logo

Genes within 1Mb (chr6:138990746:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0452 0.0811 0.265 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 2.26e-01 -0.075 0.0617 0.265 B L1
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0217 0.0618 0.265 B L1
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 2.04e-01 -0.1 0.0786 0.265 B L1
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 7.23e-02 0.125 0.0692 0.265 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 4.63e-02 0.0814 0.0406 0.265 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 3.80e-02 0.208 0.0994 0.265 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.87e-01 0.0673 0.0631 0.265 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0446 0.0703 0.265 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0283 0.0922 0.265 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 8.03e-01 0.0154 0.0619 0.265 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 1.18e-01 0.0911 0.058 0.265 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 4.49e-01 0.0582 0.0768 0.265 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0161 0.0605 0.265 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0549 0.0442 0.265 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.12e-01 -0.018 0.0757 0.265 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0675 0.0745 0.265 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0144 0.0988 0.265 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00924 0.0647 0.265 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 2.12e-01 0.0821 0.0657 0.265 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 9.17e-01 0.00737 0.0707 0.265 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 9.62e-01 0.00321 0.0665 0.265 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.50e-02 -0.0916 0.0374 0.265 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.98e-01 0.00919 0.0719 0.265 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 8.22e-01 0.0197 0.0873 0.265 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 4.09e-01 0.0813 0.0983 0.27 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 4.06e-01 0.0575 0.0691 0.27 DC L1
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 3.07e-01 0.0828 0.0809 0.27 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0267 0.0902 0.27 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 4.58e-01 0.0593 0.0797 0.27 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.24e-01 -0.12 0.0777 0.27 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00794 0.0928 0.27 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 8.79e-01 0.0143 0.0944 0.27 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0321 0.0702 0.265 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 9.87e-01 0.000791 0.0486 0.265 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 7.18e-01 0.0232 0.0641 0.265 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0187 0.0918 0.265 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 4.29e-01 0.0425 0.0537 0.265 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 8.71e-05 -0.27 0.0674 0.265 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0478 0.0739 0.265 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 5.90e-02 0.18 0.0947 0.265 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0906 0.0851 0.264 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0516 0.0751 0.264 NK L1
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 9.06e-01 0.00754 0.0638 0.264 NK L1
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.19e-01 0.0367 0.0737 0.264 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 9.15e-01 0.00747 0.0702 0.264 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.57e-02 -0.123 0.0505 0.264 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 3.75e-01 0.0605 0.068 0.264 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0238 0.103 0.265 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 1.79e-01 0.0892 0.0662 0.265 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 3.27e-01 0.0804 0.0818 0.265 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0297 0.0745 0.265 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 6.22e-01 0.0396 0.0801 0.265 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0527 0.0523 0.265 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0479 0.0613 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 2.89e-01 -0.123 0.115 0.26 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 7.40e-02 -0.181 0.101 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 7.62e-01 -0.016 0.0527 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 5.97e-01 0.0584 0.11 0.26 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 9.00e-01 0.0145 0.116 0.26 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 5.88e-01 0.0566 0.104 0.26 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.0891 0.26 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 1.57e-01 0.159 0.112 0.26 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0655 0.112 0.26 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 4.86e-01 0.0695 0.0995 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 7.02e-01 0.0265 0.069 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 5.54e-01 -0.052 0.0877 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0811 0.0861 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 9.61e-01 0.0045 0.0931 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0226 0.0792 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 9.02e-01 -0.012 0.097 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.49e-01 -0.017 0.0893 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0938 0.0965 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0207 0.101 0.263 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0373 0.0759 0.263 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 5.41e-01 0.0579 0.0946 0.263 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.07e-01 0.045 0.0873 0.263 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 5.57e-02 0.18 0.0938 0.263 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0345 0.0748 0.263 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 8.48e-01 0.0184 0.0955 0.263 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0189 0.0878 0.263 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 2.50e-01 -0.124 0.107 0.263 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0418 0.0947 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 1.03e-01 -0.108 0.0662 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0894 0.0901 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0744 0.0824 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 2.73e-01 0.0838 0.0762 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 4.17e-02 0.108 0.0529 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 3.78e-03 0.287 0.0981 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 5.75e-01 0.0408 0.0727 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0135 0.0955 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 6.39e-01 0.0432 0.092 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0608 0.0628 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 6.34e-02 0.14 0.0751 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0372 0.0867 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0424 0.0827 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 3.62e-01 0.0555 0.0608 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 7.89e-01 0.0258 0.0964 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.38e-01 -0.116 0.0981 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0576 0.0902 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 6.75e-01 0.0418 0.0995 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0846 0.0858 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 8.31e-01 0.0224 0.105 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 5.39e-01 0.0618 0.1 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 3.21e-01 0.0969 0.0973 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0208 0.0889 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.08e-01 0.112 0.0889 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 1.43e-01 0.135 0.0916 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 7.42e-01 0.0318 0.0967 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 7.49e-01 0.0193 0.0603 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 3.67e-01 0.0719 0.0795 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.41e-01 0.035 0.0751 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0295 0.0666 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 9.10e-01 0.0051 0.0449 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.53e-01 0.0141 0.0762 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0394 0.0771 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 1.79e-01 -0.126 0.0931 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0193 0.0696 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000407 0.0873 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 7.32e-01 0.0256 0.0748 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00104 0.0709 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 6.17e-02 -0.102 0.0541 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0674 0.081 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 1.11e-01 -0.14 0.0871 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0156 0.105 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0523 0.0717 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 2.46e-01 0.0969 0.0833 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 9.03e-01 0.01 0.082 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0191 0.0894 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0327 0.0637 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00386 0.0837 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0832 0.0873 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 9.08e-01 0.0123 0.106 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00577 0.0757 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 1.66e-02 0.225 0.0932 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0221 0.0772 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 7.84e-01 0.0226 0.0826 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.13e-01 -0.106 0.0665 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0424 0.0778 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 1.23e-01 0.144 0.0929 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0161 0.103 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 4.75e-01 0.047 0.0658 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 8.00e-01 0.0201 0.0791 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.26e-01 0.0388 0.0795 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 5.58e-01 0.0467 0.0797 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0593 0.0416 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 5.63e-01 0.0489 0.0845 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 7.64e-01 0.0291 0.0967 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 3.88e-01 0.0967 0.112 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0677 0.0786 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 1.44e-01 0.152 0.103 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 9.96e-01 0.000418 0.0819 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 8.19e-02 -0.148 0.0845 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.43e-01 0.124 0.0844 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0674 0.0871 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 1.99e-01 -0.118 0.0917 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 3.31e-01 0.104 0.107 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 1.00e+00 -2.17e-05 0.0975 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 9.88e-01 0.00162 0.111 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0387 0.1 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 4.10e-01 -0.086 0.104 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 2.80e-02 -0.176 0.0795 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.81e-01 0.0131 0.0875 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 8.20e-01 0.0227 0.0995 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 7.47e-01 0.0363 0.112 0.264 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 1.93e-01 0.101 0.0775 0.264 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 2.66e-02 0.227 0.102 0.264 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0913 0.085 0.264 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 4.42e-01 0.0706 0.0917 0.264 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.13e-01 -0.107 0.0671 0.264 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0166 0.0795 0.264 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 2.80e-01 -0.109 0.1 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 5.83e-01 0.047 0.0855 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 9.77e-01 0.00264 0.0916 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0038 0.0911 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 7.29e-01 0.0294 0.0849 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00275 0.0783 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0548 0.0839 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0716 0.0922 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0652 0.0818 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0535 0.0734 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 3.23e-01 0.0785 0.0793 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 7.14e-01 0.0276 0.0753 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.66e-02 -0.121 0.0503 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 1.51e-01 0.0976 0.0676 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 3.89e-01 0.0915 0.106 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0294 0.0904 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0441 0.0803 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 7.68e-01 0.0293 0.0992 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 9.37e-01 0.00776 0.0979 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0482 0.0805 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.18e-02 0.149 0.0854 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 1.39e-01 -0.141 0.0949 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0408 0.0821 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 6.69e-01 0.0327 0.0766 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.53e-01 -0.037 0.0821 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0787 0.0847 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0761 0.0544 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.59e-01 0.0127 0.0713 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 1.21e-01 -0.18 0.115 0.289 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 1.88e-01 -0.136 0.103 0.289 PB L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 9.89e-01 0.00108 0.0788 0.289 PB L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0336 0.127 0.289 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 8.38e-03 0.293 0.109 0.289 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0396 0.0787 0.289 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0535 0.115 0.289 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.51e-01 0.0654 0.0865 0.289 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 3.82e-01 0.102 0.116 0.289 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0334 0.107 0.265 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 8.04e-01 0.0212 0.0853 0.265 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0356 0.0788 0.265 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0337 0.0842 0.265 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0396 0.0992 0.265 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 9.40e-01 0.00479 0.064 0.265 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.28e-01 -0.092 0.076 0.265 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 6.92e-01 0.0395 0.0996 0.265 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0169 0.0681 0.265 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 1.41e-03 0.338 0.105 0.265 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 8.50e-01 0.0157 0.0828 0.265 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 1.04e-01 0.139 0.0852 0.265 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0786 0.0728 0.265 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.85e-01 0.0118 0.0815 0.265 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -248907 sc-eQTL 2.18e-01 -0.115 0.0929 0.265 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 1.60e-01 0.14 0.0991 0.271 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 3.64e-01 0.0648 0.0713 0.271 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 3.86e-01 0.0821 0.0946 0.271 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0314 0.0927 0.271 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 5.06e-01 0.0711 0.107 0.271 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.66e-01 -0.121 0.0869 0.271 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0119 0.0926 0.271 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00683 0.102 0.271 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0122 0.0766 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 9.32e-01 0.00472 0.055 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.41e-01 0.0296 0.0633 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0735 0.0921 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00659 0.0823 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.28e-04 -0.261 0.0669 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0128 0.0724 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 7.30e-02 0.173 0.0958 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.62e-01 0.0153 0.0878 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 1.77e-01 -0.081 0.0598 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.30e-01 0.0358 0.0741 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 2.42e-01 0.11 0.0937 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0271 0.0889 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 2.98e-03 -0.228 0.0757 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0633 0.0764 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 2.65e-01 0.115 0.103 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0037 0.127 0.239 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0688 0.121 0.239 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 2.66e-01 0.125 0.112 0.239 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0208 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 3.64e-01 -0.113 0.124 0.239 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 2.00e-01 0.12 0.0931 0.239 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.88e-01 0.115 0.108 0.239 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0222 0.106 0.264 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 2.37e-01 -0.084 0.0708 0.264 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 4.83e-01 0.0609 0.0867 0.264 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0154 0.0957 0.264 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 5.79e-01 0.0549 0.0988 0.264 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 2.42e-02 -0.202 0.0891 0.264 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.22e-01 -0.107 0.0873 0.264 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 5.95e-01 0.0571 0.107 0.264 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0307 0.0951 0.267 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 5.77e-01 0.0317 0.0567 0.267 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0231 0.0869 0.267 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0796 0.0912 0.267 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 2.61e-02 0.152 0.068 0.267 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 3.73e-03 -0.238 0.0812 0.267 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0553 0.0703 0.267 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.101 0.267 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0204 0.111 0.266 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 9.61e-01 0.00426 0.086 0.266 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 5.41e-01 0.0573 0.0936 0.266 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 7.66e-01 0.0255 0.0856 0.266 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 2.25e-01 0.105 0.0863 0.266 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0579 0.0947 0.266 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.85e-01 0.0779 0.111 0.266 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00022 0.086 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0318 0.0959 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0287 0.0664 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 9.24e-01 0.00841 0.0875 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0364 0.0853 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 6.22e-01 0.0436 0.0884 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 8.02e-01 0.0154 0.0613 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 5.24e-01 0.0646 0.101 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0123 0.0861 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 2.47e-01 -0.116 0.0998 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0504 0.0886 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 8.04e-02 -0.107 0.0611 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0436 0.0903 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0833 0.0828 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 6.47e-01 0.0324 0.0707 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 6.04e-02 0.0929 0.0492 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -301252 sc-eQTL 1.79e-02 0.245 0.102 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 4.10e-01 0.0621 0.0753 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0325 0.0886 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00548 0.0707 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 9.51e-01 0.00323 0.0527 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 4.57e-01 0.0472 0.0633 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0365 0.0927 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 7.83e-01 -0.021 0.0762 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 5.52e-05 -0.269 0.0653 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0447 0.0742 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 8.97e-02 0.168 0.0988 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0341 0.0961 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 7.93e-01 0.0135 0.0513 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 9.26e-01 0.0076 0.082 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 298175 sc-eQTL 9.10e-01 0.0103 0.0912 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 5.14e-02 0.11 0.0563 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 3.25e-03 -0.242 0.0815 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0914 0.0714 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 298198 sc-eQTL 3.00e-01 0.104 0.101 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0775 0.0884 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 587215 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0548 0.0767 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 883327 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0089 0.0648 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -144334 sc-eQTL 6.29e-01 0.0365 0.0755 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 2485 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0106 0.0738 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -37999 sc-eQTL 1.37e-02 -0.117 0.0469 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -383902 sc-eQTL 2.94e-01 0.0722 0.0686 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 217237 eQTL 0.042 0.0357 0.0175 0.0 0.0 0.258
ENSG00000135540 NHSL1 298175 eQTL 0.0353 -0.0568 0.027 0.0 0.0 0.258
ENSG00000135597 REPS1 2485 pQTL 0.0161 0.0685 0.0284 0.00147 0.0 0.266
ENSG00000135597 REPS1 2485 eQTL 5.17e-08 0.1 0.0183 0.00355 0.00179 0.258
ENSG00000146386 ABRACL -37999 eQTL 1.36e-19 -0.227 0.0245 0.0 0.0 0.258
ENSG00000226571 AL592429.2 -280616 eQTL 4.20e-02 -0.0749 0.0368 0.0 0.0 0.258

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 2485 6.14e-05 5.73e-05 9.41e-06 2.19e-05 1.03e-05 2.24e-05 7.21e-05 8.07e-06 6.1e-05 3.1e-05 7.63e-05 3.02e-05 9.09e-05 2.61e-05 1.24e-05 4.17e-05 3.18e-05 4.58e-05 1.4e-05 1.28e-05 2.83e-05 6.97e-05 5.2e-05 1.51e-05 7.33e-05 1.68e-05 2.78e-05 2.41e-05 5.69e-05 4.12e-05 3.49e-05 2.89e-06 5.3e-06 1.18e-05 1.61e-05 9.43e-06 5.09e-06 5.68e-06 8.64e-06 4.34e-06 2.04e-06 6.29e-05 5.99e-06 5.78e-07 4.68e-06 6.79e-06 7.37e-06 2.8e-06 2.05e-06
ENSG00000146386 ABRACL -37999 1.98e-05 2.43e-05 3.08e-06 1.27e-05 3.08e-06 8.91e-06 2.83e-05 3.47e-06 1.85e-05 9.54e-06 2.42e-05 9.95e-06 3.63e-05 9.88e-06 5.37e-06 1.03e-05 1.03e-05 1.53e-05 4.67e-06 4.81e-06 8.63e-06 2.01e-05 2e-05 5.19e-06 2.94e-05 5.37e-06 8.26e-06 8.02e-06 2.01e-05 1.67e-05 1.25e-05 1.1e-06 1.73e-06 4.56e-06 8.5e-06 3.9e-06 1.79e-06 2.7e-06 3.16e-06 2.42e-06 1.12e-06 2.62e-05 2.65e-06 1.54e-07 1.41e-06 2.75e-06 3.24e-06 9.54e-07 8.17e-07