logo

Genes within 1Mb (chr6:138993026:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.88e-01 0.025 0.0928 0.186 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00838 0.0708 0.186 B L1
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 8.89e-01 0.00992 0.0707 0.186 B L1
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 3.91e-02 -0.185 0.0894 0.186 B L1
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 4.08e-02 -0.163 0.079 0.186 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 3.06e-02 -0.101 0.0463 0.186 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0824 0.115 0.186 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 6.21e-01 0.0357 0.0723 0.186 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0774 0.0803 0.186 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 6.68e-01 0.0441 0.103 0.186 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 7.55e-01 0.0216 0.069 0.186 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 8.24e-01 0.0145 0.0651 0.186 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.55e-01 -0.122 0.0854 0.186 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 2.62e-01 0.0756 0.0672 0.186 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 4.76e-02 -0.0977 0.049 0.186 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 7.08e-01 0.0317 0.0844 0.186 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 8.58e-01 0.015 0.0833 0.186 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 2.53e-01 0.128 0.112 0.186 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0253 0.0734 0.186 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 8.83e-01 -0.011 0.0748 0.186 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0628 0.0802 0.186 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 2.21e-01 0.0924 0.0753 0.186 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0645 0.0428 0.186 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 3.55e-01 0.0755 0.0815 0.186 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 8.72e-01 -0.016 0.0992 0.186 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0204 0.115 0.182 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 5.27e-01 -0.051 0.0805 0.182 DC L1
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 3.46e-01 -0.089 0.0942 0.182 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 9.11e-01 0.0118 0.105 0.182 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 4.28e-01 0.0737 0.0928 0.182 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 2.41e-01 0.107 0.0907 0.182 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0359 0.108 0.182 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 6.38e-02 -0.203 0.109 0.182 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 9.91e-01 0.000972 0.0823 0.186 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0295 0.0569 0.186 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.12e-01 -0.119 0.0747 0.186 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 1.71e-01 0.147 0.107 0.186 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0527 0.0629 0.186 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 8.74e-01 -0.013 0.082 0.186 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 6.86e-02 0.158 0.0861 0.186 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 2.26e-01 -0.135 0.112 0.186 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 4.04e-02 0.206 0.0999 0.187 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 9.09e-01 0.0102 0.0889 0.187 NK L1
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 5.80e-02 0.143 0.0748 0.187 NK L1
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0589 0.0871 0.187 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0503 0.083 0.187 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 6.21e-01 -0.03 0.0606 0.187 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 2.39e-01 0.0949 0.0803 0.187 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0679 0.119 0.186 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0487 0.0771 0.186 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 4.29e-01 0.0753 0.0951 0.186 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0611 0.0865 0.186 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0561 0.093 0.186 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0306 0.0609 0.186 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 3.38e-01 0.0684 0.0712 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.39e-01 0.045 0.135 0.189 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 2.69e-01 0.131 0.118 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 6.51e-02 -0.113 0.0609 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 6.29e-02 -0.239 0.127 0.189 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 8.01e-01 0.034 0.135 0.189 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 8.83e-01 0.018 0.122 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 2.08e-01 -0.132 0.104 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 2.24e-01 -0.16 0.131 0.189 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 2.84e-01 -0.141 0.131 0.189 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 1.89e-01 0.151 0.115 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 6.98e-01 -0.031 0.0797 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 9.16e-01 0.0107 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.90e-01 -0.131 0.0993 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.67e-03 -0.276 0.106 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 7.49e-01 0.0293 0.0915 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 2.95e-01 0.117 0.112 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0129 0.103 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 7.95e-01 0.029 0.112 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00821 0.118 0.188 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 3.20e-01 0.0885 0.0887 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0438 0.111 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0653 0.102 0.188 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 1.20e-01 -0.172 0.11 0.188 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 2.36e-01 -0.104 0.0873 0.188 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0553 0.112 0.188 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 4.28e-01 0.0814 0.103 0.188 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 9.57e-01 0.0068 0.126 0.188 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0952 0.111 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 8.29e-01 0.0168 0.0779 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0416 0.106 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.55e-02 -0.233 0.0953 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 6.46e-01 0.0411 0.0894 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0373 0.0625 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 8.83e-01 0.0172 0.117 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 5.17e-01 0.0552 0.0851 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0809 0.112 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 2.96e-01 0.114 0.109 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0225 0.0747 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0333 0.0898 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0917 0.103 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0064 0.0982 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0683 0.0721 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0985 0.114 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 8.27e-01 0.0255 0.117 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 9.39e-02 -0.179 0.106 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0334 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 1.51e-01 0.143 0.0993 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 2.28e-01 0.147 0.121 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0559 0.117 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.01e-01 0.014 0.113 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00457 0.103 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 3.60e-01 0.095 0.103 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 6.16e-01 0.0537 0.107 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.25e-01 0.0384 0.109 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 7.19e-01 0.0245 0.068 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 3.56e-01 -0.083 0.0896 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.82e-01 -0.113 0.0844 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 2.16e-01 0.0929 0.0749 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0661 0.0504 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 5.26e-01 0.0546 0.0858 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 7.74e-01 -0.025 0.0869 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 2.86e-01 0.112 0.105 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00391 0.0784 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 2.48e-01 -0.114 0.098 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 2.26e-01 -0.102 0.0839 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0608 0.0798 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0797 0.0612 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 5.71e-01 0.0519 0.0913 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 6.40e-01 0.0461 0.0986 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0931 0.119 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 6.34e-01 0.0388 0.0815 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 7.52e-01 -0.03 0.0947 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 6.35e-02 -0.172 0.0923 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 2.18e-01 0.125 0.101 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 1.07e-01 -0.116 0.0719 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0213 0.0949 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 5.27e-01 0.0629 0.0992 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 1.96e-01 0.16 0.123 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0195 0.0884 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0742 0.11 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0326 0.0901 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0637 0.0964 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0947 0.0778 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 5.41e-01 0.0555 0.0908 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0963 0.109 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0436 0.117 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0431 0.0749 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 2.46e-01 -0.104 0.0898 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0653 0.0904 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 1.21e-01 0.14 0.0902 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 3.67e-01 -0.043 0.0475 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 2.52e-01 0.11 0.0959 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0876 0.11 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 4.35e-01 0.103 0.132 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 4.44e-01 0.0714 0.093 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 3.27e-01 0.121 0.123 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0835 0.0967 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.41e-01 0.0075 0.101 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 5.69e-03 -0.275 0.0984 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0768 0.103 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0227 0.109 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 1.55e-01 0.173 0.121 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 2.54e-01 0.126 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0631 0.126 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 8.40e-01 0.0231 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 5.98e-01 0.0627 0.119 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 1.82e-02 -0.215 0.0902 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 5.33e-01 0.062 0.0994 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 2.15e-01 -0.14 0.113 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.127 0.186 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 8.03e-01 0.022 0.0882 0.186 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 1.60e-01 0.164 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 8.11e-01 0.0231 0.0967 0.186 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0635 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 5.38e-01 0.0472 0.0765 0.186 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0399 0.0901 0.186 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 9.74e-01 0.00396 0.122 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 6.32e-01 0.0496 0.103 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 8.30e-01 0.0239 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0629 0.11 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0646 0.103 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 6.28e-03 -0.257 0.093 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 3.07e-01 0.104 0.101 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00547 0.0975 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 1.96e-02 0.203 0.0862 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 9.26e-02 -0.159 0.0938 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 8.60e-01 0.0159 0.0895 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0273 0.0606 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 1.04e-01 0.131 0.0803 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 9.21e-01 0.0124 0.125 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 4.46e-01 0.0814 0.107 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 9.97e-02 0.156 0.0942 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.78e-01 0.157 0.117 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 6.40e-01 -0.054 0.116 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0769 0.0949 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 2.19e-01 0.125 0.101 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 3.20e-02 0.244 0.113 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0572 0.0983 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 3.34e-01 0.0885 0.0915 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 2.55e-01 -0.112 0.0981 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 6.58e-01 -0.045 0.102 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 6.14e-01 -0.033 0.0654 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 7.36e-01 0.0288 0.0854 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0476 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0566 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0982 0.193 PB L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0257 0.159 0.193 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 3.20e-01 -0.14 0.141 0.193 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.193 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 2.82e-01 0.155 0.144 0.193 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 1.53e-01 -0.155 0.108 0.193 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0766 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 1.96e-01 -0.159 0.123 0.185 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0975 0.0982 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0641 0.0909 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0737 0.0971 0.185 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 1.35e-01 -0.171 0.114 0.185 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 8.25e-01 0.0163 0.0738 0.185 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 2.01e-01 0.113 0.0876 0.185 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.05e-01 0.0436 0.115 0.186 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 9.20e-01 0.00794 0.0785 0.186 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0261 0.123 0.186 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 7.70e-01 0.0279 0.0954 0.186 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 4.88e-01 0.0685 0.0986 0.186 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00236 0.0841 0.186 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 4.74e-01 0.0672 0.0938 0.186 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -246627 sc-eQTL 1.97e-01 0.138 0.107 0.186 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0269 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 1.76e-01 -0.113 0.083 0.185 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0934 0.11 0.185 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 5.27e-01 0.0686 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0357 0.125 0.185 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 2.21e-01 0.125 0.102 0.185 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 8.64e-01 0.0186 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 8.42e-02 -0.206 0.119 0.185 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0819 0.0896 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0335 0.0644 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.77e-01 -0.1 0.0738 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 1.09e-01 0.173 0.107 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 8.94e-02 0.163 0.0958 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 6.45e-01 0.0374 0.0811 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 4.24e-01 0.0678 0.0847 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0887 0.113 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 3.60e-01 0.0956 0.104 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 7.31e-01 0.0245 0.0714 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 2.14e-01 -0.11 0.0879 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0333 0.112 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.00e-03 -0.274 0.104 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 7.55e-01 0.0288 0.0919 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 1.07e-01 0.146 0.0905 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0664 0.122 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 1.46e-01 0.205 0.14 0.176 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 1.08e-01 0.215 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 7.97e-01 0.0323 0.125 0.176 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0373 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.65e-01 0.00604 0.139 0.176 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0532 0.104 0.176 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 7.56e-01 0.0375 0.12 0.176 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 8.30e-01 0.0263 0.122 0.184 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 2.30e-01 0.0984 0.0818 0.184 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.95e-01 0.13 0.1 0.184 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 5.65e-01 0.0638 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 3.11e-01 -0.116 0.114 0.184 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 4.64e-01 0.0765 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 1.31e-01 0.153 0.101 0.184 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0534 0.124 0.184 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 6.06e-01 0.0579 0.112 0.181 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0693 0.0668 0.181 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00164 0.103 0.181 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 9.94e-01 0.000823 0.108 0.181 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0821 0.0811 0.181 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 4.46e-02 -0.196 0.097 0.181 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 4.31e-02 0.167 0.0823 0.181 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0882 0.12 0.181 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 8.54e-01 0.0234 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 5.26e-01 0.0627 0.0987 0.195 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0964 0.107 0.195 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0665 0.0983 0.195 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.43e-01 0.00711 0.0997 0.195 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 1.30e-01 0.165 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 8.98e-02 0.217 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 1.34e-01 -0.148 0.0981 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 2.46e-01 0.128 0.11 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 4.82e-01 0.0539 0.0765 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0201 0.101 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 3.82e-02 -0.203 0.0974 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 2.17e-03 -0.31 0.0998 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0404 0.0707 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 8.21e-01 0.0265 0.117 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0242 0.0993 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 6.34e-01 -0.055 0.115 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 6.70e-01 0.044 0.103 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 8.36e-01 0.0148 0.0715 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0514 0.105 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 1.51e-02 -0.233 0.0951 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0167 0.0822 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0475 0.0576 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -298972 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.121 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 5.39e-01 0.054 0.0877 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -278336 sc-eQTL 5.35e-02 -0.198 0.102 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0229 0.0833 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0359 0.0621 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 7.95e-02 -0.131 0.0742 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 2.80e-01 0.118 0.109 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 9.77e-01 0.00257 0.0899 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 5.74e-01 0.045 0.0799 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 2.65e-01 0.0976 0.0873 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0857 0.117 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 7.78e-01 0.032 0.113 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0225 0.0606 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 7.03e-01 0.0369 0.0968 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 300455 sc-eQTL 5.93e-01 0.0577 0.108 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0481 0.067 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0977 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 8.12e-02 0.147 0.084 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 300478 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0312 0.119 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 sc-eQTL 2.91e-02 0.23 0.105 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 589495 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00125 0.092 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 885607 sc-eQTL 1.97e-02 0.18 0.0766 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -142054 sc-eQTL 2.33e-01 -0.108 0.0901 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 4765 sc-eQTL 8.03e-01 0.0221 0.0883 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -35719 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0511 0.0569 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -381622 sc-eQTL 2.81e-01 0.0889 0.0822 0.188 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 219517 eQTL 0.0346 0.0407 0.0192 0.0 0.0 0.184
ENSG00000135597 REPS1 4765 eQTL 2.9199999999999998e-24 -0.202 0.0193 0.036 0.0325 0.184
ENSG00000146386 ABRACL -35719 eQTL 0.0225 0.064 0.028 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 4765 4.1e-05 3.51e-05 6.79e-06 1.62e-05 6.92e-06 1.63e-05 4.92e-05 5.27e-06 3.63e-05 1.77e-05 4.41e-05 2.01e-05 5.32e-05 1.57e-05 8.1e-06 2.25e-05 2.01e-05 2.91e-05 8.82e-06 7.47e-06 1.86e-05 3.87e-05 3.52e-05 1.02e-05 4.97e-05 9.62e-06 1.63e-05 1.52e-05 3.57e-05 2.88e-05 2.34e-05 1.75e-06 3.24e-06 7.83e-06 1.3e-05 6.44e-06 3.58e-06 3.47e-06 5.44e-06 3.6e-06 1.83e-06 4.09e-05 4.23e-06 4.38e-07 2.79e-06 4.74e-06 4.55e-06 1.93e-06 1.56e-06
ENSG00000146386 ABRACL -35719 1.95e-05 2.61e-05 4.32e-06 1.31e-05 3.38e-06 8.76e-06 3.16e-05 3.67e-06 2.13e-05 9.85e-06 2.6e-05 9.95e-06 3.63e-05 9.56e-06 5.5e-06 1.23e-05 1.24e-05 1.87e-05 6.06e-06 5.11e-06 9.57e-06 2.24e-05 2.19e-05 6.06e-06 3.36e-05 5.83e-06 8.81e-06 8.88e-06 2.43e-05 1.77e-05 1.33e-05 1.66e-06 2.02e-06 5.28e-06 8.71e-06 4.51e-06 2.36e-06 2.77e-06 3.71e-06 2.42e-06 1.55e-06 2.75e-05 2.65e-06 3.6e-07 1.9e-06 2.69e-06 3.43e-06 1.34e-06 1.12e-06