logo

Genes within 1Mb (chr6:139014651:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00942 0.0933 0.179 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.50e-01 0.102 0.0708 0.179 B L1
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 2.12e-01 0.0886 0.0708 0.179 B L1
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 2.90e-01 -0.096 0.0904 0.179 B L1
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 8.91e-01 -0.011 0.0801 0.179 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 3.51e-03 -0.136 0.0461 0.179 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 2.91e-01 -0.122 0.115 0.179 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.24e-01 0.112 0.0723 0.179 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 3.75e-02 -0.167 0.08 0.179 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 6.49e-01 0.0467 0.102 0.179 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 9.57e-02 0.114 0.0683 0.179 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 8.87e-01 0.0092 0.0648 0.179 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.10e-01 0.0206 0.0854 0.179 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 7.27e-01 0.0234 0.0671 0.179 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0609 0.049 0.179 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 8.70e-02 0.143 0.0835 0.179 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 3.63e-01 0.0754 0.0827 0.179 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0197 0.112 0.179 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.77e-01 0.0994 0.0733 0.179 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 7.80e-01 -0.021 0.075 0.179 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.81e-01 0.0121 0.0805 0.179 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000832 0.0757 0.179 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 3.19e-01 -0.043 0.043 0.179 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 2.97e-02 0.177 0.0809 0.179 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 4.71e-01 0.0717 0.0993 0.179 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.38e-01 0.072 0.117 0.173 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 8.14e-01 0.0193 0.0822 0.173 DC L1
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00151 0.0963 0.173 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 9.70e-01 0.00403 0.107 0.173 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 8.13e-02 -0.165 0.0941 0.173 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 1.25e-03 0.296 0.0904 0.173 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0259 0.11 0.173 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 1.83e-02 -0.263 0.11 0.173 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.51e-02 -0.16 0.083 0.179 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0497 0.0578 0.179 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0648 0.0762 0.179 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0241 0.109 0.179 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0532 0.0639 0.179 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 1.76e-01 0.113 0.083 0.179 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 4.69e-01 0.0639 0.0881 0.179 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 6.26e-03 -0.309 0.112 0.179 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 1.57e-01 0.148 0.105 0.178 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 2.02e-01 0.118 0.0922 0.178 NK L1
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 1.01e-01 0.129 0.0781 0.178 NK L1
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.86e-01 0.0494 0.0907 0.178 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 4.56e-01 0.0645 0.0864 0.178 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0231 0.0631 0.178 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.23e-02 0.209 0.0827 0.178 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.16e-01 0.0126 0.119 0.179 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 4.43e-01 0.0592 0.0771 0.179 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0169 0.0952 0.179 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.44e-01 0.0171 0.0865 0.179 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 3.67e-01 -0.084 0.0928 0.179 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 2.06e-01 0.0769 0.0607 0.179 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.04e-01 0.116 0.0709 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 6.24e-01 0.0655 0.133 0.184 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 2.99e-01 0.122 0.117 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 3.25e-02 -0.129 0.06 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 6.50e-01 0.0578 0.127 0.184 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 3.02e-01 -0.137 0.133 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 6.33e-01 0.0576 0.12 0.184 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 7.59e-02 -0.183 0.102 0.184 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 2.34e-02 -0.293 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 1.82e-01 -0.173 0.129 0.184 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0161 0.116 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0561 0.08 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 4.10e-01 0.084 0.102 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 3.09e-01 -0.102 0.0999 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0486 0.108 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 8.14e-01 0.0216 0.092 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0222 0.113 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 7.80e-01 0.029 0.104 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 9.48e-01 0.00739 0.112 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 6.27e-01 0.0575 0.118 0.181 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 3.74e-02 0.184 0.0879 0.181 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0571 0.111 0.181 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 9.48e-01 0.00667 0.102 0.181 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 4.89e-02 -0.217 0.11 0.181 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0805 0.0873 0.181 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 3.26e-01 -0.11 0.111 0.181 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 2.68e-01 0.113 0.102 0.181 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 2.54e-01 -0.143 0.126 0.181 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0876 0.111 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 2.09e-01 0.0984 0.0781 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 4.33e-02 0.214 0.105 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 1.71e-01 -0.133 0.0968 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 4.89e-01 0.0623 0.0899 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 4.54e-03 -0.177 0.0617 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 4.90e-01 0.0813 0.118 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 3.52e-02 0.18 0.0848 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0676 0.112 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 4.39e-01 0.0848 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 6.76e-01 0.0314 0.0749 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 8.03e-01 0.0224 0.09 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.00e-02 -0.201 0.102 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 1.56e-01 0.139 0.0979 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0915 0.0721 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 3.38e-01 -0.11 0.114 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.83e-01 0.156 0.117 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0567 0.107 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 8.33e-01 0.0244 0.116 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.50e-02 0.242 0.0987 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 6.52e-01 0.0552 0.122 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0652 0.117 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 2.21e-01 0.139 0.113 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 4.99e-01 0.0701 0.103 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 4.74e-01 0.0747 0.104 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 9.98e-01 0.00028 0.107 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 7.82e-02 0.189 0.107 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.50e-01 0.0964 0.0668 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 7.62e-01 0.0268 0.0886 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0468 0.0835 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 5.36e-01 0.046 0.0741 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0556 0.0498 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.07e-01 0.136 0.0843 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 6.90e-01 0.0342 0.0857 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0742 0.106 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 2.04e-01 0.0998 0.0783 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 2.52e-02 -0.22 0.0974 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 3.85e-01 0.0734 0.0843 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0341 0.0801 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 9.15e-01 0.00662 0.0616 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 4.83e-02 0.18 0.0908 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 3.69e-01 0.0889 0.0988 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 1.99e-01 -0.154 0.12 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 3.36e-01 0.0789 0.0817 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00604 0.0952 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 2.53e-01 -0.107 0.0932 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 8.51e-01 0.0192 0.102 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 4.75e-01 -0.052 0.0726 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 2.30e-01 0.114 0.0951 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000809 0.0998 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 8.30e-02 0.216 0.124 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.40e-01 0.131 0.0887 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00694 0.111 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00572 0.0909 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 5.29e-02 -0.188 0.0965 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 6.08e-01 0.0404 0.0787 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.07e-01 0.147 0.0911 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 2.16e-01 0.136 0.11 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 1.04e-01 -0.19 0.116 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 5.91e-01 0.0401 0.0746 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0133 0.0898 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00155 0.0902 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 7.21e-01 0.0324 0.0904 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0575 0.0473 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.09e-01 0.153 0.0953 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 8.73e-01 0.0175 0.11 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 6.57e-01 0.0577 0.13 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 8.85e-02 0.155 0.0907 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 9.65e-02 -0.2 0.12 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 4.84e-01 0.0666 0.095 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 9.94e-01 0.000706 0.0989 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 2.00e-01 -0.126 0.0981 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 6.35e-01 0.0481 0.101 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 1.94e-01 -0.139 0.106 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 1.41e-01 0.179 0.121 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 2.98e-01 0.115 0.11 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 8.22e-02 0.219 0.125 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.98e-01 0.0602 0.114 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.10e-01 0.0606 0.119 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0576 0.0914 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 6.01e-01 0.0521 0.0994 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0425 0.113 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00826 0.13 0.177 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.19e-01 0.14 0.0895 0.177 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0615 0.119 0.177 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.24e-01 0.022 0.0986 0.177 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 2.40e-01 -0.125 0.106 0.177 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 4.69e-03 0.219 0.0766 0.177 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 7.10e-01 0.0343 0.0919 0.177 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.82e-01 0.00279 0.123 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 8.38e-01 0.0215 0.105 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 2.87e-01 -0.119 0.112 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 6.29e-01 0.0538 0.111 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 2.97e-01 0.108 0.104 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 1.24e-03 -0.306 0.0933 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 5.17e-01 0.0665 0.103 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.15e-01 0.0734 0.113 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.96e-01 0.129 0.0996 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 9.91e-02 0.148 0.0891 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0384 0.0969 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 5.70e-01 0.0522 0.0918 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 9.09e-01 0.00709 0.0622 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 8.27e-04 0.274 0.0808 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 8.37e-01 0.0263 0.127 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 3.85e-01 0.0943 0.108 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 4.20e-01 0.0779 0.0963 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 4.71e-01 0.086 0.119 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0657 0.118 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 6.22e-01 0.0477 0.0967 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.69e-02 0.245 0.102 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.43e-02 0.224 0.116 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 6.67e-01 0.0432 0.1 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 7.63e-01 0.0283 0.0935 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0212 0.1 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0447 0.104 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 5.18e-01 0.0432 0.0667 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 8.27e-02 0.151 0.0865 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0753 0.141 0.204 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 9.46e-01 0.00855 0.125 0.204 PB L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 6.07e-03 0.258 0.0921 0.204 PB L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 1.25e-01 -0.234 0.152 0.204 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0566 0.136 0.204 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 5.01e-01 0.0642 0.0951 0.204 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 9.57e-02 0.231 0.137 0.204 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 9.64e-01 0.00472 0.105 0.204 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 3.22e-01 -0.139 0.14 0.204 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 6.97e-02 -0.225 0.123 0.183 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 8.85e-01 0.0144 0.0991 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0483 0.0915 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0231 0.0979 0.183 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 7.04e-01 0.0438 0.115 0.183 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 6.77e-01 0.0311 0.0743 0.183 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.14e-01 0.14 0.0881 0.183 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00926 0.115 0.179 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 7.25e-01 0.0276 0.0786 0.179 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 6.25e-01 0.0605 0.124 0.179 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.31e-01 -0.06 0.0955 0.179 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00936 0.0989 0.179 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 9.43e-01 0.00604 0.0843 0.179 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 3.83e-02 0.194 0.0931 0.179 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -225002 sc-eQTL 6.00e-01 0.0565 0.108 0.179 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.84e-01 0.0645 0.118 0.168 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 5.30e-01 -0.053 0.0844 0.168 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0642 0.112 0.168 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00905 0.11 0.168 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 1.34e-01 -0.189 0.126 0.168 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 7.18e-03 0.275 0.101 0.168 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 4.52e-01 0.0824 0.109 0.168 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 5.09e-03 -0.336 0.118 0.168 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 7.87e-03 -0.243 0.0904 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0599 0.0659 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 5.00e-02 -0.148 0.0753 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 4.88e-01 0.0768 0.111 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 8.83e-01 0.0145 0.0988 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 3.16e-02 0.178 0.0822 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 6.32e-01 0.0416 0.0868 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 5.95e-02 -0.218 0.115 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.68e-01 0.00415 0.105 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00439 0.0719 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0119 0.0887 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0725 0.112 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 4.19e-02 -0.216 0.105 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 2.48e-02 0.207 0.0914 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 5.32e-01 0.0573 0.0915 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 3.25e-02 -0.262 0.122 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.40e-01 0.0884 0.144 0.164 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 7.30e-01 0.0474 0.137 0.164 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 9.30e-01 0.0112 0.128 0.164 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 4.60e-01 0.101 0.137 0.164 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.41e-01 0.0661 0.141 0.164 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 8.80e-01 0.0161 0.107 0.164 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0299 0.123 0.164 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 7.82e-01 0.0343 0.124 0.173 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00926 0.083 0.173 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 8.37e-02 0.175 0.101 0.173 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0857 0.112 0.173 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 2.94e-01 -0.121 0.115 0.173 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 1.16e-01 0.165 0.105 0.173 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.10e-01 0.163 0.102 0.173 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 6.32e-02 -0.232 0.124 0.173 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0202 0.118 0.172 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0266 0.0701 0.172 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0392 0.107 0.172 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 2.52e-02 -0.252 0.112 0.172 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 8.22e-01 0.0192 0.0851 0.172 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0694 0.102 0.172 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 4.43e-02 0.174 0.0862 0.172 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 3.24e-01 -0.124 0.125 0.172 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 8.15e-01 0.0311 0.133 0.175 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 6.66e-01 0.0445 0.103 0.175 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 9.24e-01 0.0108 0.112 0.175 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 9.18e-01 0.0106 0.103 0.175 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0444 0.104 0.175 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 1.42e-01 0.167 0.113 0.175 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 1.96e-01 0.173 0.133 0.175 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0564 0.103 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.22e-01 0.0714 0.111 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 2.09e-01 0.0968 0.0768 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00566 0.102 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0272 0.0991 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 6.62e-02 -0.188 0.102 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0505 0.0711 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 1.33e-01 -0.177 0.117 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 8.99e-01 0.0127 0.1 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 2.11e-01 -0.145 0.116 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.87e-01 0.00165 0.104 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.40e-01 0.106 0.0715 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 7.35e-02 0.188 0.105 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 7.09e-02 -0.175 0.0962 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 2.84e-01 0.0885 0.0824 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 5.79e-03 -0.159 0.0569 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -277347 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0491 0.121 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 4.28e-02 0.178 0.0873 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -256711 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 5.20e-02 -0.164 0.0837 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0512 0.0629 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 1.48e-01 -0.11 0.0754 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 6.60e-01 0.0487 0.111 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 2.19e-01 -0.112 0.0908 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 1.57e-02 0.195 0.0799 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 6.84e-01 0.0362 0.0887 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 1.57e-02 -0.286 0.117 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00325 0.115 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0139 0.0616 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 7.34e-01 0.0334 0.0984 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 322080 sc-eQTL 6.52e-02 -0.201 0.109 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 7.85e-01 0.0186 0.0681 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0307 0.0997 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 9.16e-02 0.145 0.0853 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 322103 sc-eQTL 1.12e-01 -0.192 0.12 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 241142 sc-eQTL 1.24e-01 0.167 0.108 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 611120 sc-eQTL 1.67e-01 0.13 0.0939 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 907232 sc-eQTL 8.92e-02 0.135 0.079 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -120429 sc-eQTL 7.07e-01 0.0349 0.0927 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 26390 sc-eQTL 4.77e-01 0.0645 0.0905 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -14094 sc-eQTL 9.35e-01 0.0048 0.0585 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -359997 sc-eQTL 6.88e-03 0.227 0.0831 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 26390 eQTL 2.93e-17 -0.171 0.0199 0.00127 0.00292 0.181
ENSG00000146386 ABRACL -14094 eQTL 0.000657 0.0963 0.0282 0.0 0.0 0.181

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 26390 3.75e-05 3.42e-05 6.45e-06 1.61e-05 6.21e-06 1.51e-05 4.7e-05 4.99e-06 3.43e-05 1.66e-05 4.09e-05 1.87e-05 5.08e-05 1.48e-05 7.4e-06 2.07e-05 1.88e-05 2.74e-05 8.23e-06 7.09e-06 1.71e-05 3.64e-05 3.36e-05 9.6e-06 4.66e-05 8.49e-06 1.53e-05 1.4e-05 3.42e-05 2.61e-05 2.17e-05 1.63e-06 2.8e-06 7.48e-06 1.25e-05 5.99e-06 3.39e-06 3.25e-06 5.03e-06 3.56e-06 1.7e-06 3.92e-05 3.8e-06 4.02e-07 2.71e-06 4.28e-06 4.23e-06 1.67e-06 1.5e-06
ENSG00000146386 ABRACL -14094 4.42e-05 3.69e-05 7.1e-06 1.7e-05 7.14e-06 1.74e-05 5.17e-05 6.11e-06 3.88e-05 1.95e-05 4.8e-05 2.11e-05 5.64e-05 1.67e-05 8.64e-06 2.45e-05 2.14e-05 3.11e-05 9.7e-06 8e-06 2.02e-05 4.26e-05 3.64e-05 1.07e-05 5.22e-05 1.08e-05 1.78e-05 1.61e-05 3.79e-05 3.01e-05 2.48e-05 2.22e-06 3.74e-06 8.12e-06 1.37e-05 7.06e-06 3.67e-06 3.82e-06 6e-06 3.88e-06 1.83e-06 4.29e-05 4.6e-06 4.16e-07 2.92e-06 4.98e-06 4.77e-06 2.25e-06 1.62e-06
ENSG00000231329 \N -225002 3.91e-06 4.75e-06 6.71e-07 3.22e-06 8.73e-07 9.33e-07 2.49e-06 8.47e-07 3.98e-06 2.01e-06 4.22e-06 3.37e-06 6.82e-06 1.52e-06 1.39e-06 2.27e-06 1.95e-06 2.26e-06 1.46e-06 1.17e-06 3e-06 4.14e-06 3.45e-06 1.82e-06 4.08e-06 1.03e-06 2.2e-06 1.77e-06 3.52e-06 3.09e-06 2.51e-06 5.43e-07 5.9e-07 1.32e-06 2.19e-06 1.17e-06 9.48e-07 4.38e-07 1.19e-06 4.88e-07 6.17e-07 3.95e-06 4e-07 1.8e-07 7.18e-07 5.87e-07 7.59e-07 7.19e-07 4.57e-07