logo

Genes within 1Mb (chr6:139001058:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.92e-01 0.0366 0.138 0.071 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 2.95e-01 -0.111 0.105 0.071 B L1
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 3.18e-01 0.105 0.105 0.071 B L1
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00661 0.135 0.071 B L1
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0287 0.119 0.071 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 6.17e-02 0.13 0.0693 0.071 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0792 0.171 0.071 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0897 0.108 0.071 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 6.00e-01 0.0629 0.12 0.071 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 3.33e-02 0.323 0.151 0.071 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0942 0.102 0.071 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 2.04e-01 -0.123 0.0961 0.071 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000903 0.127 0.071 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 1.44e-01 -0.146 0.0995 0.071 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0993 0.073 0.071 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 1.45e-01 -0.182 0.125 0.071 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 6.76e-03 0.332 0.121 0.071 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.87e-01 0.115 0.165 0.071 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 2.86e-01 -0.115 0.108 0.071 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0844 0.11 0.071 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 3.07e-01 0.121 0.118 0.071 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 2.63e-01 -0.124 0.111 0.071 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 9.68e-01 0.00255 0.0634 0.071 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0861 0.12 0.071 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 3.82e-01 0.128 0.146 0.071 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 2.32e-01 0.197 0.165 0.07 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 2.73e-01 -0.128 0.116 0.07 DC L1
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 1.58e-01 0.192 0.136 0.07 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 5.17e-01 0.0984 0.152 0.07 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 7.23e-02 0.241 0.133 0.07 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.89e-01 -0.172 0.131 0.07 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0103 0.156 0.07 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 5.63e-02 0.302 0.157 0.07 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 2.03e-01 0.159 0.125 0.071 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 5.05e-01 0.0579 0.0867 0.071 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 3.83e-01 0.0998 0.114 0.071 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0885 0.164 0.071 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0137 0.0959 0.071 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 2.38e-03 -0.376 0.122 0.071 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 2.62e-01 0.148 0.132 0.071 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 2.44e-01 -0.198 0.17 0.071 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.37e-01 0.0507 0.151 0.071 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 3.22e-01 -0.132 0.132 0.071 NK L1
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 8.56e-01 0.0205 0.113 0.071 NK L1
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 7.94e-02 0.228 0.129 0.071 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0215 0.124 0.071 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 8.54e-02 -0.155 0.0899 0.071 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00486 0.12 0.071 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.69e-01 0.053 0.18 0.071 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 2.30e-01 -0.139 0.116 0.071 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 9.82e-01 0.00332 0.143 0.071 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.31e-01 -0.156 0.13 0.071 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 3.66e-01 -0.127 0.14 0.071 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0859 0.0915 0.071 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0488 0.107 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.51e-01 -0.15 0.198 0.077 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 9.36e-01 0.0139 0.174 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 3.40e-01 0.0862 0.0902 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 9.41e-02 0.316 0.188 0.077 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 9.63e-01 0.00931 0.198 0.077 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 3.27e-01 0.176 0.179 0.077 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 9.91e-01 0.00173 0.153 0.077 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00339 0.193 0.077 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 5.37e-01 0.119 0.193 0.077 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 6.96e-01 0.0666 0.171 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 6.32e-01 0.0566 0.118 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 1.54e-02 0.362 0.148 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.83e-01 0.159 0.147 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 5.99e-01 0.0839 0.159 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 2.09e-01 0.17 0.135 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 3.31e-01 0.162 0.166 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0649 0.153 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0144 0.166 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 1.27e-01 0.268 0.175 0.071 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 9.06e-03 -0.343 0.13 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 1.35e-01 -0.246 0.164 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 7.63e-01 0.046 0.152 0.071 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 1.72e-01 0.225 0.164 0.071 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 6.66e-01 0.0563 0.13 0.071 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 9.85e-01 0.00313 0.166 0.071 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 3.22e-01 0.152 0.153 0.071 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 5.89e-01 0.101 0.188 0.071 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 9.87e-01 0.00272 0.162 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0934 0.114 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 7.04e-02 0.279 0.153 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 8.76e-01 0.0221 0.141 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 1.84e-01 -0.173 0.13 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 2.29e-01 0.11 0.0911 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 6.76e-02 -0.312 0.17 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 3.68e-01 -0.112 0.124 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 3.46e-01 -0.154 0.163 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.19e-01 0.0588 0.163 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0192 0.112 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0585 0.134 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0302 0.154 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 4.95e-01 -0.1 0.147 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.39e-01 0.16 0.108 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 1.32e-01 -0.257 0.17 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 7.22e-01 0.0621 0.175 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 2.44e-01 0.187 0.16 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.38e-01 0.0542 0.162 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 3.34e-02 -0.296 0.138 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 2.87e-03 -0.503 0.167 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 1.80e-01 0.219 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00571 0.159 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 9.33e-01 0.0122 0.145 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 1.53e-01 -0.208 0.145 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 8.33e-01 0.0317 0.15 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 5.72e-02 0.303 0.159 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0806 0.0996 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 6.35e-03 -0.357 0.129 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 9.11e-01 0.0139 0.124 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0724 0.11 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0042 0.0742 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 6.55e-02 -0.231 0.125 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 1.74e-03 0.395 0.125 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 1.98e-01 0.202 0.156 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0729 0.117 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 2.24e-01 0.178 0.146 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0155 0.126 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 6.15e-01 -0.06 0.119 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 4.60e-02 -0.182 0.0907 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.49e-02 -0.227 0.135 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 2.55e-01 0.167 0.147 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.15e-01 0.146 0.179 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0344 0.122 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 7.08e-01 0.0532 0.142 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 5.62e-01 0.0809 0.139 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.54e-01 0.028 0.152 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.46e-01 -0.157 0.108 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 4.36e-01 -0.111 0.142 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 8.96e-01 0.0194 0.149 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.76e-01 0.132 0.184 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 1.16e-01 -0.207 0.131 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 3.21e-01 -0.163 0.164 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.15e-02 0.307 0.133 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0564 0.144 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0884 0.116 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 5.04e-01 0.0908 0.135 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0641 0.163 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.31e-01 0.135 0.171 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00639 0.132 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 4.51e-01 0.0997 0.132 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0475 0.133 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 8.77e-01 0.0108 0.0696 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 2.42e-01 -0.164 0.14 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 3.80e-01 0.141 0.161 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 8.96e-01 0.0253 0.194 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0975 0.136 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 5.76e-01 0.101 0.18 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0173 0.142 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 3.42e-01 -0.14 0.147 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 5.93e-01 0.0784 0.147 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 2.25e-01 0.183 0.15 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 1.83e-01 0.212 0.158 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 5.20e-01 -0.115 0.178 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0462 0.162 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0116 0.184 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 4.01e-01 0.14 0.166 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 4.69e-01 0.126 0.173 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00529 0.134 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 2.98e-01 0.151 0.145 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 8.27e-02 0.286 0.164 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 3.12e-01 0.196 0.193 0.071 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0824 0.134 0.071 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 1.59e-01 -0.25 0.177 0.071 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.79e-01 -0.16 0.147 0.071 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 4.58e-01 -0.118 0.159 0.071 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 7.41e-02 -0.208 0.116 0.071 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 6.54e-01 0.0616 0.137 0.071 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 2.63e-01 0.192 0.172 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0606 0.146 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 3.27e-01 0.154 0.156 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.48e-01 0.18 0.155 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 4.84e-01 -0.102 0.145 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0193 0.134 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 7.82e-01 0.0399 0.144 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0792 0.161 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0796 0.143 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 3.41e-01 0.122 0.128 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 1.36e-02 0.34 0.136 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0297 0.131 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 8.34e-02 -0.153 0.0882 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0363 0.118 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.72e-01 -0.055 0.19 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 5.07e-01 -0.107 0.161 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 2.81e-01 -0.155 0.143 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0457 0.177 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 1.81e-01 0.234 0.174 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.12e-01 -0.228 0.143 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.45e-01 0.0106 0.154 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.99e-01 0.113 0.167 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0789 0.144 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00553 0.134 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.35e-01 0.171 0.144 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0982 0.149 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.13e-01 -0.152 0.0953 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 6.79e-01 0.052 0.125 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0717 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 1.25e-01 0.277 0.179 0.074 PB L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0787 0.138 0.074 PB L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 6.01e-02 -0.415 0.218 0.074 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.51e-01 0.037 0.197 0.074 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.35e-01 -0.206 0.137 0.074 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0998 0.201 0.074 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.24e-01 0.0145 0.152 0.074 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0106 0.203 0.074 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.76e-01 0.133 0.186 0.067 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 3.56e-01 -0.137 0.148 0.067 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 4.12e-01 0.113 0.137 0.067 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 1.69e-04 -0.543 0.142 0.067 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0353 0.173 0.067 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 4.66e-02 -0.221 0.11 0.067 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00716 0.133 0.067 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 2.79e-02 0.376 0.17 0.071 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0542 0.117 0.071 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 9.82e-02 -0.305 0.184 0.071 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0651 0.143 0.071 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 3.99e-01 -0.125 0.148 0.071 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 3.10e-02 -0.27 0.125 0.071 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0598 0.14 0.071 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -238595 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0479 0.161 0.071 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 2.61e-01 0.201 0.178 0.068 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0988 0.128 0.068 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0348 0.17 0.068 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 2.32e-01 0.199 0.166 0.068 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 5.54e-01 0.114 0.192 0.068 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0897 0.157 0.068 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0989 0.166 0.068 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 4.41e-02 0.369 0.182 0.068 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 5.26e-01 0.089 0.14 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00896 0.101 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 4.68e-01 0.0841 0.116 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 1.73e-01 -0.229 0.168 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 1.20e-01 -0.234 0.15 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 4.35e-02 -0.255 0.125 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 7.88e-01 0.0357 0.132 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 8.87e-02 -0.3 0.175 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 1.38e-01 0.243 0.163 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 8.87e-01 0.0159 0.112 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.61e-01 0.156 0.138 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 4.79e-01 -0.125 0.176 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 5.91e-01 0.0895 0.166 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 6.64e-03 -0.39 0.142 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 5.72e-02 0.271 0.142 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0533 0.193 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 9.01e-01 0.0236 0.19 0.079 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 8.41e-02 -0.311 0.179 0.079 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 8.70e-01 0.0275 0.168 0.079 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 1.97e-01 -0.232 0.179 0.079 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0476 0.186 0.079 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 3.31e-01 -0.137 0.14 0.079 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 3.46e-01 -0.153 0.161 0.079 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 6.82e-01 -0.077 0.188 0.067 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0258 0.126 0.067 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00768 0.154 0.067 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 2.98e-01 0.177 0.169 0.067 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 3.07e-01 0.179 0.175 0.067 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 8.10e-02 -0.279 0.159 0.067 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0625 0.155 0.067 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 9.96e-01 0.000982 0.191 0.067 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 4.93e-01 0.113 0.165 0.072 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 1.19e-01 -0.153 0.0978 0.072 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 6.35e-01 0.0716 0.151 0.072 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 1.11e-01 0.252 0.158 0.072 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 3.44e-01 -0.113 0.119 0.072 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 4.79e-02 -0.284 0.143 0.072 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0236 0.122 0.072 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0669 0.176 0.072 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 3.16e-01 -0.191 0.19 0.073 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0764 0.148 0.073 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.50e-01 0.185 0.16 0.073 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0163 0.147 0.073 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 8.78e-01 0.023 0.149 0.073 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 5.41e-02 -0.312 0.161 0.073 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 2.26e-01 -0.232 0.191 0.073 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 7.53e-01 0.0466 0.148 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 2.19e-01 0.203 0.165 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 2.70e-01 -0.126 0.114 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 8.42e-01 0.03 0.151 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 2.13e-01 0.183 0.146 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 2.02e-01 0.194 0.152 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 9.76e-03 0.271 0.104 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 4.44e-01 0.134 0.175 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0477 0.148 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 8.96e-01 0.0226 0.172 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 9.87e-01 0.00253 0.153 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0712 0.106 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 2.00e-01 0.199 0.155 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0292 0.143 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 1.55e-01 -0.173 0.121 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 8.90e-02 0.145 0.0848 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -290940 sc-eQTL 2.00e-01 -0.229 0.178 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 3.26e-01 -0.127 0.129 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -270304 sc-eQTL 7.83e-01 0.042 0.152 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 1.19e-01 0.201 0.128 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 7.78e-01 0.0271 0.096 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 3.37e-01 0.111 0.115 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 1.79e-01 -0.227 0.168 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00534 0.139 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 1.38e-02 -0.302 0.122 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 3.41e-01 0.129 0.135 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 1.21e-01 -0.281 0.18 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.75e-01 0.0482 0.168 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0346 0.0898 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 4.16e-01 0.117 0.143 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 308487 sc-eQTL 8.50e-02 0.275 0.159 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0264 0.0995 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 3.09e-02 -0.313 0.144 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 3.75e-01 -0.111 0.125 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 308510 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0774 0.177 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 227549 sc-eQTL 7.58e-01 -0.048 0.156 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 597527 sc-eQTL 4.59e-01 -0.1 0.135 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 893639 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00497 0.114 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -134022 sc-eQTL 1.22e-01 0.205 0.132 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 12797 sc-eQTL 9.87e-01 0.00211 0.13 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -27687 sc-eQTL 2.07e-02 -0.193 0.0827 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -373590 sc-eQTL 9.34e-01 0.01 0.121 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA -134022 eQTL 0.00784 0.0441 0.0165 0.00198 0.0 0.0775
ENSG00000146386 ABRACL -27687 eQTL 3.11e-13 -0.291 0.0393 0.0 0.0 0.0775

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 \N 308487 1.4e-06 1.25e-06 2.48e-07 1.21e-06 3.73e-07 6.06e-07 1.49e-06 3.82e-07 1.5e-06 5.9e-07 2.05e-06 8.26e-07 2.53e-06 2.82e-07 5.39e-07 9.92e-07 1.03e-06 9.53e-07 8.2e-07 6.21e-07 8.07e-07 1.8e-06 1.1e-06 5.65e-07 2.36e-06 7.38e-07 9.28e-07 9.19e-07 1.63e-06 1.23e-06 8.06e-07 2.7e-07 2.67e-07 6.29e-07 5.34e-07 5.06e-07 7.24e-07 3.1e-07 4.97e-07 1.86e-07 3.56e-07 1.62e-06 1.39e-07 2.07e-07 3.17e-07 1.59e-07 2.33e-07 1.4e-07 1.16e-07
ENSG00000146386 ABRACL -27687 1.77e-05 1.69e-05 3.01e-06 9.74e-06 3.06e-06 7.88e-06 2.26e-05 2.9e-06 1.73e-05 8.35e-06 2.22e-05 8.6e-06 2.89e-05 7.03e-06 5.07e-06 1.02e-05 8.87e-06 1.58e-05 4.31e-06 4.22e-06 8.17e-06 1.68e-05 1.77e-05 5.19e-06 2.89e-05 5.26e-06 8.03e-06 7.09e-06 1.72e-05 1.63e-05 1.19e-05 1.26e-06 1.55e-06 4.4e-06 7.03e-06 4.02e-06 1.91e-06 2.64e-06 3.01e-06 2.1e-06 1.67e-06 2.21e-05 2.56e-06 2.85e-07 1.76e-06 2.49e-06 2.94e-06 1.11e-06 6.76e-07
ENSG00000164440 \N -290940 1.6e-06 1.42e-06 2.92e-07 1.21e-06 3.81e-07 6.06e-07 1.41e-06 3.81e-07 1.74e-06 6.36e-07 2.06e-06 1.01e-06 2.64e-06 3.61e-07 4.92e-07 9.55e-07 1.12e-06 1.09e-06 6.6e-07 5.13e-07 7.58e-07 1.91e-06 1.27e-06 5.67e-07 2.4e-06 7.43e-07 1.02e-06 8.46e-07 1.63e-06 1.26e-06 8.18e-07 2.54e-07 3e-07 5.87e-07 6.47e-07 5.22e-07 7.3e-07 3.65e-07 4.73e-07 2.25e-07 3.16e-07 1.96e-06 2.33e-07 1.99e-07 3.14e-07 2.16e-07 2.47e-07 1.7e-07 1.69e-07