-06 1.02e-06 1.02e-06 1.57e-05 1.63e-06 1.76e-07 9.54e-07 1.74e-06 1.75e-06 8.5e-07 4.79e-07