logo

Genes within 1Mb (chr6:138999873:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 9.02e-01 0.0118 0.0959 0.165 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 9.12e-02 0.123 0.0727 0.165 B L1
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 1.96e-01 0.0946 0.0728 0.165 B L1
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0961 0.0931 0.165 B L1
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00482 0.0825 0.165 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.73e-03 -0.15 0.0473 0.165 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 2.29e-01 -0.143 0.118 0.165 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.68e-01 0.103 0.0744 0.165 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 1.83e-01 -0.111 0.0828 0.165 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 4.26e-01 0.0841 0.105 0.165 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 7.82e-02 0.125 0.0704 0.165 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 3.06e-01 0.0683 0.0666 0.165 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 8.34e-01 0.0185 0.088 0.165 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.59e-01 0.0635 0.0691 0.165 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.34e-01 -0.076 0.0505 0.165 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 7.10e-02 0.156 0.086 0.165 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 3.19e-01 0.0851 0.0853 0.165 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 2.36e-01 0.137 0.115 0.165 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 3.44e-01 0.0717 0.0757 0.165 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00288 0.0772 0.165 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00521 0.0829 0.165 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 4.50e-01 0.0589 0.0779 0.165 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0454 0.0443 0.165 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 3.11e-02 0.181 0.0833 0.165 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 4.76e-01 0.0731 0.102 0.165 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 3.28e-01 0.116 0.118 0.158 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 5.76e-01 0.0467 0.0833 0.158 DC L1
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0644 0.0976 0.158 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0476 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 2.12e-01 -0.12 0.0958 0.158 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 5.20e-03 0.261 0.0924 0.158 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0156 0.112 0.158 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 4.45e-03 -0.321 0.111 0.158 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0614 0.0851 0.165 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0219 0.059 0.165 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0766 0.0776 0.165 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 5.71e-01 0.0632 0.111 0.165 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0352 0.0652 0.165 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 5.23e-01 0.0542 0.0848 0.165 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 3.81e-01 0.0786 0.0896 0.165 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 7.23e-03 -0.309 0.114 0.165 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 6.91e-02 0.19 0.104 0.163 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.06e-01 0.149 0.0919 0.163 NK L1
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 2.28e-02 0.178 0.0776 0.163 NK L1
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 5.05e-01 0.0605 0.0906 0.163 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.80e-01 0.0758 0.0863 0.163 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0275 0.0631 0.163 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 2.10e-02 0.193 0.0828 0.163 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 9.59e-01 0.0063 0.122 0.165 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 3.02e-01 0.0814 0.0786 0.165 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0139 0.0973 0.165 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 7.34e-01 0.03 0.0884 0.165 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0597 0.095 0.165 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 3.64e-01 0.0565 0.0621 0.165 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.22e-01 0.113 0.0725 0.165 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 5.93e-01 0.0729 0.136 0.171 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 4.09e-02 0.243 0.118 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 4.99e-02 -0.121 0.0614 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0798 0.13 0.171 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0392 0.136 0.171 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0283 0.123 0.171 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 9.07e-02 -0.178 0.105 0.171 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.16e-02 -0.332 0.13 0.171 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 1.54e-01 -0.189 0.132 0.171 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 6.37e-01 0.0562 0.119 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 8.02e-01 0.0207 0.0824 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 8.97e-01 0.0136 0.105 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0712 0.103 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 1.73e-01 -0.151 0.111 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0533 0.0946 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 8.97e-01 0.015 0.116 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 9.15e-01 0.0115 0.107 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 6.20e-01 0.0573 0.116 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 6.05e-01 0.0628 0.121 0.166 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.73e-03 0.283 0.0892 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 9.29e-01 0.0101 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 9.60e-01 0.00531 0.105 0.166 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 5.15e-02 -0.221 0.113 0.166 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0674 0.0899 0.166 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 2.92e-01 -0.121 0.115 0.166 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 2.04e-01 0.134 0.105 0.166 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0519 0.13 0.166 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 2.83e-01 -0.121 0.113 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.66e-01 0.11 0.0792 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 1.60e-01 0.151 0.107 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0939 0.0985 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 2.41e-01 0.107 0.091 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.88e-02 -0.149 0.063 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 7.52e-01 0.0378 0.12 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 3.67e-02 0.181 0.0861 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0781 0.114 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 3.46e-01 0.106 0.113 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 6.17e-01 0.0387 0.0773 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 8.48e-01 0.0178 0.0929 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 1.13e-01 -0.168 0.106 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 1.14e-01 0.16 0.101 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.57e-01 -0.106 0.0744 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 1.52e-01 -0.169 0.118 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 5.00e-01 0.0814 0.121 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0825 0.111 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 7.10e-01 0.0441 0.119 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.72e-02 0.243 0.101 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 5.10e-01 0.0824 0.125 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00539 0.12 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.92e-01 0.0995 0.116 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 4.27e-01 0.0843 0.106 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 2.03e-01 0.135 0.106 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 5.16e-01 0.0714 0.11 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 1.26e-01 0.17 0.111 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.07e-01 0.111 0.0689 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 2.31e-01 0.11 0.0912 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0297 0.0863 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 4.64e-01 0.0562 0.0765 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0772 0.0513 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 5.18e-02 0.17 0.0868 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 4.81e-01 0.0624 0.0885 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 8.60e-01 0.0191 0.108 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.41e-01 0.119 0.0803 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 1.45e-01 -0.147 0.101 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 5.97e-01 0.0459 0.0867 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 8.12e-01 0.0196 0.0822 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00794 0.0632 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 3.37e-02 0.199 0.093 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 6.32e-01 0.0487 0.102 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0449 0.122 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 2.47e-01 0.0964 0.0829 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0393 0.0967 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0846 0.0948 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 1.43e-01 0.151 0.103 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0499 0.0737 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 3.70e-01 0.0868 0.0967 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0121 0.101 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 6.93e-03 0.341 0.125 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 2.57e-01 0.103 0.0906 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0236 0.113 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0201 0.0926 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0988 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0139 0.0802 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.67e-01 0.129 0.093 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 3.09e-01 0.114 0.112 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 2.65e-01 -0.134 0.12 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 7.43e-01 0.0253 0.0769 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0632 0.0923 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00502 0.0928 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 2.88e-01 0.0989 0.0928 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0348 0.0488 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 2.05e-02 0.227 0.0974 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0392 0.113 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 4.75e-01 0.0952 0.133 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.17e-01 0.147 0.093 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 2.89e-01 -0.131 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0144 0.0975 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 9.57e-01 0.00541 0.101 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 7.07e-02 -0.182 0.1 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00544 0.104 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 1.94e-01 -0.142 0.109 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 2.76e-01 0.136 0.124 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.35e-01 0.169 0.113 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 5.01e-01 0.087 0.129 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 4.55e-01 0.0871 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 9.61e-02 0.202 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0386 0.0935 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 4.99e-01 0.0688 0.102 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0904 0.115 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0237 0.132 0.165 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.43e-01 0.134 0.0912 0.165 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 9.37e-01 0.00959 0.121 0.165 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 4.65e-01 0.0734 0.1 0.165 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 2.51e-01 -0.124 0.108 0.165 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 6.66e-03 0.214 0.0781 0.165 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 9.31e-01 0.00815 0.0936 0.165 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0032 0.124 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 7.18e-01 0.0382 0.106 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0833 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 8.70e-01 0.0184 0.112 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.76e-01 0.0929 0.105 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 6.62e-04 -0.325 0.0939 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 3.43e-01 0.0982 0.103 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 1.41e-01 0.167 0.113 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.98e-01 0.13 0.101 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 3.18e-02 0.194 0.0896 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0507 0.0979 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.17e-01 0.0929 0.0926 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00144 0.0629 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 2.24e-03 0.254 0.082 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 7.20e-01 0.0469 0.13 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.53e-01 0.159 0.111 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 6.09e-02 0.184 0.0979 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 2.70e-01 0.134 0.122 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0315 0.12 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0279 0.099 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.19e-01 0.165 0.105 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 1.25e-01 0.18 0.117 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 2.45e-01 0.118 0.101 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 3.82e-01 0.0826 0.0943 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 9.56e-01 0.00554 0.101 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0372 0.105 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 6.67e-01 0.0291 0.0674 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.26e-01 0.134 0.0875 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0971 0.142 0.181 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 5.36e-01 0.0784 0.126 0.181 PB L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 1.00e-02 0.245 0.0936 0.181 PB L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 1.55e-01 -0.22 0.154 0.181 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.03e-01 -0.142 0.137 0.181 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 3.37e-01 0.0926 0.096 0.181 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 1.14e-01 0.221 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00874 0.106 0.181 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 2.33e-01 -0.169 0.141 0.181 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 2.42e-01 -0.15 0.128 0.167 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0699 0.0946 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 6.93e-01 -0.04 0.101 0.167 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 7.87e-01 0.0323 0.119 0.167 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 3.13e-01 0.0776 0.0767 0.167 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 4.58e-02 0.182 0.0907 0.167 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0617 0.118 0.165 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 3.33e-01 0.0781 0.0805 0.165 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 8.42e-01 0.0254 0.127 0.165 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 9.07e-01 0.0115 0.0981 0.165 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00652 0.102 0.165 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0279 0.0865 0.165 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.51e-01 0.138 0.0961 0.165 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -239780 sc-eQTL 3.22e-01 0.109 0.11 0.165 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 8.33e-01 0.0251 0.119 0.159 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00338 0.0852 0.159 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0503 0.113 0.159 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0292 0.111 0.159 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 7.98e-02 -0.223 0.126 0.159 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 2.54e-03 0.311 0.102 0.159 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 4.50e-01 0.0836 0.11 0.159 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 8.69e-03 -0.318 0.12 0.159 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 1.71e-01 -0.128 0.093 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0247 0.0671 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 1.06e-01 -0.125 0.0767 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 1.09e-01 0.18 0.112 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 5.06e-01 0.0668 0.1 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 7.01e-02 0.153 0.0838 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00439 0.0883 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 2.90e-02 -0.256 0.116 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 6.13e-01 0.0542 0.107 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 6.08e-01 0.0377 0.0732 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0635 0.0904 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 2.88e-01 -0.122 0.114 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 1.89e-02 -0.253 0.107 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 4.17e-01 0.0766 0.0942 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 2.09e-01 0.117 0.0931 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 4.07e-02 -0.256 0.124 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 3.62e-01 0.133 0.146 0.152 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 2.68e-01 0.154 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0277 0.13 0.152 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 3.17e-01 0.139 0.138 0.152 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 4.36e-01 0.112 0.143 0.152 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0737 0.108 0.152 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 9.10e-01 0.0141 0.125 0.152 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0284 0.128 0.158 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 6.22e-01 0.0424 0.0858 0.158 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 1.05e-01 0.17 0.104 0.158 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0308 0.116 0.158 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.45e-01 -0.113 0.119 0.158 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 3.93e-01 0.0933 0.109 0.158 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 8.93e-02 0.18 0.105 0.158 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 1.02e-01 -0.212 0.129 0.158 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 7.07e-01 0.0447 0.119 0.154 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0106 0.0709 0.154 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0218 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 2.85e-01 -0.122 0.114 0.154 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 9.55e-01 0.00485 0.086 0.154 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0986 0.103 0.154 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 5.59e-02 0.168 0.0871 0.154 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0741 0.127 0.154 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 5.50e-01 0.0794 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 4.18e-01 0.0836 0.103 0.167 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.112 0.167 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0387 0.103 0.167 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0592 0.104 0.167 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.51e-01 0.163 0.113 0.167 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.07e-01 0.215 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 6.08e-01 -0.053 0.103 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 3.65e-01 0.104 0.114 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.58e-02 0.19 0.0782 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 6.18e-01 0.0521 0.104 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0555 0.102 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 2.02e-02 -0.244 0.104 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.58e-01 -0.103 0.0729 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 3.00e-01 -0.126 0.121 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 8.64e-01 0.0177 0.103 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 3.95e-01 -0.102 0.119 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 8.42e-01 0.0211 0.105 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 1.17e-01 0.114 0.0727 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 1.57e-01 -0.139 0.0982 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 1.81e-01 0.113 0.0837 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 1.62e-02 -0.141 0.0582 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -292125 sc-eQTL 3.19e-01 -0.123 0.123 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 6.69e-02 0.164 0.089 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -271489 sc-eQTL 2.80e-01 -0.114 0.105 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0656 0.086 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0251 0.0641 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 1.29e-01 -0.117 0.0768 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 2.98e-01 0.118 0.113 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0742 0.0927 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 9.89e-02 0.136 0.0821 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 6.59e-01 0.0399 0.0904 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 1.45e-02 -0.294 0.119 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 8.64e-01 0.0203 0.119 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0125 0.0635 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 5.98e-01 0.0536 0.101 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 307302 sc-eQTL 3.11e-01 -0.114 0.113 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 8.09e-01 0.017 0.0703 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0754 0.103 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 8.70e-02 0.151 0.088 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 307325 sc-eQTL 1.59e-01 -0.176 0.124 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 sc-eQTL 6.81e-02 0.199 0.109 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 596342 sc-eQTL 7.50e-02 0.169 0.0942 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 892454 sc-eQTL 1.43e-02 0.195 0.0789 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -135207 sc-eQTL 6.39e-01 0.0438 0.0933 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 11612 sc-eQTL 3.02e-01 0.0942 0.091 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -28872 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00703 0.0588 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -374775 sc-eQTL 1.55e-02 0.205 0.0839 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 226364 eQTL 0.044 0.0405 0.0201 0.0 0.0 0.172
ENSG00000135597 REPS1 11612 eQTL 1.71e-17 -0.178 0.0205 0.0 0.0 0.172
ENSG00000146386 ABRACL -28872 eQTL 0.00129 0.094 0.0291 0.0 0.0 0.172

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 11612 4.16e-05 3.08e-05 6.12e-06 1.51e-05 5.6e-06 1.46e-05 4.36e-05 4.01e-06 3.01e-05 1.47e-05 3.66e-05 1.61e-05 4.65e-05 1.3e-05 6.73e-06 1.84e-05 1.61e-05 2.52e-05 7.51e-06 6.34e-06 1.46e-05 3.27e-05 3.06e-05 8.8e-06 4.24e-05 7.7e-06 1.31e-05 1.22e-05 3.14e-05 2.41e-05 1.87e-05 1.64e-06 2.5e-06 7.07e-06 1.08e-05 5.45e-06 3.03e-06 3.14e-06 4.48e-06 3.2e-06 1.7e-06 3.66e-05 3.55e-06 3.43e-07 2.49e-06 3.59e-06 4.05e-06 1.53e-06 1.56e-06
ENSG00000146386 ABRACL -28872 3.36e-05 2.15e-05 3.18e-06 1.21e-05 3.22e-06 1.09e-05 2.99e-05 3.1e-06 2e-05 9.85e-06 2.58e-05 9.52e-06 3.45e-05 8.55e-06 5.26e-06 1.18e-05 1.05e-05 1.73e-05 5.31e-06 4.27e-06 9.65e-06 2.18e-05 2.02e-05 6.36e-06 3.35e-05 5.31e-06 8.23e-06 8.35e-06 2.3e-05 1.69e-05 1.29e-05 1.66e-06 1.68e-06 5.59e-06 7.8e-06 3.89e-06 2.08e-06 2.7e-06 3.2e-06 2.36e-06 1.52e-06 2.6e-05 2.79e-06 2.62e-07 1.91e-06 2.83e-06 3.62e-06 1.3e-06 9.39e-07