logo

Genes within 1Mb (chr6:139012521:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 9.09e-01 0.00929 0.0808 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00999 0.0617 0.235 B L1
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 5.28e-01 0.0389 0.0615 0.235 B L1
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 5.76e-01 0.044 0.0785 0.235 B L1
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0586 0.0693 0.235 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0414 0.0407 0.235 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 5.08e-02 -0.195 0.099 0.235 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0889 0.0626 0.235 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 9.78e-01 0.00193 0.07 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0196 0.0886 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 7.24e-02 -0.107 0.059 0.235 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 7.79e-02 -0.0986 0.0557 0.235 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 2.58e-01 0.0836 0.0737 0.235 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0167 0.0581 0.235 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 2.06e-07 0.215 0.04 0.235 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0854 0.0725 0.235 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 9.42e-01 0.00519 0.0717 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 9.67e-02 -0.16 0.0961 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0536 0.0632 0.235 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 5.27e-01 0.0408 0.0645 0.235 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 5.78e-01 0.0385 0.0692 0.235 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0306 0.0651 0.235 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 5.60e-05 0.147 0.0357 0.235 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 1.42e-01 -0.103 0.07 0.235 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 7.30e-01 0.0296 0.0855 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 2.87e-01 -0.105 0.0983 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0349 0.0692 0.232 DC L1
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 8.46e-01 0.0157 0.0812 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 4.30e-01 0.0713 0.0902 0.232 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.17e-02 -0.2 0.0786 0.232 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.14e-04 0.297 0.0754 0.232 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0725 0.0927 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0266 0.0944 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 2.51e-01 0.0808 0.0703 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0301 0.0487 0.235 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 3.43e-01 0.061 0.0642 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0832 0.092 0.235 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0504 0.0538 0.235 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.92e-13 0.485 0.0618 0.235 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 9.52e-01 0.00451 0.0743 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 2.16e-01 -0.118 0.0955 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0192 0.087 0.236 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0695 0.0765 0.236 NK L1
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0485 0.065 0.236 NK L1
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 9.18e-01 0.00775 0.0752 0.236 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0642 0.0715 0.236 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 7.57e-07 0.251 0.0493 0.236 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0802 0.0693 0.236 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 8.78e-01 0.0158 0.103 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0888 0.0663 0.235 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0496 0.0821 0.235 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 7.11e-01 0.0277 0.0746 0.235 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0661 0.0801 0.235 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 4.66e-02 0.104 0.0521 0.235 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0649 0.0614 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 6.98e-01 -0.045 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.44e-01 0.0962 0.101 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 1.20e-01 0.0817 0.0524 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 1.66e-01 -0.153 0.11 0.235 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 3.29e-01 0.113 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 7.55e-01 0.0327 0.105 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 5.32e-01 -0.056 0.0894 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.71e-01 0.124 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 2.71e-01 -0.124 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0487 0.101 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0216 0.0701 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 4.23e-01 0.0716 0.0892 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 1.88e-01 0.115 0.0874 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 6.86e-01 0.0383 0.0946 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 3.28e-01 0.0788 0.0804 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 1.92e-01 -0.129 0.0983 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00756 0.0908 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0371 0.0983 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 6.84e-01 0.0419 0.103 0.235 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.87e-01 -0.067 0.0773 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 3.82e-01 0.0844 0.0964 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 7.09e-01 0.0333 0.089 0.235 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 4.29e-01 0.0764 0.0964 0.235 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 6.59e-02 0.14 0.0757 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 8.40e-02 -0.168 0.0967 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0526 0.0894 0.235 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 4.29e-01 0.0869 0.11 0.235 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 9.17e-02 0.161 0.0948 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0591 0.0669 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 7.07e-01 0.0342 0.0909 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 2.27e-01 0.1 0.0829 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 5.10e-02 -0.15 0.0763 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 9.89e-03 -0.138 0.053 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 2.67e-02 -0.222 0.0996 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 3.70e-02 -0.152 0.0726 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0473 0.0962 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 1.81e-01 -0.126 0.0936 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0342 0.0643 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0313 0.0772 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 8.97e-01 0.0115 0.0885 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0192 0.0845 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 4.05e-04 -0.217 0.0603 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 4.34e-01 0.077 0.0983 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.01e-01 -0.128 0.1 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0116 0.0922 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 7.99e-01 0.0248 0.0969 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 5.33e-02 -0.161 0.0829 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0271 0.102 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 8.97e-01 0.0127 0.0978 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00971 0.095 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 2.06e-02 0.199 0.0854 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.32e-02 -0.175 0.086 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 1.74e-01 -0.122 0.0893 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 9.24e-01 0.00886 0.0934 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 9.76e-02 -0.0963 0.0579 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 8.90e-02 -0.131 0.0764 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 3.58e-01 0.0667 0.0725 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0197 0.0644 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 5.56e-02 0.0827 0.043 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 1.39e-01 -0.109 0.0732 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00389 0.0745 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 7.22e-01 0.0326 0.0914 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0694 0.0679 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00463 0.0853 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 1.50e-01 0.105 0.0727 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 9.99e-01 5.88e-05 0.0693 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 4.93e-10 0.317 0.0486 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0877 0.0791 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0579 0.0856 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00649 0.102 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0518 0.0697 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 9.01e-01 0.0101 0.0812 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 3.80e-02 0.165 0.0789 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 9.59e-02 -0.144 0.0863 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.33e-05 0.264 0.0592 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.46e-02 -0.163 0.0805 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 4.98e-01 0.0577 0.0849 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 3.97e-02 -0.217 0.105 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0157 0.0757 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 4.45e-01 0.0722 0.0944 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 1.50e-01 0.111 0.0768 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 3.91e-01 0.0709 0.0825 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 4.50e-04 0.232 0.065 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0756 0.0777 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0253 0.0934 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 9.40e-01 0.00756 0.0998 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0566 0.0637 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 6.32e-01 0.0368 0.0766 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 5.35e-01 0.0478 0.077 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0753 0.0771 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 7.40e-02 0.0722 0.0402 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.00e-02 -0.168 0.0811 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 6.44e-01 0.0434 0.0937 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 1.00e-01 -0.189 0.115 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0517 0.0811 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 9.33e-01 0.00906 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 2.00e-01 0.108 0.0841 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0136 0.0878 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.30e-01 0.132 0.087 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.78e-01 0.0638 0.0898 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 6.51e-01 0.0429 0.0949 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 2.78e-01 -0.113 0.104 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 2.17e-01 -0.117 0.0945 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 5.63e-02 0.206 0.107 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 8.56e-01 0.0178 0.0977 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 7.29e-01 0.0353 0.102 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 5.94e-02 0.147 0.0776 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0211 0.0851 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 5.89e-01 0.0524 0.0968 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 7.18e-01 0.0401 0.111 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0177 0.077 0.236 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0642 0.102 0.236 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 2.68e-01 0.0933 0.0841 0.236 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0482 0.0908 0.236 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 4.12e-02 0.136 0.0661 0.236 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0282 0.0786 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 8.81e-01 0.0154 0.103 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 8.57e-01 0.0158 0.0873 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 7.93e-01 0.0245 0.0934 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 1.69e-01 0.128 0.0925 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 5.27e-01 0.0549 0.0866 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 8.14e-04 0.264 0.0777 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0622 0.0856 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 7.30e-01 0.0324 0.0938 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 6.40e-01 -0.039 0.0833 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 1.17e-01 -0.117 0.0743 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 9.06e-01 0.00951 0.0808 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 9.13e-02 -0.129 0.076 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.12e-05 0.223 0.0495 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.98e-02 -0.149 0.0683 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 1.48e-01 -0.155 0.106 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0364 0.0911 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0497 0.081 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0439 0.1 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 3.77e-02 0.204 0.0977 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.98e-02 0.188 0.0801 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 1.35e-02 -0.213 0.0854 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0934 0.0966 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 1.72e-01 -0.114 0.0831 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 1.26e-01 0.119 0.0773 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 4.73e-01 0.0599 0.0833 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0593 0.086 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.28e-04 0.209 0.0536 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0339 0.0724 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 5.96e-01 0.0618 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.58e-01 0.0954 0.103 0.241 PB L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 2.21e-02 -0.179 0.0771 0.241 PB L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 6.03e-01 0.0662 0.127 0.241 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00976 0.113 0.241 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.80e-01 0.106 0.0783 0.241 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 8.28e-01 0.0251 0.115 0.241 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0533 0.0867 0.241 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 6.51e-01 0.0528 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 5.15e-01 0.0688 0.106 0.233 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 7.23e-01 0.0299 0.0842 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 9.11e-01 0.00868 0.0778 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 9.85e-01 0.0016 0.0832 0.233 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.25e-01 -0.15 0.0975 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 8.73e-01 0.0101 0.0632 0.233 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 3.79e-02 -0.156 0.0745 0.233 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 2.60e-01 -0.113 0.1 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0713 0.0685 0.235 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0435 0.108 0.235 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 9.29e-01 0.00743 0.0835 0.235 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00604 0.0864 0.235 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.35e-08 0.403 0.0682 0.235 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0851 0.0819 0.235 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -227132 sc-eQTL 3.90e-01 0.0807 0.0938 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0217 0.102 0.234 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0525 0.0734 0.234 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0234 0.0975 0.234 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 2.11e-01 0.119 0.095 0.234 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0626 0.11 0.234 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 5.42e-03 0.248 0.088 0.234 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 8.11e-01 0.0228 0.0953 0.234 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0439 0.105 0.234 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 5.48e-01 0.0462 0.0767 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0205 0.0551 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 5.21e-01 0.0407 0.0634 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0386 0.0923 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.38e-01 -0.122 0.082 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 2.29e-09 0.398 0.0637 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 8.84e-01 0.0106 0.0725 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 1.50e-01 -0.139 0.0962 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0546 0.0883 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0732 0.0603 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 8.35e-01 0.0156 0.0747 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0944 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.27e-01 0.137 0.0891 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.31e-10 0.478 0.0706 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0613 0.077 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 8.40e-01 0.0209 0.104 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 2.02e-02 -0.268 0.114 0.242 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 7.75e-02 -0.195 0.11 0.242 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 1.90e-01 -0.135 0.102 0.242 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 3.75e-01 0.0981 0.11 0.242 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0775 0.114 0.242 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.26e-01 0.131 0.0853 0.242 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 4.77e-01 0.0706 0.0989 0.242 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 2.50e-01 0.118 0.103 0.238 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0446 0.069 0.238 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0419 0.0844 0.238 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00851 0.0931 0.238 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 2.09e-02 -0.221 0.0949 0.238 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 5.02e-04 0.301 0.0852 0.238 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0186 0.0852 0.238 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0523 0.104 0.238 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 5.67e-01 0.0548 0.0956 0.233 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 5.48e-01 0.0344 0.057 0.233 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 3.13e-01 0.0883 0.0873 0.233 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0707 0.0918 0.233 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 9.03e-01 0.00846 0.0693 0.233 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 5.84e-06 0.369 0.0793 0.233 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 5.45e-01 0.0429 0.0708 0.233 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 2.09e-01 -0.128 0.102 0.233 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 4.51e-01 0.0846 0.112 0.223 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0864 0.0869 0.223 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 3.14e-01 0.0955 0.0947 0.223 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 7.74e-01 -0.025 0.0868 0.223 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.39e-02 -0.215 0.0862 0.223 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 4.93e-03 0.267 0.0936 0.223 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 3.39e-02 -0.238 0.111 0.223 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 2.94e-01 0.0915 0.0869 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 2.27e-01 -0.117 0.0969 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0274 0.0673 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 5.27e-01 0.0562 0.0886 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 4.04e-01 0.0722 0.0864 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.38e-01 0.133 0.0892 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 6.97e-02 0.112 0.0617 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 8.04e-03 -0.271 0.101 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 8.41e-01 0.0175 0.0873 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 8.75e-01 -0.016 0.102 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 5.09e-01 0.0589 0.0889 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0149 0.0617 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 6.58e-01 0.0401 0.0906 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 4.07e-01 0.0691 0.0831 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 5.22e-02 -0.137 0.0703 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.02e-04 -0.19 0.048 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -279477 sc-eQTL 3.16e-01 -0.104 0.104 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 7.31e-02 -0.135 0.0751 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -258841 sc-eQTL 7.89e-01 0.0238 0.0889 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 7.21e-01 0.0254 0.071 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0274 0.0529 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 4.52e-01 0.0479 0.0636 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0928 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0235 0.0765 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.12e-11 0.439 0.061 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0235 0.0746 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0813 0.0997 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 1.37e-01 0.142 0.0953 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0254 0.0511 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 8.45e-01 0.016 0.0817 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 319950 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0313 0.0909 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0739 0.0564 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 3.04e-07 0.412 0.0778 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 5.47e-01 0.043 0.0713 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 319973 sc-eQTL 1.91e-01 -0.131 0.1 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 239012 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0529 0.0902 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 608990 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0819 0.0781 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 905102 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0326 0.066 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -122559 sc-eQTL 9.90e-01 0.00094 0.077 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 24260 sc-eQTL 1.67e-01 -0.104 0.0749 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -16224 sc-eQTL 1.07e-07 0.25 0.0454 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -362127 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0891 0.0699 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA -122559 eQTL 0.00307 -0.0332 0.0112 0.00297 0.0 0.236
ENSG00000146386 ABRACL -16224 eQTL 8.77e-49 0.38 0.0245 0.0 0.0 0.236

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146386 ABRACL -16224 3.22e-05 2.99e-05 4.84e-06 1.35e-05 5.32e-06 1.27e-05 3.78e-05 4.44e-06 2.72e-05 1.33e-05 3.44e-05 1.61e-05 4.23e-05 1.26e-05 6.5e-06 1.59e-05 1.52e-05 2.25e-05 7.02e-06 5.63e-06 1.3e-05 2.83e-05 2.73e-05 7.87e-06 3.87e-05 7.23e-06 1.13e-05 1.12e-05 2.71e-05 2.19e-05 1.76e-05 1.54e-06 2.24e-06 6.27e-06 1.08e-05 4.91e-06 2.83e-06 2.99e-06 3.99e-06 2.84e-06 1.67e-06 3.56e-05 3.39e-06 3.6e-07 2.04e-06 3.29e-06 3.85e-06 1.49e-06 1.36e-06