logo

Genes within 1Mb (chr6:138997579:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 7.97e-01 0.0211 0.082 0.201 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0367 0.0625 0.201 B L1
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 9.86e-01 0.00109 0.0625 0.201 B L1
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00956 0.0797 0.201 B L1
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0623 0.0703 0.201 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0435 0.0413 0.201 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 1.22e-02 -0.253 0.0999 0.201 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 6.64e-02 -0.117 0.0634 0.201 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 7.22e-01 0.0253 0.071 0.201 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0317 0.0907 0.201 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.70e-02 -0.134 0.0602 0.201 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 3.89e-02 -0.118 0.0568 0.201 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00369 0.0757 0.201 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0134 0.0595 0.201 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 2.74e-04 0.156 0.0423 0.201 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0719 0.0743 0.201 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0231 0.0734 0.201 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0953 0.0984 0.201 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0953 0.0642 0.201 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 6.52e-01 0.0296 0.0657 0.201 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0414 0.0705 0.201 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00105 0.0664 0.201 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.91e-02 0.0881 0.0373 0.201 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.34e-01 -0.107 0.0714 0.201 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 6.30e-01 0.042 0.0871 0.201 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0788 0.0992 0.196 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0804 0.0696 0.196 DC L1
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 9.71e-01 0.00297 0.0819 0.196 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 6.10e-01 0.0466 0.091 0.196 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 7.03e-02 -0.145 0.0799 0.196 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 4.16e-04 0.275 0.0765 0.196 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0436 0.0936 0.196 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 7.88e-01 0.0257 0.0952 0.196 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 2.06e-01 0.0901 0.0709 0.201 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0805 0.0489 0.201 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0401 0.0649 0.201 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0284 0.093 0.201 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0346 0.0544 0.201 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.46e-10 0.434 0.0643 0.201 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 7.35e-01 0.0254 0.075 0.201 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 6.91e-02 -0.175 0.096 0.201 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0812 0.0884 0.202 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0805 0.0778 0.202 NK L1
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0799 0.066 0.202 NK L1
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0805 0.0763 0.202 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0389 0.0728 0.202 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 8.20e-04 0.176 0.0518 0.202 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0871 0.0705 0.202 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.30e-01 0.0661 0.105 0.201 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.98e-02 -0.139 0.0672 0.201 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0276 0.0838 0.201 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 4.71e-01 -0.055 0.076 0.201 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 8.29e-01 0.0177 0.0819 0.201 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 6.11e-01 0.0273 0.0536 0.201 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.40e-02 -0.126 0.0622 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.24e-01 0.074 0.116 0.196 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.65e-01 0.0921 0.101 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 4.78e-01 0.0375 0.0527 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 1.91e-01 -0.144 0.11 0.196 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 5.47e-01 0.0698 0.116 0.196 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0494 0.105 0.196 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0154 0.0897 0.196 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 3.62e-01 0.103 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 3.01e-01 -0.117 0.112 0.196 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.102 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0676 0.0707 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 6.15e-01 0.0454 0.0901 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 2.19e-01 0.109 0.0882 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.50e-01 0.0722 0.0954 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00676 0.0813 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 1.47e-01 -0.144 0.0991 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 5.93e-01 -0.049 0.0916 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0262 0.0993 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.64e-01 0.0945 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0907 0.078 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0193 0.0976 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 8.20e-01 0.0205 0.0899 0.2 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 8.92e-01 0.0132 0.0975 0.2 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.91e-01 0.101 0.0768 0.2 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 1.49e-01 -0.142 0.0979 0.2 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.94e-01 -0.117 0.0901 0.2 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 7.81e-02 0.195 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 1.22e-01 0.15 0.0966 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0835 0.0681 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0102 0.0926 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 8.06e-01 0.0208 0.0847 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.69e-02 -0.155 0.0777 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.62e-02 -0.131 0.0541 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 1.68e-02 -0.244 0.101 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.56e-02 -0.18 0.0737 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0995 0.0978 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0607 0.095 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0233 0.065 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0475 0.0781 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 4.22e-01 -0.072 0.0894 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 7.22e-01 0.0305 0.0854 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 9.83e-03 -0.161 0.0619 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 5.39e-01 0.0612 0.0995 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0609 0.102 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0377 0.0933 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.86e-01 0.068 0.0974 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 4.60e-02 -0.168 0.0834 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0437 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0323 0.0984 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0662 0.0955 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.99e-02 0.178 0.0862 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 2.15e-02 -0.2 0.0863 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 1.89e-01 -0.118 0.0899 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 8.46e-01 0.0185 0.0952 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 5.34e-02 -0.114 0.0589 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 7.70e-02 -0.138 0.0779 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 7.25e-01 -0.026 0.074 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0329 0.0656 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 5.81e-01 0.0244 0.0442 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.60e-01 -0.105 0.0747 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0254 0.0759 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0087 0.0937 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0974 0.0694 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 4.44e-01 -0.067 0.0873 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 9.00e-01 0.00944 0.0749 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0037 0.0711 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.99e-06 0.253 0.0518 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0882 0.081 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0218 0.0878 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0707 0.104 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0985 0.0706 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 9.84e-01 0.00167 0.0825 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 7.53e-02 0.144 0.0804 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0437 0.0882 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 6.88e-03 0.169 0.0619 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 7.66e-02 -0.146 0.082 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 6.70e-01 0.0369 0.0864 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0564 0.108 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0889 0.0769 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 8.27e-01 0.021 0.0963 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 4.50e-01 0.0595 0.0786 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 2.99e-01 0.0875 0.084 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 7.66e-02 0.12 0.0676 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0992 0.0791 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 6.53e-01 0.0429 0.0951 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 6.48e-01 0.0461 0.101 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0718 0.0643 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 1.75e-01 0.105 0.0772 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 8.27e-01 -0.017 0.0779 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0427 0.0781 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.42e-01 0.039 0.0409 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.94e-02 -0.162 0.0821 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 2.57e-01 0.108 0.0945 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 1.13e-01 -0.184 0.116 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0611 0.0818 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0675 0.108 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.09e-01 0.0564 0.0852 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 7.31e-01 0.0305 0.0886 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.06e-01 0.0904 0.0881 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 7.07e-01 0.0341 0.0907 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 4.06e-01 0.0797 0.0957 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 7.65e-02 -0.187 0.105 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.28e-02 -0.205 0.0952 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 4.31e-02 0.221 0.109 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.86e-01 0.054 0.0991 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.08e-01 0.0854 0.103 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 2.50e-01 0.0916 0.0793 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0448 0.0864 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 6.53e-01 0.0442 0.0983 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.201 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0716 0.0793 0.201 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0528 0.105 0.201 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00503 0.087 0.201 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.61e-01 0.069 0.0936 0.201 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.72e-01 0.0616 0.0688 0.201 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.95e-01 -0.105 0.0808 0.201 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.61e-01 0.0769 0.104 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0116 0.0886 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0363 0.0948 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 6.87e-01 0.0381 0.0943 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 9.04e-01 0.0106 0.088 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 8.35e-03 0.212 0.0797 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.34e-01 -0.068 0.0869 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.04e-01 -0.064 0.0955 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0581 0.0847 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 1.28e-01 -0.116 0.0756 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0413 0.0822 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0652 0.0778 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 2.91e-03 0.156 0.0517 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.40e-02 -0.141 0.0697 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 1.84e-01 -0.144 0.108 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0198 0.0924 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0662 0.082 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 1.95e-01 -0.131 0.101 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 1.77e-01 0.135 0.0997 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.51e-01 0.118 0.0819 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.33e-02 -0.177 0.087 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.09e-01 -0.1 0.0983 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 1.00e-01 -0.139 0.0843 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 6.42e-01 0.0368 0.079 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0516 0.0848 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0381 0.0876 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 7.26e-03 0.15 0.0555 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0516 0.0736 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.54e-01 0.0875 0.116 0.204 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 6.22e-01 0.0512 0.104 0.204 PB L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 1.15e-01 -0.124 0.0781 0.204 PB L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0804 0.127 0.204 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 3.54e-01 -0.105 0.112 0.204 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.32e-01 0.0767 0.0787 0.204 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0417 0.115 0.204 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 3.83e-01 0.0758 0.0866 0.204 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 8.10e-01 0.028 0.116 0.204 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00627 0.107 0.2 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 6.65e-01 -0.037 0.0854 0.2 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0186 0.079 0.2 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0196 0.0844 0.2 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 1.97e-01 -0.128 0.0991 0.2 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0215 0.0641 0.2 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.50e-02 -0.185 0.0753 0.2 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0956 0.1 0.201 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0729 0.0684 0.201 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 5.79e-01 -0.06 0.108 0.201 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 8.36e-01 0.0173 0.0833 0.201 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0671 0.0861 0.201 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.95e-05 0.296 0.0706 0.201 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.26e-01 -0.125 0.0816 0.201 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -242074 sc-eQTL 3.83e-01 0.0818 0.0936 0.201 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.57e-01 0.0613 0.104 0.195 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 1.26e-01 -0.114 0.0743 0.195 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0627 0.0991 0.195 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 5.04e-01 0.0649 0.0969 0.195 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0167 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 7.74e-02 0.161 0.0907 0.195 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 5.25e-01 0.0617 0.0969 0.195 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 9.03e-01 0.0131 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.38e-01 0.0604 0.0777 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0663 0.0557 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0181 0.0643 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 7.58e-01 0.0289 0.0937 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 1.14e-01 -0.132 0.0831 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.05e-07 0.362 0.0658 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.94e-01 0.0503 0.0735 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 3.96e-02 -0.201 0.0971 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0567 0.089 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 6.30e-02 -0.113 0.0604 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0761 0.0751 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0523 0.0953 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 2.51e-02 0.201 0.0892 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 9.61e-09 0.434 0.0726 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0704 0.0775 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 8.76e-01 0.0163 0.104 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 3.38e-02 -0.251 0.117 0.212 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 4.00e-02 -0.232 0.112 0.212 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 2.57e-01 -0.12 0.105 0.212 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 6.12e-01 0.0574 0.113 0.212 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 3.35e-01 -0.113 0.117 0.212 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 9.72e-01 0.00312 0.088 0.212 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 8.13e-01 0.024 0.101 0.212 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.80e-02 0.198 0.104 0.204 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0668 0.0701 0.204 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0972 0.0857 0.204 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0757 0.0946 0.204 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 6.23e-02 -0.182 0.0971 0.204 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 2.47e-03 0.268 0.0873 0.204 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 7.01e-01 0.0334 0.0867 0.204 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 2.65e-01 -0.118 0.106 0.204 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.43e-01 0.0743 0.0965 0.199 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0139 0.0577 0.199 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 5.80e-01 0.0489 0.0883 0.199 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0702 0.0927 0.199 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 7.72e-01 0.0203 0.07 0.199 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.32e-04 0.298 0.0816 0.199 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 8.81e-01 0.0107 0.0716 0.199 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 6.99e-02 -0.186 0.102 0.199 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.27e-01 0.0744 0.117 0.186 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0779 0.0911 0.186 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 2.16e-01 0.123 0.099 0.186 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0162 0.0909 0.186 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.43e-02 -0.184 0.0909 0.186 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 4.99e-03 0.279 0.0981 0.186 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 6.69e-03 -0.318 0.116 0.186 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 2.68e-01 0.101 0.091 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 2.21e-01 -0.121 0.0983 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0631 0.0682 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0575 0.0899 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 3.44e-01 0.083 0.0876 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 2.49e-01 0.105 0.0907 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 5.45e-01 0.0382 0.063 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 7.64e-03 -0.276 0.103 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0414 0.0885 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 5.88e-01 0.0558 0.103 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 4.70e-01 0.0655 0.0905 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0406 0.0628 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0058 0.0923 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 8.13e-01 -0.02 0.0848 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 1.29e-01 -0.109 0.0719 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 9.12e-04 -0.166 0.0494 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -294419 sc-eQTL 1.99e-01 -0.136 0.106 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 4.26e-02 -0.156 0.0763 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -273783 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0177 0.0906 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 6.78e-01 0.0298 0.0717 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0827 0.0532 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0444 0.0643 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0149 0.0941 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 9.99e-01 0.000111 0.0774 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 1.80e-09 0.397 0.0632 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000444 0.0754 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 1.73e-01 -0.138 0.101 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 5.38e-02 0.186 0.0959 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0503 0.0515 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0357 0.0825 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 305008 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0789 0.0917 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0656 0.057 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 3.02e-05 0.342 0.0803 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 5.32e-01 0.045 0.072 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 305031 sc-eQTL 2.93e-02 -0.22 0.1 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 224070 sc-eQTL 1.70e-01 -0.126 0.0916 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 594048 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0993 0.0795 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 890160 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0616 0.0672 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -137501 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0851 0.0783 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 9318 sc-eQTL 4.50e-01 -0.058 0.0766 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -31166 sc-eQTL 2.50e-04 0.179 0.0479 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -377069 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0972 0.0712 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146386 \N -31166 0.000241 9.39e-05 9.55e-06 1.61e-05 4.43e-06 5.16e-05 6.71e-05 4.74e-06 4.29e-05 1.55e-05 5.7e-05 2.12e-05 7.22e-05 2.61e-05 1.44e-05 3.38e-05 2.94e-05 3.53e-05 7.94e-06 7.61e-06 1.9e-05 6.18e-05 8.08e-05 1.2e-05 6.88e-05 7.8e-06 2.16e-05 1.41e-05 5.69e-05 2.57e-05 2.26e-05 9.92e-07 2.9e-06 7.73e-06 1.14e-05 4.59e-06 1.81e-06 2.2e-06 5e-06 2.62e-06 1.21e-06 0.000142 2.13e-05 1.53e-07 4.04e-06 3.65e-06 3.49e-06 8.34e-07 1.3e-06