logo

Genes within 1Mb (chr6:139029110:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0203 0.144 0.068 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0632 0.11 0.068 B L1
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 2.99e-01 -0.114 0.11 0.068 B L1
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 3.39e-01 -0.134 0.14 0.068 B L1
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 7.08e-01 0.0465 0.124 0.068 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 1.12e-01 0.116 0.0725 0.068 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 2.42e-01 -0.209 0.178 0.068 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 6.49e-01 0.0513 0.112 0.068 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 5.28e-01 0.0791 0.125 0.068 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 6.82e-01 0.0662 0.161 0.068 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.65e-01 0.0184 0.108 0.068 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 4.60e-02 0.203 0.101 0.068 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.54e-01 -0.191 0.134 0.068 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 1.43e-01 0.155 0.105 0.068 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 4.64e-02 -0.154 0.0768 0.068 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.82e-01 0.00301 0.132 0.068 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0672 0.13 0.068 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 7.69e-01 0.0518 0.177 0.068 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.90e-01 0.016 0.116 0.068 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 1.23e-01 0.182 0.117 0.068 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.26e-01 -0.153 0.126 0.068 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0669 0.119 0.068 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 2.10e-03 -0.206 0.0662 0.068 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.17e-01 0.0134 0.129 0.068 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 9.24e-01 0.0148 0.156 0.068 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 6.85e-01 0.07 0.172 0.072 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 3.90e-01 0.104 0.121 0.072 DC L1
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 9.71e-02 -0.235 0.141 0.072 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 2.13e-01 0.197 0.157 0.072 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 9.24e-01 0.0133 0.14 0.072 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 4.41e-01 -0.105 0.137 0.072 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 1.92e-01 0.212 0.162 0.072 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 4.49e-01 0.125 0.165 0.072 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 8.93e-01 0.0169 0.126 0.068 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0463 0.087 0.068 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.50e-01 -0.165 0.114 0.068 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 9.29e-01 0.0147 0.164 0.068 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 7.29e-02 0.172 0.0956 0.068 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 3.59e-01 -0.115 0.125 0.068 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 7.22e-01 0.0472 0.133 0.068 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0367 0.171 0.068 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0483 0.155 0.069 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.93e-01 0.0729 0.136 0.069 NK L1
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 4.57e-01 0.0861 0.116 0.069 NK L1
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.17e-01 -0.209 0.133 0.069 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 7.64e-01 0.0382 0.127 0.069 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0987 0.0927 0.069 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 6.66e-01 0.0534 0.124 0.069 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 3.59e-01 -0.168 0.183 0.068 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0566 0.118 0.068 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 1.51e-01 0.21 0.145 0.068 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 3.99e-01 -0.112 0.132 0.068 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0718 0.143 0.068 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0899 0.0932 0.068 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 4.39e-01 0.0847 0.109 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 3.81e-01 0.181 0.206 0.069 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.00e-01 0.122 0.181 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 1.51e-01 -0.135 0.0934 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 3.84e-01 -0.171 0.196 0.069 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 6.27e-01 0.1 0.206 0.069 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 9.05e-01 0.0223 0.186 0.069 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 7.83e-01 0.0441 0.16 0.069 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 7.94e-01 0.0525 0.201 0.069 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 1.67e-01 -0.277 0.2 0.069 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 7.21e-01 -0.063 0.176 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.77e-01 -0.068 0.122 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0832 0.155 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.68e-01 -0.169 0.152 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.07e-01 0.0402 0.165 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 5.92e-01 0.0751 0.14 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 2.55e-01 0.195 0.171 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.49e-01 0.0102 0.158 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0719 0.171 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 8.61e-01 0.0316 0.18 0.069 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0782 0.135 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 4.81e-01 -0.119 0.169 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0876 0.156 0.069 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 4.21e-01 -0.136 0.169 0.069 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0223 0.134 0.069 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 4.79e-01 0.121 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.05e-01 0.0187 0.157 0.069 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 2.91e-01 0.203 0.192 0.069 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 1.22e-01 -0.261 0.168 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 6.99e-01 -0.046 0.119 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0578 0.161 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 5.50e-02 -0.282 0.146 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 7.82e-01 0.0379 0.137 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 1.04e-01 0.155 0.0949 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 1.95e-01 -0.231 0.178 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 7.51e-01 0.0413 0.13 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 4.68e-01 0.124 0.171 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 1.20e-01 0.257 0.164 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 7.88e-01 0.0305 0.113 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0488 0.136 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 7.96e-01 0.0402 0.156 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 5.54e-01 0.0881 0.148 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 8.31e-02 0.189 0.109 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 1.85e-01 -0.229 0.172 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 4.21e-01 0.142 0.176 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 9.61e-01 0.00797 0.162 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0695 0.177 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 3.61e-01 0.14 0.153 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 6.24e-01 0.0914 0.186 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 3.18e-01 -0.178 0.178 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 2.13e-01 0.216 0.173 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 6.54e-02 -0.29 0.157 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.91e-01 0.00186 0.159 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0178 0.164 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 9.10e-01 0.0191 0.169 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0374 0.105 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 6.78e-01 0.0577 0.139 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.50e-01 -0.189 0.13 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 2.77e-01 0.126 0.116 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0858 0.0781 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 8.67e-01 0.0223 0.133 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 7.47e-01 0.0434 0.134 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 6.47e-01 0.0766 0.167 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 7.17e-01 0.0451 0.125 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 2.63e-01 0.175 0.156 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 9.53e-01 0.00798 0.134 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 2.62e-01 -0.142 0.127 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0973 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 2.42e-01 0.17 0.145 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00398 0.157 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0682 0.187 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 9.34e-01 0.0105 0.127 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0343 0.148 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.27e-01 -0.176 0.145 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.67e-01 0.0265 0.159 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 6.51e-04 -0.381 0.11 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 7.94e-01 0.0387 0.148 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 5.89e-01 -0.084 0.155 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 2.51e-01 -0.223 0.194 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 2.99e-01 0.144 0.139 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 4.57e-01 0.129 0.173 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00688 0.142 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 2.14e-01 -0.189 0.151 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 3.24e-03 -0.359 0.12 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0348 0.143 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 4.74e-01 0.123 0.171 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 8.26e-01 0.0401 0.182 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0285 0.116 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 7.46e-01 0.0453 0.14 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 6.49e-02 -0.259 0.139 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 1.05e-01 -0.12 0.0735 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.70e-01 0.00566 0.149 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 2.02e-01 -0.218 0.17 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 4.17e-01 0.164 0.202 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 4.53e-01 0.107 0.142 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 1.41e-02 0.458 0.185 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.19e-01 -0.23 0.147 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0276 0.154 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 3.75e-01 -0.136 0.153 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 6.25e-01 0.0772 0.157 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 9.29e-01 0.0148 0.166 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 9.70e-01 0.00715 0.189 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 4.25e-01 -0.137 0.171 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 2.78e-02 0.428 0.193 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 9.73e-01 0.00594 0.177 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 9.22e-02 -0.309 0.183 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 3.33e-01 -0.137 0.141 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 2.86e-01 -0.164 0.154 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0226 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 4.43e-02 -0.391 0.193 0.069 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0534 0.135 0.069 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 2.33e-02 0.404 0.177 0.069 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 3.23e-01 -0.147 0.148 0.069 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0551 0.16 0.069 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 9.28e-01 0.0107 0.118 0.069 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 7.46e-01 0.0449 0.138 0.069 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 7.47e-01 0.0584 0.181 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 3.77e-01 0.136 0.154 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 2.50e-01 0.19 0.164 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.49e-01 -0.236 0.163 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 5.65e-01 0.088 0.153 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 8.25e-01 0.0312 0.141 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 3.86e-01 0.131 0.151 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0171 0.166 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0337 0.148 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 2.99e-01 0.138 0.132 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.54e-02 -0.345 0.141 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0562 0.136 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 1.29e-01 -0.139 0.0914 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 4.61e-01 0.0905 0.122 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 5.93e-01 -0.104 0.194 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.78e-01 0.0254 0.166 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0201 0.147 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0419 0.182 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 6.38e-01 0.0844 0.179 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 7.12e-01 0.0545 0.148 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 1.52e-01 0.226 0.157 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 3.43e-01 0.164 0.172 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 4.96e-01 0.101 0.149 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 1.64e-01 -0.193 0.138 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0889 0.149 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0749 0.154 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 1.20e-01 -0.154 0.0984 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.25e-01 0.0122 0.129 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 9.20e-01 0.0207 0.205 0.078 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0383 0.182 0.078 PB L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 5.14e-01 0.0909 0.139 0.078 PB L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.29e-01 -0.268 0.222 0.078 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.32e-01 0.0422 0.198 0.078 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 3.18e-01 -0.139 0.138 0.078 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 7.45e-01 -0.066 0.203 0.078 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 1.38e-01 0.226 0.151 0.078 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 8.22e-01 0.0463 0.205 0.078 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 1.10e-01 0.302 0.189 0.07 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 9.62e-01 0.0072 0.151 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 4.65e-01 0.102 0.14 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 3.45e-01 -0.141 0.149 0.07 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 4.22e-01 0.141 0.176 0.07 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0876 0.113 0.07 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 2.01e-01 0.173 0.135 0.07 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 6.78e-01 0.0751 0.181 0.068 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 2.96e-01 0.129 0.123 0.068 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 2.62e-01 0.218 0.194 0.068 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 4.93e-01 -0.103 0.15 0.068 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 7.85e-02 0.273 0.154 0.068 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 8.98e-02 -0.224 0.131 0.068 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 3.15e-01 0.148 0.147 0.068 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 sc-eQTL 7.52e-02 0.3 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 3.27e-01 0.169 0.172 0.073 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 3.63e-02 0.257 0.122 0.073 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.29e-01 -0.197 0.163 0.073 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 3.16e-01 0.161 0.16 0.073 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 4.82e-01 0.13 0.184 0.073 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00587 0.151 0.073 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 8.20e-01 0.0365 0.16 0.073 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 3.37e-01 0.17 0.176 0.073 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0775 0.137 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 6.56e-01 -0.044 0.0986 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.73e-01 -0.124 0.113 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 1.31e-01 -0.25 0.164 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 2.40e-01 0.173 0.147 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 1.39e-01 -0.183 0.124 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.08e-01 0.015 0.13 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 6.81e-01 0.0712 0.173 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 4.51e-01 0.119 0.158 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 3.27e-01 0.106 0.108 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 3.49e-01 -0.125 0.133 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 3.21e-01 0.168 0.169 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.61e-01 0.0281 0.16 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 4.50e-01 -0.105 0.139 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 6.13e-01 0.0698 0.138 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0788 0.186 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 1.99e-01 -0.276 0.214 0.067 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 7.81e-02 0.36 0.203 0.067 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 4.57e-01 0.142 0.19 0.067 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.45e-01 -0.297 0.203 0.067 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 4.99e-01 0.143 0.211 0.067 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 6.77e-01 0.0664 0.159 0.067 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 5.46e-01 0.111 0.183 0.067 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 2.54e-01 0.206 0.18 0.071 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00985 0.121 0.071 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0404 0.148 0.071 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 3.67e-01 0.148 0.163 0.071 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 1.75e-01 0.229 0.168 0.071 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 2.72e-01 -0.169 0.154 0.071 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0108 0.15 0.071 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 3.79e-01 -0.162 0.183 0.071 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00593 0.173 0.07 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0172 0.103 0.07 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.92e-02 -0.343 0.156 0.07 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 8.05e-01 0.0412 0.166 0.07 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.13e-01 0.0297 0.125 0.07 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 4.41e-01 -0.116 0.151 0.07 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 7.97e-01 0.033 0.128 0.07 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 7.30e-01 0.0637 0.185 0.07 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 4.93e-01 0.135 0.197 0.076 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 3.59e-01 0.141 0.153 0.076 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 5.46e-01 -0.101 0.167 0.076 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 5.17e-01 0.0989 0.152 0.076 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 9.52e-01 0.00938 0.155 0.076 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0437 0.169 0.076 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 3.92e-01 0.17 0.198 0.076 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 7.74e-01 0.044 0.153 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 6.54e-01 0.077 0.172 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0308 0.119 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 4.93e-01 -0.107 0.157 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.71e-01 -0.168 0.152 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0618 0.158 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0268 0.11 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 1.44e-01 0.265 0.181 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 8.93e-01 0.0207 0.154 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0129 0.179 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 8.55e-01 0.0288 0.157 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0667 0.109 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0822 0.16 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.89e-01 -0.193 0.146 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 7.91e-01 0.0333 0.125 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 6.44e-02 0.162 0.0873 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -262888 sc-eQTL 4.61e-02 -0.366 0.182 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 9.59e-01 0.00693 0.134 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -242252 sc-eQTL 7.84e-01 0.0432 0.157 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 8.81e-01 -0.019 0.127 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 5.06e-01 -0.063 0.0946 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.53e-01 -0.13 0.114 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0509 0.167 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 3.56e-01 0.127 0.137 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 2.10e-01 -0.153 0.121 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 6.49e-01 0.0608 0.133 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 8.36e-01 0.0371 0.179 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 5.27e-01 0.108 0.17 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 8.47e-01 0.0176 0.0909 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 2.41e-01 -0.17 0.145 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 336539 sc-eQTL 6.46e-01 0.0744 0.162 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 1.86e-01 0.133 0.1 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0715 0.147 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 7.08e-01 0.0475 0.127 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 336562 sc-eQTL 5.06e-01 -0.119 0.178 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 255601 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0457 0.161 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 625579 sc-eQTL 7.01e-01 0.0536 0.139 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 921691 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0139 0.118 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -105970 sc-eQTL 1.69e-01 -0.188 0.136 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 40849 sc-eQTL 8.18e-01 0.0309 0.134 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 365 sc-eQTL 2.39e-01 -0.102 0.0861 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -345538 sc-eQTL 6.35e-01 0.0594 0.125 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146386 ABRACL 365 eQTL 3.64e-13 -0.282 0.0383 0.999 0.978 0.0932
ENSG00000231329 AL031772.1 -210543 eQTL 0.0438 0.062 0.0307 0.0 0.0 0.0932
ENSG00000279968 GVQW2 255458 eQTL 0.00331 -0.223 0.0757 0.00437 0.0 0.0932

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146386 ABRACL 365 0.000987 0.00135 0.00023 0.000436 0.000442 0.000577 0.00109 0.000309 0.00142 0.000654 0.00146 0.000781 0.00197 0.000531 0.000264 0.000635 0.000478 0.00106 0.000608 0.000283 0.00101 0.00105 0.001 0.00039 0.00138 0.000483 0.000607 0.000807 0.00129 0.000459 0.00096 0.000146 0.000141 0.000331 0.000323 0.000249 0.000157 0.000137 0.000215 0.000193 0.0001 0.00113 0.000162 2.07e-05 0.000108 0.000369 0.000229 0.000173 9.87e-05