logo

Genes within 1Mb (chr6:139016599:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00724 0.1 0.16 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.19e-01 0.119 0.0761 0.16 B L1
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 1.27e-01 0.117 0.076 0.16 B L1
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0676 0.0974 0.16 B L1
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0578 0.0861 0.16 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.77e-03 -0.145 0.0496 0.16 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0258 0.124 0.16 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 5.40e-01 0.048 0.0781 0.16 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 9.64e-02 -0.144 0.0863 0.16 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 4.00e-01 0.093 0.11 0.16 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 3.71e-02 0.154 0.0734 0.16 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 8.45e-01 0.0137 0.0699 0.16 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 6.92e-01 0.0365 0.092 0.16 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 8.58e-01 -0.013 0.0724 0.16 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0829 0.0528 0.16 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.83e-01 0.121 0.0903 0.16 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 4.12e-01 0.0733 0.0892 0.16 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0135 0.121 0.16 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 3.16e-02 0.169 0.0783 0.16 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0213 0.0806 0.16 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 3.52e-01 0.0806 0.0864 0.16 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 8.13e-01 0.0193 0.0814 0.16 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0473 0.0462 0.16 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 4.07e-02 0.179 0.0871 0.16 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 4.92e-01 0.0736 0.107 0.16 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 7.33e-01 0.0436 0.128 0.153 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00594 0.0897 0.153 DC L1
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0146 0.105 0.153 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0421 0.117 0.153 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 3.31e-01 -0.101 0.103 0.153 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 5.29e-03 0.28 0.0993 0.153 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0898 0.12 0.153 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 4.51e-03 -0.344 0.12 0.153 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 2.07e-01 -0.113 0.089 0.16 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0338 0.0617 0.16 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0408 0.0814 0.16 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00343 0.117 0.16 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0741 0.0681 0.16 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 2.54e-01 0.101 0.0886 0.16 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 4.92e-01 0.0647 0.094 0.16 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 5.34e-02 -0.234 0.12 0.16 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 2.42e-01 0.133 0.113 0.159 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.14e-01 0.157 0.0992 0.159 NK L1
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 8.31e-02 0.146 0.0841 0.159 NK L1
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 3.16e-01 0.0982 0.0976 0.159 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 9.77e-01 0.00267 0.0932 0.159 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0562 0.0679 0.159 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 9.16e-03 0.234 0.089 0.159 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 8.66e-01 0.0217 0.129 0.16 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 2.75e-01 0.0909 0.083 0.16 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0687 0.103 0.16 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 2.64e-01 0.104 0.093 0.16 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0987 0.1 0.16 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.92e-01 0.0562 0.0656 0.16 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 9.64e-02 0.128 0.0764 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 9.88e-01 0.0021 0.143 0.166 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 6.41e-01 0.0586 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 5.19e-02 -0.126 0.0644 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0174 0.136 0.166 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0845 0.143 0.166 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 7.13e-01 0.0475 0.129 0.166 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 1.82e-01 -0.147 0.11 0.166 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.13e-02 -0.35 0.137 0.166 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 8.47e-02 -0.239 0.138 0.166 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 9.78e-01 0.00344 0.124 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0774 0.0859 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 4.29e-01 0.0867 0.109 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 3.48e-01 -0.101 0.107 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 2.59e-01 -0.131 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 9.58e-01 0.00522 0.0988 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 8.47e-01 0.0234 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 7.06e-01 -0.042 0.111 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 8.17e-01 0.0279 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 6.71e-01 0.0539 0.127 0.162 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 2.92e-02 0.207 0.0942 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 6.85e-01 0.0483 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 5.14e-01 0.0715 0.109 0.162 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 2.17e-02 -0.271 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0823 0.0937 0.162 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0307 0.12 0.162 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 5.81e-01 0.0608 0.11 0.162 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 3.95e-01 -0.115 0.135 0.162 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0535 0.12 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.99e-01 0.109 0.0843 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 3.36e-02 0.243 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0855 0.105 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 4.60e-01 0.0718 0.097 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.88e-03 -0.195 0.0666 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 3.62e-01 0.116 0.127 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 2.56e-01 0.105 0.0923 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0596 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 3.67e-01 0.106 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 7.37e-01 0.0271 0.0807 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 6.70e-01 0.0414 0.0969 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 1.03e-01 -0.181 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 2.67e-01 0.118 0.106 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 1.06e-01 -0.126 0.0775 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 3.44e-01 -0.117 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 3.02e-01 0.13 0.126 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0616 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 5.62e-01 0.0712 0.123 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 8.27e-03 0.278 0.104 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 7.01e-01 0.0497 0.129 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0189 0.124 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 5.68e-01 0.0687 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 6.26e-01 0.0535 0.11 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 2.76e-01 0.12 0.11 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0556 0.114 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 3.12e-02 0.249 0.115 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 7.24e-02 0.13 0.0719 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 6.70e-01 0.0408 0.0956 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0149 0.0903 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 9.64e-01 0.0036 0.0801 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0764 0.0537 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 2.22e-01 0.112 0.0912 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 8.33e-01 0.0196 0.0926 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00801 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 8.28e-02 0.147 0.0841 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 1.21e-01 -0.164 0.106 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 5.05e-01 0.0608 0.0909 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0337 0.0863 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0171 0.0664 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.09e-01 0.158 0.0981 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 3.43e-01 0.101 0.106 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 1.73e-01 -0.176 0.129 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.93e-01 0.115 0.0878 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 8.75e-01 0.0162 0.102 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0852 0.1 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00686 0.11 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0523 0.0781 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.68e-01 0.141 0.102 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 4.13e-01 0.088 0.107 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 6.33e-02 0.25 0.134 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.36e-01 0.144 0.096 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0306 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.87e-01 0.014 0.0983 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 1.63e-01 -0.147 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 7.43e-01 0.0279 0.0852 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.10e-01 0.158 0.0986 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 2.43e-01 0.139 0.119 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 9.98e-02 -0.207 0.125 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.29e-01 0.122 0.0801 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 9.45e-01 0.0067 0.0968 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 6.31e-01 0.0468 0.0972 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 6.04e-01 0.0507 0.0975 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0523 0.051 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.63e-01 0.144 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 7.17e-01 0.0429 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0254 0.14 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.52e-01 0.141 0.0981 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 9.39e-02 -0.218 0.129 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 1.07e-01 0.165 0.102 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0327 0.107 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.13e-01 -0.107 0.106 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0302 0.109 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 3.74e-01 -0.103 0.115 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 5.47e-02 0.248 0.128 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.76e-01 0.159 0.117 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 1.59e-01 0.189 0.134 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.10e-01 0.0292 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 4.22e-01 0.101 0.126 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 1.95e-01 -0.126 0.0969 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 3.90e-01 0.0909 0.106 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0817 0.12 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 7.56e-01 0.0432 0.139 0.158 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 9.87e-02 0.159 0.0956 0.158 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 3.01e-01 -0.132 0.127 0.158 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 6.32e-01 0.0506 0.105 0.158 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 2.72e-01 -0.125 0.113 0.158 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.03e-02 0.18 0.0826 0.158 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 9.94e-01 0.000793 0.0983 0.158 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0107 0.134 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 6.27e-01 0.0555 0.114 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 3.97e-01 -0.103 0.122 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 2.07e-01 0.153 0.121 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 5.51e-01 0.0674 0.113 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.72e-04 -0.365 0.101 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 5.24e-01 0.0713 0.112 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 5.41e-01 0.0747 0.122 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.07e-01 0.174 0.108 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 8.62e-02 0.166 0.0964 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.27e-01 0.023 0.105 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 7.72e-01 0.0288 0.0995 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0378 0.0673 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.62e-03 0.28 0.0877 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 7.50e-01 0.0442 0.138 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.91e-01 0.154 0.117 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 2.34e-01 0.125 0.104 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 5.09e-01 0.0856 0.129 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 3.30e-01 -0.124 0.127 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 6.77e-01 0.0439 0.105 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.66e-02 0.267 0.111 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 1.34e-01 0.188 0.125 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 4.21e-01 0.0873 0.108 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 8.32e-01 0.0215 0.101 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00294 0.108 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00923 0.112 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 6.79e-01 0.0299 0.0721 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 3.55e-02 0.197 0.0932 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 3.78e-01 -0.132 0.149 0.178 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 7.19e-01 0.0481 0.133 0.178 PB L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 6.72e-03 0.271 0.0981 0.178 PB L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 1.87e-01 -0.215 0.162 0.178 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0613 0.145 0.178 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 4.85e-01 0.0708 0.101 0.178 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 1.42e-01 0.217 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0813 0.111 0.178 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0455 0.149 0.178 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 8.64e-03 -0.349 0.132 0.163 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0328 0.107 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 2.46e-01 -0.114 0.0983 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 7.64e-01 0.0317 0.105 0.163 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0998 0.124 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 9.87e-01 0.0013 0.0801 0.163 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 6.93e-02 0.173 0.0946 0.163 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 7.95e-01 0.0323 0.124 0.16 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 4.66e-01 0.0619 0.0847 0.16 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 4.26e-01 0.106 0.133 0.16 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0312 0.103 0.16 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 8.19e-01 0.0244 0.107 0.16 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0301 0.0909 0.16 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 7.47e-02 0.18 0.101 0.16 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -223054 sc-eQTL 6.65e-01 0.0503 0.116 0.16 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0827 0.128 0.151 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 3.96e-01 -0.078 0.0916 0.151 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0735 0.122 0.151 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 6.51e-01 -0.054 0.119 0.151 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 1.07e-01 -0.221 0.136 0.151 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 7.59e-02 0.199 0.111 0.151 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 7.49e-01 0.0381 0.119 0.151 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 3.25e-03 -0.383 0.128 0.151 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 8.76e-02 -0.167 0.0972 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0424 0.0703 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 1.89e-01 -0.106 0.0806 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 1.64e-01 0.164 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 4.49e-01 0.0796 0.105 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 6.03e-02 0.166 0.0877 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 7.68e-01 0.0274 0.0925 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 1.98e-01 -0.159 0.123 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 5.92e-01 0.0603 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 8.46e-01 0.015 0.0769 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0237 0.095 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 2.49e-01 -0.139 0.12 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 6.69e-02 -0.208 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 1.16e-01 0.156 0.0985 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 6.19e-01 0.0489 0.098 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 3.06e-01 -0.135 0.132 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 2.30e-01 0.187 0.155 0.145 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 3.25e-01 0.146 0.148 0.145 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 9.04e-01 0.0166 0.138 0.145 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 2.81e-01 0.159 0.147 0.145 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 6.46e-01 0.0703 0.153 0.145 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 7.69e-01 0.0338 0.115 0.145 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 7.23e-01 0.0471 0.133 0.145 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 3.47e-01 -0.125 0.133 0.153 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 8.20e-01 0.0204 0.0895 0.153 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 9.85e-02 0.18 0.109 0.153 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 3.55e-01 -0.112 0.12 0.153 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 2.13e-01 -0.155 0.124 0.153 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 5.56e-02 0.217 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 8.52e-02 0.19 0.11 0.153 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 6.61e-02 -0.248 0.134 0.153 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.126 0.154 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 9.56e-01 0.00414 0.0755 0.154 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00848 0.116 0.154 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 4.55e-02 -0.242 0.12 0.154 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0636 0.0915 0.154 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 3.23e-01 -0.109 0.11 0.154 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.37e-01 0.139 0.0932 0.154 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 3.57e-01 -0.124 0.135 0.154 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 3.02e-01 0.147 0.142 0.158 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 8.76e-01 0.0173 0.11 0.158 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0545 0.12 0.158 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00448 0.11 0.158 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 7.68e-01 0.0329 0.111 0.158 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 2.36e-01 0.144 0.121 0.158 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 2.85e-01 0.153 0.143 0.158 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 2.34e-01 -0.131 0.11 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 5.05e-01 0.0793 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 2.92e-01 0.0867 0.0821 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 5.96e-01 0.0575 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0336 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 8.46e-03 -0.287 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0582 0.0759 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0712 0.126 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0727 0.107 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 3.20e-01 -0.123 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 8.63e-01 0.0194 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.49e-01 0.112 0.0773 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 3.58e-02 0.238 0.113 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 1.91e-01 -0.137 0.104 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 4.16e-01 0.0726 0.0891 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 4.75e-03 -0.175 0.0614 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -275399 sc-eQTL 8.67e-01 -0.022 0.131 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 2.56e-01 0.108 0.0949 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -254763 sc-eQTL 3.02e-01 -0.115 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0811 0.09 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0279 0.0672 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0928 0.0806 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 6.13e-01 0.0598 0.118 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0689 0.0971 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 4.90e-02 0.17 0.0857 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 8.12e-01 0.0226 0.0947 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 1.58e-01 -0.179 0.126 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 2.13e-01 -0.154 0.123 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 7.69e-01 0.0194 0.066 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 7.69e-01 0.031 0.106 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 324028 sc-eQTL 1.01e-01 -0.192 0.117 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0438 0.073 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 6.81e-01 -0.044 0.107 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 1.37e-01 0.137 0.0917 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 324051 sc-eQTL 1.46e-01 -0.188 0.129 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 243090 sc-eQTL 1.99e-01 0.151 0.117 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 613068 sc-eQTL 1.06e-01 0.164 0.101 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 909180 sc-eQTL 4.18e-02 0.174 0.085 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -118481 sc-eQTL 4.42e-01 0.0771 0.1 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 28338 sc-eQTL 8.34e-01 0.0206 0.0978 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -12146 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0284 0.0631 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -358049 sc-eQTL 6.86e-03 0.245 0.0897 0.155 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 28338 eQTL 6.48e-18 -0.186 0.0211 0.00183 0.0074 0.157
ENSG00000146386 ABRACL -12146 eQTL 8.63e-05 0.118 0.03 0.0 0.0 0.157

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 28338 2.73e-05 2.48e-05 5.43e-06 1.28e-05 3.64e-06 9.07e-06 2.99e-05 3.41e-06 1.87e-05 8.98e-06 2.48e-05 1.13e-05 3.56e-05 7.61e-06 5.8e-06 1.17e-05 1.33e-05 1.88e-05 5.56e-06 4.15e-06 9.08e-06 2.08e-05 2.34e-05 5.76e-06 3.35e-05 6.35e-06 8.28e-06 7.09e-06 2.36e-05 1.63e-05 1.35e-05 1.65e-06 1.93e-06 4.69e-06 8.41e-06 4.07e-06 1.79e-06 2.89e-06 3.25e-06 2.37e-06 1.58e-06 2.67e-05 3.34e-06 3.62e-07 1.7e-06 2.75e-06 3.36e-06 1.24e-06 1.19e-06
ENSG00000146386 ABRACL -12146 5.35e-05 3.64e-05 6.48e-06 1.61e-05 5.81e-06 1.54e-05 4.7e-05 4.84e-06 3.11e-05 1.34e-05 3.69e-05 1.91e-05 4.89e-05 1.33e-05 7.75e-06 2.02e-05 2.01e-05 2.91e-05 7.94e-06 6.54e-06 1.41e-05 3.46e-05 3.51e-05 8.66e-06 4.91e-05 9.71e-06 1.38e-05 1.07e-05 3.6e-05 2.19e-05 2.22e-05 1.63e-06 2.75e-06 7.07e-06 1.11e-05 5.68e-06 2.7e-06 3.17e-06 5.18e-06 3.22e-06 1.77e-06 3.94e-05 4.65e-06 3.73e-07 2.18e-06 4.38e-06 4.38e-06 1.6e-06 1.53e-06
ENSG00000231329 \N -223054 1.24e-06 1.08e-06 6.9e-07 1.21e-06 2.69e-07 6.02e-07 1.5e-06 1.76e-07 1.28e-06 4.78e-07 1.56e-06 5.22e-07 2.34e-06 2.81e-07 5.7e-07 8.19e-07 8.06e-07 5.57e-07 8.21e-07 2.27e-07 3.8e-07 1.17e-06 8.9e-07 5.6e-07 2.43e-06 3.02e-07 9.54e-07 4.75e-07 1.01e-06 1.23e-06 6.18e-07 4.06e-08 4.74e-08 6.68e-07 5.64e-07 1.71e-07 1.05e-07 1.47e-07 1.1e-07 8.59e-09 8.29e-08 1.46e-06 9.48e-08 1.81e-07 1.87e-07 2.13e-07 1.6e-07 8.82e-08 5.86e-08