Genes within 1Mb (chr6:138996380:GTAA:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0035 0.0951 0.154 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 3.98e-01 0.0614 0.0725 0.154 B L1
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 5.51e-01 0.0433 0.0724 0.154 B L1
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 7.44e-02 -0.165 0.0918 0.154 B L1
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 5.09e-01 -0.054 0.0817 0.154 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 9.52e-03 -0.124 0.0473 0.154 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 2.72e-01 -0.129 0.117 0.154 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 3.42e-01 0.0704 0.0739 0.154 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0886 0.0822 0.154 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 6.18e-01 0.0527 0.105 0.154 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 7.13e-01 0.0261 0.0708 0.154 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0219 0.0668 0.154 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0495 0.088 0.154 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 4.59e-01 0.0513 0.0691 0.154 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0792 0.0505 0.154 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 2.88e-01 0.0921 0.0864 0.154 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 8.39e-01 0.0173 0.0854 0.154 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 2.65e-01 0.129 0.116 0.154 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0216 0.0758 0.154 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00412 0.0773 0.154 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 8.28e-01 -0.018 0.0829 0.154 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 8.23e-02 0.135 0.0775 0.154 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0261 0.0444 0.154 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 6.59e-02 0.155 0.0836 0.154 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0104 0.102 0.154 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 4.98e-01 0.0803 0.118 0.149 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0138 0.0832 0.149 DC L1
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0895 0.0972 0.149 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 3.56e-01 -0.1 0.108 0.149 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0185 0.0959 0.149 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 2.38e-02 0.211 0.0927 0.149 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00936 0.111 0.149 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 2.16e-02 -0.259 0.112 0.149 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0281 0.0849 0.154 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00517 0.0587 0.154 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0773 0.0773 0.154 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 5.42e-01 0.0676 0.111 0.154 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0473 0.0649 0.154 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 6.54e-01 0.0379 0.0845 0.154 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.93e-01 0.116 0.0891 0.154 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 2.40e-01 -0.135 0.115 0.154 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 5.68e-02 0.197 0.103 0.155 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 7.78e-01 0.0258 0.0912 0.155 NK L1
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 5.03e-02 0.151 0.0767 0.155 NK L1
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 8.66e-01 0.0151 0.0895 0.155 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0344 0.0852 0.155 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0425 0.0621 0.155 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 4.83e-02 0.163 0.082 0.155 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 6.87e-01 -0.049 0.122 0.154 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 9.29e-01 0.00704 0.0785 0.154 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 8.48e-01 0.0186 0.0969 0.154 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00924 0.088 0.154 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 8.50e-01 -0.018 0.0947 0.154 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 9.44e-01 0.00438 0.062 0.154 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.20e-01 0.113 0.0722 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 9.71e-01 0.00501 0.137 0.161 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 1.60e-01 0.169 0.12 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 6.57e-02 -0.115 0.0619 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 8.69e-02 -0.223 0.13 0.161 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 4.06e-01 0.114 0.137 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 8.88e-01 0.0174 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 1.26e-01 -0.162 0.105 0.161 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 3.11e-02 -0.286 0.132 0.161 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0919 0.133 0.161 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 2.71e-01 0.131 0.118 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0281 0.0822 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 7.05e-01 0.0396 0.105 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0555 0.103 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 1.69e-01 -0.152 0.11 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0454 0.0943 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 8.69e-01 0.0191 0.116 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00189 0.106 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 4.30e-01 0.0909 0.115 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0379 0.121 0.155 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 9.27e-02 0.152 0.0903 0.155 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0105 0.113 0.155 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0785 0.104 0.155 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 2.94e-01 -0.119 0.113 0.155 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0526 0.0895 0.155 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 3.16e-01 -0.114 0.114 0.155 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 2.03e-01 0.134 0.105 0.155 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 8.22e-01 -0.029 0.129 0.155 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 3.60e-01 -0.103 0.113 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 5.00e-01 0.0536 0.0794 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 5.55e-01 0.0636 0.108 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 2.79e-02 -0.216 0.0974 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 2.76e-01 0.0994 0.0909 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 1.00e-01 -0.105 0.0634 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 6.85e-01 0.0485 0.119 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.64e-01 0.121 0.0865 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 3.33e-01 -0.11 0.114 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 5.75e-01 0.0631 0.112 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.92e-01 0.0105 0.0769 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0618 0.0923 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 1.51e-01 -0.152 0.105 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 8.08e-01 0.0246 0.101 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0923 0.0741 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 1.27e-01 -0.18 0.117 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 8.95e-01 0.0159 0.12 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 6.37e-02 -0.204 0.109 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0273 0.122 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 2.10e-01 0.132 0.105 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 3.47e-01 0.121 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 7.73e-01 0.0356 0.123 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0137 0.12 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 4.60e-01 0.0806 0.109 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 6.25e-02 0.203 0.109 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 4.61e-01 0.0833 0.113 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 4.27e-01 0.0885 0.111 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 6.55e-01 0.031 0.0694 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 7.68e-01 -0.027 0.0917 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0816 0.0864 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 5.94e-01 0.041 0.0767 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 2.30e-01 -0.062 0.0515 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 2.09e-01 0.11 0.0874 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 9.96e-01 0.000471 0.0888 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 5.15e-01 0.0707 0.108 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.79e-01 0.0123 0.0807 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 7.75e-02 -0.178 0.101 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0394 0.0867 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 9.68e-01 0.00334 0.0823 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 4.21e-01 -0.051 0.0632 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 2.65e-01 0.105 0.0938 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00922 0.102 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 2.69e-01 -0.135 0.122 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0142 0.0832 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 2.61e-01 -0.109 0.0965 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 2.55e-01 -0.108 0.0947 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 2.67e-01 0.115 0.103 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0275 0.0738 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 4.80e-01 0.0684 0.0968 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 9.53e-01 0.00599 0.101 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 2.42e-02 0.285 0.126 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 9.43e-01 0.00648 0.0908 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00179 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 9.05e-01 0.0111 0.0926 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0761 0.099 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0426 0.0802 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 9.58e-02 0.155 0.0928 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 7.82e-01 0.031 0.112 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 1.93e-01 -0.156 0.119 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0531 0.0765 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0836 0.0919 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0219 0.0925 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 7.82e-02 0.163 0.092 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00751 0.0486 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.10e-01 0.157 0.0977 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 3.05e-01 -0.115 0.112 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 1.26e-01 0.203 0.132 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 6.49e-01 0.0427 0.0936 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0912 0.124 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0428 0.0974 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 5.27e-01 0.0641 0.101 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 3.20e-02 -0.215 0.0998 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0349 0.104 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0819 0.109 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 1.63e-01 0.175 0.125 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0246 0.13 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 9.58e-01 0.00618 0.118 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 2.12e-01 0.153 0.122 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0855 0.0942 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 7.33e-01 0.0351 0.103 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 4.78e-02 -0.23 0.116 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0745 0.131 0.154 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 5.06e-01 0.0604 0.0907 0.154 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00324 0.12 0.154 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 4.44e-01 0.0762 0.0993 0.154 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0849 0.107 0.154 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 1.68e-01 0.109 0.0784 0.154 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 7.46e-01 0.03 0.0927 0.154 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 8.23e-01 0.0282 0.126 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.60e-01 0.0189 0.107 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0515 0.115 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00661 0.114 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0467 0.106 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 1.30e-03 -0.312 0.0955 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 4.85e-01 0.0733 0.105 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 3.55e-01 0.104 0.112 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.00e-01 0.0253 0.0994 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 5.50e-02 0.17 0.0884 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0918 0.0962 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 6.77e-01 0.0381 0.0913 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0144 0.0619 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.06e-02 0.209 0.0812 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0183 0.128 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 5.01e-01 0.0736 0.109 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 1.87e-02 0.227 0.0959 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 1.19e-01 0.187 0.119 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0492 0.119 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0556 0.0974 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.40e-01 0.154 0.104 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 1.38e-02 0.284 0.114 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0387 0.0999 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 2.40e-01 0.109 0.0928 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0484 0.0998 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0759 0.103 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00395 0.0664 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.56e-01 0.123 0.0863 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 3.73e-01 -0.132 0.147 0.156 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 7.33e-01 0.0449 0.131 0.156 PB L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 3.04e-01 0.103 0.0997 0.156 PB L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 4.74e-01 -0.116 0.161 0.156 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 2.61e-01 -0.161 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 4.17e-01 0.0814 0.0998 0.156 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 1.42e-01 0.214 0.145 0.156 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 4.68e-01 -0.08 0.11 0.156 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 2.22e-01 -0.18 0.147 0.156 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 1.36e-01 -0.188 0.126 0.154 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0565 0.101 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0536 0.0932 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0353 0.0997 0.154 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0768 0.117 0.154 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 6.17e-01 0.0379 0.0757 0.154 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.02e-01 0.147 0.0896 0.154 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0265 0.118 0.154 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.75e-01 0.0127 0.0806 0.154 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 4.02e-01 -0.107 0.127 0.154 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 8.74e-01 0.0156 0.098 0.154 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 9.32e-01 0.0087 0.101 0.154 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 5.66e-01 0.0497 0.0864 0.154 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 2.29e-01 0.116 0.0961 0.154 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -243273 sc-eQTL 5.15e-01 0.0719 0.11 0.154 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 7.12e-01 0.0438 0.119 0.151 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 1.99e-01 -0.109 0.0847 0.151 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0619 0.113 0.151 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0226 0.11 0.151 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 2.13e-01 -0.159 0.127 0.151 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 2.00e-02 0.241 0.103 0.151 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 4.68e-01 0.0802 0.11 0.151 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 4.99e-02 -0.238 0.121 0.151 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0574 0.0925 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00985 0.0665 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0968 0.0762 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 9.09e-02 0.188 0.111 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 3.96e-01 0.0844 0.0993 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 1.65e-01 0.116 0.0833 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 5.99e-01 0.046 0.0875 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 2.63e-01 -0.131 0.116 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00283 0.108 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 5.77e-01 0.0411 0.0736 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0851 0.0907 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 2.72e-01 -0.127 0.115 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 1.71e-02 -0.258 0.108 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 3.90e-01 0.0814 0.0946 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 2.34e-01 0.112 0.0935 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 3.72e-01 -0.113 0.126 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 2.36e-01 0.17 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 6.24e-01 0.0674 0.137 0.148 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 8.70e-01 0.0209 0.127 0.148 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 4.90e-01 0.0944 0.136 0.148 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 5.85e-01 0.0773 0.141 0.148 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 4.30e-01 -0.084 0.106 0.148 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 8.25e-01 0.0272 0.123 0.148 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0275 0.125 0.151 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 1.81e-01 0.112 0.0838 0.151 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 2.35e-01 0.122 0.103 0.151 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0196 0.113 0.151 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 4.85e-01 -0.082 0.117 0.151 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 6.82e-01 0.0439 0.107 0.151 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.12e-01 0.165 0.103 0.151 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0256 0.127 0.151 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 6.52e-01 0.0535 0.118 0.147 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 3.43e-01 -0.067 0.0704 0.147 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 8.14e-01 0.0255 0.108 0.147 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0216 0.114 0.147 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0173 0.0857 0.147 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0948 0.103 0.147 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 1.81e-02 0.206 0.0864 0.147 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0829 0.126 0.147 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 6.58e-01 0.0582 0.131 0.161 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 5.42e-01 0.0623 0.102 0.161 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 2.06e-01 -0.14 0.111 0.161 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 1.52e-01 -0.145 0.101 0.161 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0195 0.103 0.161 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 1.83e-01 0.149 0.112 0.161 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 5.77e-02 0.25 0.131 0.161 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 2.77e-01 -0.111 0.102 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 4.35e-01 0.0891 0.114 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 2.54e-01 0.09 0.0788 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 8.57e-01 0.0188 0.104 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 1.52e-01 -0.151 0.105 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0721 0.0728 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 3.18e-01 -0.121 0.12 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 8.83e-01 0.0151 0.102 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 7.12e-01 -0.044 0.119 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 8.95e-01 0.0139 0.105 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 3.07e-01 0.0746 0.0728 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 8.35e-01 0.0223 0.107 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 2.13e-02 -0.225 0.0972 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 5.83e-01 0.0461 0.0838 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 8.01e-02 -0.103 0.0584 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -295618 sc-eQTL 3.88e-01 -0.106 0.123 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 2.27e-01 0.108 0.0892 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -274982 sc-eQTL 5.70e-02 -0.199 0.104 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 5.92e-01 -0.046 0.0858 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0024 0.064 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 1.63e-01 -0.107 0.0767 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 4.28e-01 0.0894 0.112 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0607 0.0925 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 1.67e-01 0.114 0.082 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 4.66e-01 0.0658 0.0901 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 2.93e-01 -0.127 0.121 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 8.84e-01 0.0173 0.118 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00608 0.0631 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 7.44e-01 0.0329 0.101 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 303809 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0231 0.112 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00544 0.0698 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 2.92e-01 -0.108 0.102 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 8.26e-02 0.152 0.0874 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 303832 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0461 0.124 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 sc-eQTL 7.00e-02 0.196 0.108 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 592849 sc-eQTL 7.54e-01 0.0295 0.0942 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 888961 sc-eQTL 1.44e-02 0.193 0.0784 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -138700 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0156 0.0927 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 8119 sc-eQTL 8.14e-01 0.0213 0.0906 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -32365 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0369 0.0584 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -378268 sc-eQTL 4.20e-02 0.171 0.0836 0.155 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 222871 eQTL 0.0325 0.0443 0.0207 0.0 0.0 0.158
ENSG00000135597 REPS1 8119 eQTL 3.29e-19 -0.193 0.021 0.0 0.0 0.158
ENSG00000146386 ABRACL -32365 eQTL 5.01e-05 0.122 0.0299 0.0 0.0 0.158


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 8119 0.000261 0.00018 4.61e-05 3.66e-05 2.08e-05 5.43e-05 0.00014 1.02e-05 9.81e-05 4.66e-05 0.000145 6.21e-05 0.000202 4.91e-05 4.28e-05 0.000101 8.32e-05 0.000109 2.74e-05 1.22e-05 5.67e-05 0.000152 0.000127 3.54e-05 0.000193 4.62e-05 5.45e-05 3.41e-05 0.000114 7.41e-05 6.99e-05 4.62e-06 5.67e-06 1.41e-05 2.87e-05 1.46e-05 7.41e-06 1.11e-05 8.1e-06 8.1e-06 3.87e-06 0.000205 2.61e-05 2.47e-06 9.2e-06 1.52e-05 1.69e-05 6.01e-06 3.42e-06
ENSG00000146386 ABRACL -32365 0.000204 9.98e-05 3.44e-05 1.6e-05 7.07e-06 2.67e-05 6.81e-05 3.51e-06 3.43e-05 1.2e-05 4.41e-05 1.65e-05 7.69e-05 1.54e-05 2.1e-05 4.66e-05 5.1e-05 7.04e-05 8.82e-06 4.89e-06 2.52e-05 6.97e-05 5.02e-05 1.02e-05 8.67e-05 2.48e-05 1.83e-05 1.18e-05 5.14e-05 2.73e-05 2.41e-05 1.23e-06 2.38e-06 5.59e-06 1.03e-05 6.19e-06 5.7e-06 5.01e-06 3.56e-06 2.93e-06 1.71e-06 6.87e-05 2.06e-05 1.57e-06 2.63e-06 4.53e-06 9.13e-06 1.32e-06 5.35e-07